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Articles by Judy E. Kim in JoVE
JoVE Bioengineering
막 단백질 폴딩의 열역학은 형광 분광학에 의해 측정
Chemistry and Biochemistry, University of California San Diego - UCSD
트립토판 형광으로 막 단백질 폴딩의 깁스 자유 에너지를 얻기 위해이 동영상 기사 세부 실험 절차.
Other articles by Judy E. Kim on PubMed
여성에서 중앙 액 Chorioretinopathy의 임상 특성입니다
여성에서 중앙 액 chorioretinopathy (CSC)의 임상 기능을 설명 하 고 완전 한 복구, 온건한 시각적인 손실 및 머리말 붙인된 기간 예측 요소 식별.
시간이 해결 형성 마이크론 구조 변화의 Raman 분석 및 Rhodopsin의 BSI 중급의 공명
시간이 해결 공명 라만 rhodopsin의 BSI 중급에 마이크론의 진동 스펙트럼을 얻기 위해 마이크로칩 흐름 실험 수행 됩니다 bathorhodopsin BSI의 구조적 변화를 조사 하 고 BSI lumirhodopsin 전환. 250에서 키네틱 Raman 스펙트럼 3 마이크로 단위를 ns BSI의 키 진동 기능을 식별 합니다. BSI에 할당 된 및 C (11) (12) H = C H A(u) C (14) H 왝 스, 각각 886 945 cm(-1)에서 상대적으로 강한 고 난이도 모드 전시. 이 결과 bathorhodopsin BSI 전환에 매우 긴장된 모든 트랜스 발 C(10)-C(11)=C(12)-C(13) 지역에서 완화 했다 하지만 여전히 C(14) 근처 왜곡 나왔다. BSI는 lumirhodopsin와 metarhodopsin 11 H와 12 H 간의 약한 결합을 나타냅니다에 비해 11,12 A(u) 고 난이도 모드의 낮은 주파수를 C(11)=C(12) 근처 BSI 마이크론의 잔여 왜곡으로 인해 흔든 다. 1653 Cm(-1)에서 BSI에 C=NH(+) 스트레칭 모드 Schiff 기본 counterion 영역 BSI에 bathorhodopsin의 전환에서의 중요 한 구조 재배치 아무 암시 23 cm(-1)의 정상적인 deuteriation 유도 downshift 전시. 그러나, 극적인 Schiff 기본 환경 변화 발생 BSI lumirhodopsin 전환 1638 cm(-1) C=NH(+) 스트레칭 모드 lumirhodopsin에 비정상적으로 낮은 7만 cm(-1) D (2) 오, 그것은 본질적으로 아무 H 본딩 수락자 제안에 이동 하기 때문에. 이러한 데이터와 함께 우리 처음으로 비교 하 고 수 실내 온도 공명 라만 시각적 자극에 모든 핵심 중간체의 진동 구조에 설명 합니다.
Fluorescein 감염된 Scleral 버클 Angiographic 발견입니다
이 보고서에 표시 fluorescein angiographic (FA) 연구 결과 환자에 scleral 버클 감염. Scleral 변형 수술 후 10 일 FA 시연 넓힐 안 혈관 fluorescein 누설 버클 위로 subretinal 공간으로. 불규칙 한 확산 scleral 두껍게 계산 된 단층 촬영 (CT)에 지적 했다. FA, 또는 확산 scleral 두껍게 한 CT에 의해 입증 본 동 공이 확장 되어 새는 안 배와 초점 choroiditis의 연구 결과 수립 scleral 버클 감염의 진단에 도움이 있습니다.
피코 스톡 및 Anti-Stokes 공명 라만 분광학 Beta-Carotene Probed에서 진동 이완
피코 시간 해결 스톡 및 anti-Stokes 공명 모든 트랜스 베타 카로 틴의 라만 스펙트럼 획득 및 흥분 상태 (S(1)) 인구와 부패,으로 접지 상태 진동 이완의 역학을 분석. 스톡 스 스펙트럼 시간 해결 보여 바닥 상태 독특한 S(1) 스톡 스 밴드의 관찰 된 부패와 12.6 ps 시간 상수와 복구. Anti-Stokes 스펙트럼 전시 아니 봉우리 S(1) 진동 이완 2 ps 내에서 거의 완전 해야 나타내는 S(1) (2A(g) (-)) 상태에 기인 합니다. Photoexcitation 후 내부를 통해 흥분 vibrationally 접지 상태 모드에서 anti-Stokes 산란에 큰 증가입니다. 데이터는 0.7 ps에서 C = C 모드 이완 운동 체계에 맞게 anti-Stokes C C 모드 5.4 ps에서 편안 하 고 12.1 ps에서 이완 하는 C-CH(3) 모드. 이러한 결과 C = C 모드 기본 수락자는 S(1)-S(0) 내부 변환 모델와 일치 하 고 C C 모드는 사소한 수락자 C-CH(3) 모드 intramolecular 진동 에너지 재분배를 통해 흥분.
Anti-stokes Raman Rhodopsin의 기본 광화학에 진동 냉각 역학의 연구
Rhodopsin의 기본 cis 트랜스 수 반응에 흐름 피코 스톡 및 anti-Stokes 라만 스펙트럼 구조 역학 및 반응 에너지를 조사 하는 데 사용 됩니다. 특성 ethylenic, 수소 비행기 밖 (농구 대), 그리고 낮은 wavenumber photoproduct 밴드의 라만 스펙트럼에서 외관은 악기 응답 제한, subpicosecond 제품 외관 시간와 일치 합니다. 강렬한 높고 낮은 주파수 anti-Stokes 봉우리 바닥 상태 화면에서 모든 트랜스 photoproduct vibrationally 뜨거운 생성 하는 방법을 보여 줍니다. 특히, 282, 350, 477 cm(-1)에서 낮은 주파수 모드를이 낮은 주파수 동작 직접 반응 곡선이 교차 프로세스에 참여 공개 vibrationally 매우 흥분된 (T > 2000 K) 즉시 다음 수 있습니다. Photorhodopsin bathorhodopsin 변환와 일치 하는 약 2.5 ps 시간적 부패 anti-Stokes 모드 특징입니다. 이 서신을 사진 batho 전환 바닥 상태 냉각 과정은 피코 시간 규모에 완료 되 면 그 에너지 저장 기본 visual photoproduct에서 보여줍니다. 마지막으로, 독특한 스톡 스 진동 290, 992, 1254, 1290, 그리고 1569 rhodopsin의 흥분된 상태에서 발생 하는 cm(-1) 0 ps 지연에만 관찰 된다.
