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Articles by Birgitte Regenberg in JoVE
JoVE Immunology and Infection
Pseudomonas aeruginosa e biofilm Saccharomyces cerevisiae in celle di flusso
1Department of Systems Biology, Danish Technical University, 2Department of Biology, University of Copenhagen
Protocollo che descrive l'applicazione di un sistema di cella di flusso per la coltivazione e l'analisi biofilm microbici per la microscopia confocale a scansione laser (CLSM).
Other articles by Birgitte Regenberg on PubMed
Riproducibilità Delle Analisi Di Transcriptome Microarray Del Oligonucleotide. Un Confronto Interlaboratorio Utilizzando Chemostato Colture Di Saccharomyces Cerevisiae
Valutazione della riproducibilità dell'analisi di microarray del DNA da insiemi di dati pubblicati è complicata dall'uso di diversi ceppi microbici, tecniche di coltivazione e procedure analitiche. Poiché la riproducibilità intra - e interlaboratorio è altamente pertinenti per l'applicazione dell'analisi di microarray del DNA nel campo della genomica funzionale e ingegneria metabolica, abbiamo progettato una serie di esperimenti di affrontare specificamente la questione. Saccharomyces cerevisiae sec.PK113-7D è stato coltivato in condizioni definite in glucosio-limited chemostati, seguita da analisi del transcriptome con Affymetrix GeneChip Array. In ognuno dei laboratori, tre culture replicare indipendenti sono state coltivate aerobicamente nonché anaerobicamente. Anche se le variazioni introdotte da passaggi di manipolazione in vitro erano piccole e imparziale, maggiore variazione da replicare culture ha sottolineato che, per ottenere informazioni affidabili, replica sperimentale è essenziale. In condizioni aerobiche, 86% della maggior parte dei geni altamente espressi lievito ha mostrato un coefficiente di intralaboratory media di variazione di 0,23. Questo è significativamente inferiore a quello precedentemente segnalato per agitare-pallone-cultura transcriptome analisi e probabilmente riflette il controllo rigoroso delle condizioni di crescita in chemostati. Utilizzando il triplicate set di dati e analisi statistica appropriata, le chiamate di cambiamento da anaerobico contro i confronti aerobici ceduto oltre 95% di accordo tra i laboratori per le trascrizioni che ha cambiato da oltre 2 volte, lasciando solo una piccola frazione di geni che esposto bias di laboratorio.
Transcriptional, Proteomica E Risposte Metaboliche a Litio in Cellule Di Lievito Coltivato Di Galattosio
Il litio è altamente tossico per lievito quando cresciuto nel mezzo di galattosio, principalmente perché Fosfoglucomutasi, un enzima chiave del metabolismo del galattosio, sono inibita. Abbiamo studiato i profili di espressione gene e proteina globali di Saccharomyces cerevisiae coltivate in galattosio in intervalli di tempo diversi dopo l'aggiunta del litio. Questi risultati sono stati collegati alla fisiologici studi dove sono stati determinati metaboliti secrete e intracellulari. Analisi di microarray hanno mostrato che 664 open reading frames sono stati giù-regolato e 725 up-regolate in risposta all'aggiunta del litio. Geni coinvolti nel metabolismo del nucleotide, trascrizione e traduzione sono stati giù-regolato a livello trascrizionale, mentre geni sensibli a reagire alle diverse sollecitazioni così come geni da energia riservano metabolismo e metabolismo monosaccaride erano up-regolati. Confrontati con i dati di proteomic, 26% di down-regolato e il 48% delle proteine up-regolato inoltre sono stati identificati come viene modificato il livello di mRNA. Cluster funzionali ottenuti dai dati proteome erano coincidenti con i cluster di transcriptional. Studi fisiologici hanno mostrato che acetato, glicerolo e glicogeno si accumulano in risposta al litio, che si riflette nei dati dell'espressione, considerando che un cambiamento dal respiro-fermentativa per la crescita delle vie respiratorie non poteva essere predetto dall'analisi di espressione.
