Journal
/
/
Transkription start webbplats mappning med Super-low ingång Carrier-CAGE
JoVE Journal
Genetics
This content is Free Access.
JoVE Journal Genetics
Transcription Start Site Mapping Using Super-low Input Carrier-CAGE
DOI:

06:59 min

June 26, 2019

, ,

Chapters

  • 00:04Title
  • 01:04Preparation of DNA Templates
  • 01:38Reverse Transcription
  • 02:24Purification of cDNA:RNA Hybrids Using Magnetic Beads
  • 03:42Cap-trapping
  • 05:16Control of Degradation Level and Determination of the Number of PCR Cycles
  • 05:39Results: DNA Quality and Validation of SLIC-CAGE Libraries
  • 06:26Conclusion

Summary

Automatic Translation

Cap analys av Gene Expression (CAGE) är en metod för genombred kvantitativ kart läggning av mRNA 5 ' ändar för att fånga RNA-polymeras II transkription start platser vid en enda-nukleotid upplösning. Detta arbete beskriver en låg-input (SLIC-CAGE) protokoll för generering av högkvalitativa bibliotek med nanogram-mängder av totalt RNA.

Related Videos

Read Article