इस प्रोटोकॉल का उद्देश्य सैकड़ों माइक्रोबियल कोशिकाओं पर एएफएम माप को स्वचालित करना है। सबसे पहले, रोगाणुओं को पीडीएमएस स्टांप माइक्रोस्कोप में स्थिर किया जाता है और फिर सैकड़ों स्थिर कोशिकाओं पर स्वचालित रूप से बल स्पेक्ट्रोस्कोपी माप किया जाता है।