Journal
/
Environment
/
Nanopore DNA-sekventering for Metagenomic jordbundsanalyser
JoVE Journal
Environment
This content is Free Access.
JoVE Journal Environment
Nanopore DNA Sequencing for Metagenomic Soil Analysis

Nanopore DNA-sekventering for Metagenomic jordbundsanalyser

DOI:
10.3791/55979-v

•

07:33 min

•

December 14, 2017

•

, ,
1Center for Biotechnology Education, Krieger School of Arts and Sciences,Johns Hopkins University

Chapters

  • 00:05Title
  • 00:45Rapid Library Preparation Method
  • 02:06Setup and Sequencing Run
  • 05:36Results: Classroom Application
  • 06:47Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

Nanopore teknologi til sekvensering biomolekyler har bredt programmer inden for biovidenskab, herunder identifikation af patogener, fødevarer sikkerhed overvågning, genomisk analyse, metagenomic miljøovervågning og karakterisering af bakterielle antibiotikaresistens. I denne artikel demonstreres proceduren for metagenomic jord DNA-sekventering for identifikation af arter ved hjælp af nanopore sekventering teknologi.

Tags

NanoporeDNA SequencingMetagenomicsSoil AnalysisReal-time SequencingBioinformaticsDNA FragmentationLibrary PreparationFlow CellQuality ControlSample Preparation

Article

Embed

ADD TO PLAYLIST

Usage Statistics

Related Videos

Design og drift af en kontinuerlig<sup> 13</sup> C og<sup> 15</sup> N Mærkning Afdeling for Uniform eller differentiale, Metabolisk og Konstruktioner, Plant isotopmærkning

Eksperimentel protokol til at manipulere Plant-induceret Soil Heterogenitet

Air-samplet Filter Analyse for Endotoxiner og DNA indhold

Udvinding Metrics til tredimensionel Root Systems: Volumen og Overflade Analyse fra In-jord X-ray Computed Tomography data

En protokol til Indsamling og Konstruktion Jord Core lysimetre

En gusseted Thermogradient Table at styre Jord Temperaturer for Evaluering plantevækst og jordbundsovervågning Processer

Protokoller til Kvantificering Omsættelige pesticidrester i slider mere på græsset Systems

En lipidekstraktions- og analysemetode til karakterisering af jordmikrober i forsøg med mange prøver

Måling og kortlægning mønstre af jorderosion og Deposition relateret til jordbunden karbonat koncentrationer Under landbrugsdrift

Kollektion og udvinding af erhvervsmæssig Luftprøver til analyse af svampe DNA

Read Article