생 합성 및 SULFOLIPID SULFOQUINOVOSYL DIACYLGLYCEROL의 기능입니다

Annual Review of Plant Physiology and Plant Molecular Biology. Jun, 1998  |  Pubmed ID: 15012227

Sulfolipid sulfoquinovosyl diacylglycerol는 풍부한 유황이 포함 된 nonphosphorous glycerolipid 특별히 연결 된 더 높은 식물, 이끼, 고 사리, 조류, 광합성 박테리아의 가장의 광합성 세포 막 이다. Sulfoquinovosyl diacylglycerol의 구조적 특징은 독특한 머리 그룹 구성 sulfoquinovose, 포도 당 유도체에는 6-히 드 록 된 그룹에 의해 대체 됩니다. UDP-sulfoquinovose에서 diacylglycerol의 sn-3 위치 sulfoquinovosyl moiety 전송 하 여 sulfolipid의 최종 조립에 대 한 성장 하 고 있는 증거는, 아주 작은 UDP sulfoquinovose 선구자의 생 합성에 대 한 알려져 있다. 최근, 다양 한 돌연변이 sulfolipid 생 합성 및 해당 sqd 유전자가 부족 한 다른 유기 체에서 제공 되. 이러한 sulfolipid 생 합성 분자 및 생화학 적인 방법 조합 하 여 분석 하는 새로운 도구를 제공 합니다. 또한, sulfolipid 결핍 돌연변이 분석 광합성 세포 막에서 sulfoquinovosyl diacylglycerol 함수에 새로운 통찰력을 제공 하고있다.

Chloroplasts Arabidopsis Dgd1 돌연변이의 Digalactosyldiacylglycerol 합성

Plant Physiology. Mar, 2002  |  Pubmed ID: 11891245

Galactolipid 생 합성 식물에는 매우 복잡 합니다. 그것은 다른 분자 종을 야 기한 여러 경로 포함. Galactolipid 합성의 다른 노선과 성장과 광합성에 대 한 분자 종의 역할의 기여를 평가 하기 위해 우리는 acyltransferase 돌연변이, act1, fad2 및 fad3 두 desaturase 돌연변이와 digalactosyldiacylglycerol (DGDG) synthase 돌연변이 dgd1의 이중 돌연변이 분석의 유전 접근 시작. 이중 돌연변이 보여준 성장 지체의 다른 학위: act1, dgd1 가장 심각 하 게 영향을 하 고 fad2, dgd1의 증가 약간 감소 반면 fad3, dgd1 식물 했다 dgd1와 매우 비슷합니다. Act1, dgd1, 지질 및 엽록소 콘텐츠 감소 했다 고 광합성 능력에 영향을 했다. 콘텐츠, 지방산 조성 및 위치 유통 성장 결핍 dgd1의 당 se. Chloroplasts galactolipid 조성의 변화에 의해 발생 하지 않습니다 제안 된 galactolipid의 분자 분석 monogalactosyldiacylglycerol, DGDG, 및 트라이-및 tetragalactosyldiacylglycerol 합성이 가능 했다. 따라서, act1, dgd1 및 fad2, dgd1의 감소 성장에서 chloroplasts DGDG synthase 활동의 부재에 의해 설명할 수 없는. DGDG 돌연변이에 누적 되는 인산 부족 중의 분자 분석 그 유사 하 게 dgd1의 잔여 DGDG을 추가 지질이 합성 됩니다 돌연변이, act1, dgd1, fad2, 및 fad3 통로 통해 엽록체 막으로 협회에 제안 했다. 우리의 데이터는 act1 심한 성장 결함 dgd1 발생 진 핵 prokaryotic 통로 통해 엽록체 지질 합성의 감소 대사 플럭스 뿐만 아니라 광합성 단지의 불안에 의해 발생 하는 광합성 능력의 감소에 의해 암시.

종자 식물에 Galactolipids 규칙입니다

Trends in Plant Science. Mar, 2002  |  Pubmed ID: 11906834

엽록체 막 galactolipids monogalactosyldiacylglycerol (MGDG) 및 digalactosyldiacylglycerol (DGDG)의 높은 수준을 포함 합니다. MGDG 및 DGDG, 생 합성 및 galactolipid 불충분 한 Arabidopsis 돌연변이의 식별에 관련 된 유전자의 분리는 크게 galactolipid 생 합성 및 기능 분석을 용이 하 게. Galactolipids 광합성에 직접적인 역할을 제안 하는 광합성 단지의 x-선 구조에서 발견 된다. 또한, galactolipids는 인지질, 인산 부족 후 galactolipid:phospholipid 비율의 증가 의해 제안에 대 한 대체할 수 있습니다. DGDG에는 MGDG의 비율 또한 thylakoid 세포 막의 물리적 단계에 대 한 중요 하 고 통제 될 수 있습니다.

Arabidopsis SQD2 인코딩 Sulfolipid Synthase 중단 인산 염 제한 성장에 장애입니다

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Apr, 2002  |  Pubmed ID: 11960029

Sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol는 종자 식물의 광합성 세포 막의 구조 지질 대량 제공 하는 3 개의 nonphosphorous glycolipids 중 하나입니다. Galactolipids, 달리 sulfolipid 6 deoxy-6-된-포도 당 (sulfoquinovose) 헤드 그룹 때문에 생리 적인 Ph에서 음이온 이다. 이 지질 생 합성은 두 단계로 진행 됩니다: 첫째, UDP-포도 당 및 황산, 및 두 번째에서 UDP-sulfoquinovose의 조립, UDP-sulfoquinovose에서 diacylglycerol sulfoquinovose moiety 전송. 첫 번째 반응은 Arabidopsis SQD1 단백질에 의해 촉매 이다. 여기는 Arabidopsis의 SQD2 유전자의 식별에 설명. 우리는이 유전자 sulfoquinovosyltransferase sulfolipid 생 합성의 두 번째 단계 catalyzing 인코딩합니다 제안 합니다. 대장균에서 SQD1 및 sqd2의 식 공장 sulfolipid 생 합성이이 박테리아의 재구성. Arabidopsis에서이 유전자에 전송 DNA의 삽입 각각 sqd2 돌연변이에 sulfolipid의 부족을 완료 하는 데 주도. 이 돌연변이 인산 염 제한 성장 조건 하에서 감소 성장을 보여 주었다. 결과 그 sulfolipid 음이온 인지질 인산 염 제한 성장 조건 하에서 대체 역할을 할 수 하는 가설을 지원 합니다. Phosphatidylglycerol, 함께 sulfolipid는 아마도 광합성 세포 막의 적절 한 기능에 필요한 부정 청구 지질 물 인터페이스를 유지에 기여 한다.

Arabidopsis의 Pgp1 돌연변이 로커 스 장애인 활동 Phosphatidylglycerolphosphate Synthase를 인코딩합니다

Plant Physiology. Jun, 2002  |  Pubmed ID: 12068104

Phosphatidylglycerol는 또한 식물의 광합성 세포 막에 존재 하는 유비쿼터스 인지질 이다. 증거의 여러 독립적인 줄이이 지질 광합성 세포 막과 차가운 새 환경 순응의 적절 한 기능에 대 한 중요 한 역할을 한다는 것이 좋습니다. 진핵생물에서 다른 subcellular 구획 phosphatidylglycerol의 생 합성에 대 한 능력이 있습니다. 다른 organelles 식물 특정 경로에 사항은 부족 한 것이 있습니다. 여기, 우리는 Arabidopsis pgp1의 phosphatidylglycerol 생 합성 결핍 돌연변이 설명. Phosphatidylglycerol의 전반적인 내용은 30% 감소 됩니다. 이 돌연변이 유전자 염색체 2에 의해 phosphatidylglycerolphosphate synthase (EC 2.7.8.5) isoform의 CDP 알코올 phosphotransferase 모티브에 점 돌연변이 수행 합니다. 돌연변이에서는 80% 감소 plastidic phosphatidylglycerolphosphate synthase 활동 특정 isoform이 plastidic 위치와 일치 합니다. 돌연변이 식물은 옅은 녹색 이며 그들의 광합성 장애. 이 돌연변이 하 생 합성 및 종자 식물 plastidic phosphatidylglycerol의 기능 유망한 새로운 도구를 제공 합니다.

Arabidopsis 씨앗 충전 하는 동안 유전자 발현의 저작 네트워크

The Plant Cell. Jun, 2002  |  Pubmed ID: 12084821

우리가 cDNA microarrays Arabidopsis 종자 개발 하는 동안 유전자 발현의 변화를 조사 하 고 야생 형 및 돌연변이 wrinkled1 비교 사용 (wri1) 씨 오일에서 80% 감소 했습니다. 꽃, 한 기간 이전 및 스토리지 오일과 단백질의 주요 축적을 포함 한 후 5 ~ 13 일, 약 35%의 유전자 배열에 표현 변경 적어도 두 가지, 큰 일부분 (65%) 식에 거의 또는 전혀 변화를 보였다. 누구의 식 변경 가장 유전자 씨앗을 다른 조직 보다 더 표현할 수 있었습니다. 저장소 구성 요소 몇 가지 임시 식 패턴을 보여준의 생 합성 유전자 관련. 예를 들어, 인코딩 코어 지방산 합성 효소 유전자의 수는 개화 후 5 일에서 13 일 사이 식의 종 모양의 패턴 표시. 대조적으로, 저장 단백질, oleosins, 및 기타 알려진 abscisic 산 레 귤 레이트 된 유전자의 표현을 증가 나중 높은 남아. 광합성 단백질에 대 한 유전자 CO(2) refixation와 cofactors 석유 합성에 대 한 공급에 있는 역할을 연루 지방산 합성 단백질의 매우 비슷한 패턴에 따라. 주요 탄소 전송기 및 glycolytic 효소 식 프로필 plastid 대사 cytosolic에서 유동적에서 변화 반영. Wri1 및 야생-타입 씨 간의 대사에 큰 변화에도 불구 하 고 < 유전자의 1%, 2 중 이상으로 달랐다 고 대부분의 중앙 지질 및 탄수화물 대사에 참여 했다. 따라서, 이러한 데이터 정의 부분에 WRI1 유전자의 중단에 대 한 다운스트림 응답.

네이티브 Uridine 5'-diphosphate-sulfoquinovose Synthase, SQD1, 시금치에서 250 KDa 콤플렉스로 정화

Archives of Biochemistry and Biophysics. May, 2003  |  Pubmed ID: 12706349

Sulfoquinovosyldiacylglycerol은 극 지 지질 광합성 세포 막에 존재 합니다. 그것은 막의 네거티브 표면 차지에 기여 하 고 인산 염 스트레스 하에서 중추적인 역할을 한다. SQD1 단백질은 sulfolipid 머리 그룹 전조, uridine 5'-diphosphate (UDP)의 형성에 관련 된 주요 효소-UDP-포도 당 및 황산에서 sulfoquinovose. 시금치 SQD1 단백질 인코딩 cDNA 고립 되었고 대장균에 기능적으로 표현. 재조합 효소 정화 하 고 격리 된 시금치 chloroplasts에서 네이티브 효소에 비해 했다. K(m) 동안 UDP 포도 두 가지 형태에 대 한 구별에 대 한 황산에 대 한 k(m)는 사중 낮은 이상 (< microM) 네이티브 효소에 대 한. 젤 여과 하 여 크기 조정 표시 기본 형태 보다는 homodimer에 대 한 계산 된 크기 만큼 큰 두 번은 약 250 Kda의 대형 복합으로 순화. Vivo에서 SQD1 액세서리 단백질 복합체 형성을 제안 합니다.

Permease 같은 단백질 Arabidopsis의 Thylakoid 지질 이전에 응급실에 관여

The EMBO Journal. May, 2003  |  Pubmed ID: 12743031

진핵생물, 다른 subcellular 구획의 효소 막 지질 조립에 참여. 그 결과, interorganelle 지질 전송은 세포 성장에 광범위 한. 눈에 띄는 예 endoplasmic 그물 (ER)과 식물의 광합성 thylakoid 세포 막 간의 막 지질 선구자 전송입니다. 모노와 digalactolipids는 일반적인 광합성 막 지질. Arabidopsis, 그들은 두 경로 중 하나에서 파생 됩니다, 그리고 합성된 드 노 보에서 plastid, 또는 선구자 고유 분자 종에 기한 응급실에서 가져옵니다. Arabidopsis의 돌연변이 고립, 되었다 자리 chromatograms의 배열 생성 높은-처리량 로봇 심사 절차를 채용 하는 특이 한 trigalactolipids를 축적. 한 유전자 돌연변이 서브, trigalactosyldiacylglycerol1, 기본 결함 응급실 파생 thylakoid 지질의 생 합성은 중지를 발생합니다. Secondarily, oligogalactolipids의 축적으로 이어지는 processive galactosyltransferase 활성화 되었다. Chloroplastic 외피의 permease 같은 단백질에 돌연변이 기본 생 화 학적 결함에 대 한 책임이 있습니다. 이 단백질은 복잡 한 지질 전송 부분을 제안 합니다.