Genome-wide Risposta Trascrizionale Di Un Ceppo Di Saccharomyces Cerevisiae Con Un Metabolismo Alterato Redox
La risposta di transcriptional genome-wide di un Saccharomyces cerevisiae ceppo eliminato in GDH1 che codifica un NADP (+)-dipendente glutammato deidrogenasi è stato confrontato con un ceppo selvaggio-tipo in condizioni anaerobiche steady-state. Il ceppo GDH1-eliminato ha un requisito di NADPH significativamente ridotto e di conseguenza, un metabolismo alterato redox. Identificazione di geni con espressione significativamente modificato utilizzando un t-test e la correzione di Bonferroni ha reso solo 16 trascrizioni accettando due falsi positivi e 7 di questi sono stati Open Reading frame (ORF) con funzione sconosciuta. Tra le 16 trascrizioni l'unico con un link diretto al metabolismo redox è stata GND1, codifica Fosfogluconato deidrogenasi. Per estrarre informazioni aggiuntive abbiamo analizzato i dati di trascrizione per un sottoinsieme di gene costituito da tutti i noti geni codificano enzimi metabolici che utilizzano NAD(+) o NADP(+). Il sottoinsieme è stato analizzato per geni con espressione significativamente cambiata nuovamente con un t-test e correzione di test multipli. Questo approccio è stato trovato per arricchire l'analisi dal GND1, ZWF1 e ALD6, che codifica gli enzimi più importanti per la rigenerazione di NADPH in condizioni anaerobiche, giù-sono state regolate insieme a otto altri geni che codificano il NADP (H)-enzimi dipendenti. Questo indica una possibile regolamentazione redox-dipendente comune di questi geni. Inoltre, abbiamo dimostrato che potrebbe essere necessario analizzare l'espressione di un sottoinsieme dei geni per estrarre tutte le informazioni disponibili dall'analisi globale della trascrizione.
Profilatura Trascrizionale Di Amminoacidi Extracellulari Di Rilevamento in Saccharomyces Cerevisiae E Il Ruolo Di Stp1p E Stp2p
S. cerevisiae risponde alla presenza di aminoacidi nell'ambiente attraverso la membrana-limiti complessi SPS, alterando la trascrizione di numerosi geni. Trascrizione globale analisi dimostra che i 46 geni sono indotte da L-citrullina. Sotto le condizioni date sembra essere solo un percorso per induzione con L-citrullina, e questo percorso è completamente dipendente dal componente SPS, Ssy1p e uno dei fattori di trascrizione, Stp1p e Stp2p. Oltre agli effetti sui geni permeasi amminoacido, un ssy1 e un stp1 stp2 mutante presentano un certo numero di altri fenotipi trascrizionali, come la maggiore espressione dei geni soggetti a repressione catabolite azoto e dei geni coinvolti nella risposta allo stress. Un gruppo di geni coinvolti nella parte superiore della glicolisi, compresi quelli codifica esoso trasportatori Hxt4p, Hxt5p, Hxt6p, Hxt7p, Hxk1p esochinasi, gliceraldeide 3-fosfato deidrogenasi Tdh1p e glucochinasi (Glk1p), Mostra livelli di trascrizione aumentata in uno o entrambi dei mutanti. Inoltre, la maggior parte dei geni strutturali coinvolti nella sintesi di trealosio e glicogeno e pochi geni del gliossilato ciclo e pentoso fosfati sono derepressed in ceppi stp2 ssy1 e stp1.
Utilizzo Della Creazione Di Una Serie Di Saggi Biochimici Miniaturizzati a Flusso Laminare
Cappe a flusso laminare in microfluidica chambers è stato utilizzato per costruire densità bassa (uno dimensionale) adatti per matrici miniaturizzati dosaggi biochimici. Variando il rapporto dei flussi di due torrenti guida che fiancheggiano un flusso di campione, messa a fuoco precisa e il posizionamento di quest'ultimo è stato raggiunto, e specie reattive trasportati nel flusso del campione sono stati depositati sulle superfici funzionalizzate chip come discreta 50 microm larghezza corsie. Utilizzando sistemi di modello diverso abbiamo confermato idoneità del metodo per le attività di screening e quantificazione qualitativa in dosaggi del ricevitore-ligand, registrazione biotina-streptavidina interazioni, ibridazione DNA e DNA-triplex formazione. Il sistema è semplice, veloce, riproducibile, flessibile e ha requisiti di piccolo campione.
