Native polyacrylamidgelelektroforese er et grundlæggende redskab til analyse af RNA-proteininteraktioner. Traditionelt har de fleste eksperimenter brugt vertikale geler. Imidlertid tilvejebringer vandrette geler flere fordele, såsom muligheden for at overvåge komplekser under elektroforese. Vi leverer en detaljeret protokol til generering og anvendelse af horisontal indfødte gelelektroforese.