모드 관련 흥분 상태 에너지 분포 및 파장-종속 Photoreaction 양자 수율 Rhodopsin의 분석
Rhodopsin의 photoreaction 양자 수율은 종속 파장: phi(lambda) 500의 빨강 파장에서 최대 5%까지 줄일 수 있다 nm는 아니지만 변형 (피 = 0.01 + 0.65) 450 및 500 nm (김 외. 2001) 사이. 이 nonstatistical 내부 변환 프로세스를 이해 하려면 이러한 결과 동적 곡선 교차점의 란 다우-제너 모델의 예측 비교 됩니다. Rhodopsin의 28 프랑크 Condon 활성 진동 모드에서 초과 광자 에너지의 초기 배포 완전히 thermalized 합 이상 상태 vibronic 계산에 의해 정의 됩니다. 이 계산은 밝혀 높은 주파수 unreactive 모드에 의해 그 흡수 (예를 들어, C [이중 채권] C 뻗어) 570의 여기 파장 450에 이동 된다 증가 nm 반면 상대적으로 적은 에너지 반응성 낮은 주파수 모드에 입금 됩니다. 이 결과 질적 rhodopsin에 대 한 phi(lambda)의 실험적으로 관찰된 파장 의존성을 설명 하 고 사후 통로에서 delocalized, 비틀림 모드의 중요성을 보여준다.
받고 눈에 망막 분리 유지 렌즈 파편의 제거를 위한 플 래 나 Vitrectomy 갈 거 예요
발병 률과 관련 된 망막 분리 (RD)의 결과 조사 하기 위해 렌즈 조각 갈 거 예요 플 래 나 vitrectomy (PPV)에 의해 제거 유지.
피코 Rhodopsin 시간 해결 자외선 공명 라만 분광학에서에서의 G-단백질 결합 수용 체 활성화의 역학
시각 색소 rhodopsin에서 망막 발 수에 대 한 단백질 응답 피코 시간 해결 자외선 공명 라만 분광학을 사용 하 여 공부입니다. 높은 신호-잡음 Raman 스펙트럼 제공 1khz Ti:Sapphire 레이저 기구를 사용 하 여 얻을 수 있습니다 < 3 ps 표시 (466 nm) 펌프 및 UV (233 nm) 펄스를 조사 합니다. 펌프와 프로브 이벤트 사이 시간 지연이 있을 때 트립토판 모드 W18, W16, W3 감소 라만 산란 강도 전시. 펌프-프로브 장시간 지연 + 5 및 + 20 추 신 (W18, W16, W3, w 1) 트립토판과 티로신 (y 1 + 2xY16a, Y7a, Y8a)의 피크 농도에서 최대 3%까지 삭제. 이러한 강도 변경 하나 이상의 트립토판 근처 microenvironment에서 감소 hydrophobicity를 특성을 사용 하 고 하나의 티로신 잔류물에서 발생할 가능성이 있는 다음 cis 트랜스 수 마이크론의 베타 ionone 반지와의 상호 작용. 크리스탈 구조 시험 w265와 y268이이 신호에 대 한 책임을 지는 나왔다. 이러한 자외선 Raman 스펙트럼 변화 rhodopsin-하-메타 나 충 중 200 fs isomerizing 발 단백질 모션에 힘입어 그 기본 전환 단백질 활성화를이 끌 주요 구조적인 변화를 드라이브을 암시 하 고 전환에 대 한 관찰 된 게 거의 동일 합니다.
유리 체, 수성, 그리고 인 간에 있는 구두로 관리 Voriconazole의 플라스마 농도의 결정
유리 체 및 구강 관리 후 수성 유머로 voriconazole, 새로운 세대 triazole antifungal 에이전트의 침투를 조사.
급성 Postcataract 추출 Endophthalmitis-에 대 한 항생제 눈은 필요 합니까?
급성 postcataract 추출 endophthalmitis 치료에서 adjunctive 눈 항생제 주사의 효능 평가.
아연-포 르 피 린 Solvation Zn-시 토 크롬 C의 접힌 및 펼친 상태에서
광화학 트리거와 heme 금속 대체 시 토 크롬 c의 접는 역학 조사를 사용의 간략 한 검토 후 선물이 photophysics 고 아연 대체 단백질 (Zn cyt c)의 접힌와 펼친 상태의 광화학에 대 한 새로운 결과. Zn cyt c triplet 상태 감퇴 속도 론 우리의 측정 공개 수명에 체계적인 동위 원소 효과: 접힌 단백질 (tau(H)2(O) 약 10ms) 부패만 겸손 하 게 isotopically 대체 버퍼의 영향을 받는 (k(H)2(O)/k(D)2(O) = 1.2) 감소 triplet 수명 (약 1.3 ms) 및 큰 동위 원소 효과 (1.4) 발견 된 반면, 화학적으로 변성에 대 한단백질을 완벽 하 게 펼쳐 졌습니다. 가장 짧은 수명 (0.1-0.4 ms) 최고의 동위 원소 효과 (1.5) 복합 완전 노출된 모델에 대 한 발견, 아연 대체 N-아 세 틸-microperoxidase-8 (ZnAcMP8), 암시 펼친된 단백질 완전히 변성 조건 에서도 Zn-포 르 피 린 그룹에 몇 가지 보호를 제공 합니다. 펼친된 Zn cyt c 부분 구조에 대 한 추가 증거 외부 Zn-포 르 피 린 triplet 상태 끄는으로 ru(nh(3))(6)(3+)를 사용 하 여 bimolecular 냉각 실험에서 온다. 끄는, 중간점 guanidinium 염화 물 (GdmCl)와 우 레 아 농도 전시 나아졌다 triplet 감퇴 속도 론에서 부분적으로 펼친된 단백질, 확장, 용 매에 노출 된 상태 (6.6 x 10(8) M(-1) s(-1) GdmCl, 우 레 아에 6.3 x 10(8) M(-1) s(-1)) 및 소형, 상대적으로 용 매 액세스할, 상태 (10(7) M(-1) s(-1) Gdmcl에서 x 5.9에 기인 느린 구성 요소에 해당 하는 빠른 구성 요소 존재우 레 아에 시민권이 M(-1) s(-1) x 8.6). Zn-포 르 피 린 solvation 2 denaturants에서 압축 상태에 대 한 변화는 부분적으로 펼친 단백질에서 공동 인자는 우 레 아 솔루션 보호 더 나은 보여준다.