Grr1p è Richiesto Per Induzione Trascrizionale Dei Geni Permeasi Amminoacido E Corretta Regolazione Trascrizionale Dei Geni Nel Metabolismo Del Carbonio Di Saccharomyces Cerevisiae
La proteina della F-scatola Grr1p è coinvolto nella regolazione del ciclo cellulare, glucosio repressione e induzione trascrizionale del gene dell'amminoacido permeasi (AAP) AGP1. Abbiamo studiato il ruolo di Grr1p nell'induzione dell'amminoacido-mediata dei geni AAP eseguendo colture batch con un ceppo wild-type e un ceppo grr1Delta e aggiunta di citrullina in fase esponenziale. Trascrizione del genoma intero analisi sono state effettuate su campioni di ogni coltura, sia immediatamente prima e 30 min dopo l'aggiunta di citrullina. Induzione trascrizionale dei geni AAP AGP1, BAP2, BAP3, DIP5, GNP1 e TAT1 è completamente dipendente Grr1p. confronto del ceppo grr1Delta con il ceppo di riferimento in assenza di citrullina ha rivelato che GRR1 perturbazione porta ad una aumentata trascrizione di numerosi geni. Queste codificano enzimi nel ciclo dell'acido tricarbossilico, via del pentosio-fosfato e metabolismo del glucosio e di amido. Promotore l'analisi ha mostrato che molti dei geni con trascrizione aumentata per visualizzare siti Mig1p - e/o Msn2p/Msn4p-associazione. Aumentata espressione di geni repressi glucosio nel ceppo di grr1Delta può essere spiegato dall'espressione ridotta di esoso transporter geni HXT1, HXT2, HXT3 e HXT4 e un successivo abbassamento dell'assorbimento del glucosio; e l'effetto di cancellazione GRR1 sul metabolismo generale carbonio può quindi essere indiretta. Infine, nessuno dei geni noti per essere principalmente coinvolto nella regolazione del ciclo cellulare visualizzato livelli diversi di espressione nelle cellule grr1Delta rispetto al ceppo di riferimento, suggerendo che il ruolo di Grr1p nella regolazione del ciclo cellulare non include alcun componente di transcriptional.
Miglioramento Dell'assorbimento Di Galattosio in Saccharomyces Cerevisiae Attraverso La Sovraespressione Della Fosfoglucomutasi: Esempio Di Analisi Di Trascrizione Come Strumento in Inverso Ingegneria Metabolica
Attraverso analisi genome-wide trascrizione di un ceppo di riferimento e due ceppi ricombinanti Saccharomyces cerevisiae con diversi tassi di assorbimento di galattosio, abbiamo ottenuto informazioni circa la risposta di transcriptional globale di ingegneria metabolica dei GAL rete regolamentare gene. Uno dei ceppi ricombinanti overexpressed il gene che codifica per l'attivatore trascrizionale Gal4, e nel ceppo di altri geni che codificano per Gal80, Gal6 e Mig1, sono regolatori negativi del sistema GAL, sono stati eliminati. Anche se i tassi di assorbimento galattosio erano significativamente differenti in tre ceppi, sorprendentemente non abbiamo trovato cambiamenti significativi nell'espressione di geni che codificano per gli enzimi per catalizzare i primi passi del percorso (cioè, i geni che codificano Gal2, Gal1, Gal7 e Gal10). Abbiamo, tuttavia, trovato che PGM2, che codifica l'isoenzima principale della Fosfoglucomutasi, era leggermente regolato in due ceppi ricombinanti con più alti tassi di assorbimento di galattosio. Questo indicato PGM2 è una destinazione per la sovraespressione in termini di aumento del flusso attraverso la via di Leloir, che attraverso la sovraespressione di PGM2 potrebbe essere aumentato il tasso di assorbimento di galattosio del 70% rispetto a quella del ceppo di riferimento. Basato sui nostri risultati, abbiamo concluso che Fosfoglucomutasi gioca un ruolo chiave nel controllare il flusso attraverso la via di Leloir, probabilmente a causa della maggiore conversione di glucosio-1-fosfato in glucosio-6-fosfato. Questa conclusione è stata sostenuta da misurazioni dei fosfati dello zucchero, che ha mostrato che non c'erano aumentate concentrazioni di glucosio-6-fosfato, galattosio-6-fosfato e fruttosio-6-fosfato nel costrutto ceppo con sovraesprimono relativa PGM2.
