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Articolo metodologico

Rilevamento e quantificazione di nanotubi a effetto tunnel mediante immagini 3D Volume View

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DOI:

10.3791/63992

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31 agosto 2022

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* These authors contributed equally

In questo articolo

Sommario

I nanotubi a effetto tunnel (TNT) sono principalmente nanotubi di membrana F-actina aperti che collegano le cellule vicine, facilitando la comunicazione intercellulare. La caratteristica notevole che distingue i TNT da altre protrusioni cellulari è la natura sospesa dei nanotubi tra le cellule. Qui, caratterizziamo i TNT costruendo una vista del volume 3D di immagini z-stack confocali.

Abstract

Recenti scoperte hanno rivelato che le cellule eseguono un trasferimento intercellulare diretto, a lungo raggio, tramite condotti su nanometria, membrana di actina, vale a dire "nanotubi tunneling" (TNT). I TNT sono definiti come estensioni di membrana a doppio strato lipidico aperte che mediano la continuità tra cellule vicine di diametro compreso tra 50 nm e 1 μm. I TNT sono stati dimostrati inizialmente nelle cellule neuronali, ma studi successivi hanno rivelato l'esistenza di TNT in diversi tipi di cellule e malattie, come malattie neurodegenerative, infezioni virali e cancro. Diversi studi hanno fatto riferimento a nanostrutture di membrana chiuse e accoppiate elettricamente tra cellule vicine come TNT o strutture simili al TNT.

La spiegazione dell'ultrastruttura in termini di continuità della membrana all'endpoint è tecnicamente impegnativa. Inoltre, gli studi sulla comunicazione cellula-cellula sono impegnativi in termini di caratterizzazione dei TNT utilizzando metodi convenzionali a causa della mancanza di marcatori specifici. I TNT sono principalmente definiti come protrusioni di membrana aperte a base di F-actina. Tuttavia, una delle principali limitazioni è che la F-actina è presente in tutti i tipi di protrusioni, rendendo difficile differenziare i TNT da altre protrusioni. Una delle caratteristiche notevoli dei TNT a base di F-actina è che queste strutture si librano tra due cellule senza toccare il substrato. Pertanto, TNT distinti colorati con F-actina possono essere convenientemente distinti da altre sporgenze come filopodi e neuriti in base al loro librarsi tra le cellule.

Abbiamo recentemente dimostrato che l'internalizzazione dell'amiloide-β oligomerica1-42 (oAβ) attraverso l'endocitosi actina-dipendente stimola la chinasi-1 attivata da p21 attivata (PAK1), che media la formazione di TNT contenenti F-actina coespressi con fosfo-PAK1 tra cellule neuronali SH-SY5Y. Questo protocollo delinea un metodo di analisi del volume 3D per identificare e caratterizzare i TNT dalle immagini z-stack catturate di protrusioni di membrana immunocolorate con F-actina e fosfo-PAK1 in cellule neuronali trattate con oAβ. Inoltre, i TNT si distinguono dallo sviluppo di neuriti e escrescenze neuronali basate su condotti di membrana con tubazione tubulinica F-actina e β-III.

Introduzione

I nanotubi a effetto tunnel (TNT) sono condotti di membrana basati su F-actina, principalmente aperti e svolgono un ruolo vitale nel trasferimento intercellulare di carichi e organelli1. La caratteristica unica dei TNT è che collegano le cellule vicine senza alcun contatto con il substrato; Sono lunghi oltre 10-300 μm e i loro diametri variano tra 50 nm e 1 μm 2,3. I TNT sono strutture transitorie e la loro durata dura da pochi minuti a diverse ore. I TNT sono stati dimostrati per la prima volta nelle cellule neuronali PC121; Successivamente, numerosi studi hanno....

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Protocollo

NOTA: Le cellule SH-SY5Y coltivate in terreni DMEM/F-12 sono state differenziate con acido retinoico 10 μM per 7 giorni e trattate con oligomeri oAβ da 1 μM per 2 ore a 37 °C (5% CO2). Dopo il trattamento, le cellule sono state fissate con la soluzione fissativa di Karnovsky e doppiamente immunocolorate con anticorpo fosfo-PAK1 (Thr423)/PAK2 (Thr402) e falloidina legante la F-actina. Successivamente, sono state scattate immagini confocali z-stack utilizzando un microscopio a scansione laser confocale. I TNT sono stati quantificati mediante conteggio manuale e distinti da altri neuriti / protrusioni cellulari costruendo immagini di visualizzazione del volume....

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Risultati

Qui, identifichiamo e caratterizziamo i TNT indotti da oAβ nelle cellule neuronali SH-SY5Y costruendo viste del volume 3D da immagini confocali z-stack (Figura 1). Le cellule sono state doppiamente immunocolorate con F-actina e fosfo-PAK1. Sono state analizzate immagini z-stack confocali di cellule immunocolorate per identificare i TNT (Figura 2). Inoltre, le immagini DIC sono state analizzate per verificare che le strutture TNT colorate con F-actina e fosfo-PAK.......

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Discussione

Diversi ricercatori negli ultimi 2 decenni hanno cercato di capire e caratterizzare la struttura dei TNT18. La mancanza di marcatori specifici ostacola il progresso e vi è una crescente domanda di un metodo conveniente e standardizzato che possa essere utilizzato per identificare, caratterizzare e quantificare i TNT. I TNT sono definiti come condotti di membrana a base di F-actina che si librano tra due cellule. Gli studi hanno dimostrato che i neuriti in via di sviluppo β-tubulina-positivi, vicin.......

