Mycobacterium tuberculosis, этиологический агент туберкулеза человека, обладает исключительной способностью выживать в условиях воздействия стрессовых факторов окружающей среды, включая воздействие антибиотиков. Хотя устойчивость M. tuberculosis к стрессу, вероятно, является одним из факторов, обуславливающих необходимость 6-месячного курса химиотерапии туберкулеза 1, молекулярные механизмы, лежащие в основе этого характерного фенотипа патогена, остаются неясными. Многие виды микроорганизмов в ходе эволюции приспособились к выживанию в стрессовых условиях путем самоорганизации в высокоструктурированные, прикрепленные к поверхности и заключенные в матрикс образования, называемые биопленками 2-4. Рост в сообществах, по-видимому, является предпочтительной стратегией выживания микробов и обеспечивается генетическими компонентами, которые регулируют прикрепление к поверхности, межклеточную коммуникацию и синтез внеклеточных полимерных веществ (ВПВ) 5,6. Устойчивость к стрессу окружающей среды, вероятно, обеспечивается ВПВ и, возможно, физиологической адаптацией отдельных бацилл к гетерогенным микросредам внутри сложной архитектуры биопленок 7.
В серии недавних работ мы установили, что M. tuberculosis и Mycobacterium smegmatis обладают сильной склонностью к росту в виде организованных многоклеточных структур, называемых биопленками, которые могут выдерживать концентрации противотуберкулезных препаратов изониазида и рифампицина, более чем в 50 раз превышающие минимальные ингибирующие концентрации 8-10. Однако, что примечательно, для формирования зрелых биопленок M. tuberculosis требуются специфические условия, в частности соотношение объема над фазой среды к объему самой среды 9:1, а также ограниченный газообмен с атмосферой 9. Потребность в специальных условиях окружающей среды, возможно, связана с тем, что M. tuberculosis является облигатным патогеном человека и, следовательно, адаптирован к тканевой среде. В данной публикации мы демонстрируем методы культивирования биопленок M. tuberculosis во флаконах и в формате 12-луночного планшета, что удобно как для бактериологических, так и для генетических исследований. Мы описали протокол для аттенуированного штамма M. tuberculosis, mc27000, с делециями в двух локусах panCD и RD1, которые имеют решающее значение для роста патогена in vivo 9. Этот штамм может быть безопасно использован в условиях уровня биобезопасности BSL-2 для изучения фундаментальной биологии возбудителя туберкулеза, что позволяет избежать необходимости использования дорогостоящих лабораторий уровня BSL-3. Данный метод может быть расширен при соответствующей модификации состава среды для выращивания биопленок других культивируемых видов микобактерий.
В целом, единый протокол культивирования микобактериальных биопленок поможет исследователям, заинтересованным в изучении основных характеристик устойчивости микобактерий. Кроме того, четкий и лаконичный метод выращивания микобактериальных биопленок поможет клиническим и фармацевтическим специалистам в тестировании эффективности потенциальных лекарственных препаратов.