In Silico Aiutato Ingegneria Metabolica Di Saccharomyces Cerevisiae Per La Produzione Di Bioetanolo Migliorata
In silico modellini in scala del genoma delle cellule sono promettenti strumenti per accelerare la progettazione delle cellule con proprietà migliorate e desiderata. Abbiamo dimostrato questo utilizzando una scala di genoma ricostruite rete metabolica di Saccharomyces cerevisiae di segnare un certo numero di strategie per l'ingegneria metabolica del metabolismo redox che porterà a glicerolo diminuita e aumentata etanolo rendimenti su glucosio in condizioni anaerobiche. Le strategie di best-scored erano predetto completamente eliminare formazione di glicerolo e aumentare la resa di etanolo al 10%. Abbiamo perseguito con successo una delle migliori strategie esprimendo un non-fosforilante, NADP (+)-dipendente gliceraldeide-3-fosfato deidrogenasi, in S. cerevisiae. La tensione risultante aveva una glicerolo inferiore 40% rendimento su glucosio, mentre la resa di etanolo è aumentato con il 3% senza influenzare il tasso di crescita specifico massimo. Allo stesso modo, espressione di GAPN in un ceppo che ospita xilosio reduttasi e xilitolo deidrogenasi ha portato ad un miglioramento nel rendimento di etanolo fino al 25% su miscele di xilosio/glucosio.
Eliminazione Di RTS1, Codifica Per Una Subunità Normativa Della Proteina Fosfatasi 2A, Risultati in Costitutiva Dell'amminoacido Segnalazione Via Maggiore Elaborazione Stp1p
In Saccharomyces cerevisiae, amminoacidi extracellulari sono percepiti alla membrana del plasma dal sensore SPS, costituito l'omologo transporter Ssy1p, Ptr3p ed endoprotease Ssy5p. Amino acid sensing risultati nel troncamento proteolitico dei fattori di trascrizione Stp1p e Stp2p, seguita da loro delocalizzazione dal citoplasma al nucleo, dove attivano la trascrizione dei geni permeasi amminoacido. Abbiamo proiettato una libreria mutante trasposone per segnalazione costitutivamente mutanti, con lo scopo di identificare componenti giù-regolazione del percorso SPS-mediata. Tre mutanti isolati stavano portando una trasposone RTS1 gene, che codifica per una subunità della proteina fosfatasi 2A normativa. Abbiamo indagato l'attività basale dei promotori AGP1 e BAP2 nelle cellule rts1delta e trovato aumento trascrizione da questi promotori, come pure aumentato Stp1p elaborazione, anche in assenza di aminoacidi. Sulla base delle nostre scoperte proponiamo che la fosfatasi complessa contenenti Rts1p mantiene il pathway SPS-mediated down-regolato in assenza di amminoacidi extracellulari da dephosphorylating un componente del percorso.
Globale Transcriptional E Fisiologiche Risposte Di Saccharomyces Cerevisiae Di Limitazione Di L-glutamina, L-alanina O Ammonio
Il lievito Saccharomyces cerevisiae, incontra una serie di fonti di azoto a varie concentrazioni nel suo ambiente. L'impatto di questi due parametri sulla trascrizione e metabolismo è stato studiato dalla crescente S. cerevisiae in Chemostato culture con l-glutamina, l-alanina o l-ammonio nella limitazione e facendo crescere le cellule in un eccesso di ammonio. Cellule coltivate in colture di l-alanina-limited avevano biomassa superiore resa per mole di azoto (19%) rispetto a quelli provenienti da culture di ammonio-limitata. Profili di trascrizione del genoma intero sono stati analizzati con un modello in scala del genoma metabolica che ha suggerito la maggiore attività anabolizzanti nelle cellule l-alanina-limited. I cambiamenti in queste cellule sono stati trovati per essere focalizzata intorno a piruvato, acetil coenzima A, gliossilato e alfa-chetoglutarato attraverso livelli aumentati di ALT1, DAL7, PYC1, GDH2 e ADH5 e diminuzione dei livelli di GDH3, CIT2 e ACS1 trascrizioni. I profili di trascrizione sono stati poi raggruppati. Circa 1.400 trascrizioni hanno mostrato livelli alterati quando cellule coltivate dell'amminoacido sono state confrontate con quelli di ammonio. Un altro 400 geni avevano livelli di trascrizione basso quando ammonio era in eccesso. Sovrarappresentazione dell'elemento GATAAG nel loro promotori suggerisce che la repressione di azoto catabolite (NCR) può essere responsabile di questo regolamento. Novantuno geni avevano livelli di trascrizione sia l-glutamina e ammonio che sono diminuiti rispetto a quelli di l-alanina, indipendente della concentrazione. L'elemento GATAAG in questi geni, suggerisce due gruppi di geni NCR-sensible a reagire, quelli che rispondono ad alti livelli di azoto e quelli che rispondono a livelli inferiori a 30 mamma. In conclusione, i nostri risultati rivelano che la fonte di azoto ha influenza notevole su transcriptome dei lieviti e che modifiche trascrizionali possono essere correlate alla fisiologia tramite un modello metabolico.
