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Sequenciamento de leitura ultralonga para análise de DNA genômico completo
JoVE Journal
Bioengineering
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JoVE Journal Bioengineering
Ultra-long Read Sequencing for Whole Genomic DNA Analysis
DOI:

10:34 min

March 15, 2019

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Chapters

  • 00:04Title
  • 01:24High-molecular Weight (HMW) DNA Extraction
  • 03:11Ultra-long DNA Library Construction – Mechanical Shearing-based Protocol
  • 05:19Ultra-long DNA Library Construction – Transposase Fragmentation-based Protocol
  • 06:23Sequencing on the Nanopore Device
  • 07:52Results: Ultra-long DNA Sequencing Protocol
  • 09:38Conclusion

Summary

Automatic Translation

Long-leitura sequências facilitam grandemente a montagem de genomas complexas e caracterização da variação estrutural. Nós descrevemos um método para gerar as sequências ultra-longa pelas plataformas de sequenciamento baseado em nanopore. A abordagem adota uma extração de DNA otimizada seguida de preparações de biblioteca modificada para gerar centenas de mil leituras com cobertura moderada de células humanas.

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