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저하된 FFPE-RNA 시료의 시퀀싱 및 분석을 위한 최적화
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Optimization for Sequencing and Analysis of Degraded FFPE-RNA Samples
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저하된 FFPE-RNA 시료의 시퀀싱 및 분석을 위한 최적화

DOI:
10.3791/61060-v

•

07:30 min

•

June 08, 2020

•

, , , , ,
1NCI CCR Sequencing Facility,Frederick National Laboratory for Cancer Research, 2Advanced Biomedical and Computational Sciences,Frederick National Laboratory for Cancer Research

Chapters

  • 00:04Introduction
  • 01:21RNA Quantity and Quality Assessment
  • 02:03Sequencing
  • 04:01Data Analysis and Quality Assessment
  • 04:33Results: Representative Degraded Formalin-Fixed Paraffin Embedded (FFPE)- RNA Sample Sequencing and Analysis
  • 06:28Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

이 방법은 포르말린 고정 파라핀 임베디드(FFPE) RNA 샘플로부터 얻을 수 있는 서열 데이터의 질 및 양을 개선하는 단계를 설명한다. 우리는 FFPE-RNA 샘플의 품질을 보다 정확하게 평가하고, 시퀀싱 라이브러리를 준비하고, FFPE-RNA 샘플의 데이터를 분석하는 방법론을 설명합니다.

Tags

FFPE-RNARNA QualityRNA DegradationSample QCLibrary PreparationSequencing ProcessRNA FragmentsSequencing ReagentsFlow CellSample LibraryPhiX Control

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