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Dichiarazioni

Gli autori non hanno alcun conflitto di interessi da rivelare.

Ringraziamenti

D.K.V e A.R ringraziano la Manipal Academy of Higher Education per la borsa di studio TMA Pai. Ringraziamo il Science and Engineering Research Board of India per SERB-SRG (#SRG/2021/001315), nonché l'Indian Council of Medical Research of India (#5/4-5/Ad-hoc/Neuro/216/2020-NCD-I) e il fondo intramurale della Manipal Academy of Higher Education, Manipal, India. Ringraziamo la struttura confocale del JNCASR (Jawaharlal Nehru Centre for Advanced Scientific Research, India) e B. Suma per la microscopia confocale in JNCASR.

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Materiali

Elenco dei materiali utilizzati in questo articolo
NomeAziendaNumero di catalogoCommenti
Piatto da 35 mm con pozzetto da 14 mm realizzato con vetrino coprioggetto #1.5CellvisD35-14-1.5-NPiatto di imaging utilizzato per seminare le cellule per esperimenti di colorazione
Aβ (1-42) 1 mgAnaSpec#64129Oligomeri di beta amiloide per trattare le cellule
Farina Alexa 488 IgG anti-coniglio di capra (H+L)InvitrogenA11070Anticorpo secondario per fosfo-PAK1
Cabina di sicurezza biologicaThermo Scientific (MSC Advantage)51025411Fornisce condizioni asetiche durante la coltura cellulare
CO2 IncubatoreThermo Electron Corporation (Heraeus Hera Cell 240)51026556Per la crescita di cellule a temperatura corporea o vicino alla temperatura corporea
Microscopio a scansione laser confocaleZEISS (Carl Zeiss)LSM 880In grado di generare immagini tridimensionali di campioni di grandi dimensioni a super-risoluzione
DABCO [1,4-Diazobiciclo-(2,2,2) ottano]Merck8034560100Reagente anti-sbiancamento
DAPI (4′,6-diamidino-2-fenilidolo)SigmaD9542-1MGColoratore Neuclear
DMEM mediaGibco11965092Utilizzato per la preparazione di 100uM di Aβ (1-42)
  DMEM/F12 (miscela 1:1 di DMEM e Ham' s F12)Gibco12500062Terreni di coltura per SH-SY5Y
DMSO (dimetilsolfuro) Grado di coltura cellulareCryopurCP-100Grado di coltura cellulare utilizzato come agente di dissoluzione per l'acido retinoico
DMSO (dimetilsolfuro) Grado molecolareHimediaMB058Utilizzato come uno degli agenti di dissoluzione per l'A&beta liofilizzato; (1-42)
Siero fetale bovinoGibco16000044  Integratore principale per terreni di coltura (origine USA)
Fissativo in formalina (tamponato neutro 10%)Sigma AldrichHT5014-120MLComponente nella soluzione fissativa di Karnovsky
Glutaraldeide (Grado I, 25% in H2O)SigmaG5882Componente nella soluzione fissativa di Karnovsky
Soluzione HFIP (1,1,1,3,3-esafluoro-2-propanolo )TCIH024Utilizzato per sciogliere Aβ (1-42) 1 mg
Software di elaborazione/analisi delle immagini: FIJI (ImageJ)National Institute of Health (NIH)Utilizzato per elaborare/analizzare le immagini e per differenziare i TNT dai neuriti utilizzando il suo plug-in denominato "visualizzatore di volume".
LiofilizzanteCristo, Alfa2,4 LDplus0,05 mg aliquote di Aβ (1-42) può essere memorizzato in -20 ° C solo dopo liofilizzazione
Miscela Penicillina-Streptomicina-NeomicinaThermo fisher Scientific15640055Miscela di antibiotici
Falloidina-iFlor 555Abcamab176756Colorante legante F-actina
Fosfo-PAK1 (Thr423) /PAK2 (Thr402) [Coniglio]CST#2601Anticorpo
primario Anticorpo policlonale contro la tubulina beta 3 (TUBb3)Clonedella nuvolaPAE711Hu01Anticorpo primario
Acido retinoicoSigma-AldrichR2625-50MGReagente differenziante
SaponinaMerck8047-15-2Detergente utilizzato nel tampone di incubazione nell'immunocolorazione Sonicatore
bagno d'acqua (Quart, valvola di scarico Riscaldatore)Pulitore ad ultrasuoni3.0 L/3.2Sonicatore utilizzato per sciogliere Aβ (1-42) brodo, dopo l'aggiunta di DMSO durante la preparazione di 100 µ M Aβ (1-42)
Software di microscopia ZENZEISS (Carl Zeiss)Software di imaging per l'acquisizione di immagini di microscopia confocale con automazione intelligente
a

Riferimenti

  1. Rustom, A., Saffrich, R., Markovic, I., Walther, P., Gerdes, H. H. Nanotubular highways for intercellular organelle transport. Science. 303 (5660), 1007-1010 (2004).
  2. Desir, S., et al. Chemotherapy-induced tunneling nanotubes mediate intercellular drug ef....

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