밀 교 Subfoveal 안 Neovascularization 나이 관련 황 반 변성의 치료를 위한 녹색 염료 기능 추가 Indocyanine Transpupillary 찜질
Indocyanine 녹색 (ICG) 염료 기능 추가 (TTT +) Transpupillary 찜질 (TTT) 혼자 TTT 안전과 밀 교 subfoveal 안 neovascularization 나이 관련 황 반 변성의 치료 효과 대 한 비교 했다.
접혀 프로 빙 및 외부 막 단백질의 펼쳐는 안정 된 상태 및 시간 해결 트립토판 형광와 함께
(OmpA)에서 만든 대장균 외부 막 단백질의 전체 길이 및 잘린 변종 5 네이티브 트립토판 잔류물의 각 정상 상태 및 시간 해결 형광 측정 접혀 및 변성 상태. 트립토판 내의 흥분 상태 수명 multiexponential 고 잔류물 마다 다릅니다. 또한, 흥분 상태 수명에 상당한 증가 동반 OmpA 폴딩, 인지질 bilayers에 micelles 보다 더 긴 수명. 이 찾는 제안 OmpA Trp 환경 micelles에 접혀 인지질 bilayers는 다릅니다. 전체 길이 Ompa와 Trp 형광 감퇴 속도 론 측정 vesicles 공개 w 7은 가장 가까운 W102 탄화수소 코어에서 가장 먼 fluorophore는 브롬된 지질에 접혀. 안정 된 상태 및 시간 해결 편광된 형광 측정을 나타냅니다 감소 Trp 이동성 단백질을 bilayer에 접었을 때 OmpA micelle, 그리고 더 낮은 이동성에 접혀 있다. 수용 성 periplasmic 도메인 제거 됩니다 잘린된 Ompa의 형광 속성만 겸손 하 게 이러한 조건 하에서 두 가지 형태에 대 한 비슷한 접힌된 구조를 제안 하는 전체 길이 폼의 그 다.
펩 티 드 삽입, 위치, 고 막의 안정화: 모든 원자 분자 동역학 시뮬레이션에서 통찰력
펩 티 드 삽입, 위치 지정 및 안정화 모델 멤브레인에서 모든 원자 분자 역학 (MD) 시뮬레이션을 통해 조사 됩니다. 1 개의 펩 티 드 (WL5) solvated dimyristoylglycero-3-인산 (DMPC) 막의 각 전단지에 시뮬레이션 합니다. 내 첫 5 ns, 펩 티 드를 저절로 막에 삽입 하 고 다음 나머지 70 동안 안정을 ns 시뮬레이션 시간. 두 전단지에는 펩 티 드 막 인터페이스를 지역화 하 고이 지역화 펩타이드 지질 수소 결합의 형성에 기인. 우리가 보여 각 펩 티 드에 단일 트립토판 잔류물이 수소 채권;에 크게 기여 특히, 질소 heteroatom indole 링의 중요 한 역할을 한다. 상위 및 하위 전단지에 일반 멤브레인에 상대적인 indole 링의 기울기 각도 약 26도, 54도, 각각. 전체 펩 티 드 사슬의 기울기 각도 62도 74도. 막 유도 베타-시트의 특성은 펩 티 드의 conformations 및 펩 티 드 멤브레인 주문 지질을 향상 시킵니다. 마지막으로, 막 비행기에서 펩 티 드의 보급 속도 계산 됩니다 (실험 펩 티 드 농도에 따라) 대략 6 A (2) / ns, 따라서 제안 하는 500 ns 시간 규모 intermolecular 상호 작용에 대 한.
황 반 두께 당뇨 황 반 부 종 환자에서 자이 스 광학 일관성 단층 촬영을 사용 하 여 볼륨의 재현성
당뇨 황 반 부 종 (DME)를 가진 환자에서 광학 일관성 단층 촬영 (OCT) 재현성 평가.
이시스-DME: 장래, 무작위, 복용량 에스컬레이션 Intravitreal 스테로이드 주사 내 화 당뇨 황 반 부 종에 대 한 연구
:을 안전과 intravitreal triamcinolone (IVTA) 내 화 임상적으로 중요 한 당뇨 황 반 부 (DME)에 대 한 아 세토 니드의 효능을 확인 합니다.
자외선 공명 라만 분광학 필수적인 막 단백질의 접힌와 펼친 상태의
네이티브 정박 트립토판 (Trp) 및 정수 막 단백질, 박테리아 외부 막 단백질 (OmpA) 티로신 잔류물의 진동 구조 자외선 공명 라만 (UVRR) 분광학을 사용 하 여 처음으로 조사 되었습니다. 네이티브 OmpA, 단일 Trp 돌연변이 Trp 없는 돌연변이의 스펙트럼 접힌 및 펼친 상태에서 기록 되었다 고 트립토판 구조와 지역 환경에 상당한 변화를 공개 합니다. 폴딩 시 현저한 변경 indole N1H, I1361/I1340 비율의 증가 의해 지원 로컬 트립토판 환경의 hydrophobicity W17 주파수: 874 878 cm(-1), 및 성장에에서 변화에 의해 입증의 수소 결합 문자의 손실을 포함 합니다. 단일 트립토판 잔류물에 이러한 사이트별 변화 이외에 나머지 네이티브 트립토판과 티로신 아미노산의 진동 구조 수정 또한 분명 하다. 마지막으로, 여기에 제시 된 UVRR 데이터 나타냅니다 OmpA 소포에 접혀 및 세제에 접혀 구조 다를 수 있습니다 고 막 단백질 접기의 지속적인 연구를 위한 중요 한 기초를 제공 합니다.
