Journal
/
Genetics
/
Transkription start webbplats mappning med Super-low ingång Carrier-CAGE
JoVE Journal
Genetics
This content is Free Access.
JoVE Journal Genetics
Transcription Start Site Mapping Using Super-low Input Carrier-CAGE
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Transkription start webbplats mappning med Super-low ingång Carrier-CAGE

DOI:
10.3791/59805-v

•

06:59 min

•

June 26, 2019

•

, ,
1Institute of Clinical Sciences, Faculty of Medicine,Imperial College London, 2MRC London Institute of Medical Sciences, 3Sars International Centre for Marine Molecular Biology,University of Bergen

Chapters

  • 00:04Title
  • 01:04Preparation of DNA Templates
  • 01:38Reverse Transcription
  • 02:24Purification of cDNA:RNA Hybrids Using Magnetic Beads
  • 03:42Cap-trapping
  • 05:16Control of Degradation Level and Determination of the Number of PCR Cycles
  • 05:39Results: DNA Quality and Validation of SLIC-CAGE Libraries
  • 06:26Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

Cap analys av Gene Expression (CAGE) är en metod för genombred kvantitativ kart läggning av mRNA 5 ' ändar för att fånga RNA-polymeras II transkription start platser vid en enda-nukleotid upplösning. Detta arbete beskriver en låg-input (SLIC-CAGE) protokoll för generering av högkvalitativa bibliotek med nanogram-mängder av totalt RNA.

Tags

Transcription Start Site MappingSLIC-CAGECarrier-CAGERNA Polymerase IIGene RegulationCore PromoterEnhancer DiscoveryDiagnostic MarkersEmbryonic DevelopmentReverse TranscriptionSPRI Magnetic Beads

Article

Embed

ADD TO PLAYLIST

Usage Statistics

Related Videos

Transkription in vitro analyser och deras tillämpning i Drug Discovery

Kartläggning av RNA-RNA-interaktioner globalt med användning av biotinylerad psoralen

Analys av terminering av transkription Använda BrUTP strängspecifik transkription Run-on (TRO) Approach

Tvåriktad retroviral integrationsplats PCR-metodik och kvantitativ dataanalys arbetsflöde

Retroviral Scanning: Kartläggning av MLV-integrationswebbplatser för att definiera cellspecifika reglerande regioner

Realtidsanalys av transkriptionsfaktor som bindande, transkription, översättning och omsättning under cellulär aktivering med visning av globala händelser

Ultralåga ingående Genome Sequencing bibliotek förberedelse från enda Tardigrade prov

Genome-wide övervakning av transkription fel i eukaryota organismer

Förbättrad jäst en-hybrid skärmar att identifiera transkriptionsfaktor som binder till humant DNA sekvenser

Diskriminering och kartläggning av de primära och bearbetade Transkripterna i Mitokonskbaserade majs med hjälp av en cirkulär RT-PCR-baserad strategi

Read Article