Вычислительное прогнозирование аминокислотных предпочтений потенциально мультиспецифических пептид-связывающих доменов, участвующих в белок-белковых взаимодействиях

Мы предлагаем протокол для вычислительного прогнозирования предпочтений аминокислот в более специфических белок-белковых взаимодействиях. Этот протокол можно рассматривать как первый шаг в разработке медиаторов этих взаимодействий. Мы заинтересованы в использовании этих медиаторов в качестве потенциальных ингибиторов специфических взаимодействий, в иммунологической технологии.

Наш разработчик, используемый для характеристики аминокислотных предпочтений среди конкретных сайтов связывания, является дорогостоящим и громоздким. Наш протокол представляет собой биологическую технологию, основанную на эффективности и серийных операциях. Эта стратегия обладает потенциалом для обработки большого числа линейных последовательностей, обеспечивая полное и последовательное различие предпочтений аминокислот.