Веб-рабочий процесс для выбора ген- и тканеспецифических энхансеров

1.1K просмотров

08:12 мин

18 июля 2025 г.

10.3791/66840-v

18 июля 2025 г.

1.1K просмотров

Jooa Kwon¹^,² , George Z. He³^,⁴ , Mirana Ramialison¹^,²^,³^,⁴^,⁵ , Hieu T. Nim¹^,²^,³^,⁴

¹Department of Paediatrics, Faculty of Medicine, Dentistry and Health Sciences, University of Melbourne, ²Australian Regenerative Medicine Institute, Monash University, ³Stem Cell Medicine Department, Murdoch Children's Research Institute, The Royal Children's Hospital, ⁴The Novo Nordisk Foundation Center for Stem Cell Medicine, reNEW Melbourne, Murdoch Children's Research Institute, ⁵Systems Biology Institute (SBI) Australia

Мы представляем биологам рабочий процесс без программирования для идентификации тканеспецифичных генных энхансеров с использованием только браузерных инструментов. Наш протокол использует общедоступные гистоновые метки H3K4me1/H3K27ac и данные Hi-C, что позволяет исследователям, не имеющим опыта программирования, получать доступ, анализировать и идентифицировать потенциальные регуляторные элементы, связанные с их генами, представляющими интерес.