Sulfolipids 2'-O-acyl-sulfoquinovosyldiacylglycerol와 Sulfoquinovosyldiacylglycerol는 결 석 SQD1 삭제 Chlamydomonas Reinhardtii 돌연변이 체에서

Plant Physiology. Oct, 2003  |  Pubmed ID: 14500794

진 핵 광합성 생물의 thylakoid 지질 생 합성에는 종종 효소 endoplasmic 그물 (응급실)와 엽록체 봉투에 포함 됩니다. Thylakoid 지질 생 합성, 응급실 및 plastid 경로 2 경로 Arabidopsis를 포함 하 여 많은 종에서 병렬로 존재 하지만 다른 식물에서 목초 예를 들어, 응급실 통로 활성. 단 세포 조류 Chlamydomonas reinhardtii 모델과 다른 방식에서 Arabidopsis 같은 식물에서 phosphatidylcholine, 그 세포 막에 포함 되어 있지 않습니다 때문에 대부분의 thylakoid 지질 plastid 경로에서 파생 됩니다. 여기, 우리는 sulfolipid, 2'-O-acyl-sulfoquinovosyldiacylglycerol (ASQD), C. reinhardtii에 있는 acylated 파생 한 설명. Sulfoquinovosyldiacylglycerol (SQDG)의 지방산은 포화 대부분은 비록 ASQD 분자 종 주로 불포화 지방산을 운반. 또한, 직접 머리에 연결 된 ASQD 그룹은 우선적으로 18 탄소 4 개의 이중 결합을 가진 지방산. 높은-처리량 로봇 심사 C. reinhardtii, Deltasqd1, SQDG 및 ASQD로 부족 지정의 플라스 미드 중단 돌연변이 체의 분리를 이끌었다. 이 돌연변이 체에서 SQD1 ortholog 완전히 삭제 되 고 플라스 미드 시퀀스로 바뀝니다. 그것은 제안 ASQD sulfolipid 생 합성의 설탕 뉴클레오티드 통로에서 발생 sulfoquinovosyl 머리 그룹의 ' 2-hydroxyl의 acylation. 생리 적 수준에서 돌연변이 증가 감도 diuron 제 초 제를 보여 주며 특히 인산 염 제한 조건 하에서 C. reinhardtii에 의해 실시로 광합성에 SQDG 또는 ASQD에 대 한 역할을 제안 인산 염 제한 아래 성장 감소.

음이온 지질이 엽록체 구조와 Arabidopsis의 함수에 필요 합니다

The Plant Journal : for Cell and Molecular Biology. Dec, 2003  |  Pubmed ID: 14675442

식물의 광합성 세포 막에는 주로 비 인 glycolipids 포함 되어 있습니다. 예외는 phosphatidylglycerol (PG), 산 성/음이온 인지질은. Chloroplasts에 두 번째 주요 음이온 지질은 sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol (SQDG). 그것은 그 심한 인산 염 제한 아래 SQDG PG, 음이온 지질도 불리 한 조건 하에서 일정 비율을 보장에 대 한 대체 가설을 세웠다. 새로 생성된 된 SQDG 및 PG 불충분 한 이중 돌연변이이 가설을 지원합니다. 이 돌연변이, sqd2 pgp1-1, SQDG synthase (SQD2)의 구조 유전자에 T DNA 삽입 및 phosphatidylglycerolphosphate synthase (PGP1)의 구조 유전자의 점 돌연변이 운반합니다. Sqd2 pgp1-1 이중 돌연변이 총 음이온 지질 분수 약 1 / 3, 창백한 노란색 cotyledons 결과 의해 감소 하 고 감소 엽록소 콘텐츠를 남긴다. Photoautotrophic 이중 돌연변이의 성장 심각 하 게 손상 될 및 광합성 능력 장애인입니다. 특히, photosystem II (PSII)의 수준에서 광합성 전자 전송 영향을 받습니다. 이러한 생리 적 변화 외에도 돌연변이 변경 된 잎 구조, mesophyll 세포 수 감소는 chloroplasts ultrastructural 변경 보여 줍니다. Sqd2 pgp1-1 돌연변이 대 한 모든 관측 음이온 thylakoid 지질 콘텐츠의 전체 엽록체 구조와 기능에 대 한 제한 하 고 전반적으로 photoautotrophic 성장과 식물 개발을 위한 중요 결론으로 이어질.

Plastidic Lysophosphatidic 산 Acyltransferase의 손실 Arabidopsis의 배아 치 사 율을 발생합니다

Plant & Cell Physiology. May, 2004  |  Pubmed ID: 15169931

Phosphatidic 산 엽록체 막 지질 생 합성에 대 한 키 중급입니다. 생 드 노 보 phosphatidic 산 합성 식물에 두 단계에서 발생 합니다: 먼저 글리세롤 3 인산 염 주는 sn-1 위치 acylation lysophosphatidic 산; 상승 둘째, 양식 phosphatidic 산 lysophosphatidic 산의 sn-2 위치 acylation. 두 번째 단계는 lysophosphatidic 산 acyltransferase (LPAAT)에 의해 촉매 이다. 여기 우리가이 효소의 plastidic isoform 인코딩 Arabidopsis의 ATS2 유전자의 식별 기술. 온도 민감한 이며 그것의 LPAAT 유전자 Plsc에 돌연변이 운반, E. 콜라가 JC 201로 ATS2 Cdna의 소개 높은 온도에서 거의 야생 타입 성장에이 돌연변이 복원. Ats2는 엽록체에 지역화와 녹색 형광 단백질 퓨전. T DNA 삽입 하 여 Arabidopsis의 ATS2 유전자의 파괴는 배아 치 사 율을 발생합니다. 태아의 개발 ATS2 유전자 발현의 일시적 증가 수 반하는 구형 단계에서 체포 됐다. 분명히, plastidic LPAAT chloroplasts 형성 시작 때 심장 무대는 구형에서 전환 하는 동안 Arabidopsis의 배아 개발을 위해 필수적입니다.

직접 대사 산물 분석 하 여 유전자 돌연변이 검사

Analytical Biochemistry. Sep, 2004  |  Pubmed ID: 15301943

Arabidopsis Interorganelle 지질 인신 매매에 대 한 유전자 모델

Genetic Engineering. 2004  |  Pubmed ID: 15387289

WRINKLED1 AP2/EREB 도메인 단백질을 화합물 생 합성 저장 Arabidopsis의 제어에 관여를 인코딩합니다

The Plant Journal : for Cell and Molecular Biology. Nov, 2004  |  Pubmed ID: 15500472

종자 개발 하는 동안 저장소 화합물의 축적 어린 종묘의 생존을 보장 하 고 영양 인간과 동물의 음식과 피드 형태로 제공 합니다. 상 AP2/EREBP 전사 인자 WRINKLED1 (WRI1) Arabidopsis의 씨앗 저장소 신진 대사 조절에 관여 합니다. 접합 돌연변이 체 대립 유전자, wri1-1, 씨앗 기름 축적의 감소를 발생합니다. 분해 개발 배아 자당 triacylglycerol 생 합성의 전조로 효율적으로 변환할 수 없습니다 렌더링이 돌연변이에 훼손 됐다. 꽃 양배추 모자이크 바이러스 35S 발기인 통제 WRINKLED1 Cdna의 식을 증가 씨앗 오일 콘텐츠를 이끌었다. 또한, WRINKLED1 Cdna의 소성 식 모 종 개발에 triacylglycerols의 축적을 발생 합니다. 이 효과 성장 매체 또는 즉시 포도 당을 물질 대사로 변화 다른 설탕에 포도의 존재에 의존 한다. 오일 축적 모 탈 선 개발 장기 미 발달 상태와 일치 했다.

온도 Acidophilic 레드 Microalga Galdieria Sulphuraria EST 분석 A 지질 생 합성에 대 한 가능성을 보여 하 고 Rhodoplasts에서 탄소 수출 통로 발표 했다

Plant Molecular Biology. May, 2004  |  Pubmed ID: 15604662

Prokaryotes 우리가 extremophiles, 극한 환경에 적응 하는 생물의 생각에 서 마음을 먼저. 그러나, 단 세포 붉은 마이크로 조류 Galdieria sulphuraria (Cyanidiales)는 0-4의 pH 값과 최대 56도 C의 온도와 뜨거운 유황 온천과 같은 극단적인 서식 지에서 바이오 매스의 90%까지 나타낼 수 있는 진핵생물 이 빨간 조류 뿐만 아니라 autotrophically으로 heterotrophically 희귀 설탕 및 설탕 알콜의 수를 포함 하 여 50 개 이상의 서로 다른 탄소 소스에 번성. 이 생물 다양성 제안 몇 가지 미생물 및 생명 공학에 대 한 온도 안정 효소의 잠재적으로 풍부한 소스 rivaled 대사 효소의 큰 레 퍼 토리. 온도는이 유기 체 수행 광합성 광합성 기구에 G. sulphuraria 실제 연구에 대 한 귀중 한 모델을 제작 하는이 프로세스에 대 한 범위의 하이 엔드에 있습니다. 또한,이 살아있는 화석의 유전자 시퀀스 많은 현대 진핵생물의 진화에 대해 공개 했다. 마지막으로, 조류는 카드뮴, 수은, 알루미늄과 bioremediation에서 잠재적인 응용 프로그램을 제안, 니켈 등 독성 금속 이온의 높은 농도 허용. G. sulphuraria의 독특한 생물 탐험 시작 두 다른 cDNA 라이브러리 로부터 태그 5270 표명 했다 시퀀스 시퀀싱 하 고 주석이 되었습니다. 이 유기 체에 변화 통로의 재건에 특히 중점을 배치 되었습니다. 예를 들어, 우리는 (i) 지질 A 생 합성;에 대 한 완전 한 경로 대 한 증거를 제공 (ii) rhodoplasts;에서 triose 인산 염 수출 (iii)과 진 핵 hexokinases의 부재입니다. 시퀀스 데이터 및 자세한 내용은 http://genomics.msu.edu/galdieria에서 사용할 수 있습니다.

Arabidopsis의 포도 당 6 인산 염 Dehydrogenases의 게놈 넓은 분석

The Plant Journal : for Cell and Molecular Biology. Jan, 2005  |  Pubmed ID: 15634201

조명 아래 식물의 녹색 조직에서 광합성 탄소 고정과 질소 동화 같은 reductive 반응에 활용 하는 감소 니코틴아미드 아데닌 디뉴클레오티드 인산 (NADPH)의 기본 소스입니다. 비 광합성 조직 또는 비 광합성 조건 하에서 산화 pentose 인산 염 통로 NADPH의 주요 소스 중 하나로 기본적인 물질 대사에 기여 한다. 첫 번째 고 헌신 반응 포도 당 6 인산 염 dehydrogenase (G6PDH)에 의해 촉매 이다. 우리 특징 Arabidopsis G6PDH 유전자 가족의 여섯 멤버를 보여 줍니다. 대 중 교통 펩 티 드 분석 두 cytosolic 및 4 개의 plastidic isoforms 예측 했다. 5 6 개의 유전자의 활성 G6PDHs 인코딩. 재조합 isoforms 피드백 저해를 기판 요구 사항 및 감도의 차이 보였다. Plastidic isoforms redox 민감 했다입니다. 다른 산화에 의해 비활성화 하는 동안 한 cytosolic isoform redox 변화에 민감 했다. 각 유전자가 mRNA 풍부 통제할 규제 메커니즘을 암시 하는 단백질의 활동 관련 되지 않은 고유한 식 패턴 했다. 2 Cytosolic 고 한 plastidic isoform 사용 zymograms, vivo에서 발견 된 고 각 유전자 T DNA 삽입 행을 사용 하 여 발견 했다. Plastidic isoform 활동 감도 감소 관찰 체 외에 불구 하 고 광합성 조직을 포함 한 모든 조직에서 발견 되었습니다. 게놈 데이터, 유전자 발현, 그리고 vivo에서 효소 활동 데이터는 Arabidopsis의 개별 G6PDH isoforms에 대 한 vivo에서 역할을 제안 체 외 생 화 확 적인 데이터와 통합 했다.

