Protein kropsbygning og dynamik er nøglen til at forstå forholdet mellem protein struktur og funktion. Hydrogen udveksling kombineret med høj opløsning massespektrometri er en alsidig metode til at studere de konformationelle dynamik proteiner samt karakterisering af protein-ligand-og protein-protein-interaktioner, herunder kontaktflader og allosteriske effekter.