Journal
/
Biology
/
Обнаружение соматических генетических изменений в опухолевых образцов экзоном улавливания и Massively Parallel Секвенирование
JoVE Journal
Biology
A subscription to JoVE is required to view this content.  Sign in or start your free trial.
JoVE Journal Biology
Detecting Somatic Genetic Alterations in Tumor Specimens by Exon Capture and Massively Parallel Sequencing
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Обнаружение соматических генетических изменений в опухолевых образцов экзоном улавливания и Massively Parallel Секвенирование

DOI:
10.3791/50710-v

•

11:02 min

•

October 18, 2013

•

, , , ,
1Department of Pathology,Memorial Sloan-Kettering Cancer Center, 2Human Oncology and Pathogenesis Program,Memorial Sloan-Kettering Cancer Center

Chapters

  • 00:05Title
  • 02:08Library Preparation: End Repair
  • 04:12Library Preparation: dA-Tailing and Adapter Ligation
  • 05:55Roche Nimblegen SeqCAP EZ Library Hybridization, Wash, and Amplification
  • 08:31Tumor-normal Pair Analysis
  • 10:08Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

Мы описывают получение штрих библиотек ДНК и последующей гибридизации на основе захвата экзона для обнаружения ключевых связанных с раком мутаций в клинических образцах опухолей по массовым параллелизмом секвенирования "следующего поколения". Целевые экзон последовательности предлагает преимущества высокой пропускной способности, низкой стоимости и глубокой покрытия последовательности, что позволит обеспечить высокую чувствительность для обнаружения низкие мутации частот.

Tags

Somatic Genetic AlterationsTumor SpecimensExon CaptureMassively Parallel SequencingNext-generation SequencingCancer-associated MutationsSequence MutationsCopy Number AlterationsStructural RearrangementsTargeted Exon SequencingHigh ThroughputLow CostDeep Sequence CoverageHigh Sensitivity

Article

Embed

ADD TO PLAYLIST

Usage Statistics

Related Videos

CD4 + T-лимфоцитов Захват Использование одноразовых микрофлюидный чип на ВИЧ

Дважды Всего горе на месте гибридизация раннего куриных эмбрионов

В естественных перепрограммирования взрослых соматических клеток в плюрипотентности сверхэкспрессией Яманака факторов

Эффективная генерация человека индуцированных плюрипотентных стволовых клеток из человеческих соматических клеток с Сендай-вируса

Линейного усиления опосредованного ПЦР - Локализация генетических элементов и характеристика Неизвестного фланговые ДНК

Массивно-параллельных Репортер Анализы в культивируемых клетках млекопитающих

Фекальные глюкокортикоиды Анализ: безоперационная Надпочечная Мониторинг в Equids

Целенаправленное РНК Секвенирование анализа к характеризации экспрессии генов и геномных Подгон

Одновременное измерение митохондриальной кальция и митохондриальной мембраны Потенциал в живых клетках с помощью флуоресцентной микроскопии

Interactome-Seq: Протокол для строительства Domainome Библиотека, проверки и отбора Фаговые отображения и следующего поколения последовательности

Read Article