Chlamydomonas Reinhardtii에서 Glycerolipid 생 합성에 관련 된 유전자의 주석: Betaine 지질 Synthase Bta1cr의 발견

Eukaryotic Cell. Feb, 2005  |  Pubmed ID: 15701786

꽃 피는 식물에서 지질 대사 달아 공부 하고있다 하지, 및 컴포넌트의 주요 지방산과 막 지질 생 합성 경로 인코딩 하는 유전자의 정체성에 관한 지식은 매우 광범위 한. 우리는 지금 현재 시내 silico 지방산과 glycerolipid 대사 표현된 시퀀스 태그의 최근 가용성 및 Chlamydomonas reinhardtii의 게놈 시퀀스를 설정한 조류 모델의 분석. 인코딩 단백질 막 속에 관련 된 단백질을 유사성에 근거 하 여 예측 된 유전자 기능을 확인 하 고 Chlamydomonas에 glycerolipid 합성의 주요 통로 재구성 하기 위하여 조직 되었다. 이 분석 근육 막 지질 생 합성 반응에 관련 된 효소를 인코딩하는 데 예측 하는 유전자의 대다수를 차지 하 고 비교 하 고 Chlamydomonas와 꽃 식물에 이러한 경로 대조. 생물 정보학 분석의 중요 한 결과로 서 우리가 식별 하 고 격리 C. reinhardtii BTA1 (BTA1Cr) 유전자 고 인코딩합니다; bifunctional 단백질 분석 우리는 betaine 지질 diacylglyceryl-N, N, N-trimethylhomoserine (DGTS), 주 막의 구성 요소 Chlamydomonas에서의 합성에 대 한 충분 한 것이 단백질을 예측 했다. Bta1cr의 분리 식은 일반적으로이 지질이 부족 하 고 bta1cr의 효소 속성의 생체 외 분석을 허용 하는 대장균, DGTS 축적 이끌어 냈다. 반면, 박테리아 Rhodobacter sphaeroides, BtaARs 및 BtaBRs, 두 개의 별도 단백질은 DGTS의 생 합성에 필요한. Bta1cr의 두 도메인의 활성 사이트의 사이트 감독 mutagenesis를 사용 하면 세균 orthologs BtaARs 및 Btabrs에 그들의 기능적 homology를 직접 시연에 그들의 활동을 개별적으로 연구 수 있었습니다.

비교 유전체학 두 개의 밀접 하 게 관련 된 단 세포 온도 Acidophilic 레드 조류의, Galdieria Sulphuraria 및 Cyanidioschyzon Merolae Galdieria Sulphuraria 신진 대사 유연성 두 조류의 탄수화물 대사에 중요 한 차이의 분자 단위로 보여준다

Plant Physiology. Feb, 2005  |  Pubmed ID: 15710685

단 세포 조류 연구 및 대사 경로, organellar 부문, 셀 운동 성 등 셀 생물 학적 과정의 기능 해 부 및 새로운 유전자와 유전자 기능 식별의 발견에 대 한 모델을 제공합니다. 핵 및 organellar 변환 방법의 설립 및 여러 조류 게놈 시퀀스 및 표현된 시퀀스 태그 모음 최근 완료 조류 모델 시스템을 사용 하 여 기능 유전체학 접근에 대 한 방법을 열었습니다. 단 세포 온도 acidophilic 레드 조류 Galdieria sulphuraria와 같은 때문에 그 특별 한 대사 다양성 유전체학 접근에 대 한 특히 흥미로운 종족을 나타냅니다 heterotrophic 및 50 개 이상의 서로 다른 탄소 소스와 핫 산 성 환경에의 적응에 mixotrophic 성장. 그러나, 게놈 시퀀스에서 알 수 없는 대사 경로에 필요한 유전자의 ab 론 적 예측은 하 찮은. 유전자 식별을 위한 경쟁력 있는 전략은 다른 장점도 관련된 생물의 유전자를 비슷한 크기의 비교. 이 접근을 사용 하 여, 후보 유전자 Galdieria의 대사 다양성에 중요 한 발견 했다. 표현된 시퀀스 태그와 높은 처리량 게놈 시퀀스 읽습니다 취재 &gt; G. sulphuraria 게놈의 70%는 단 세포, 의무 photoautotrophic 레드 조류 Cyanidioschyzon merolae의 게놈을 비교 했다. Galdieria 시퀀스의 30% 이상 Cyanidioschyzon 유전자의 관계 하지 않았다. 이러한 시퀀스의 가까이 검사 막 전송기의 많은 Galdieria에 고유한 탄수화물 대사의 효소 공개 했다. 이러한 데이터를 바탕으로, 그것은 감소 된 탄소 화합물의 글귀에 관여 하는 유전자와 그들의 신진 대사에 관련 된 효소는 G. sulphuraria의 대사 유연성에 중요 한 제안입니다.

밤에 부업 Ferredoxin 종속 산 염 Synthase로 복잡 한 SQD1 형성 하 여 공장 Sulfolipid 생 합성에

Archives of Biochemistry and Biophysics. Apr, 2005  |  Pubmed ID: 15752726

UDP-sulfoquinovose synthase, SQD1, 황산의 UDP-sulfoquinovose, 공장 sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglyerol의 생 합성에 대 한 머리 그룹 기증자는 UDP-포도 당 주는 상승 전송을 catalyzes. 시금치의 네이티브 SQD1 효소를 250 kDa heteroprotein 복잡 한 재조합 SQD1 단백질 자체 보다 기판 황산에 대 한 훨씬 높은 선호도 존재합니다. 9 개의 단백질 co-purified SQD1 단백질입니다. 가능성이 바인딩 파트너 rubisco activase, HSP70, ferredoxin 종속 산 염 synthase (FdGOGAT)를 포함 합니다. 처음 두 단백질 많은 다른 단백질 상호 작용 알려져 있습니다, 160kDa 단백질이 아 체 외에 바인딩할 알려진 FMN 공동 인자를 포함 하기 때문에 Fdgogat의 식별 가장 흥미 했다. 다중 도메인 단백질 Fdgogat의 재조합 형태를 표현 하는 다른 구문을 사용 하 여, FdGOGAT FMN 바인딩 도메인 SQD1 단백질의 특정 바인딩에 필수적입니다 시연 되었다. 모델 FdGOGAT SQD1 하 아 채널 수 나왔다.

BtaA 및 BtaB, 두 효소는 박테리아에 Betaine 지질 생 합성에 대 한 충분 한

Archives of Biochemistry and Biophysics. Sep, 2005  |  Pubmed ID: 16095555

Betaine 지질은 phosphatidylcholine 비 인 glycerolipid 매우 유사 합니다. Diacylglyceryl-N, N, N-trimethylhomoserine Rhodobacter sphaeroides 보라색 박테리아의 인산 염 굶 어 세포와 유전자 접근 이전에 공부 했다 betaine 지질 생 합성이이 과정에 필요한 두 가지 단백질을 식별 합니다. 여기, 우리가 일반적으로이 지질이 부족 하는 대장균에 DGTS 형성에 리드 각 유전자의 co-expression R. sphaeroides에 DGTS 생 합성의 모든 반응 기인 Rsbtaa와 RsBtaB, 하는 보여줍니다. 재조합 RsBtaA 단백질 막에 연결 되었고 S-adenosylmethionine/diacylglycerol 3-아미노-3-carboxypropyl과 활동을 보여주었다. RsBtaA 감독 1-[(14) C]에서 레이블 전송 S adenosylmethionine 또는 [(14) C] diacylglycerol 반응의 기판으로 모두 대사 산물 식별 betaine 지질 전조 diacylglycerylhomoserine에 동등한 속도로. RsBtaA 및 그것의 세균성 orthologs의 비교 분석 유사성에 methyltransferases, AdoMet 바인딩 주머니와 모티브를 공개 하 고 잔류물의 예측 기판 바인딩에 참여 허용.

TGD1 엽록체 봉투 단백질의 변이 Arabidopsis Phosphatidate 대사를 영향을 줍니다

The Plant Cell. Nov, 2005  |  Pubmed ID: 16199613

Phosphatidate (PA) 지질 대사 및 식물을 포함 하 여 많은 진핵생물에서 신호 분자의 중앙 대사 산물 이다. TRIGALACTOSYLDIACYLGLYCEROL1 permease 같은 단백질에 돌연변이 (TGD1) Arabidopsis thaliana triacylglycerols, oligogalactolipids, 실바의 축적 발생 엽록체 지질 지질은 엽록체와 응급실 파생 전조에서 thylakoid 지질 생 합성 장애에 endoplasmic 그물 (응급실)에서 인신 매매의 장애와 일치의 지방산 조성 변경 했다. Tgd1에 의해 중재 과정 태아 낙태의 높은 발생률을 발생 하는 단백질의 돌연변이 서 필수적인 것 같습니다. 격리 된 tgd1 돌연변이 chloroplasts galactolipids PA 통합할 감소 능력을 보여주었다. TGD1 단백질과 내부 엽록체 봉투에 지역화는 지질 전송의 요소가 될 것으로 보인다. TGD1 함수의 부분 중단 중앙 지질 물질 대사에 격렬 한 결과으로 tgd1 돌연변이 지질 항상성와 지질 식물에서 인신 매매 규제 메커니즘을 탐구 도구를 제공 합니다.

Galactoglycerolipid 생 합성에 대 한 세 가지 효소 시스템 Coordinately 식물에서 통제 된다

The Journal of Biological Chemistry. Jan, 2005  |  Pubmed ID: 15590685

Galactose 바인딩되어 O glycosidic 연계의 글리세롤 sn-3 위치에 diacylglycerol, Galactoglycerolipids는 풍부한 식물과 광합성 박테리아, 광합성 세포 막의 극 지 지질의 대부분을 구성 하는 어디에. Galactoglycerolipid 생 합성 식물에는 대단히 endoplasmic 그물 그리고 2 개의 엽록체 봉투에서 효소와 관련 된 들 에게만. 이 독특한 조직 지질 유도체의 광범위 한 인신 매매 필요 합니다. 그것은 지금 점점 더 모델 식물 Arabidopsis galactoglycerolipid 생 합성의 지질 galactosyltransferases의 3 가지 세트는 명백한입니다. 두 효소, MGD1 및 DGD1, 일반적으로 galactoglycerolipids는 엽록체와 광합성 조직을 대량 제공. 인산 염 제한 성장 조건 하에서 그리고 비 광합성에 조직 MGD2/3, dgd2는 매우 활동적이 다. 또한,이 두 번째 통로 제작한 galactoglycerolipids 종종 extraplastidic 세포 막에서 발견 된다. 이러한 galactosyltransferases galactose 기증자 UDP Gal 사용, 하지만 세 번째 통로 galactose 한 galactolipid 전송 processive 효소를 포함 한다.

비 기공을 고 기공을 지질 관련 Plastids 인신 매매

Current Opinion in Plant Biology. Jun, 2006  |  Pubmed ID: 16603410

식물에서 새로 합성 된 지방산은 중 직접는 plastid의 glycerolipids에 통합 또는 내보내고 endoplasmic 그물 (응급실)에서 지질에 조립. 응급실에서 파생 된 glycerolipids extraplastidic 세포 막의 구성 요소 역할. 또는 그들은 그들의 diacylglycerol 백본 광합성 세포 막에서 thylakoids의 glycerolipids에 통합 되어는 plastid를 반환할 수 있습니다. Thylakoid 지질 plastid 봉투 막에 조립 하 고는 thylakoids에 게 전송 됩니다. 인산 염 제한 성장 조건 하에서 galactolipids extraplastidic 세포 막 외부 plastid 봉투 세포 막에서 내보냅니다. TRIGALACTOSYLDIACYLGLYCEROL1 같은 단백질 (TGD1) 또는 기 유도 단백질에 PLASTIDS1 (VIPP1)는 plastid 지질 인신 매매 현상의 다른 측면에 관련 된 최근 확인 된 및 이러한 구성 요소 분석에 기초한 기계 론 적인 모델 등장 하기 시작 했습니다.

Wri1는 종자 발 아 및 종묘 설립 필요 합니다

Plant Physiology. Jun, 2006  |  Pubmed ID: 16632590

종자 개발 하는 동안 저장소 복합 축적 생존을 위한 식물의 다음 세대를 준비합니다. 프로세스 규정 및 종자 개발 곰 관련성 발 아 및 종묘 설립을 하는 동안 스토리지 복합 축적의 합성에 관여 하는 따라서. Wrinkled1 (wri1) 돌연변이 Arabidopsis (Arabidopsis thaliana)의 씨앗 오일 축적에 장애. WRI1 유전자 개발 씨앗에 특히 해당 분해 대사의 제어에 관여 하는 APETALA2/에틸렌 반응 요소 바인딩 단백질 전사 요소를 인코딩합니다. 여기 우리가 비교 wri1 1 돌연변이 유전자 변형 라인 wri1 1 돌연변이 배경 및 야생 타입 WRI1 야생-타입 Cdna를 표현 하 여 종자 발 아 및 종묘 설립에이 규제 요인의 역할을 조사 합니다. 식물 WRI1 유전자의 표현에 변경 다른 발 아 응답 증가율 abscisic 산 (ABA), 설탕, 및 매체에서 제공 하는 지방산을 보였다. 발 아의 돌연변이 ABA, 설탕, 및 osmolites, 유전자 변형 라인에 있는 증가 WRI1 식으로 완화 하는 효과에 더 민감한. ABA 반응 유전자 AtEM6 및 ABA 구분 3 식 (ABI3) wri1-1 돌연변이에 증가 했다. Abi3-3 wri1-1 사이의 이중 돌연변이 분석 제안 WRI1 및 ABI3, 종자의 ABA 응답 중재 한 전사 요소 행동에 병렬 경로. 2 Deoxyglucose의 종자 발 아 저해 했지만 너무 덜 라인 WRI1 overexpressing. 종묘 설립 wri1 1 돌연변이에 감소 했다 하지만 자당에 의해 완화 될 수 있습니다. 발 아에는 가능한 신호 역할 외에도 중간에 설탕 빌딩 블록 및 에너지 공급 중 wri1-1 모 종 설립 필요 했다.

