-1::1
Simple Hit Counter
Skip to content

Products

Solutions

×
×
Sign In

RU

EN - EnglishCN - 简体中文DE - DeutschES - EspañolKR - 한국어IT - ItalianoFR - FrançaisPT - Português do BrasilPL - PolskiHE - עִבְרִיתRU - РусскийJA - 日本語TR - TürkçeAR - العربية
Sign In Start Free Trial

RESEARCH

JoVE Journal

Peer reviewed scientific video journal

Behavior
Biochemistry
Bioengineering
Biology
Cancer Research
Chemistry
Developmental Biology
View All
JoVE Encyclopedia of Experiments

Video encyclopedia of advanced research methods

Biological Techniques
Biology
Cancer Research
Immunology
Neuroscience
Microbiology
JoVE Visualize

Visualizing science through experiment videos

EDUCATION

JoVE Core

Video textbooks for undergraduate courses

Analytical Chemistry
Anatomy and Physiology
Biology
Calculus
Cell Biology
Chemistry
Civil Engineering
Electrical Engineering
View All
JoVE Science Education

Visual demonstrations of key scientific experiments

Advanced Biology
Basic Biology
Chemistry
View All
JoVE Lab Manual

Videos of experiments for undergraduate lab courses

Biology
Chemistry

BUSINESS

JoVE Business

Video textbooks for business education

Accounting
Finance
Macroeconomics
Marketing
Microeconomics

OTHERS

JoVE Quiz

Interactive video based quizzes for formative assessments

Authors

Teaching Faculty

Librarians

K12 Schools

Biopharma

Products

RESEARCH

JoVE Journal

Peer reviewed scientific video journal

JoVE Encyclopedia of Experiments

Video encyclopedia of advanced research methods

JoVE Visualize

Visualizing science through experiment videos

EDUCATION

JoVE Core

Video textbooks for undergraduates

JoVE Science Education

Visual demonstrations of key scientific experiments

JoVE Lab Manual

Videos of experiments for undergraduate lab courses

BUSINESS

JoVE Business

Video textbooks for business education

OTHERS

JoVE Quiz

Interactive video based quizzes for formative assessments

Solutions

Authors
Teaching Faculty
Librarians
K12 Schools
Biopharma

Language

ru_RU

EN

English

CN

简体中文

DE

Deutsch

ES

Español

KR

한국어

IT

Italiano

FR

Français

PT

Português do Brasil

PL

Polski

HE

עִבְרִית

RU

Русский

JA

日本語

TR

Türkçe

AR

العربية

    Menu

    JoVE Journal

    Behavior

    Biochemistry

    Bioengineering

    Biology

    Cancer Research

    Chemistry

    Developmental Biology

    Engineering

    Environment

    Genetics

    Immunology and Infection

    Medicine

    Neuroscience

    Menu

    JoVE Encyclopedia of Experiments

    Biological Techniques

    Biology

    Cancer Research

    Immunology

    Neuroscience

    Microbiology

    Menu

    JoVE Core

    Analytical Chemistry

    Anatomy and Physiology

    Biology

    Calculus

    Cell Biology

    Chemistry

    Civil Engineering

    Electrical Engineering

    Introduction to Psychology

    Mechanical Engineering

    Medical-Surgical Nursing

    View All

    Menu

    JoVE Science Education

    Advanced Biology

    Basic Biology

    Chemistry

    Clinical Skills

    Engineering

    Environmental Sciences

    Physics

    Psychology

    View All

    Menu

    JoVE Lab Manual

    Biology

    Chemistry

    Menu

    JoVE Business

    Accounting

    Finance

    Macroeconomics

    Marketing

    Microeconomics

Start Free Trial
Loading...
Home
JoVE Journal
Biology
Экстракция дезоксирибонуклеиновой кислоты целого генома из видов Mycobacterium с пом...
Экстракция дезоксирибонуклеиновой кислоты целого генома из видов Mycobacterium с пом...
JoVE Journal
Biology
A subscription to JoVE is required to view this content.  Sign in or start your free trial.
JoVE Journal Biology
Whole-Genome Deoxyribonucleic Acid Extraction from Mycobacterium Species via the Cetyltrimethylammonium Bromide Technique