펩 티 드 Self-cleaving는 2a와 배아 줄기 세포를 마킹: NKX2 5 에메랄드 GFP BAC 기자
형광 기자는 살아있는 세포에서 유전자 발현 시 및 식별 하 고 배아 줄기 (ES의) 세포를 포함 한 다른 유형의 문화에서 순수한 세포 인구를 분리에 유용 합니다. 여러 개의 fluorophores 및 유전자 선택 마커 존재; 그러나, 유전자의 네이티브 ATG 시작 사이트 근처 규제 시퀀스를 보존 하는 기자가 구문을 만드는 시스템을 광범위 하 게 사용할 수 있다.
펩 티 드 삽입 및 지질 Bilayer에 집계의 열역학
Biomolecules의 다양 한 생리 적 프로세스를 삽입 하 고 세포 막에서 다시 구성 하 여 중재 하 고 큰 관심의 열역학적 세력 그들의 분할에 대 한 책임은. 최근 실험 막 물에서 개별 아미노산의 양도와 관련 된 자유 에너지 변화에 중요 한 데이터를 제공 합니다. 그러나, 경로 및 멤브레인으로 펩 티 드 삽입의 에너지에 관련 된 변경의 완전 한 그림 애매 남아 있습니다. 이 위해 전산 기법 원자 수준 세부 정보를 사용 하 여 실험 데이터를 보충 하 고 삽입의에 너 지론에 빛을 발산. 자, 우리 총 850에 우산 샘플링 하는 기술을 고용 자유 에너지 프로 파일 삽입 한 트립토판과 5 개의 leucines (WL5)으로 구성 된 모델 hexapeptide의 통로 공부 하 고 모든 원자 분자 동역학 시뮬레이션의 ns. 펩 티 드의 계산 된 자유 에너지 프로 파일으로 막 코어를 통해 대량 용 매에서 이동 전시 두 최소: 물 막 인터페이스 또는 headgroup 지역 및 지질 글리세롤 지역 가까이 친수성 소수 성 인터페이스에서 세계 최소 로컬 최소. 약 1 kcal mol (-1)의 다소 작은 장벽을 깊이 넣으면 펩 티 드의 향상 된 유연성에 의해 설명 막 핵심에 존재 합니다. 우리의 결과 결합 하 여 문학에, 펩 티 드 삽입 및 용 매 지질 headgroup 인터페이스에서 막 접촉 시 집계 펩 티 드를 포함 하는 집계를 위한 열역학 모델을 소개 합니다.
A 시험 비교 Intravitreal Triamcinolone 및 초점/그리드 Photocoagulation 당뇨 황 반 부 종에 대 한 무작위: 기본 기능
연령과이 당뇨병 성 망막 증 임상 연구 네트워크 임상 시험에서 참가자 간의 인종 하위 그룹 내에서 초기 인구 통계 학적, 조직, 그리고 눈 특성을 비교 하 고 다른 동료와 함께이 일대를 비교 하 등록 단계에서 당뇨병 성 망막 증에 대 한 임상 실험 3.
Anti-vascular 내 피 성장 인자 에이전트 Intravitreal 주사 후 즉시 단기 Intraocular 압력 변화
단기 동향 및 모니터 intraocular 필요가 평가 압력 (IOP) ranibizumab, bevacizumab, pegaptanib, 및 triamcinolone 아 세토 니드의 intravitreal 주사 후 즉시 변경 됩니다.
멤브레인 단백질 접기의 열역학에 트립토판 Microenvironment, 수용 성 도메인 및 소포 효과 크기: 막 횡단 단백질 OmpA 교훈
멤브레인 단백질 접기에 대해 모델 시스템의 구조적 안정성을 결정 하 refolding 곡선 정수 막 단백질 외부 막 단백질 (OmpA)의 측정 했다. 야생-타입 OmpA 전시 전개 (DeltaG 정도의 물) 7, 15, 57, 102, 또는 143, 기본 위치에서 단일 트립토판 잔류물을 포함 하는 10.5 kcal/mol. 돌연변이의 자유 에너지는 각각 6.7, 4.8 2.4 4.7 2.8 kcal/mol, Deltag도 물 값과 야생-타입 OmpA 보다 덜 안정. 여기에 관찰 된 추세 아로마 상호 작용 및 수소 결합을 포함 하 여 noncovalent 상호 작용 측면에서 설명 합니다. OmpA 막 횡단 도메인의 구조적 안정성에 녹는 꼬리의 영향 또한 잘린된 단일 Trp 돌연변이;을 통해 조사 DeltaG 4 5 잘린된 돌연변이 물 값은에 의해 더 큰 > 수용 성 도메인의 부재 펼친된 막 횡단 도메인 불안정 수 있습니다 제안 하는 전체 길이 버전을 기준으로 2.7 kcal/mol. 마지막으로, 동적 광 산란 실험 기 크기와 안정성에 우 레 아 및 단백질의 효과 측정을 수행 했다. 요소 농도가 1m 보다 큰 소포 크기의 증가 일으키는 원인이 고 이러한 직경 변경 단백질의 존재 하지 않습니다. 이러한 동적 광 산란 결과 형광 연구를 보충 하 고 단백질의 구조적 안정성에 소포 크기의 중요 한 효과 보여 줍니다.
Förster 공명 에너지 전달 및 단백질의 구조적 안정성: 물리 화학 학생 들을 위한 고급 생물 리 모듈
단백질 폴딩 연구에서 생물 물리학 및 물리 화학의 폭발 영역입니다. 여기, 우리가 흡수 분광학, 프로브 단백질 폴딩에 중요 한 주제를 Förster 공명 에너지 전송 (무서 워) 측정, 형광 분광학, 등 여러 기술의 통합 기술. 시 토 크롬 c 모델 단백질;로 사용 구조적 안정성 (ΔGH2O∘)의 비교 두 개의 화학 denaturants, 우 레 아, guanidinium 염을 통해 측정 단백질 접히는 intermolecular 상호 작용에서 중요 한 개념을 설명 합니다. 또한, Trp 59 무서 워 쌍을 기반으로 intraprotein 거리의 결정 및 시 토 크롬 c의 펼친 상태 heme 그룹 하이라이트 전개 조건 하에서 단백질 구조 진화. 분석 하 고 이러한 결과의 논의 광학 기술로 학생 들의 능력을 강화 하면서 접는 단백질에 대 한 모델의 깊이 있는 이해를 얻을 수 있는 기회를 제공 합니다. 총칭 하 여 광 분광학, 엄격한 정량 분석 및 생물 물리학에 초점 조합 화학, 생물학, 물리학의 성장 하 고 있는 교차로에서 기초 연구의 중요성을 보여 줍니다.