Phosphatidylglycerol 생 합성 Chloroplasts Arabidopsis 돌연변이 Acyl ACP 글리세롤 3 인산 염 Acyltransferase 부족의

The Plant Journal : for Cell and Molecular Biology. Jul, 2006  |  Pubmed ID: 16774646

Phosphatidylglycerol 생 합성 모든 유기 체에서 지질 물질 대사에 있는 중앙 통로 나타냅니다. 효소는 plastid의 통로의 첫 반응은 catalyzing 글리세롤 3 인산 염 acyl acyl 캐리어 단백질 acyltransferase Arabidopsis ATS1 로커 스에서에서 인코딩할 수 생각 이다. 다양 한 유전자 돌연변이이 활동에서 부족 한 설명 되었습니다. 그러나, 해당 돌연변이 대립 아직 분자 수준에서 분석 되지가지고 돌연변이 고기 및 ATS1 로커 스에서 부족 간의 인과 관계가 설립 되지 않았습니다. 야생-타입 양의 phosphatidylglycerol 근처의 모든 알려진된 ats1 돌연변이의 존재는 plastid에서 phosphatidylglycerol 어셈블리의 대체 통로 존재 여부의 질문을 제기. 그러나, 여러 독립 ats1 돌연변이 체 대립의 상세한 분석 모두 새는 밝혔다. Ats1-1 ats1-1 돌연변이 배경에서 RNA 레벨의 Rnai에 의해 감소 (작은 녹색 식물 및 감소 된 씨앗 세트) 더 심한 성장 형 아니라 phosphatidylglycerol의 상대적인 양을 감소 하지 않았다. 반면, 인코딩 통로의 두 번째 반응은 catalyzing plastidic lysophosphatidic 산 acyltransferase ATS2 Mrna의 양을 ats1 1 돌연변이 백그라운드로 Rnai에 의해 감소 했다, phosphatidylglycerol 금액 감소, pgp1-1 돌연변이 plastidic phosphatidylglycerol 생 합성의 후반 단계에서 결핍의 연상 되는 성장 형 (작은 창백한 황색 식물)로 이어지는. 이러한 관측 plastid 지질 대사 및 플랜트 개발의 조정된 규칙을 나타냅니다.

지질 인신 매매에 관련 된 엽록체 내부 봉투 막의 Phosphatidic 산 바인딩 단백질

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Jul, 2006  |  Pubmed ID: 16818883

식물 chloroplasts 내부 광합성 thylakoid 세포 막 속 plastid 봉투 그리고 endoplasmic 그물 (응급실)에서 효소가 필요합니다. 광범위 한 지질 밀매 thylakoid 지질 생 합성에 필요 하다. 여기에는 trigalactosyldiacylglycerol2 (tgd2) 돌연변이 Arabidopsis의 설명. 테스트 범위 내 tgd2 복합 지질 형을 앞에서 설명한 tgd1 돌연변이 동일 했다. Oligogalactolipids 및 triacylglycerols의 탈 선 축적과 응급실에서 파생 된 galactolipids의 분자 종의 감소는 plastid에 응급실에서 파생 된 지질 가져오기 중단와 일치 하는. TGD1 단백질의 엽록체 내부 봉투 막에 있는 ABC transporter permease 같은 구성 요소입니다. TGD2 유전자 예측된 mycobacterial 셀 항목 도메인 phosphatidic 산 바인딩 단백질을 인코딩합니다. 그것은 내부 엽록체 봉투 막 외피 막에 직면에 닿는 곳에. 추정된 세균 orthologs TGD1 및 TGD2 그람 음성 박테리아에의 일반적으로 일반적인 생물 학적 과정에 참여를 제안 하는 transcriptional 단위로 구성 됩니다. 식 tgd2-1 돌연변이 Cdna의 tgd2 돌연변이 형 복제 지배적인 부정적인 효과 발생 합니다. 이 결과 복잡 한 기본 단백질의 돌연변이 단백질의 간섭으로 해석 됩니다. 그것은 제안 TGD2 엽록체 내부 봉투 막에서 복잡 한 지질 산 phosphatidic/전송에 대 한 기판 바인딩 또는 규제 구성 요소를 나타냅니다.

Sulfolipid 생 합성에 남아 있는 질문: 역사적 관점

Photosynthesis Research. May, 2007  |  Pubmed ID: 17334828

공장 sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol는 1950 년대 후반에 A.A. 벤슨에 의해 발견 되었다. (35)과 같은 생물 학적 기판 포함 하는 방사성의 증가 가용성 S 황산 소설 생물 학적 화합물을 발견 하 고 그들의 생 합성 경로 밖으로 스케치 하는 수단을 제공. 이 시간 그것의 6-deoxy-6-sulfo-alpha-d와 sulfolipid의 구조:-포도 당 (sulfoquinovose) headgroup 결정 했다. 즉시,이 특이 한 생물 술 폰 산의 기원은 신비 과학 커뮤니티와의 생 합성에 대 한 여러 가지 제안을 개발 하 고 테스트 했다. Sulfolipid 생 합성의 뉴클레오티드 통로 대 한 강력한 지원 증거는 1990 년대 동안 sulfolipid 생 합성 효소를 인코딩 세균 및 식물 유전자의 발견과 함께 가능 하 게 되었다. 이 후자의 작업과 A.A. 벤슨 누워 토대를 기반으로 하는 sulfolipid 생 합성에 대 한 초기 가설을 확인 했다. Sulfolipid 생 합성에 대 한 메커니즘을 정의 하 고 나머지 sulfolipid 생화학에서 문제에 터 닝 포인트의 약식된 요약 제공 됩니다.

Heteromeric Plastidic Pyruvate 니 복잡 한 Arabidopsis의 씨앗 오일 생 합성에 관여

The Plant Cell. Jun, 2007  |  Pubmed ID: 17557808

분해 Arabidopsis thaliana 및 오일 작물의 종자 개발에 있는 기름의 생산을 위해 필수적인 것으로 생각 하는 유비 쿼터 스 통로 이다. Compartmentation 배아 개발 기본 물질 대사의이 가설을 테스트 하 고 시드 바이오 매스 생산 엔지니어링에 대 한 중대 한 도전 포즈. 또한 태아에서 씨 기름에 가져온된 photosynthate에서 탄소 기본 경로 인지 질문을 제기. Plastidic pyruvate 니 분해의 높은 규제 ATP 생산 반응 catalyzes. Arabidopsis 게놈의 pyruvate kinases 14 putative isoforms를 인코딩합니다. 3 유전자 인코딩 subunits 알파, beta(1), 및 plastidic pyruvate 니 beta(2). 가능성이 종자 개발에 널리 퍼진 plastid 효소 4alpha4beta(1)의 소 단위 구성을 하 고 pH 8.0에서 가장 활성화 되어 Glu에 의해 저해. Beta(1) 소 단위를 인코딩 하는 유전자의 중단 씨앗 기름 내용에 plastidic pyruvate 키 니 아 제 활동 및 60% 감소 감소를 발생 합니다. 시드 오일 형 beta(1) 소 단위 인코딩 Cdna의 표현 및 beta(2) 소 단위 인코딩 Cdna에 의해 부분적으로 완벽 하 게 복원. 따라서 확인 된 pyruvate 니 catalyzes 오일, 지방산의 기판 phosphoenolpyruvate에서 기본 plastid 경로 제안으로 photosynthate의 변환에 중요 한 단계.

Digalactosyldiacylglycerol는 Synechocystis Sp. PCC6803 인산 염 제한 아래 광합성 성장 더 필요 합니다

Plant & Cell Physiology. Nov, 2007  |  Pubmed ID: 17932115

Digalactosyldiacylglycerol (DGDG) oxygenic 광합성 생물의 일반적인 막 지질 이다. DGDG synthase 유전자 식물 로부터 격리 되어, 비록 아무 동종 유전자 남조류와 단 세포 레드 조류 Cyanidioschyzon merolae의 유전자에 주석이 달린 있다. 여기 비교 유전체학 접근 사용 sp. Synechocystis pcc6803에서에서 식물 타입 DGDG synthase 유전자 (지정 된 dgdA)를 확인 합니다. 효소는 대장균에 DGDG을 생산 할 때 오이 monogalactosyldiacylglycerol synthase와 co-expressed. DeltadgdA 노크 아웃 돌연변이 DGDG BG11 중간에 성장 될 때 나타내는 DGDG는 최적의 조건에서 불가결의 이외의 아무 명백한 표현 형을 보였다. 그러나, 돌연변이 DGDG 등 남조류의 자연 틈새에서 인산 염 제한 조건 하에서 해야 할 수 있습니다 제안 하는 인산 염 제한 조건 하에서 감소 성장을 보여 주었다.

Arabidopsis, 엽록체 지질 가져오기에 관련 된 Tgd3의 작은 ATPase 단백질

The Journal of Biological Chemistry. Dec, 2007  |  Pubmed ID: 17938172

극 지 지질 인신 매매 하는 것은 필수 진 핵 세포에서 세포 막 지질 어셈블리의 최종 목적지는 세포 막 다를 경우가 많습니다. 눈에 띄는 예는에 식물의 plastids 광합성 세포 막 (thylakoids)의 속. Endoplasmic 그물 및 내부 및 외부 plastid 봉투 세포 막 지질 생 합성 효소 관련 됩니다. 이 보험회사는 광범위 한 지질 인신 매매를 요구 한다. Arabidopsis의 돌연변이 사용할 수 있는 endoplasmic 그물 파생 된 지질 전조 없이 thylakoid 지질에 중단 됩니다. 두 이러한 돌연변이 trigalactosyldiacylglycerol 1 (TGD1)의 영향을 받는 두 가지 단백질 및 인코딩 permease 및 기판 바인딩 구성 요소 각각의 내부 엽록체 봉투 막에서 제안 된 지질 translocator TGD2. 여기 우리가 Arabidopsis, tgd3의 세 번째 단백질, 작은 Atpase이이 translocator의 일부가 될 것을 제안 합니다. Tgd1 및 tgd2 돌연변이 같이 triacylglycerols 및 trigalactolipids T DNA 삽입을 들고 tgd3 돌연변이의 축적 단지 5'는 tgd3의 지역 코딩. TGD3 단백질과 기저 ATPase 활동을 보여주는 내부 엽록체 봉투 막 넘어 엽록체 안에 지역화 됩니다. 단백질 orthologous TGD1,-2을-3 그램 박테리아에 있을 것으로 예상 된다 그리고 해당 유전자는 유전자 제품에 대 한 일반적인 생 화 확 적인 역할을 제안 하는 operons 구성 되어 있습니다. 현재 분석을 바탕으로, 그것 TGD3 TGD1 관련 된 지질 전송의 누락 ATPase 구성 요소 이며 TGD2 Arabidopsis의 응급실 파생 thylakoid 지질 생 합성에 필요한 가설입니다.

Arabidopsis 묘 Plastidic Pyruvate 키 니 아 제 결핍 씨앗 발 아와 설립에 대 한 저장소 화합물을 활용 하지 못하는.입니다

Plant Physiology. Dec, 2007  |  Pubmed ID: 17965177

스토리지의 풀어 보유 하 고 성장에 필요한 대사 산물의 생 합성 씨앗 발 아 및 설립을 위해 필수적입니다. Arabidopsis (Arabidopsis thaliana) 돌연변이 (pkp1) plastidic pyruvate 니 부족 한 설명은 (PK(p)) 및 야생 타입 쇼 지연된 발 아 및 종묘 설립 exogenous 설탕 공급에 의존으로 동일한 정도로 석유 저장소 축적 수 없습니다. 그러나 그것은, 마치이 고기 씨 오일의 부족으로 특히 완전히 발생 하지 씨를 출 아에 감소 된 PK(p) 활동에 관련이 있을 수 있습니다 나타납니다. 매체 추가에 자당 농도 증가 씨앗에 있는 수용 성 당 분의 축적으로 인해 pkp1의 발 아를 억제 한다. Pkp1 germinating 씨앗 저장소 석유를 대사 하지 못하는 고 어둠 속에서 hypocotyl 연신 율에 대 한 적용 된 자당을 활용할 수 없습니다. 또한, pkp1 적은 토 코 페 롤과 야생 타입 보다 엽록소를 포함. 함께 찍은 결과 모델 pk(p)는 다른 근육 통로 위한 선구자로 설탕의 효율적인 변환을 위한 필요와 일치 합니다.

