Vi beskriver en teknik för analys av globala RNA-syntes i hypoxi med hjälp av bildbehandling. Klicka-kemi märkning av RNA inte tidigare har utförts i enlighet med hypoxi och möjliggör visualisering av globala RNA förändringar på enskild cellnivå. Denna metod kompletterar de befintliga medelvärdes RNA-tekniker, vilket gör att direkt visualisering av cell-till-cell förändringar i den globala RNA-syntes.