Tasso Di Crescita Regolato Geni Hanno Profondo Impatto Sull'interpretazione Del Transcriptome Profilatura in Saccharomyces Cerevisiae
Tasso di crescita è centrale per lo sviluppo delle cellule in tutti gli organismi. Tuttavia, poco è noto circa l'impatto della modifica dei tassi di crescita. Abbiamo utilizzato colture continue per controllare il tasso di crescita e studiato il programma trascrizionale di modello eucariote Saccharomyces cerevisiae, con generazione tempi variabili tra 2 e 35 ore.
Multiscala Clustering Robusto Di Grandi DNA Microarray DataSet Con L'algoritmo Di Consenso
Gerarchico e rilocazione clustering (ad esempio K-means e Self-Organizing maps) sono stati strumenti di successo nella visualizzazione e analisi dei dati di espressione intero genoma DNA microarray. Tuttavia, i risultati del clustering gerarchico sono sensibili ai valori erratici, e la maggior parte dei metodi di trasferimento dare risultati che dipendono l'inizializzazione dell'algoritmo. Pertanto, è difficile valutare l'importanza dei risultati. Abbiamo sviluppato un consenso clustering algorithm, dove il risultato finale è mediato su più piste clustering, dando un clustering robusto e riproducibile, in grado di catturare le variazioni di segnale piccolo. L'algoritmo conserva preziose proprietà di clustering gerarchico, che è utile per la visualizzazione e l'interpretazione dei risultati.
I Ruoli Di Galattitolo, Galattosio-1-fosfato E Fosfoglucomutasi Nella Tossicità Indotta Da Galattosio in Saccharomyces Cerevisiae
L'assorbimento e catabolismo del galattosio dal lievito Saccharomyces cerevisiae è molto inferiore a quello per il glucosio e fruttosio e in applicazioni di questo lievito per l'utilizzo di substrati complessi contenenti galattosio, ad esempio, lignocellulosa e raffinosio, questo provoca fermentazioni prolungate. Galattosio viene metabolizzata attraverso la via di Leloir, e oltre l'interesse industriale nel migliorare il flusso attraverso questo percorso è di pertinenza medica a studiare la via di Leloir. Così, malattie genetiche nei geni che codificano la galattosio-1-fosfato uridylyltransferase o galattochinasi causare tossicità galattosio in pazienti affetti da galattosemia e nel lievito. Al fine di delucidare galattosio relative tossicità, che può spiegare il basso assorbimento e tariffe catabolici di S. cerevisiae, abbiamo studiato le caratteristiche fisiologiche e profili metabolici intracellulari di ricombinanti ceppi di S. cerevisiae con crescita migliorata o alterata il galattosio. Colture batch aerobico su galattosio di ceppi con diverse combinazioni di sovraespressione dei geni GAL1, GAL2, GAL7 e GAL10, che codificano le proteine che insieme convertono extracellulare galattosio in glucosio-1-fosfato, ha rivelato una diminuzione del tasso di crescita specifico massimo rispetto al ceppo di riferimento. L'ipotizzata tossico intermedio galattosio-1-fosfato non può essere l'unica causa del galattosio legata tossicità, ma indicazioni trovate quello galattosio-1-fosfato potrebbe causare un effetto negativo attraverso l'inibizione della Fosfoglucomutasi. Inoltre, mostriamo che galattitolo è formata in S. cerevisiae, e che la combinazione di concentrazione elevata galattitolo intracellulare e il rapporto tra la concentrazione di galattosio-1-fosfato e Fosfoglucomutasi attività sembra essere importante per galattosio correlati causando tossicità sono diminuiti i tassi di crescita.
