מעקב אחר זבובים מהלכים בחופשיות: שיטה להערכת תנועה בדרוזופילה

Abstract

מקור: Sun, M. and Chen, L. L. שיטה חדשנית למדל אנצפלופתיה טראומטית כרונית בדרוזופילה. J. Vis. Exp. (2017).

סרטון זה מתאר כיצד לעקוב אחר זבובים ההולכים בחופשיות כדי להעריך את יכולת התנועה הכללית שלהם. הפרוטוקול המוצג מדגים את הגדרת הבדיקה וניתוח הנתונים באמצעות תוכנת מעקב וידאו.

Protocol

פרוטוקול זה הוא קטע מתוך Sun and Chen, A Novel Method to Model Chronic Traumatic Encephalopathy in Drosophila, J. Vis. Exp. (2017).

1. מעקב תנועה בעזרת וידאו

1. מלאו צלחת פטרי בקוטר 6 ס"מ באלסטומר סיליקון שקוף ליצירת זירת המעקב. השאירו מרווח של 3 מ"מ בין הסיליקון למכסה הכלים כדי לאפשר לזבובים ללכת בחופשיות אך לא לעוף.
2. להרדים בכל פעם ארבעה זבובים מהקבוצה המזויפת או המטופלת ולמקם אותם בזירה. השאירו את הזבובים על 22 מעלות צלזיוס למשך שעה אחת.
3. מקם מצלמת CCD (Charge-Coupled Device) מעל הזירות והקלט במשך 5 דקות.
4. נתח את מסלולי התנועה המוקלטים באמצעות תוכנת Ctrax (זמינה בחינם מ- Caltech). יצא את הנתונים במעקב בפורמט תואם שפת תכנות (לדוגמה, Matlab) ונתח את הנתונים בהתבסס על המרחק שעבר בכל מסגרת. חשב את מרחק ההליכה הממוצע עבור כל זבוב ושלב אותו עם כל הזבובים / הקבוצה המתועדים האחרים כדי לקבל מרחק מצטבר ממוצע שעבר על ידי אוכלוסיית הקבצים באותה קבוצה.

Materials

List of materials used in this article

Name	Company	Catalog Number	Comments
צלחות פטרי 60 מ"מ	פישר סיינטיפיק	FB0875713A	משמש כזירות מעקב
וסת זרימה	ג'נסי סיינטיפיק	59-122WC
מברשת עדינה	ג'נסי סיינטיפיק	59-204
פלייפד	ג'נסי סיינטיפיק	59-114
אלסטומר סיליקון Sylgard	דאו קורנינג	4019862
מצלמת CCD	מיקרוסופט	HD-5000
Ctrax Walking Fly Tracker	קלטק	Ctrax 0.2.11
ארגז הכלים לעיבוד תמונה של MATLAB	MATLAB	R2015b