Hybrid De Novo Genom Assembly til generering af komplette genomer af urinbakterier ved hjælp af kort- og langlæste sekventeringsteknologier

Denne protokol beskriver en omfattende tilgang til dyrkning, sekventering, og de novo hybrid genom samling af urinbakterier. Det giver en reproducerbar procedure for generering af komplette, cirkulære genomsekvenser, der er nyttige til at studere både kromosomale og ekstrakromosomgene genetiske elementer, der bidrager til urinkolonisering, patogenese og antimikrobiel resistensformidling.