Journal
/
Genetics
/
Fånga kromosomkonformation över längdskalor
JoVE Journal
Genetics
This content is Free Access.
JoVE Journal Genetics
Capturing Chromosome Conformation Across Length Scales
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Fånga kromosomkonformation över längdskalor

DOI:
10.3791/64001-v

•

10:15 min

•

January 20, 2023

•

, , ,
1Department of Systems Biology,University of Massachusetts Medical School, 2Howard Hughes Medical Institute

Chapters

  • 00:04Introduction
  • 00:45Fixation by Crosslinking
  • 03:32Chromosome Conformation Capture
  • 08:22Results: Three‐Dimensional Chromatin Interactions Detection
  • 09:44Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

Hi-C 3.0 är ett förbättrat Hi-C-protokoll som kombinerar formaldehyd- och disuccinimidylglutarat-tvärbindare med en cocktail av DpnII- och DdeI-restriktionsenzymer för att öka signal-brusförhållandet och upplösningen av kromatininteraktionsdetektering.

Tags

Chromosome ConformationDNAChromatinCross-linkingRestriction EndonucleasesLigationLibrary PreparationHi-C3C4C5CSequencingGenomeProtocolDSGFormaldehydeGlycineCell CultureCentrifugationFixation

Article

Embed

ADD TO PLAYLIST

Usage Statistics

Related Videos

Förbättrad Polymerase Chain Reaction-restriction fragment length polymorphism Genotypning av Toxic Pufferfish genom vätskekromatografi / masspektrometri

Peptid-härledda metod för att transportgener och proteiner över Cellular och organeller hinder i växter

Skyndsam strålning Biodosimetry automatiserade av disentrisk kromosom identifiering (ADCI) och dos uppskattning

Poolade shRNA skärm för reaktivering av MeCP2 på inaktiva X-kromosomen

Generation av Genome-wide kromatin konformation fånga bibliotek från tätt stegvis tidiga Drosophila embryon

Förstärkning av nära fullängds HIV-1 Proviruses för nästa generations sekvensering

Hög genomströmning identifiering av reglerande gensekvenser som använder nästa generations sekvensering av cirkulär kromosom konformation fånga (4C-seq)

En icke-slumpmässig mus modell för farmakologisk Reaktive ring av Mecp2 på inaktiva X-kromosomen

Beredning av meiotiska kromosom sprider sig från Zebrafish Spermatocytes

Identifiering av förstärkare-promotor kontakter i embryoid organ av kvantitativa kromosom konformation Capture (4C)

Read Article