Cytosolic 포도 당 6 인산 염 Dehydrogenases와 Arabidopsis의 씨앗 오일 축적에 자신의 기여의 기능 분석

Plant Physiology. Jan, 2008  |  Pubmed ID: 17993547

포도 당 6 인산 염 dehydrogenase (G6PDH) 생 화 학적 반응에 대 한 감소 된 니코틴 아 미드 cofactors 공급에서 하 고 세포의 redox 스테이트 변조에 연루 되어 있다. 식물, 그것의 역할의 신분은 cytosol plastids에서 여러 isoforms의 존재로 인해 복잡 하다. 여기 우리가 Arabidopsis (Arabidopsis thaliana)의 두 cytosolic G6PDHs 중단 하는 단일 및 이중 돌연변이 사용 하 여 cytosol에서 g6pdhs에 초점을. G6PDH isoform만 이중 돌연변이에 남아 고 chloroplasts, cytosolic G6PDH 활동의 감소와 일치에 존재 했다. G6PD5 및 G6PD6 cytosolic isoforms 활동 된다 그들의 각각 사본 레벨의 증가 함께 단일 돌연변이 증가 했다. 우리 가상 G6PDH NADPH 광합성 조명 제한 될 수 있습니다 종자 개발에 누적 된 석유에 대 한 공급에 있는 역할을 한다. 씨앗에서 활동 G6PDH G6PD6 및 G6PDH plastid isoform에서 파생 된 고 비슷한 기름 축적으로 임시 활동 패턴. 씨앗의 이중 돌연변이 아니지만 단일 돌연변이의 높은 기름 콘텐츠 졌고 질소 비율 또는 지방산 조성으로 탄소에 없는 변경 된 야생 형식에 비해 증가 한 중량. 총 G6PDH 활동에 있는 감소는 이중 돌연변이 관찰 됩니다. 이 결과 손실 cytosolic G6PDH 활동의 종자를 개발 하는 지방산 합성 NADPH 공급 감소 하는 대신 스토리지 화합물의 합성에 대 한 증가 하 고 탄소 기판의 물질 대사에 영향을 미치는 것이 좋습니다.

미토 콘 드리 아 바깥 막 단백질의 돌연변이 엽록체 지질 생 합성을 영향을 줍니다

The Plant Journal : for Cell and Molecular Biology. Apr, 2008  |  Pubmed ID: 18208519

식물 세포에 지질 생 합성 다양 한 organelles 연결 되며 세포 지질 항상성 유지 민첩 규제와 조정 필요. 식물에 인산 염 제한 등 환경 단서 비 인 glycolipids 여 인지질을 대신 지질 생 합성 기계의 재조정 필요. Galactoglycerolipids 식물에서 우세의 생 합성을 제정 하 고 인산 부족에 대 한 응답에서으로 유도 될 것으로 알려진 대체 통로 의해 진행 됩니다. 두 경로에 관련 된 식물 지질 galactosyltransferases plastid 봉투 막 연결 되며 핵 유전자에 의해 인코딩됩니다. 대체 galactoglycerolipid 통로의 활동을 관리 하는 메커니즘을 식별 하기 위해 유전 억압 화면 Arabidopsis의 불충분 한 digalactolipid dgd1 돌연변이의 배경에서 실시 했다. 부분적으로 복원 dgd1 배경에서 digalactoglycerolipid 콘텐츠 억압 선 미정 DGD1 억압 1 (DGS1) 지정 하는 미토 콘 드리 아 단백질에 점 돌연변이 운반 합니다. 추정이 단백질의 orthologs는 식물, 조류, 곰 팡이, 있지만 분자의 기능은 아직 알려져 있지 않습니다. Dgd1 dgs1 이중 돌연변이에 효소 대체 galactoglycerolipid 통로의 인코딩 핵 유전자의 표정을 증가 하 고 과산화 수소 레벨 상승. 과산화 수소에 있는이 증가 dgd1 dgs1 이중 돌연변이에서 대체 경로의 활성화에 대 한 이유를 제안 합니다. 이 따라, 과산화 수소 및 치료 또한 반응성 산소 생산 야생-타입에서 대체 통로 활성화. 이러한 결과 가능성이 내포 식물에서 대체 galactoglycerolipid 통로의 규정에서 반응성 산소 생산.

경로 및 세포질 프로세스에 걸쳐 새 연결: 산업화 돌연변이 검사 밝혀 Arabidopsis 다양 한 고기 사이 소설 협회

Plant Physiology. Apr, 2008  |  Pubmed ID: 18263779

접근을 차단 하는 전통적인 돌연변이, 유전자 변형 하나 또는 소수의 한 고기에 대 한 테스트. 타고 난 변종을 확인 후 그들은 일반적으로 보조 phenotypic 스크린의 제한 된 수를 받게 됩니다. 이 이렇게는 특정 생물 학적 프로세스에 관련 된 유전자를 찾는 우수, 다양 하 고 체계적인 표현 형의 심문의 부족 광범위 한 증후군 및 유전자와 고기 사이 연결을 감지 하는 능력을 제한 합니다. 그것은 또한 돌연변이의 주 형의 검출을 방해할 수 있습니다. Plastid 기능을 이해 하는 시스템 생물학 접근의 일환으로, Arabidopsis thaliana homozygous T DNA 라인의 많은 수는 분석 병렬 형태, 생리, 및 화학 phenotypic 실험 (www.plastid.msu.edu)와 함께 상영 되고있다. 우리의 접근 방식을 수정 하 고 약 이해 유전자 기능 및 기능적 네트워크가 높은 처리량 검열 방법 사용의 유효성을 검사 하려면 100 야생-타입 식물 그리고 다양 한 고기를 나타내는 13 알려진된 돌연변이 분석 실험 대사 산물 프로 파일링, 형태소 분석, 엽록소 형광 반응 속도 론 등의 광범위 한 범위에 의해 분석 되었다. 다양 한 통계적 접근법을 사용 하 여 데이터 분석 같은 산업 접근 안정적으로 공장 돌연변이 고기를 식별할 수 있습니다 보였다. 더 크게, 연구는 이러한 well-characterized 돌연변이이 이렇게 접근을 차단 하는 전통적인 돌연변이 강력한 이점이 있다 보여주는 서로 다른 생리 적 프로세스 사이 예기치 않은 연결에 대 한 이전에 보고 되지 않은 고기를 발견. 야생-타입 식물 분석 공개 직접 생 합성 기원을 공유 하는 알 수 없는 대사 산물을 포함 하 여 통계적으로 강력한 phenotypic 상관 관계의 수백이 대사 경로 보다 더 가까운 관계가 가능성 제기 일반적으로 의심 됩니다.

지질 엽록체 속에서 인신 매매에 대 한 역할입니다

Progress in Lipid Research. Sep, 2008  |  Pubmed ID: 18440317

Chloroplasts 정의 공장 트는 광합성을 수행 됩니다. 광합성 단지 thylakoid 멤브레인 막 lamellae 및 cisternae의 복잡 한 시스템을 형성 하는에 포함 됩니다. 엽록체 경계 metabolites는 plastid 셀의 extraplastidic 구획 사이 교환을 제어 하는 두 봉투 세포 막으로 이루어져 있습니다. Plastid 내부 매트릭스 (기질)는 지방산 생 합성 식물에 대 한 기본 위치입니다. 지방산 plastids 봉투 막에서 glycerolipids로 조립 될 수 있다 또는 그들은 내보낼 수 있고 endoplasmic 그물 (응급실) extraplastidic 세포 막에 대 한 구성 요소를 제공 하기에 지질에 조립. 일부는 응급실에서 조립 하는이 glycerolipids를 plastid plastid 전형적인 glycerolipids로 개조 되는 어디 돌아갑니다. 이 다른 subcellular 멤브레인 시스템이 협력 결과로 지질 인신 매매 현상의 풍부한 보완 chloroplasts 속에 기여 한다. 상당한 진전이 plastid 봉투에 걸쳐 지질 전송의 더 나은 기계 론의 이해를 향해 최근 몇 년 동안 만들어왔다. 박테리아와 식물의 지질 전송기는 발견 하 고 그들의 연구 지질 밀매 현상을 엽록체 속에 관련 된 자세한 기계 통찰력을 제공 하기 시작 합니다.

생체 재료에 대 한 바이오 연료 식물 바이오 매스를 활용 합니다

The Plant Journal : for Cell and Molecular Biology. May, 2008  |  Pubmed ID: 18476860

바이오 연료의 생산에 대 한 Feedstocks로 공장 Triacylglycerols

The Plant Journal : for Cell and Molecular Biology. May, 2008  |  Pubmed ID: 18476866

Triacylglycerols 식물에 의해 생산 되는 자연에서 탄소 감소의 가장 에너지 풍부 하 고 풍부한 형태 중 하나입니다. 그들의 화학적 유사성을 감안할 때, 식물 오일 아닌 재생 가능 에너지 소스, 기존 디젤에 대 한 논리적 대체를 나타냅니다. 그러나, 식물 오일은 현대 디젤 엔진에 사용 하기 위해 너무 점성, 지방산 에스테 르에 변환 됩니다. 결과 연료 일반적으로 바이오 디젤, 라고 하며 기존 디젤에 비해 많은 이점이 있습니다. 이 중 최고는 바이오 디젤은 재생 가능한 소스 로부터 파생 된. 또한, 적은 온실 가스 배출에서 바이오 디젤 결과의 후속 소비와 생산 기존 디젤에 비해. 그러나, 바이오 디젤의 광범위 하 게 채택 다양 한도 전에 직면해 있다. 이들의 가장 큰 바이오 디젤 원료의 제한 된 공급입니다. 따라서, 크게는 세계의 현재와 미래의 연료 요구의 주요 비율을 대체 하는 바이오 디젤에 대 한 증가 석유 생산 요구를 공장. 식물에서 지방산과 triacylglycerols을 합성 하는 방법에 대 한 증가 이해를 궁극적으로 새로운 에너지 작물의 개발을 수 있습니다. 예를 들어, 석유 합성 규제의 지식 풍부한 비 씨 조직에서 triacylglycerols을 생산 하는 방법을 제안 했다. 또한, 바이오 디젤은 추운 온도 성능 저하 및 낮은 산화 안정성. 지방산 조성 변경 하 여 바이오 디젤의 연료 특성 향상을 얻을 수 있습니다. 이와 관련, 높은 올레산 콘텐츠로 유전자 변형 콩 라인의 세대 식물 생명 공학 바이오 디젤의 개선에 기여 이미 하고있다 방법을 중 하나를 나타냅니다.

지질 Arabidopsis Endoplasmic 그물 사이 Plastid 인신 매매 Extraplastidic를 TGD4 단백질을 요구 한다

The Plant Cell. Aug, 2008  |  Pubmed ID: 18689504

Arabidopsis thaliana에서 chloroplasts 개발 광범위 한 지질 endoplasmic 그물 (ER) 사이 plastid 인신 매매 필요 합니다. 엽록체 지질 어셈블리의 최종 단계에 대 한 생 합성 효소 plastid 봉투 멤브레인과 연결 되어 있습니다. 예를 들어, 광합성 세포 막의 주된 galactoglycerolipids의 생 합성, 하는 동안 galactosyltransferases와 관련 된 이러한 막 diacylglycerol에 UDP Gal에서 전송 galactosyl 잔류물. Arabidopsis, diacylglycerol 응급실 또는 합니다 plastid에서 파생 수 있습니다. 여기, 우리 기술 Arabidopsis trigalactosyldiacylglycerol4 돌연변이 (tgd4)는 응급실에서 파생 된 diacylglycerol는 galactoglycerolipid 생 합성에 대 한 사용할 수 없습니다. 이 돌연변이 축적 진단 oligogalactoglycerolipids, 따라서 그 이름과 그 조직에서 triacylglycerol. TGD4 유전자 연관 응급실 막 나타나는 단백질을 인코딩합니다. 돌연변이 ER microsomes 절연된 plastids에 지질 감소 전송을 응급실 plastid 지질 전송의 중단을 나타내는 vivo에서 레이블 데이터와 일치 표시. 돌연변이의 복잡 한 지질 형은 2, tgd1의 내부 plastid 봉투 막의 지질 전송의 구성 요소 3 돌연변이 중단을 유사 합니다. 그러나, TGD1 2, phosphatidic 산 내부 봉투 멤브레인을 통해 전송에 제안 하는 3 복잡 한, 달리 TGD4 지질 전송 응급실과 외부 plastid 봉투 막 사이 중재 하는 기계의 일부가 될 듯하다. Tgd4 돌연변이에 직접 응급실 plastid 봉투 연락처 사이트의 범위는 변경 되지 않습니다. 그러나,이 응급실과는 plastid 간의 지질 전송에 대 한 도관으로 해당 연락처 사이트에 tgd4의 가능한 기능을 배제 하지 않습니다.