Phenotypic 이종 및 병 변 크기 측정 Stargardt 황 반 영양 장애에
저 autofluorescence Stargardt 황 반 영양 장애에 사용 된 및 더 나은 저 flavimaculatus 이해 질병 상태와 진행. 저 autofluorescence 이미지 좋은 선명도 높은 콘트라스트와 함께 위축 한 영역을 나타냅니다. 저자 이기종 저 모습을 시연 하는 오랜 질병으로 3 형제 자매의 가족을 연구 하 여 저 autofluorescence 이미지에 컬러 저 사진 보다 더 위축 공개 여부 조사. 저 autofluorescence에 색 저 사진과 fluorescein 이미지 비교 되었다. 광학 일관성 단층 촬영 이미지도 분석 했다. 위축 성 병 변의 영역 측정 되었고 색상 autofluorescence 저 사진 저에 비해. Autofluorescence 이미지 위축 하 게 영역을 저 사진 색상 보다 더 명확 하 게 delineated. 그러나, 위축 측정된 분야 컬러 저 사진에 보다 저 autofluorescence 이미지에 더 큰 겸손 하 게만 이었다. 광학 일관성 단층 촬영 이미지 심한 외부 망막 위축과 시야 윤곽선의 손실을 보였다.
수소 결합 및 용 매 극성 마커 자외선 공명에 트립토판의 라만 스펙트럼: 막 단백질을 응용 프로그램
자외선 공명 라만 (UVRR) 다양 한 용 제와 모델 펩 티 드의 트립토판 화합물의 스펙트럼 제시 하 고 용 매 극성, 수소 결합 강도와 양이온-파이 상호 작용을 반영 하는 체계적인 변화를 공개 합니다. 일반적으로 활용된 UVRR 스펙트럼 마커 기반-공명 라만 데이터, 트립토판 페르미 doublet 비율 I1360/i1340으로 환경 극성에 대 한 다른 값에에-및 오프-공명 다른 트립토판 파생 상품 뿐만 아니라 라만 스펙트럼을 전시. 특히, indole UVRR 페르미 doublet 비율 범위 극 지 용 매에서 0.3에서 0.8 nonpolar 용 제에 해당 값이 여기 보고 반면에 이전에-공명 라만 스펙트럼은 0.5 1.3. 더 많은 생물학 관련 분자, N-아 세 틸 트립토판 에틸 에스테 르 (NATEE)에 대 한 UVRR 페르미 doublet 비율 1.1 (극 지 용 매) 1.7 (nonpolar 용 매)를 작은 범위에 있는 및 용 매 극성/양극 화 매개 변수 pi *와 ETN 관련. 마찬가지로 이전에 보고 된, 몇 가지 UVRR 모드 indole N H moiety의 수소 결합 강도에 민감한 있습니다. 여기에, 우리는 H 결합에 대 한 새로운 명확한 표식 보고서: W9 (약 1254 cm-1) 모드 (RW10)의 W10 (약 1237 cm-1) 강도의 비율. 이 비율은 수소 결합 수락자가 없을 경우에 NATEE에 대 한 0.7 이며 3.1 값이 2.3 물에 강한 수소 결합 수락자 존재를 증가. W8 W17 모드 이동 + 10 이상 및 약-5 c m-1 수소 결합 강도;의 증가 따라 W17이 범위가 이전에 보고 된 보다 작은 이며 단백질 및 펩 티 드 솔루션에 대 한 보다 현실적인 범위를 반영 한다. 마지막으로, 우리의 데이터 양이온-파이 상호작용 존재 W18 및 W16 상대 강도 변화에 대 한 증거를 제공합니다. 이러한 UVRR 마커 모델 막 바인딩 시스템 트립토판 octyl 에스테 르의 스펙트럼 및 펩 티 드 독 소 melittin 해석에 활용 됩니다. 이러한 스펙트럼 내부 및 지질 bilayers 또는 self-associated 수용 성 올리고 biomolecules 멤브레인 관련 된 분할에 영향을 미칠 가능성이 intermolecular 수소 결합 및 양이온-파이 상호작용의 중요성을 공개. 여기에 제시 된 UVRR 분석 수정 이전 보고서 증대 및 분자 microenvironment를 명료 하 게 적용할 수 있는 스펙트럼 제조 업체의 명확한 세트 및 광범위 한 고정 막 단백질 및 펩 티 드에 있는 트립토판 잔류물을 포함 하 여 복잡 한 시스템의 구조를 제공 합니다.
형광 및 자외선 공명 라만 연구 결과 인간 Cathelicidin LL-37과 F6W 및 F17W 돌연변이의 펩 티 드 기 상호 작용의
청각-37 cathelicidin 제품군의 스펙트럼 인간의 항균 성 펩타이드 이다. 힘 분석 실험 최소 억제 농도 기 누설의 형태로 단일 트립토판 돌연변이, F6W 및 F17W, 죽이 박테리아와 네이티브, 트립토판 무료 청각-37의 펩 티 드로 막 방해 효과가 함을 나타냅니다. 정상 상태의 형광 및 자외선 공명 라만 분광학의 F6W 및 f17w이 트립토판 잔류물의 분자 세부 정보를 공개 합니다. 지역 환경의 극성, indole N H moiety 순수 증류수;에 상대적으로 탄산 이온의 존재 F6W 및 f17w에 대 한 회전 자유 감소의 수소 결합 강도 이러한 결과 알파 나선형 청각-37 유도 탄산 이온의 존재 하는 oligomeric 코어에서의 소수 성 지역의 매장와 일치 합니다. F6W 및 f17w의 탄산을 이용한 알파 나선형 형태의 분 광 속성의 차이 F6W F6W microenvironment f17w의 그것 보다 더 극 하 게 근처 로컬 lysine 찌 꺼 기의 존재를 반영 합니다. 지질 vesicles 존재 돌연변이 환경 극성과 수소 결합 강도, 자유 회전의 추가 손실을 받 다. 브롬된 지질을 활용 하 여 냉각 실험 공개 두 돌연변이에 트립토판 잔류물 bilayer 센터에서 기본적으로 등거리 고 가까이 bilayer 센터 9,10 위치 bromines headgroups (6,7 위치)에 가까운 그 보다 더 효율적으로 형광을 끄다. 이러한 결과 청각-37, 막 장애의 카펫 또는 원환형 기 공 메커니즘을 지원 하 고 트립토판 돌연변이 및 민감한 분 도구 조합 항균 성 행동에 대 한 중요 한 분자 단서를 제공할 수 있습니다 입증.