Экстракция дезоксирибонуклеиновой кислоты целого генома из видов Mycobacterium с помощью техники бромида цетилтриметиламмония

Full Text
907 Views
06:46 min
December 12, 2025

DOI: 10.3791/68409-v

Shatha Omar1, Brendon Mann1

1DST/NRF Centre of Excellence for Biomedical Tuberculosis Research, South African Medical Research Council (SAMRC), Centre for Tuberculosis Research, Division of Molecular Biology and Human Genetics, Faculty of Medicine and Health Sciences,Stellenbosch University

AI Banner

Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.

Overview

This study addresses the challenges of extracting high-quality DNA from mycobacteria, particularly due to their robust cell walls composed of mycolic acids. The main outcome is the CTAB method, which effectively produces DNA suitable for various molecular studies.

Key Study Components

Research Area

  • Genetic characterization of mycobacteria
  • Mycobacterial diseases and interactions in co-infections
  • Pathogenic speciation and drug resistance

Background

  • Mycobacteria have structurally complex and tough cell walls, complicating DNA extraction.
  • Focus on nontuberculosis mycobacteria and their relationship with tuberculosis.
  • Challenges faced in extracting DNA due to lipid-rich cell walls.

Methods Used

  • CTAB method for DNA extraction
  • Mycobacterial species as the biological system
  • Enzymatic digestion and organic extraction techniques

Main Results

  • Yield of DNA ranged from 190 to 600 nanograms per microliter with high purity ratios.
  • Visualization of intact high molecular weight DNA through gel electrophoresis.
  • Some species yielded lower DNA amounts indicating variations in extraction efficiency.

Conclusions

  • The study establishes a reliable method for extracting high-quality DNA from mycobacteria.
  • This methodology enhances the potential for further research into mycobacterial genetics and diseases.

Frequently Asked Questions

What are mycobacteria?
Mycobacteria are a group of bacteria, some of which are pathogenic and responsible for diseases such as tuberculosis.
Why is DNA extraction from mycobacteria challenging?
Their thick, lipid-rich cell walls make it difficult to effectively lyse the cells and release genomic DNA.
What is the CTAB method?
The CTAB method is a protocol for extracting DNA that involves enzymatic digestion and organic extraction techniques.
How does the quality of extracted DNA ensure reliability in research?
High-quality DNA is essential for accurate sequencing and molecular studies, ensuring reliable results in research.
What are the purity ratios achieved in this study?
The 260/280 absorbance ratio ranged between 1.9 and 2.0, and the 260/230 ratio ranged from 1.8 to 2.2, indicating high DNA purity.
What is the significance of this research?
This research contributes to improved methodologies for studying mycobacterial genetics and their associated diseases, enhancing our understanding and potential treatment pathways.

Этот протокол описывает метод CTAB для извлечения высококачественной ДНК из микобактерий, преодолевая трудности, связанные с их жёсткими, богатыми миколиновой кислотой клетковыми стенками. Процесс включает ферментативное переваривание, лизис клеток с помощью CTAB и очистку ДНК посредством органической экстракции и осадки этанола. Этот метод даёт ДНК, пригодную для молекулярных исследований, и он надёжен для исследований микобактериями.

Наши исследования сосредоточены на генетической характеристике видов микобактерий и сложной природе микобактериальных заболеваний у человека. Особое внимание уделяется нетуберкулезным микобактериям и их взаимодействию с макрофагами во время коинфекции с другими видами, особенно с микробактериями туберкулёза. Кроме того, мы сосредоточены на видообразовании патогенных микобактерий, идентификации генов, связанных с вирулентностью, и полиморфизме одного нуклеотида, связанном с лекарственной резистентностью.