막 닿는 녹음 방송 요인 Arabidopsis Thaliana 열 스트레스 반응의 분기를 정의합니다

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Oct, 2008  |  Pubmed ID: 18849477

식물, 열 스트레스 응답 모든 진핵생물 중에서 보존 하 고 수 수 constitutively 또는 열에 의해 유도 된 하 열 스트레스 녹음 방송 요인에 의해 제어 됩니다. "클래식" 열 스트레스 녹음 방송 요인 으로부터 고유 열을 유도할 수 있는 전사 인자 열 내성에 기여 하도 보고 되었습니다. 여기, 우리는 bZIP28 표시 인코딩 상 막 닿는 전사 인자 유전자는 열에 대 한 응답에서 업 규제 하 고는 bZIP28 null 돌연변이 눈에 띄는 열에 민감한 형. BiP2, endoplasmic 그물 (응급실) 보호자 및 HSP26.5-P, 작은 열 충격 단백질을 부호화 하는 유전자의 열을 유도할 수 있는 표정 bZIP28 null 돌연변이에 감쇠 됩니다. Estradiol 유도할 수 있는 bZIP28 transgene 다양 한 더 위와 ER 스트레스를 유도할 수 있는 유전자를 유도 한다. 또한, 열 스트레스 유발 함으로써 핵을 그것의 재배포를 일으키는 응급실 막에서 Bzip28의 예측된 전사 요소 도메인 단백질 출시 나타납니다. 이러한 연구 결과 bZIP28 막 닿는 전사 요소 기반 신호 통로 열 내성에 기여의 필수 구성 요소를 나타냅니다.

ENDOSPERM Defective1은 소설 Microtubule 관련 단백질 Arabidopsis의 종자 개발을 위해 필수적

The Plant Cell. Jan, 2009  |  Pubmed ID: 19151224

초기 endosperm 개발 cytokinesis;의 부재에서 급속 한 핵 분열의 일련을 포함 한다 따라서, 많은 endosperm 돌연변이 유전자의 함수는 유사 분열에 필수적인 공개. 이 작품 찾아는 Arabidopsis thaliana endosperm-defective1 (ede1) 뮤턴트 endosperm 결코 cellularizes, 확대 polyploid 핵의 감소 된 수 포함 탈 선 microtubule cytoskeleton 기능 특화 된 방사형 microtubule 시스템과 cytokinetic phragmoplasts는 결 석. 비록 가끔 cytokinesis 결함 관찰 초기 배아 발달을 실질적으로 정상입니다. EDE1 유전자 지도 기반 방식을 사용 하 여 복제 했다 하 고 이전에 알려지지 않은 기능 유전자의 보존된 식물 관련 제품군의 개척자 구성원을 나타냅니다. EDE1 endosperm 개발 씨앗의 배아에서 표현 되 고의 식을 단단히 세포 주기 진행 하는 동안 통제. EDE1 단백질 premitotic 세포에서 핵 모자에 축적 하 고 따라 microtubules 스핀 들 및 phragmoplast, colocalizes microtubules 체 외에 바인딩합니다. 우리는 EDE1 소설 공장 관련 microtubule 관련 단백질 이다 microtubule 함수에 대 한 필수적인 mitotic 및 cytokinetic 단계 Arabidopsis endosperm와 배아를 생성 하는 동안 결론.

Arabidopsis TGD2 단백질의 25 아미노 산 시퀀스는 Phosphatidic 산의 특정 바인딩 충분 합니다

The Journal of Biological Chemistry. Jun, 2009  |  Pubmed ID: 19416982

유전자 분석 Arabidopsis의 TGD2 단백질 endoplasmic 그물 파생 thylakoid 지질 생 합성에 대 한 필요 하다 고 제안 합니다. Tgd2는 tgd1로 구성 된 추정된 지질 전송의 기판 바인딩 단백질 수 제안 (permease) 및 TGD3 (ATPase) 단백질. TGD1-2,-3 단백질 내부 엽록체 봉투 막에서 지역화 됩니다. 반면 C 터미널 도메인 얼굴 intermembrane 공간 TGD2 내부 봉투 막으로 N-터미널 멤브레인에 걸친 도메인과 고정 될 듯하다. Tgd2의 C-터미널 도메인 바인딩 phosphatidic 산 (PtdOH) 이전에 것이 보였다. 자세히 tgd2의 PtdOH 바인딩 사이트 조사를 환승 펩 티 드와 막 횡단 시퀀스 TGD2 시퀀스의 C-터미널 도메인 Discosoma sp. 빨간색 형광 단백질 (DR)의 C 말단에 융합 되었다. 이 크게 대장균에서 생산 다음 결과 박사 TGD2C 융합 단백질의 용 해도 개선. DR TGD2C 단백질 막 지질 단백질 오버레이 liposome 협회 분석 실험에 의해 증명으로 높은 특이성을 PtdOH 바인딩됩니다. 내부 삭제 및 자르기 mutagenesis PtdOH 바인딩에 대 한 충분 한 tgd2의 C-터미널 도메인에서 이전에 undescribed 최소 25 아미노 산 조각 발견. 이 25 메 르의 바인딩 특성 TGD2C, 명백 하 게 다른이 25 메 르에 대 한 적절 한 컨텍스트를 제공 하는 tgd2의 추가 시퀀스 야생 타입 같은 PtdOH 바인딩에 필요한 제안 했다.

식물 세포에 트는 속에 포함 된 지질 전송 메커니즘

Annual Review of Cell and Developmental Biology. 2009  |  Pubmed ID: 19572810

Chloroplasts photoautotrophic 식물 세포의 정의 트는 있다. 광합성 빛 반응과 전자 전송은 chloroplasts 내부의 정교한 thylakoid 멤브레인 시스템의 기능입니다. 광합성 세포 막의 지질 구성은 절약 인 착 식물의 필요를 반영 하는 nonphosphorous galactoglycerolipids의 상당한 부분에 의해 특징입니다. 지질 운송 및 glycerolipids의 필수적인 역할 개발 chloroplasts 광합성 기구 속에. 엽록체 속 중 지방산은 plastid에 합성 하 고 막 지질에 포함 있도록 endoplasmic 그물에 수출 된다. 또한, 지질 plastids 많은 식물의 내부 봉투 막에 조립된 드 노 보 수 있습니다. 지질 exchange 메커니즘 thylakoid 세포 막, 엽록체 내부 및 외부 봉투 막 그리고 endoplasmic 그물의 풍부한 레 퍼 토리는 나오고 있다. Thylakoid 속의 연구 intermembrane 지질 전송의 일반적인 메커니즘에 대 한 새로운 통찰력을 제공합니다.

지방산 Arabidopsis DESATURASE4 단백질을 특징이 지방산 Desaturases 다를 인코딩합니다

The Plant Journal : for Cell and Molecular Biology. Dec, 2009  |  Pubmed ID: 19682287

극 막 glycerolipids 북극 머리 그룹에 의해 정의 된 분자 종 및 글리세롤 등뼈 esterified 특성 acyl 그룹의 혼합물에서 발생 합니다. Phosphatidylglycerol 식물 chloroplasts 특정의 분자 종 Delta(3-trans) hexadecenoic 산의 핵심 올리브 moiety sn-2 위치에 운반합니다. Arabidopsis thaliana 누락이 특정 phosphatidylglycerol 분자 종 fad4-1 돌연변이 필요한 지방산 desaturase 또는 그 구성 요소를 결여. 공장에서 막 지질 연관 acyl 그룹의 압도적 cis 구성으로 이중 결합에 포함 되어 있습니다. 그러나, 그것은 phosphatidylglycerol의 sn-2 올리브 탄소 esterified 특별히 팔 미트 산의 carboxyl 그룹에 가까운 도입 트랜스 이중 결합의 형성에 관여 하기 때문에 FAD4 보통 아니다. 이 특이 한 desaturase 반응 분석 첫걸음 FAD4 유전자는 알려진된 지질 유전자 FAD4 로커 스 coexpression 분석의 매핑에 의해 식별 합니다. Fad4는 전체 시퀀스 보존을 기반으로 바인딩된 지방산 desaturases 클래식 멤브레인 관련 표시 되는 예측된 통합 막 단백질을 인코딩합니다. 그러나, FAD4 단백질 그 지방산 desaturases 같은 metalloproteins을 닮은 두 개의 히스티딘 모티브를 포함 합니다. Fad4는 plastid을 타겟으로 합니다. Overexpression 유전자 변형 Arabidopsis의 Cdna의 야생 타입을 기준으로 phosphatidylglycerol에서 Delta(3-trans) hexadecanoyl 그룹의 증가 축적 이끌어 냈다. 함께 이러한 결과 FAD4 지방산 desaturases의 소설 클래스의 창립 멤버인 가설과 일치.

주요 지질 방울 단백질의 RNA 간섭 입을 Chlamydomonas Reinhardtii에서 지질 방울 크기를 영향을 줍니다

Eukaryotic Cell. Jan, 2010  |  Pubmed ID: 19915074

진 핵 세포 지질 방울 라고도 별개 organelles에 triacylglycerols의 화학 형태로 오일을 저장 합니다. 이러한 동적 스토리지 구획 강렬 하 게 연구 하지 인간의 건강의 컨텍스트 및 식물 및 화학 또는 바이오 연료 원료에 대 한 인간의 소비를 위한 식물성 오일의 소스로. 많은 미세 오일, 특히 성장, 제한 조건 하에서 축적 하 고 따라서 잠재적으로 지속 가능한 원료로 바이오 연료 생산에 대 한 새로운된 관심을 얻고 있다. 그러나, 작은 세포 또는 분자 수준의 생물학적, 기름 축적에 관해서는 구조 단백질에 알려져 현재와 속, 유지 관리 및 조류 오일 저장 공간 구획의 저하에 관련 된 효소는 잘 공부 했습니다. 모델 녹색 조류 Chlamydomonas reinhardtii에 초점을 맞추고, triacylglycerols의 축적과 질소 부족 중 지질 방울 형성 조사 했다. 질량 분석 가칭 주요 지질 방울 단백질 (MLDP)를 지정 하는 주요 단백질 259 단백질 분수 지질 방울 농축, 그들 중에 확인. 이 단백질은 광합성 생물의 녹색 조류 계보에 다릅니다. RNA 간섭 방법을 사용 하는 MLDP 유전자 발현의 억제 증가 지질 방울 크기 아니라 triacylglycerol 내용이 나 대사에 변화가 관찰 되었다.

식물 생명 공학의 영역입니다

The Plant Journal : for Cell and Molecular Biology. Jan, 2010  |  Pubmed ID: 20078843

Arabidopsis의 지질 생 합성의 인산 염 규제 미토 콘 드리 아 바깥 막 복잡 한 Dgs1의 독립적입니다

Plant Physiology. Apr, 2010  |  Pubmed ID: 20181751

Galactoglycerolipids는 chloroplasts의 광합성 세포 막의 주요 성분. 효소의 적어도 3 개의 병렬 세트 성장 조건 변화에 맞게에서 조정 해야 합니다 그들의 생 합성에 관련 된. 다른 galactoglycerolipid 통로의 활동에 영향을 미치는 단백질에 대 한 잠재적인 후보는 최근 설명된 digalactosyldiacylglycerol1 (dgd1) SUPPRESSOR1 (DGS1) 단백질 Arabidopsis (Arabidopsis thaliana) 미토 콘 드 리아 외부 멤브레인에의. 특정 함수 이득 포인트 돌연변이 대립 유전자에 따라 발견 된 엽록체 galactoglycerolipid 결핍의 부분 복원 지질 galactosyltransferase, dgd1에에서 결함이 dgd1 돌연변이 일으키는 dgs1 1. Dgs1-1 대립 유전자 chloroplasts에 대체, DGD1 독립적인 galactoglycerolipid 생 합성 경로의 활성화를 리드 하는 과산화 수소의 축적을 하면 됩니다. 여기에 제시 된 분석 DGS1 단백질은 dgs1-1 대립 유전자의 표현에 따라 이전에 관찰 된 지배적인 부정적인 phenotype 설명 복잡 한, 큰 단백질의 구성 요소를 보여 줍니다. Dgs1-1 대립 유전자 dgs1 1 돌연변이 배경에서 과산화 수소의 축적에 관련이 있을 수 있습니다 대체 미토 콘 드 리아 산화 효소 (AOX) 단백질의 손실이 발생 합니다. 이 효과 AOX의 주요 형태에 대 한 mRNA 수준 dgs1 1 돌연변이 묘 목에 영향을 받지 했다 posttranscriptional. Dgs1-1, 기능 손실 대립 유전자와는 달리 dgs1 2 열 정도 테스트, dgs1의 가능한 분자 기능에 대 한 탐구를 떠나 식물 성장과 AOX, 지질 구성에 영향을 했다. 분명히, DGS1 야생-타입 단백질 지질 물질 대사 미토 콘 드리 아 또는 chloroplasts에 직접 적용 되지 않습니다.

