Количественная оценка дендритных отростков с помощью программного обеспечения для автоматической трехмерной реконструкции нейронов

Дендритные шипики являются постсинаптическими компартментами большинства возбуждающих синапсов. Изменения морфологии дендритного отростка происходят во время неврологического развития, старения, обучения и многих неврологических и психиатрических расстройств, что подчеркивает важность надежного анализа дендритного отростка. Этот протокол описывает точную и воспроизводимую количественную оценку морфологии дендритных шипиков с помощью программного обеспечения для автоматической трехмерной реконструкции нейронов.

Целью нашего исследования является изучение структурного профиля дендритных шипиков в гиппокампе, в частности апикального дендрита CA-one. С помощью этого мы пытаемся ответить на вопросы, связанные с тем, как различные входы в разные части одного и того же дендрита могут быть закодированы на клеточном уровне. Одной из проблем является получение изображений дендритных шипиков с высоким разрешением для анализа позвоночника.

Как только вы получите эти изображения, метод наиболее точного и надежного анализа шипов таким образом, чтобы это не было слишком обременительным для исследователя, представляет собой дополнительную проблему. Необходимо найти баланс между этими двумя компонентами. Этот протокол предлагает золотую середину между полностью ручным и полностью автоматизированным дендритным анализом позвоночника.

Наш протокол снижает нагрузку на ручной подсчет отдельных шипов. Кроме того, 3D-реконструкция дает возможность получить объем позвоночника. Классифицируйте колючки по подтипам автоматически.