Вычислительный конвейер для количественного определения межгенной/внутригенной энхансерной РНК в эмбриональных стволовых клетках мыши

Наша группа изучает энхансерную эпигенетику и эпитранскриптомику, сосредотачиваясь на разработке точного метода количественного определения энхансерных РНК как индикаторов активации энхансеров. Поскольку интрагенные энхансеры находились с транскриптами хозяина, различать сигналы энхансера DER и количественно их оценивать сложно. Для начала откройте терминал и введите команду для подготовки необходимых файлов и ссылок для идентификации усилителя.

Введите команду в терминале для входа в рабочий каталог. Затем запустите команду, которая копирует скрипты идентификации энхансера в текущий каталог. Затем выполните соответствующую команду для генерации BED-файлов для областей промоторов, тел генов и генов, кодирующих белки, с помощью аннотации кода гена.