Arabidopsis: 풍부한 수확 게놈 시퀀스 준공 후 10 년

The Plant Journal : for Cell and Molecular Biology. Mar, 2010  |  Pubmed ID: 20409265

지질 전송 Arabidopsis TGD 단백질에 의해 중재를 Plastid에 Endoplasmic 그물에서 단방향 이다

Plant & Cell Physiology. Jun, 2010  |  Pubmed ID: 20410050

Endoplasmic 그물 (ER)과 Arabidopsis의 plastid 간의 지질 전송 TRIGALACTOSYLDIACYLGLYCEROL (TGD) 단백질을 포함 한다. 지질 exchange Arabidopsis 돌연변이 응급실 및 plastid 지질 막의 지방산은 불포화에 장애가 특정 지질 분자 종의 존재에 따라 양방향 생각 된다. 그러나, 그것은 불분명 했다 여부 TGD 단백질 지질 양방향에서 인신 매매에 대 한 필요 했다. 이 질문은 tgd1 1 또는 tgd4-3 지질 지방산 불포화 ER (fad2) 또는 plastid (fad6)에서의 결함으로 이어지는 유전 돌연변이 배경에서의 이중 돌연변이의 분석을 통해 해결 되었습니다. Fad6 tgd1 1, fad6 tgd4-3 돌연변이 보여준 과감 한 감축 상대 수준에 불포화 지방산 및 galactolipids의 두 번. 이 식물의 성장과 광합성 시스템 개발 심각 하 게 훼손 됐다, 불포화 지방산이 포함 된 지질 종 응급실에서의 수입 중단을 제안. 또한, tgd1 2 dgd1 돌연변이 배경에서 앞으로 유전자 화면 digalactosyldiacylglycerol 양을 표시 된 감소와 새로운 fad6 2 대립 유전자의 분리를 이끌었다. 반면, fad2에 영향을 미치는 지방산 불포화 지질, 응급실에서의 두 tgd 돌연변이 배경으로 도입 extraplastidic 세포 막의 지질에 지방산 불포화 수준을 추가 감소 하지 않았다. 이러한 결과 제안 TGD 단백질의 역할 plastid 지질 가져오기로 제한 되지만 plastid extraplastidic 세포 막에서 지질 내보내기 확장 되지 않습니다.

동결 내성 식물 지질 외부 엽록체 막에서 리 모델링 필요 합니다

Science (New York, N.Y.). Oct, 2010  |  Pubmed ID: 20798281

식물 동결 세포 탈수로 인 한 세포 손상을 방지 하는 복잡 한 각 색을 보여줍니다. 지질 세포 막의 탈수 동안 개장 대항 멤브레인 무결성 및 세포 죽음의 손실의 중요 한 메커니즘 중 하나입니다. 민감한 동결 2 (SFR2), 동결 Arabidopsis, 관용에 대 한 필수적인 유전자 개조 외부 엽록체 봉투 막의 효소 galactolipid를 인코딩합니다. SFR2 processively galactosyl 잔류물에서에서 전송 풍부한 monogalactolipid 다른 galactolipid 수락자 형성 oligogalactolipids 및 diacylglycerol, triacylglycerol로 변환 추가. Sfr2과 triacylglycerol 생 합성 효소의 결합 된 활동 bilayer-하 비-bilayer 형성 막 지질 비율 변경 봉투 막에서 monogalactolipids의 제거에 이르게. SFR2 기반 메커니즘이 트는 볼륨의 변화에 대 한 보상 및 동결 기간 동안 세포 막 안정화.

대 본 풍부 하 게 Chlamydomonas Reinhardtii 질소 부족에 따라 변화 예측 물질 대사의 양 동

Plant Physiology. Dec, 2010  |  Pubmed ID: 20935180

많은 미세 처럼 Chlamydomonas reinhardtii 영양분을 박탈 하는 경우 triacylglycerols이 풍부한 지질 방울을 형성 한다. 이 과정을 기본 메커니즘을 공부 하려면 질소 (N) 부족 triacylglycerol 축적 및 gametogenesis 등의 개발 프로그램의 변화를 유도 하기 위해 사용 되었다. 녹취 록 유도 하 고 noninduced 조건에서의 비교 글로벌 분석을 홍보 하거나 새로운 영양 환경 발생 하는 셀에 triacylglycerol 축적을 동반 하는 분자 변화를 공부 하 고 첫 번째 접근 방식으로 적용 되었습니다. 이 목표를 향해 높은 처리량 시퀀싱 기술 4 N 충만 각 조건에 대 한 8 개의 생물학적으로 독립적인 라이브러리의 표현된 시퀀스 태그의 큰 번호를 생성 하 고용 했다 하 고 N 박탈, 허용 두 시험된 조건 하에서 식 레벨의 통계적으로 사운드 비교. 예상 대로, N 부족 제어 유전자 관여 단백질 생 합성 다운을 규제 하는 동안 gametogenesis의 하위 집합을 활성화. 광합성의 구성 요소에 대 한 유전자 PSBS 유전자 제외한 다운 규제 했다. N 부족 주도 대사의 표시 된 리디렉션: 기본 탄소 소스, 초 산, 더 이상 glyoxylate 사이클 gluconeogenesis에 의해 셀 블록으로 변환 하지만 지방산 생 합성에 직접 앞. 추가 지방산 putative lipase 유전자의 사본 풍요에서 관찰 된 변화에 의해 제시 된 과정을 개장 하는 막에 의해 생산 될 수 있습니다. 추론 transcriptional 분석을 기반으로 하는 신진 대사에 직접, 하지만 생화학 실험이 공제의 일부 지원. 여기에 제공 된 데이터 미세에 누적 된 오일의 메커니즘의 탐험에 대 한 풍부한 소스를 나타냅니다.

Galactoglycerolipid 신진 대사 스트레스: 개장을 위한 시간

Trends in Plant Science. Feb, 2011  |  Pubmed ID: 21145779

Galactoglycerolipids는 엽록체 막의 주된 지질 구성 요소 및 식물의 성장에 필수적입니다. 식물 chloroplasts 제정 된 UDP Gal 종속 지질 galactosyltransferases galactoglycerolipid 생 합성의 일괄 담당 하는 항구. Paralogs 집합은 응답 digalactosyldiacylglycerol에 의해 extraplastidic 막의 phosphoglycerolipid의 부분적인 교체와 리 모델링에 이르게 인산 부족으로 유도 된다. Galactoglycerolipid 생 합성 효소, UDP Gal 독립적인 galactoglycerolipid galactosyltransferase의 세 번째 유형은 최근 공차 냉동에 관련 된 표시 했다. 자, 어떻게 이러한 여러 효소에 의해 chloroplasts에서 galactoglycerolipid 생 합성의 규정의 이해는 급속 하 게 진화 하 고 지질 개장 다양 한 abiotic 스트레스에 대 한 응답에서의 점점 더 인식된 역할에 설명 하겠습니다.

Arabidopsis 엽록체 지질 전송 단백질 TGD2 막 방해 하 고 큰 복잡 한의 일부입니다

The Plant Journal : for Cell and Molecular Biology. Jun, 2011  |  Pubmed ID: 21309871

대부분의 식물에서 광합성 thylakoid 멤브레인 어셈블리 지질 유도체 합성 endoplasmic 그물 (ER)에 필요 합니다. 따라서,는 엽록체에 응급실에서 지질 전송 속은 thylakoids의 필수적입니다. TGD2 Arabidopsis는 엽록체에 지질 가져오기에 필요한 4 개의 단백질 중 하나 이며 바인딩할 phosphatidic 산 생체 외에서 발견 되었다. 그러나, vivo에서 TGD2 함수에 대 한 phosphatidic acid 바인딩과 TGD2 상호 작용 하는 세포 막의 의미가 불분명 남아 있었다. 3 기능적 분석 실험 TGD2 지질 bilayers 체 외에 미치는 영향 조사 개발, 우리 perturbs 세포 막 융합의 지점에, liposome 누설 발생을 재분배 한다 지질 bilayer는에서 보여 줍니다. 식별 하 여 5 개의 새로운 돌연변이 대립 특성화 지질 고기 생체 조건으로 특정 돌연변이에 이러한 기능 장애는 보여 줍니다. 구조적 수준에서 우리는 TGD2 500 Kda의 형성 보다 더 큰이 TGD2 포함 된 복잡 한 생물 학적 관련성을 나타내는 두 개의 돌연변이 체 대립을 중단은 복잡 한 단백질의 일부는 보여준다. 표시 되는 데이터를 바탕으로, 우리는 TGD2, 더 큰 단지의 일부로 형성 사이 내부와 외부 엽록체 봉투 막 안쪽 막과 바깥쪽 막에서의 C 말단 바인딩 phosphatidic 산에 정박의 N 말단과 지질 전송 도관 제안 합니다.

결정된 시 토 크롬 산화 효소와 세포 막의 지질 프로 파일을 변경 하는 Rhodobacter Sphaeroides에 있는 Cardiolipin 부족 하지만 구조와 기능 유지 됩니다

Biochemistry. May, 2011  |  Pubmed ID: 21476578

많은 최근의 연구는 지질 막 단백질, 잘된 결정의 형성에서 등의 중요성을 강조. 지질 프로 파일 생산, 기능, 그리고 내부 막 단백질, 시 토 크롬 c 산화 효소의 결정 화에의 한 지질, cardiolipin, 변화 효과 검토 하려면 우리 돌연변이 cardiolipin synthase (cls) 유전자 Rhodobacter sphaeroides의 발생 한 &gt; 다른 지질 나타났는데의 cardiolipin 콘텐츠 in vivo 및 선택적 변화 90% 감소. 이러한 조건 하에서 활동, 스펙트럼 속성과 크리스탈 특성에 의해 표시 된 대로 원시 시 토 크롬 c 산화 효소 (CcO) 제작 되었다. MALDI 탠덤 질량 분석 (MS/MS)에 의해 분석 공개 cardiolipin 레벨, 세포 막에서 CcO 결정에서 크게 감소 했다. 지질 종 결정에 직접 MS/MS, 자신의 정체성과 지방산 사슬 구성 문서화를 사용 하 여 처음으로 분석 했다. R. sphaeroides CcO (주로 18:1)에 있는 cardiolipin의 지방산 콘텐츠 포유류 CcO (18:2)에 다릅니다. 포유류 CcO 활동 cardiolipin 의존 달리 R. sphaeroides에 있는 cardiolipin의 주요 고갈 CcO 구조 또는 세균이 시스템에서 다른 지질과 cardiolipin의 교류의 더 큰 관용을 제안 하는 행동의 모든 측면에 영향을 주지 않았다.

Rhodobacter Sphaeroides에 있는 Lipids의 결합 하 여 유전 및 대사 조작 밝혀 완전히 활성 시 토 크롬 C 산화 효소에 있는 인지질이 아닌 대체

Biochemistry. May, 2011  |  Pubmed ID: 21476580

지질, 특히 cardiolipin (CL), 시 토 크롬 c 산화 효소 (CcO)에 대 한 특정 요구 사항 포유류 시스템에서 주로 체 외 지질 제거 방법을 사용 하 여 많은 이전 연구에서 보고 되었습니다. 우리 함께 종이 CcO 야생-타입 속성 가능성이 다른 부정 청구 지질과 양적 대체에 의해 허용 하는 모든 측면에서 눈에 띄게 CL 소진 Rhodobacter sphaeroides 디스플레이 생산을 보여줍니다. R. sphaeroides Cco의 지질 요구 사항 및 지질 간의 교환 가능성의 범위에 대 한 구조적으로 더 검사할 우리 R. sphaeroides CL 결핍 돌연변이 외에 인산 염 제한 성장 매체를 사용 하 여 in vivo의 CcO 표현 긴장의 지질 프로필 변경 향상 대사 접근을 고용. 기 막히게, 순화 CcO 야생-타입 기능과 특성, cardiolipin 혼자 CL 결핍 돌연변이에 비해 더욱 고갈에도 불구 하 고 여전히 유지 이러한 조건 하에서 생산 (MS에 의해 탐지) 모든 인지질 및 인지질이 비의 프로필을 크게 변경 하 고. 지질 막과 정화 CcO 확인 되었고 ESI와 MALDI 질량 분석 및 탠덤 질량 분석 하 여 정량. 큰 변화를 보여준 그 지질 분자 구조 사이 비교 R. sphaeroides에서 Cco의 유연한 지질 요구 사항에 대 한 구조적 설명 새로운 통찰력을 제공 하 고 다른 인지질 및 인지질이 아닌 좀 더 포괄적인 호환성 네트워크를 보여준다.