Из-за толстой клеточной стенки, липидных и гидрофобных стенок микобактерий экстракция ДНК была сложной и требует специализированных методов лизисирования для их разрушения и эффективного освобождения геномной ДНК. В нашем протоколе мы рассматриваем экстракцию ДНК из видов микобактерий с помощью метода CTAB как надёжный и эффективный способ получения высококачественной ДНК, подходящей для всех геномных секвенировок и других молекулярных методов. Для начала убийте жидкую культуру в 15-миллилитровой трубке при 80 градусах Цельсия в течение одного часа.

View the full transcript and gain access to thousands of scientific videos

View the full transcript and gain access to thousands of scientific videos

Sign In Start Free Trial

Explore More Videos

Биология выпуск 226

Related Videos

Добыча высокомолекулярных ДНК Геномная Вес от почвы и осадков

11:24

Добыча высокомолекулярных ДНК Геномная Вес от почвы и осадков

Related Videos

26.5K Views

Добыча высокомолекулярных ДНК Вес от микробных матах

09:30

Добыча высокомолекулярных ДНК Вес от микробных матах

Related Videos

20.1K Views

Пример подготовки Микобактерий туберкулеза Экстракты для ядерно-магнитного резонанса исследований Metabolomic

07:56

Пример подготовки Микобактерий туберкулеза Экстракты для ядерно-магнитного резонанса исследований Metabolomic

Related Videos

15.9K Views

Разделение вариантов миколиевой кислоты на основе тонкослойной хроматографии: метод разделения липидов клеточной стенки микобактерий на основе полярности

03:26

Разделение вариантов миколиевой кислоты на основе тонкослойной хроматографии: метод разделения липидов клеточной стенки микобактерий на основе полярности

Related Videos

1.7K Views

Определение маркеров вирулентность микобактерий abscessus для внутриклеточного репликации в фагоцитов

08:34

Определение маркеров вирулентность микобактерий abscessus для внутриклеточного репликации в фагоцитов

Related Videos

9.1K Views

Моделирование туберкулеза Mycobacterium marinum инфицированных взрослых рыбок данио

07:00

Моделирование туберкулеза Mycobacterium marinum инфицированных взрослых рыбок данио

Related Videos

11.3K Views

Анализ липидного состава микобактерий методом тонкослойной хроматографии

07:42

Анализ липидного состава микобактерий методом тонкослойной хроматографии

Related Videos

9.3K Views

Выделение, размножение и идентификация видов бактерий, обладающих углеводородными метаболизирующими свойствами, из водной среды обитания

10:03

Выделение, размножение и идентификация видов бактерий, обладающих углеводородными метаболизирующими свойствами, из водной среды обитания

Related Videos

5.4K Views

Экстракция ДНК микобактерий с помощью взбивания шариков в специальном буфере с последующим рабочим процессом NGS

09:18

Экстракция ДНК микобактерий с помощью взбивания шариков в специальном буфере с последующим рабочим процессом NGS

Related Videos

958 Views

Матричная экстракция ДНК для целенаправленного секвенирования нового поколения на обеззараженных образцах мокроты

06:07

Матричная экстракция ДНК для целенаправленного секвенирования нового поколения на обеззараженных образцах мокроты

Related Videos

1.3K Views

JoVE logo
Contact Us Recommend to Library
Research
  • JoVE Journal
  • JoVE Encyclopedia of Experiments
  • JoVE Visualize
Business
  • JoVE Business
Education
  • JoVE Core
  • JoVE Science Education
  • JoVE Lab Manual
  • JoVE Quizzes
Solutions
  • Authors
  • Teaching Faculty
  • Librarians
  • K12 Schools
  • Biopharma
About JoVE
  • Overview
  • Leadership
Others
  • JoVE Newsletters
  • JoVE Help Center
  • Blogs
  • JoVE Newsroom
  • Site Maps
Contact Us Recommend to Library
JoVE logo

Copyright © 2026 MyJoVE Corporation. All rights reserved

Privacy Terms of Use Policies
WeChat QR code