나이 관련 황 반 변성에는 주로 클래식 안 신생 세포 막의 병 변 크기 변경의 의사 평가
진화 하는 주로 클래식 안 neovascularization 나이 관련 황 반 변성의 fluorescein 조 해석 계량.
Explanted Scleral 버클에서 분리 된 생물의 미생물 스펙트럼
Scleral 버클 제거는 여러 가지 이유로 수행 드문 절차. Explanted scleral 버클에 미생물 정보는 제한 된 유지 됩니다. 저자는 18 년 동안 scleral 버클 제거의 37 경우 식별. 세균성 문화 절연 4 9 (44%)와 환자의 임상 감염 유기 체. 확인 된 생물 포함 메 티 실린 내성 황색 포도 상 구 균, 녹 농 균, 진 abscessus와 coagulase 음수가 황색 종. 세균성 문화 절연 임상 감염 없이 11 환자 (27%)의 3 체. 확인 된 생물 Nocardia 종, Alcaligenes xylosoxidans, 및 Mycobacterium chelonae 포함. 임상적으로 감염 된 게재 scleral 버클 더 치명적인 유기 체와 유기 체를 식별 하는 큰 기회와 연결할 수 있습니다. 세균성 문화 scleral 버클 제거에 따라 값의 있을 수 있습니다.
(그)의 공명 라만 연구 Mitoneet의 (Cys) 3 2Fe-2S 클러스터: (Cys) 4 돌연변이 정한 금속 센터에 대 한 Ph의 효과 미치는 영향을 비교 합니다
MitoNEET anti-diabetic 약의 대상으로 처음 확인 2Fe-2 외부 미토 콘 드 리아 멤브레인 단백질 이다. 그것은 새로운 단백질 배 전시와 Rieske 단백질 및 ferredoxins 같은 다른 2Fe-2 단백질 달리 mitoNEET homodimer의 금속 클러스터는 각각 조정 한 히스티딘 잔류물 및 3 개의 시스테인 잔류물에 의해. 2Fe-2S moiety ligating His87 잔류물 상호 이전 연구 H87C 돌연변이에 Cys 교체 안정화 버전에 대 한 클러스터 때문에 특히 중요 하다. 여기, 우리 지역의 구조적 변화를 평가 하기 위해 자연스럽 게 발생 Fe(2)S(2)(His)(Cys)(3) 단백질이의 라만 스펙트럼 클러스터 lability 연관 공명을 보고 합니다. 자사의 ferredoxin 같은 H87C 돌연변이에 Mitoneet의 비교 나타냅니다 라만에 봉우리는 약 250-300 cm(-1) 지역의 Mitoneet의 Fe His87 moiety에 의해 영향을 받습니다. 체계적인 pH 종속 공명 라만 스펙트럼 변경 네이티브 mitoNEET 하지 H87C 돌연변이 대 한이 괴기 한 지구에서 관찰 되었다. 네이티브 Mitoneet의 약 250-300 cm(-1) 지역 인산 염 버퍼에 민감한 이기도 합니다. 따라서, 클러스터 출시 영향을 미치는 조건 concomitantly 공명 철 그의 기여와 함께 지역에서 라만 스펙트럼에 영향을 미칠 여기 표시 됩니다. 이러한 결과 지원 가설 Fe-N(His87) 상호 작용 생리 적 pH 범위 내에서 변조이 변조 Mitoneet의 기능에 중요 한 있을 수 있습니다.
청소년 Retinoschisis의 유전 및 임상 평가입니다
청소년 retinoschisis RS1 유전자 돌연변이 의해 발생 하는 드문 망막 위축 이다.(1) 임상 시험 및 분자 테스트 확실히 그들 중 하나 했다 미국에서 이전에 보고 된 새로운 돌연변이 2 남성 유아에서 청소년 retinoschisis 진단. 유전자 검사 유아에이 진단을 확인 하는 가장 간단한 방법은 수 있습니다.
단일 항목을 사용 하 여 Transconjunctival 20 게이지 갈 거 예요 플 래 나 Vitrectomy Cannulated Sutureless 시스템
갈 거 예요 플 래 나 vitrectomy cannulated 20 게이지 transconjunctival sutureless (TCS) 시스템으로 어떤 추가 휴대용 장비를 구입 하지 않아도 경제적 이점은 더 작은 게이지 vitrectomy 시스템의 장점 결합의 가능성이 있다. 그러나, sclerotomy 크기는 훨씬 더 큰 및 밀폐 sclerotomies 생성 하기 더 어려울 수 있습니다. 따라서, sclerotomy 20 게이지 TCS vitrectomy 수행한 후 봉합 하는 필요를 평가 했습니다.
Azurin 돌연변이에 급진적인 안정적인 트립토판의 공명 라만 특성
트립토판 래 디 칼 중재 생물 전자 및 촉매 프로세스에서 중요 한 역할을 합니다. 여기에, 우리는 볼 수 고용 및 자외선 공명 라만, EPR, 및 흡수 분광학 pH/동위 원소 연구 및 프로브 중립 폐쇄 셸 트립토판 및 수정된 azurin 단백질에 산화 과격 대응을 계산 합니다. 공명 진동 분석와 함께 과격 하 고 폐쇄 셸 종의 라만 스펙트럼의 비교가 두 트립토판 종 간의 중요 한 구조적 차이 보여준다. 우리는 실험적으로 W3 모드 (주로 C(2)-C(3) 스트레치) 208 cm(-1) downshift 입증 본드 순서는 급진적인 pyrrole 링에 상당한 감소를 관찰 합니다. 산 성 Ph에서 인수 deuterated 버퍼에 스펙트럼의 분석 하이라이트는 라 디 칼의 수소 결합 환경에 민감한 그 진동 모드. Deuterated 버퍼에 의해 발생 하는 가장 중요 한 변화는 45 cm(-1) downshift indole 질소 변위 모드 (W17)의. 우리의 스펙트럼 급진적인 종 산 성 환경에서 특히 강한 수소 결합 수락자는 증거를 제공 합니다. 또한, 급진적인이 트립토판에 대 한 pK(a) 되어야 합니다 미만의 4.0 l-트립토판 수성 솔루션에 대 한 이전에 보고 된 값 아래로 떨어지면 하는. 급진적인 트립토판의 표준 모드 지정 특성화 지역 환경, 나 란, 수소 결합, 그리고 단백질 내의 protonation 상태 도움말.
