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Articles by Ana Yepes in JoVE

 JoVE Immunology and Infection

Einzel-Zell-Analyse Bacillus subtilis Biofilme mittels Fluoreszenzmikroskopie und Durchflusszytometrie


JoVE 3796 2/15/2012

Institute for Molecular Infection Biology (IMIB), University of Würzburg

Mikrobielle Biofilme sind in der Regel bestehend aus Subpopulationen von spezialisierten Zellen. Einzelzell-Analyse dieser Subpopulationen setzen die Verwendung von fluoreszierenden Reporter. Hier beschreiben wir ein Protokoll zu visualisieren und überwachen mehrere subpopulationswithin

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Allgemeine Überproduktion Von Thermus Enzyme in Streptomyces Lividans

Biotechnologie muss die Fähigkeit der verschiedenen Organismen, Überproduktion der Proteine des Interesses zu niedrigen Kosten zu prüfen. In diesem Beitrag zeigen wir, dass Streptomyces Lividans eine geeignete Host für den Ausdruck von Thermus Thermophilus Gene und Bericht der Überproduktion der entsprechenden Proteine ist. Diese Kapazität wurde nach dem Klonen die Gene, die eine alkalische Phosphatase (ein periplasmatischen Enzym in T. Thermophilus) und entsprechend eine Beta-Glycosidaseinhibitoren (intrazelluläre Enzym) in Escherichia coli und S. Lividans bestätigt. Vergleich der Produktion in beide Hosts ergab, dass der Ausdruck des aktiven Proteins erreicht in S. Lividans wesentlich höher als in E. Coli, insbesondere bei den periplasmatischen Enzym. In der Tat war das native Signal-Peptid von T.-Thermophilus-Phosphatase funktionell in S. Lividans, bei der gleichen Peptidbindung in beiden Organismen, so dass die Überproduktion und Sekretion dieses Proteins auf den S. Lividans Kultur überstand verarbeitet werden. In E. Coli erlaubt die Thermostabilität der exprimierten Proteine einen große Reinigung-Faktor auf thermische Denaturierung und Niederschlag für die Host-Proteine. Wir feststellen, dass S. Lividans sehr effizient und Industrie-freundliche Host für den Ausdruck der thermophile Proteine aus Thermus spp.

Ausdruck Des Gens PstS Von Streptomyces Lividans Wird Durch Die Kohlenstoffquelle Und Teilweise Unabhängig Von Der Regulator PhoP

PST-Dateien ist ein Phosphat-Bindung-Lipoprotein, das Teil des Verkehrssystems hoher Affinität Phosphat ist. Streptomyces Lividans sammelt hohe Mengen des Proteins PST-Dateien in den überstand der flüssigen Kulturen angebaut, in Anwesenheit von verschiedenen Kohlenstoffquellen, wie Fruktose oder Mannose, aber nicht in Anwesenheit von Glukose oder komplexe Basalmedium.

Neuartige Zweikomponenten-Systeme in Der Antibiotischen Produktion in Streptomyces Coelicolor Impliziert

Die Fülle der zwei-Komponenten-Systeme (TCSs) in Streptomyces Coelicolor A3(2) Genom zeigt ihre Bedeutung in der Physiologie von diesem Bodenbakterien. Derzeit mehrere TCSs antibiotische Verordnung verwandt, und der Zweck dieser Studie war die Charakterisierung der fünf TCSs, ausgewählt von Sequenz-Homologie mit den bekannten absA1A2-System, das auch diesen wichtigen Prozess zugeordnet werden konnte. NULL Mutanten von den fünf TCSs wurden erzielt und zwei Mutanten (ΔSCO1744/1745 und ΔSCO4596/4597/4598) zeigten signifikante Unterschiede in der antibiotischen Produktion und morphologischen Differenzierung und als Abr (antibiotische Regler) umbenannt worden. Keine nachweisbaren Änderungen in der antibiotischen Produktion wurden in die Mutanten in den Systemen gefunden, die den ORFs SCO3638/3639, SCO3640/3641 und SCO2165/2166 in den Kultur-Bedingungen geprüft. Das System SCO1744/1745 (AbrA1/A2) negative Regulierung der antibiotischen Produktion beteiligt war, und fungierte auch als einen negativen Regulator der die morphologische Differenzierung. Im Gegensatz dazu hatte das System SCO4596/4597/4598 (AbrC1/C2/C3), bestehend aus zwei Histidin-Kinasen und eine Antwort Spannungsregler, positive Auswirkungen auf die morphologische Entwicklung sowohl antibiotische Produktion. Microarray Analysen der ΔabrC1/C2/C3 und Wildtyp Transcriptomes offenbart bzw. Heraufregulation ActII-ORF4 und CdaR gen, Actinorhodin und Kalzium-abhängige Antibiotika Weg-spezifische Regulierungsbehörden. Diese Resultate zeigten die Einbeziehung dieser neue zwei-Komponenten-Systeme in der antibiotischen Produktion und morphologischen Differenzierung durch unterschiedliche Ansätze. Einer ist einen pleiotropen negativen Regulator: abrA1/A2. Das andere ist ein positiver Regulator bestehend aus drei Elementen, zwei Histidin-Kinasen und eine Antwort-Regler: abrC1/C2/C3.

Streptomyzin-induzierte Expression in Bacillus Subtilis YtnP, Ein Lactonase-Homologen Protein, Das Hemmt Die Produktion Von Entwicklung Und Streptomycin in Streptomyces Griseus

Bacillus Subtilis induziert Ausdruck der Gen-YtnP in Anwesenheit der antimikrobiellen Streptomycin, produziert durch das grampositives Bakterium Streptomyces Griseus. YtnP codiert ein Lactonase-Homologen Protein, das den Signalweg zur Streptomyzin-Produktion und Entwicklung von Antenne Myzel in S. Griseus hemmen kann.

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