Adattamento Ai Diversi Ambienti Di Azoto Limitato Dall'elemento Extracromosomico Formazione Del Locus GAP1 O Eliminazione
Per studiare l'evoluzione adattiva in ambienti definiti, abbiamo eseguito esperimenti evoluzione Saccharomyces cerevisiae (lievito) in azoto-limited Chemostato culture. Abbiamo usato i microarrays del DNA per identificare la variazione copia-numero associato con adattamento e osservati frequenti amplificazioni e delezioni presso il locus GAP1. GAP1 codifica la permeasi generale dell'amminoacido, che trasporta aminoacidi attraverso la membrana del plasma. Abbiamo identificato un'auto-moltiplicazione extracromosomico circolare molecola di DNA che deriva dalla ricombinazione intracromosomica tra long terminal repeats (litri) che fiancheggiano GAP1. Cerchi di DNA extracromosomico (GAP1(circle)) contengono GAP1, l'origine di replicazione, ARS1116, e un singolo ibrido LTR derivata dalla ricombinazione tra i due che fiancheggiano LTRs. formazione del GAP1(circle) è associato con eliminazione di GAP1 cromosomiche (gap1Δ) e la produzione di un singolo ibrido LTR presso il locus cromosomico GAP1. Il GAP1(circle) è stato selezionato seguendo la coltura prolungata in chemostati L-glutammina-limitata in maniera analoga alla selezione di oncogeni presenti sul doppi minuti in tumori umani. Cloni che trasportano solo l'allele gap1Δ sono stati selezionati sotto varie limitazioni di azoto non amino acidi tra cui limitazione d'ammonio e urea, Allantoina. Studi precedenti hanno mostrato che il tasso di ricombinazione intracromosomica tra ripetizioni tandem è stimolato dalla trascrizione della sequenza di intervento. L'alto livello di espressione GAP1 chemostati azoto-limitata suggerisce che la frequenza di generazione GAP1(circle) e gap1Δ possa essere aumentata sotto azoto-limitando le condizioni. Noi proponiamo che questa architettura genomica facilita l'evolvibilità delle popolazioni cerevisiae S. esposti a variazioni nei livelli e le fonti di azoto ambientale.
Microscopia Avanzata Delle Cellule Microbiche
Crescente consapevolezza dell'eterogeneità nelle cellule delle popolazioni microbiche ha sottolineato l'importanza di microscopia avanzata per la visualizzazione e la comprensione dei meccanismi molecolari sottostanti alla cella variazione. In questa recensione, Evidenziamo alcuni dei recenti progressi nella microscopia confocal, microscopia ottica Super-risoluzione (STED, SIM, PALM) così come la microscopia a forza atomica e spettroscopia Raman. Utilizzando esempi di bistability in popolazioni microbiche, nonché lo sviluppo di biofilm e differenziazione in consorzi di batteri e lieviti, ci dimostrano l'importanza di microscopia per la visualizzazione di variazione tra le cellule in tratti fenotipici come espressione del gene.
Saccharomyces Cerevisiae - Un Modello Per Scoprire I Meccanismi Molecolari Di Biologia Di Biofilm Di Lievito
I biofilm microbici possono essere definiti come aggregati pluricellulari aderente a una superficie e incorporati in una matrice extracellulare. Il lievito non patogeno, S. cerevisiae, segue i tratti comuni di biofilm microbici con adesione cellula-cellula e cellule della superficie. S. cerevisiae è indicato per produrre una matrice extracellulare, rispondere al quorum sensing e aggregati pluricellulari hanno abbassato la suscettibilità di antimicotici. Adesione è mediata da una famiglia di proteine della superficie cellulare di cui Flo11 ha dimostrato di essere essenziale per lo sviluppo di biofilm. FLO11 espressione è regolata tramite un certo numero di vie regolarici compresa la chinasi di proteina A e un percorso MAPK. Risorse e strumenti genetici avanzati sono state sviluppate per S. cerevisiae, tra cui una collezione di ceppo mutante di delezione in un biofilm formando ceppo sfondo e collezioni della proteina GFP-fusione. Inoltre, S. cerevisiae biofilm è ben applicato per laser confocale scansione microscopia e fluoroforo tagging delle proteine, DNA e RNA. Queste tecniche possono essere utilizzate per scoprire i meccanismi molecolari per lo sviluppo di biofilm, resistenza ai farmaci e per lo studio delle interazioni molecolari, cellulari-risposta a stimoli ambientali, cellula per cellula variazione e nicchie in S. cerevisiae biofilm. Essendo strettamente correlati alla specie Candida, S. cerevisiae è un modello per studiare i biofilm di lieviti patogeni. © 2012 Federation of European Microbiological Societies. Pubblicato da Blackwell Publishing Ltd. Tutti i diritti riservati.
