Analisando dendríticas Morfologia em Colunas e Camadas

Chun-Yuan Ting; Philip G. McQueen; Nishith Pandya; Evan S. McCreedy; Matthew McAuliffe; Chi-Hon Lee

doi:10.3791/55410

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Artigo de método

Analisando dendríticas Morfologia em Colunas e Camadas

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DOI:

10.3791/55410

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23 de março de 2017

Chun-Yuan Ting¹ , Philip G. McQueen² , Nishith Pandya³ , Evan S. McCreedy³ , Matthew McAuliffe³ , Chi-Hon Lee¹

¹Section on Neuronal Connectivity, Eunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human Development, National Institutes of Health (NIH), ²Mathematical and Statistical Computing Laboratory, Center for Information Technology, National Institutes of Health (NIH), ³Biomedical Imaging Research Services Section, Center for Information Technology, National Institutes of Health (NIH)

Neste artigo

Resumo

Aqui, mostramos como analisar roteamento dendrítica de neurônios da medula Drosophila em colunas e camadas. O fluxo de trabalho inclui uma técnica de imagem dual-vista a melhorar a qualidade de imagem e ferramentas computacionais para a detecção, registrar mandris dendríticas para a matriz coluna de referência e para analisar as estruturas dendríticas no espaço 3D.

Resumo

Em muitas regiões do sistema nervoso central, tais como os lóbulos óptica da mosca e do córtex vertebrado, circuitos sinápticos são organizados em camadas e colunas para facilitar a conexão cerebral durante o desenvolvimento e processamento da informação nos animais desenvolvidos. neurônios pós-sinápticos dendritos elaborados nos padrões específicos do tipo em camadas específicas para sinapse com terminais pré-sinápticos apropriados. O neurópilo mosca medula é composta de 10 camadas e cerca de 750 colunas; cada coluna é enervado pelo dendritos de mais de 38 tipos de neurônios da medula, que combinam com os terminais axonal de cerca de 7 tipos de aferentes de uma forma específica do tipo. Este relatório detalha os procedimentos para a imagem e analisar dendrites dos neurónios da medula. O fluxo de trabalho inclui três seções: (i) a secção de imagem dual-view combina duas pilhas de imagens confocal coletadas em orientações ortogonais em um de alta resolução de imagem 3D de dendrites; (Ii) a dendrite rastreamento e secção de registo traça dendríticamandris em 3D e registra traços dendríticas para a matriz coluna de referência; (Iii) a secção de análise dendrítica analisa padrões dendríticas em relação às colunas e camadas, incluindo terminação e de projecção planar direcção específica da camada de mandris dendríticas, e obtém estimativas de ramificação e de terminação frequências dendríticas. Os protocolos utilizam plugins personalizados construídos na MIPAV open-source (Medical Imaging processamento, análise e visualização) da plataforma e personalizadas caixas de ferramentas na linguagem laboratório matriz. Juntos, estes protocolos de fornecer um fluxo de trabalho completo para analisar o encaminhamento dendríticas de medula neurónios de Drosophila em camadas e colunas, para identificar os tipos de células, e para determinar defeitos de mutantes.

Introdução

Durante o desenvolvimento, os neurônios dendritos elaborados em complexos mas estereotipados padrões ramificados para formar sinapses com os seus parceiros pré-sinápticos. padrões de ramificação dendríticas correlacionar com a identidade e as funções neuronais. Os locais de mandris dendríticas determinar o tipo de entradas pré-sinápticos que recebem, enquanto o dendríticas ramificação tamanhos de complexidade e de campo governar o número de entrada. Assim, as propriedades morfológicas dendríticas constituem factores determinantes para a conectividade sináptica e computação neuronal. Em muitas regiões do cérebro complexas, tais como os lóbulos óptica da mosca e a reti....