초점/그리드 Photocoagulation 및 Intravitreal Triamcinolone 당뇨 황 반 부 종에 대 한 비교 무작위 재판의 3 년 속 행
방부 제 없는 intravitreal triamcinolone 당뇨 황 반 부 종 치료를 위한 초점/그리드 photocoagulation에 비해 1 mg을 4 mg 투여 평가 무작위로 재판에 참여 한 환자의 3 년 결과 보고.
선택적 항균 액션 황색 Epidermidis, 피부의 정상 상주에서에서 파생 된 페 놀 성 Modulins에 의해 제공 됩니다
항균 성 펩 티 드 침입 박테리아 및 바이러스 등 미생물에 대 한 타고 난 면역 방어의 첫 번째 라인으로 제공 합니다. 이 연구에서 우리는 펩 티 드 epidermidis 인간의 피부, 황색의 정상적인 미생물 주민에 의해 생산 가설, 항균 성 방패로 고 수도 있습니다 상피 인터페이스에서 정상적인 방어에 기여. 우리 표시 원형 黄 및 트립토판 분광학에 의해 그 페 놀 수용 성 modulins (Psm) 감마 및 델타 S. epidermidis 제작한 알파 나선형 성격과 강한 지질 막 작용 청각-37 등 포유류 앰프와 비슷합니다. 직접 두 Psm 지질 기 누설 유도 하 고 포도 상 구 균 등 피부 병원 균에 대 한 선택적 항균 행동을 발휘. Psm 기능적으로 서로와 청각-37 항균 행동을 향상 시키기 위해 협력. 또한, Psm 감소 그룹 A 연쇄 상 구 균 (가스) 하지만 마우스 피부에 S. epidermidis 생존 하지. 따라서, 이러한 데이터 S. epidermidis, PSMgamma 및 Psmdelta의 생산 선택적으로 정상적인 피부 미생물을 유지 하면서 피부 병원 균의 생존을 억제 함으로써 피부 면역 방어를 혜택을 수 있는 것이 좋습니다.
황색 Epidermidis 항균 델타-독 소 (페 놀 수용 성 Modulin-감마) 호스트 그룹 A 연쇄 상 구 균을 죽 일 항균 성 펩 티 드와 협력
항균 성 펩 티 드 병원 균에 대 한 호스트 방어에 중요 한 역할을 담당할. 최근 포도 상 구 균의 epidermidis (S. epidermidis)에서 페 놀 성 modulins (Psm) 단지, 형태와 지질 세포 막 상호 작용 하는 항균 활성을 발휘을 표시 했다. 풍요로 움과 피부 상주 S. epidermidis innocuity을 바탕으로, 우리가 그들의 Psm 호스트 방어에 기여 가설. 여기 S. epidermidis 델타-독 소 (PSMgamma)은 표 피와 띄엄띄엄 기술을 사용 하 여 인간의 피부의 진 피에 정상적으로 존재 하는 것이 살펴보겠습니다. 합성 델타 독 소 호 세포 외 트랩 (그물)와 상호 작용 하 고 또한 인간 호 중구에서 그물 형성을 유도 하는 동안 cathelicidin와 함께 colocalized. 항균 성 분석 실험에 대 한 그룹 A 연쇄 상 구 균 (가스), 델타 독 쥐가, hBD2, Hbd3와 협력. 전체 혈액에서 델타-독 소의 추가 가스, bacteriostatic 효과 발휘 하 고 델타-독 소 그물에이 병원 체에 대 한 그들의 살해 능력을 증가. Coimmunoprecipitation 및 트립토판 분광학 호스트 항균 성 펩 티 드 LL-37, 쥐가, hBD2, 및 hBD3 델타 독 소의 직접 바인딩을 보여 줍니다. 마지막으로, 상처를 마우스 모델에서 가스 생존 (Mip 2 cytokine 수준) 함께 감소 했다 때 상처와 델타-독 소 pretreated 했다. 따라서, 이러한 데이터 S. epidermidis 파생 된 델타 독 펩 티는 호스트 파생 된 항균 드 중요 한 인간의 세균성 병원 체의 생존을 줄이기 위해 타고 난 면역 체계에서와 협력 제안.
Azurin에서 Photogenerated 트립토판 래 디 칼의 분 비교: 지역 환경 및 구조의 효과
트립토판 래 디 칼 중재 생물 전자 전송에 중요 한 역할을 합니다. 우리는 photogeneration의 급진적인 수명이 긴, 중립 트립토판 (Az48W *) azurin의 소수 핵심에서 네이티브 잔류물 트립토판-48에서 보고합니다. 광 흡수, 전자 기존 공명 및 공명 라만 스펙트럼 강력 하 게 중성 라 디 칼의 형성을 지원 하 고 데이터 트립토판과 copper(II) 센터 간의 직접적인 전자 전송에 일치 하는. 그 지역 환경에 민감한 트립토판 래 디 칼의 서명을 식별 하 108 위치의 이전에 공부, 용 매에 노출 된 급진적 수명이 긴 Az48W * 종의 스펙트럼 비교 됩니다. Az48W * 흡수 맥시 마 nonpolar 환경에서 약 23 nm hypsochromic shift를 표시합니다. 공명 라만 주파수는 강도에 솔벤트 노출 급진적인, 그리고 큰 변화를 기준으로 약 7 cm(-1)에 의해 downshifted의 대부분은 몇 가지 모드에 대 한 관찰. 공명 라만 여기 Az48W * 흡수 봉투 내에서 최대 전시 별개의 프로필. 전자 기존 공명 분광학 초 커플링;에 기인한 부분적으로 해결 된 선 스펙트럼 생성 매장 및 용 매에 노출 된 래 디 칼의 결합 상수 차이 주로 구조의 변형에 의해 발생 합니다. 전자, 진동, 그리고 자기 공명 분광학에 의해 얻은 통찰력 향상 급진적인 속성에 단백질 환경의 영향에 대 한 우리의 근본적인 이해. Azurin과 약 5 x 시민권이 s(-1)의 deprotonation 내에서 양성자 이동 통로 대 한 가설을 제안 했다.
