Journal
/
Genetics
/
Indfangning af kromosomkonformation på tværs af længdeskalaer
JoVE Journal
Genetics
This content is Free Access.
JoVE Journal Genetics
Capturing Chromosome Conformation Across Length Scales

Indfangning af kromosomkonformation på tværs af længdeskalaer

DOI:
10.3791/64001-v

•

10:15 min

•

January 20, 2023

•

, , ,
1Department of Systems Biology,University of Massachusetts Medical School, 2Howard Hughes Medical Institute

Chapters

  • 00:04Introduction
  • 00:45Fixation by Crosslinking
  • 03:32Chromosome Conformation Capture
  • 08:22Results: Three‐Dimensional Chromatin Interactions Detection
  • 09:44Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

Hi-C 3.0 er en forbedret Hi-C-protokol, der kombinerer formaldehyd og disuccinimidylglutarat tværbindinger med en cocktail af DpnII- og DdeI-restriktionsenzymer for at øge signal-støj-forholdet og opløsningen af kromatininteraktionsdetektion.

Tags

Chromosome ConformationDNAChromatinCross-linkingRestriction EndonucleasesLigationLibrary PreparationHi-C3C4C5CSequencingGenomeProtocolDSGFormaldehydeGlycineCell CultureCentrifugationFixation

Article

Embed

ADD TO PLAYLIST

Usage Statistics

Related Videos

Forbedret polymerasekædereaktion-restriktionsfragmentlængde-polymorfisme Genotypebestemmelse af toksiske Pufferfish ved væskekromatografi / massespektrometri

Peptid-afledt metode til Transport gener og proteiner Across Cellular og Organellar Barrierer i Planter

Fremskyndet stråling Biodosimetry automatiseret ved Dicentric kromosom identifikation (ADCI) og dosis estimering

Poolet shRNA skærmen for reaktivering af MeCP2 på det inaktive X kromosom

Generation af Genome-wide kromatin kropsbygning Capture biblioteker fra stramt iscenesatte tidlige Drosophila embryoner

Forstærkning af nær fuld længde HIV-1 provirus for næste Generation Sequencing

Høj overførselshastighed identifikation af regulerende gensekvenser ved hjælp af næste generations sekventering af cirkulære kromosom kropsbygning Capture (4C-seq)

En ikke-tilfældig muse model for farmakologisk reaktivering af Mecp2 på inaktiv X-kromosom

Forberedelse af meiotiske kromosomspreads fra zebrafisk spermatocytter

Identifikation af forstærker-promotor kontakter i embryolede organer ved kvantitative kromosom kropsbygning Capture (4C)

Read Article