Chlamydomonas에 시스템 생물학 접근 구리 영양 및 여러 대사 단계 사이의 연결을 보여준다

The Plant Cell. Apr, 2011  |  Pubmed ID: 21498682

이 작품에서 우리는 전체 게놈 수준에서 Chlamydomonas reinhardtii 구리 regulon 쿼리. 우리의 RNA Seq 데이터 시뮬레이션 및 분석 파이프라인 2-fold 컷오프 및 10 RPKM (kilobase만 매핑된 읽기 당 매핑 가능한 길이 당 읽기)의 유효성을 검사 (~ 1 셀당 mRNA) 63 CRR1 대상 플러스 다른 86 구리 반응 유전자를 공개 합니다. Proteomic 및 immunoblot 분석 그 풍요는 또한 Chlamydomonas에서 구리 시그널링을 위한 주요 제어 메커니즘으로 transcriptional 규정의 유효성을 검사 하는 구리 영양에 의존 하는 해당 단백질의 25%를 점령. 여러 O₂ 종속 효소 식에 구리 결핍의 영향 지질 수정 경로에 단계를 포함. 정량적 지질 프로 파일 표시 thylakoid 막 digalactosyldiglycerides, 광합성 기구에 구리 결핍의 세계적인 영향을 나타내는에 지방산이 증가 polyunsaturation. 상 plastid 구리 보호자는 thylakoid에서 막 단백질의 발견 활용도 구리는 엽록체를 차단 하기 위한 메커니즘을 제안 합니다. 우리는 또한 발견 N 동화 통로에서 구리 살려주는의 예: 플 라빈 종속 백업 효소에 의해 구리 아민 산화 효소의 교체. 대상의 40 %는 이전에 새롭거나 단백질, 구리의 생물학에서 새로운 발견을 위한 상당한 잠재력을 나타내는.

탄소 전 분 생 합성 유전자 변형 Arabidopsis의 석유를에서 우회 하 여 식물 조직의 에너지 밀도 증가

Plant Biotechnology Journal. Oct, 2011  |  Pubmed ID: 22003502

엔지니어링 triacylglycerols (태그)으로 식물 조직에 축적 하 여 바이오 매스의 에너지 밀도 증가 하는 것은 시너지 lignocellulosic 바이오 매스의 변환 하 여 바이오 연료를 생산 하기 위해 노력 합니다. 일반적으로 태그 씨앗, 개발에서 축적 하 고 작은 규제 메커니즘 및 대부분의 식물에서 식물 조직에서 생 합성 오일 방지 제어 요소에 대 한 알려져 있다. 여기, 우리 ectopically 전사 인자 WRINKLED1 당신과 하 Arabidopsis thaliana 엔지니어링 (WRI1) 씨 오일 생 합성의 조절에 관여 합니다. 또한, RNAi 방법을 사용 하는 전 분 생 합성에 관련 된 ADP-포도 당 pyrophosphorylase의 작은 소 단위의 주요 촉매 isoform 인코딩 APS1 식을 줄였습니다. 결과 AGPRNAi WRI1 라인 축적 적은 전 분 더 hexoses. 또한,이 라인 WRI1 또는 AGPRNAi 혼자 식물 보다 식물 조직에서 5.8-fold 더 많은 석유를 생산. 풍부한 오일 방울 식물 조직에서 볼 수 있었다입니다. 태그 분자 종 씨앗 오일에서 발견 된 것과 유사한 긴 사슬 지방산이 포함 되어 있습니다. AGPRNAi WRI1 라인에서 상대 식 수준의 자당 synthase 2는 상당히 승격 하 고 설탕 수준의 상호 연관. 상대 표현의 인코딩 plastidic 단백질 드 노 보 지방산 합성, biotin carboxyl 캐리어 단백질 isoform 2와 acyl 캐리어 단백질 1 일에 관여 하는 유전자는 또한 상승 된. 전반적인 에너지 밀도 전 분에 비해 태그의 상대적 기여도 증가 9.5-fold에 1 AGPRNAi-WRI1 유전자 변형 라인 일치 변경 탄소 오일 전 분에서 분할.

J 같은 단백질 영향 Arabidopsis의 지질 엽록체의 지방산 조성

PloS One. 2011  |  Pubmed ID: 22028775

지질 및 지방산 대사 기계에 대 한 포괄적인 이해 오일과 지방산 연료, 산업용 원료 및 식물에 영양 개선의 최적화 생산을 위해 필요 합니다. 제대로에 T DNA 돌연변이 16∶3와 18∶3의 16∶1Δ7 및 18∶1Δ9 리프 지방산과 미묘한 감소 (5-30%)의 Arabidopsis thaliana 진 At1g08640 제 법 높은 수준 (50-100%)를 포함 하는 것 확인 된 주석 (http://www.plastid.msu.edu/). 리프 극 지 지질에 지방산의 TLC 분리 chloroplastic galactolipids monogalactosyldiacylglycerol (MGDG) 및 digalactosyldiacylglycerol (DGDG)이이 돌연변이 의해 영향을 받는 주요 지질 종류 이었다고 밝혔다. At1g08640의 유추 된 아미노산 시퀀스의 분석 예측 교통 펩 티 드의 존재, 3 막 횡단 도메인 및 N-터미널 J 같은 도메인 및 유전자 엽록체 J 같은 도메인 1 CJD1 선정 되었습니다. GFP 기자 실험 및 생체 외에서 엽록체 가져오기 분석 실험 시연 CJD1 엽록체 막 단백질 이다. 효 모-2-하이브리드 (Y2H) 미끼 Y2H 분석 결과에 기본 상호 작용 파트너로 (축적 및 복제 Chloroplasts 6, ARC6) plastidial 내부 봉투 단백질 발견 cjd1의 J 같은 도메인을 사용 하 여 Arabidopsis cDNA 라이브러리의 상영. ARC6 엽록체 부문에서 핵심적인 역할을 하 고 인접 한 보존된 지역 그의 기능이 완벽 하 게 알려져 있지 않다 함께 J 같은 도메인 자체를 통해 cjd1에 바인딩합니다. 이러한 결과 cjd1에 돌연변이 지질 성분에 미치는 영향의 향후 조사에 대 한 시작 지점을 제공 합니다.

미래는 지금 20 년에서 플랜트 저널에 대 한 밝은 있습니다

The Plant Journal : for Cell and Molecular Biology. Dec, 2011  |  Pubmed ID: 22150932

Endoplasmic 그물 엽록체 지질 인신 매매에 관련 된 TGD4 Phosphatidic Acid 바인딩 단백질 이다

The Plant Journal : for Cell and Molecular Biology. Jan, 2012  |  Pubmed ID: 22269056

광합성 세포 막에 널리 퍼져 있습니다, galactoglycerolipids 합성 효소 endoplasmic 그물 (응급실)와 엽록체 봉투 세포 막에 포함 됩니다. Arabidopsis trigalactosyldiacylglycerol (TGD) 단백질의 유전자 분석은 엽록체에 응급실에서 극 지 지질 전송에서 그들의 역할을 시연 하고있다. TGD1, 2, 및 3 단백질 닮은 tgd1와 함께 세균 타입 ATP 바인딩 카세트 (ABC) 전송의 구성 요소 바인딩 단백질, 및 tgd3는 ATPase 기판 permease, tgd2를 나타내는. 그러나,이 과정에서 TGD4 단백질의 기능 덜 명확 하 고 식물의 위치 셀 확고 하 게 확인할 수 있다. TGD4 예측된 C 터미널 β 배럴 구조는 약하게 그람 음성 박테리아의 외부 세포 막의 단백질와 비슷합니다. 여기, TGD4 단백질 Dsred를 구체적으로 융합 될 때, TGD2, 같은 살펴보겠습니다 phosphatidic 산 (PtdOH)에 바인딩합니다. Tgd1 돌연변이 대 한 이전에 표시 된 것 처럼 tgd4 돌연변이 extraplastidic 세포 막에 아마 PtdOH 콘텐츠 높은. 고도로 정제 하 고 특정 항 체를 사용 하 여 다른 셀 분수 프로브, 우리 시연 TGD4 단백질 했다 chloroplasts, 외피 막에 어디 N-말단 여 cytosol에 게시 하도록 발견을 제외 하 고 막 내에서 깊이 묻힐 것 처럼 보였다. Tgd4는 아마도 PtdOH 외부 엽록체 봉투 막 또는 외부 봉투 멤브레인을 통해 Ptdoh의 전송에 응급실에서 극 지 지질 전송에 직접 참여 하거나 제안.

Oleosins 공장 부분적으로 유사한 기능을 가진 Nannochloropsis의 지질 방울 단백질

Plant Physiology. Feb, 2012  |  Pubmed ID: 22307965

지질 방울 (LDs) 동물에서의 역학의 우리의 이해로 식물과 곰 팡이 세포는 급속 하 게 진화, 여전히 약간 형성 및 미세에서 이러한 organelles의 매출에 대 한 알려져 있다. 아직 바이오 연료 생산 가치가 높은 지질에 대 한 조류 feedstocks의 성장 중요성 미세에 LD 역학의 메커니즘을 이해 하는 필요가입니다. 따라서, 우리가 신흥 heterokont 모델 조류 Nannochloropsis 특검팀의 Lds와 관련 된 단백질을 조사 하 고 독특한 기본 시퀀스 하지만 다른 LD 단백질을 구조적 유사성을 풍부한 소수 성 지질 방울 표면 단백질 (LDSP) 발견. Nannochloropsis 셀에서 LDSP 풍부 밀접 하 게 기름 축적과 저하의 상태에 있는 동안 금액 triacylglycerols를 추적합니다. Arabidopsis thaliana OLEOSIN 1 불충분 한 돌연변이에 LDSP의 기능 특성의 생리 적 또는 생 화 확 적인 활동에서 Lds의 상호 물리적, 구조적 속성의 분리 허용. Arabidopsis의 LDSP 존재에 예상 대로 LD 크기 영향을 있지만 발 아 하는 동안 triacylglycerol 가수분해에 OLEOSIN 결핍의 생리 적 영향을 하지 반대 수 그것.

분석 Porphyra 막 전송기의 광합성 진핵생물과 수많은 나트륨 결합 교통 시스템 중에서 유전자 전송을 보여 줍니다

Plant Physiology. Feb, 2012  |  Pubmed ID: 22337920

막 전송기 이온과 세포 구획 및 환경과 셀 사이의 유기 분자의 운동에 의존 하는 많은 세포 과정에 중심 역할을 합니다. 운반을 잘 식물과 녹 조류 특징 있다 하지만 작은 전송기 나 레드 조류에서 그들의 진화 역사에 대 한 알려져 있다. 여기 우리는 경제적으로 중요 한 붉은 해 초 Porphyra (Bangiophyceae, Rhodophyta)에서 상 막 전송기 인코딩 482 표현된 시퀀스 태그 (EST) contigs 검사. 이러한 contigs Porphyra umbilicalis Porphyra 푸에서 포괄적인 transcriptome 데이터 집합의 일부입니다. Phylogenomics를 사용 하 여, 빨강과 녹색 조류/식물 (Plantae 가설 즉,)의 예상된 monophyly를 지 원하는 30 나무 식별 및 endosymbiotic/수평 유전자의 증거를 보여 주어 19 EST contigs 전송 관련 된 stramenopiles. 분석 된 contigs의 대부분 (77%) 유전자의 진화 역사를 해결에 어려움을 보여주는 확인 되지 않은 phylogenies와 전송기를 인코딩합니다. 해양 조류와 지방산 생 합성 및 세포내 지질 인신 매매와 관련 된 Porphyra 운송업 자 유전자의 co-regulation에 대 한 가능성에 많은 나트륨 결합 교통 시스템의 분자 기능 관찰 합니다. 인코딩된 단백질의 조직 및 subcellular 위치 추가 조사 필요, 하지만 우리의 연구 붉은 조류 유전자 후보를 관련 된 전송 기능 및 생물학이이 전송기의 진화에 새로운 통찰력을 제공 합니다.