인구 통계 학적 변화와 레이저 조산의 임계값 망막 질환의 치료에 대 한 응답: 10 년 경험
간접 다이오드 레이저 처리 임계값 망막 질환에 대 한 조산 (ROP)와 인구 통계 학적 변화 관찰 10 년 이상 보고서의 결과 평가.
표준 치료 Vs 코르 티 코 스테로이드 망막 정 맥 폐색 (점수)에 대 한 입체 컬러 색맹 사진과 Fluorescein 조 평가 시스템 연구: 점수 연구 보고서 9
설명 하는 절차와 입체 컬러 색맹 사진과 fluorescein 조 점수 연구에서 참가자의 등급에 대 한 재현성.
멤브레인 단백질 폴딩에 트립토판 지질 작용 자외선 공명 라만 형광 분광학에 의해 조사
멤브레인 단백질의 방향족 아미노산 지질 물 인터페이스에서 농축 됩니다. 접는에 트립토판의 역할과 핵심 막 단백질의 안정성 자외선 공명 라만 및 형광 분광학 조사입니다. 우리 모델 시스템, β-배럴 바깥쪽 막 단백질 (OmpA)를 조사 하 고 계면 트립토판 잔류물을 중심으로 (trp 7, trp-170, 또는 trp 15) 지질 bilayer 또는 β-통 기 공 (trp-102)의 내부에 초점을. OmpA 돌연변이 (Trp-170) 170 nonnative 위치의 단일 트립토판 잔류물 또는 네이티브 위치 7 (Trp-7) 9.4와 6.7 kcal/mol의 denaturant의 부재에 각각 전개의 깁스 자유 에너지와 최고의 안정성을 전시 한다. 이러한 돌연변이 2.6 kcal/mol. 자외선 공명 Trp-170, Trp 7의 라만 스펙트럼 체계적인 변화 hydrophobicity 및 수소 결합 표식에 의해 입증 접는 반응 동안 nonpolar 환경에서 수소 결합의 진화 계시의 전개의 자유 에너지 전시 OmpA 트립토판 없는 돌연변이 보다 더 안정적입니다. 이러한 관측 수소 결합 수락자 지질 acyl 닐 그룹 이며이 상호 막 단백질 안정화에 크게 기여 하 고는 것이 좋습니다. 다른 스펙트럼 변경 위치 15, 트립토판 잔류물에 대 한 관찰 되 고 이러한 수정 ∼2 kcal/mol에 의해 intraprotein 수소 결합 보다 더 안정화는 트립토판 지질 양이온-π 상호 작용의 개발에 할당 됩니다. 예상 대로, β-통 기 공 내부를 향해 지향 트립토판 잔류물에 대 한 지질 단백질 상호 작용에 대 한 증거가 없다. 이러한 결과 지질 단백질 상호 작용의 중요성을 강조 하 고는 bilayer 막 단백질 폴딩에 대 한 소수 성 환경 보다 더 제공 합니다 나타냅니다. 대신, 지원 지질 막 단백질 폴딩 및 안정화의 패러다임을 채택 해야 합니다.
EPR 700 G H Z에 의해 트립토판 래 디 칼의 수소 결합
Redox active tryptophans 생물 전자 전송 및 redox 생화학에서 중요 하다. 단백질 protonation 상태 및 수소 결합 강도 제어를 통해 트립토판의 전자 전송 속도 론 및 산화 환 원 전위를 조정할 수 있습니다. 우리는 두 명의 중립 트립토판 (용 매에 노출 된 표면에 trp108와 Trp48 소수 코어에 묻혀)에 래 디 칼 두 azurin 변종의 로컬 환경 검사. 700 G h z 및 25 T 초고 필드 EPR 분광학 두 래 디 칼의 g tensors의 주요 구성 요소 모두의 완전 한 해결을 허용 하 고 g 텐서 anisotropies에 큰 차이가 밝혀. (2) H ENDOR 스펙트럼 및 지원 DFT 계산 스펙트럼 g 텐서 이방성 indole 질소를 수소 결합의 힘 뿐만 아니라 존재 또는 부재의 직접 진단 보여줍니다. 방법은 식별 및 트립토판 지원 전자 전송 규칙 및 단백질에 트립토판 중재 redox 화학에서 중요 한 수소 채권 특성화를 위한 강력한 것입니다.
Photodynamic 치료 스테로이드 관련 중앙 액 Chorioretinopathy에 대 한
Photodynamic 치료 (PDT)의 스테로이드 관련 만성 또는 재발 성 중앙 액 chorioretinopathy (CSC)의 단기 효능 평가.
멤브레인 단백질 접기의 프로브로 Förster 공명 에너지 전달
Β-배럴당 막 단백질 외부 막 단백질 (OmpA)의 접는 반응 Förster 공명 에너지 전송 (무서 워) 실험 조사 이다. Ompa의 4 명의 돌연변이 기증자 fluorophore, 트립토판와 수락자 분자, 탈 파생 접는 이벤트 중에 bilayer 뿐만 아니라 단백질 기 공 거리의 진화를 보고 단백질의 여러 위치에 배치 됩니다 생성 된. FRET 효율 분석 삽입과 관련 된 합성 bilayer로 접는 3 차 구조 변경에 대 한 세 가지 timescales를 보여준다. 삽입, bilayer 통과 뒤의 초기 단계 동안 좁은 기 공 양식. 마지막으로, 긴 시간 구성 요소 할당 평형과 휴식, 하 하와 모 공 확장 및 스트랜드 확장과 같은 세계적인 변화를 포함할 수 있습니다. 이 결과 공동된 삽입 및 접는 이벤트를 설명 하는 기존 모델을 증강 하 고 막 단백질 접는의 복잡 한 메커니즘에 대 한 통찰력을 제공 하기 무서 워의 능력을 강조. 이 문서는 자격이 특집의 일부입니다: 막 단백질 구조와 기능.
