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Methodenartikel

Adenofection: eine Methode zur Untersuchung der Rolle von molekularen Chaperonen in Cellular Morphodynamik von Depletion-Rettungs-Experimente

7.5K Aufrufe

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DOI:

10.3791/54557

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16. September 2016

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In diesem Artikel

Zusammenfassung

Wir beschreiben eine Methode für Depletion-Rescue-Experimente, die die zelluläre Integrität und Proteinhomöostase bewahrt. Die Adenofektion ermöglicht funktionelle Analysen von Proteinen innerhalb biologischer Prozesse, die auf fein abgestimmter Aktin-basierter Dynamik beruhen, wie z. B. mitotische Zellteilung und Myogenese, auf Einzelzellebene.

Zusammenfassung

Zelluläre Prozesse, wie beispielsweise die Mitose und Zelldifferenzierung werden durch Änderungen in der Zellform bestimmt, die auf die richtige Remodellierung der Zell Zytoskelettstrukturen weitgehend verlassen. Dabei wird die Montage-Demontage von höherer Ordnung makromolekulare Strukturen zu einem bestimmten Zeitpunkt und Ort, ein Vorgang, der besonders empfindlich gegenüber Störungen durch die Überexpression von Proteinen verursacht wird. Methoden, die Protein-Homöostase und aufrechtzuerhalten in der Nähe zu normalen Zellmorphologie sind höchst wünschenswert, um zu bestimmen die funktionelle Beitrag eines Proteins von Interesse in einer Vielzahl von zellulären Prozessen erhalten kann. Transient Verarmungsrettungsversuche auf Basis von RNA-Interferenz sind leistungsfähige Ansätze Proteinfunktionen und strukturellen Anforderungen zu analysieren. Allerdings Wiedereinführung des Zielproteins mit minimalen Abweichung von seiner physiologischen Ebene ist eine echte Herausforderung. Hier beschreiben wir eine Methode genannt adenofection das entwickelt wurde, um die Rolle von molekularen Chaperonen zu studieren eind Partner in dem normalen Betrieb von sich teilenden Zellen und die Beziehung mit Aktin-Umbildung. HeLa-Zellen wurden von BAG3 verarmt mit siRNA-Duplexe die 3'UTR Region abzielt. unter Verwendung von rekombinanten Adenoviren gekoppelt Transfektionsreagenzien GFP-markierten BAG3 Proteine ​​wurden gleichzeitig in> 75% der Zellen wieder eingeführt. Adenofection aktiviert BAG3-GFP-Proteine ​​bei nahezu physiologischen Konzentrationen in HeLa-Zellen verarmt BAG3, in Abwesenheit eines Stressreaktion auszudrücken. Es wurde keine Wirkung auf den Ebenen der endogenen Heat Shock Protein Chaperone beobachtet, den Stress-induzierbaren Regulatoren der Protein-Homöostase. Weiterhin kann durch Baculoviren Antreiben der Expression von fluoreszierenden Markern zum Zeitpunkt der Zell Transduktion-Transfektion Zugabe konnten wir mitotischen Zelldynamik durch Zeitraffer mikroskopische Analysen sezieren mit minimaler Störung der normalen mitotischen Progression. Adenofection ist auch auf schwer zu Infect Mauszellen, und geeignet für die funktionelle Analyse von Myoblasten differenzierung in Myotuben. So bietet adenofection eine vielseitige Methode Struktur-Funktion in sensiblen biologischen Prozessen beteiligten Proteine ​​Analysen durchzuführen, die auf höherer Ordnung Dynamik des Zytoskeletts verlassen.

Einleitung

Funktionelle Inaktivierung der Genexpression in Säugerzellen ist der Goldstandard Proteinfunktionen zu sezieren. Neu entwickelte Technologien der Genom Bearbeitung 1,2 kurz über die Verwendung von ortsspezifischen Nukleasen wie Zink-Finger - Nukleasen und gruppierten regelmäßig voneinander beabstandete Palindrom Wiederholungen (CRISPR) / CAS9 erlauben nun die Generierung von Zelllinien mit gezielten Gen - Deletion und Mutation basiert. Diese neuen Ansätze sollten revolutionieren die Art, wie wir die Proteinfunktion und unser Verständnis der Genetik von Krankheiten beim Menschen studieren. In einigen Fällen ist nicht wünschenswert, langfristige oder vollstä....

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Protokoll

1. Herstellung von Medium und Lösungen (alle steril filtriert)

  1. C2C12 Maus Muskelzellen (Differenzierung Studien)
    1. Bereiten Sie 500 ml Wachstumsmedium für C2C12 Zellkulturpflege: DMEM Hohe Glucose, ergänzt mit 10% FBS und 2 mM L-Glutamin.
    2. Bereiten Sie 100 ml Differenzierungsmedium (DM) für C2C12 Differenzierung: DMEM mit hohem Glucose ergänzt mit 2% Pferdeserum.
  2. HeLa - Zellen (Studien in mitotischen Zellen)
    1. Bereiten 500 ml & agr; MEM für HeLa RFP-H2B Zellkulturerhaltungs und Experimente: & agr; MEM mit 10% FBS ergänzt und 2 mM L-Glutamin (& agr; MEM 10%).<....

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Ergebnisse

Transfektion von BAG3-GFP - Plasmid - DNA unter Verwendung von kationischen Lipiden mit heterogenen Expression assoziiert in HeLa - Zellen einige Zellen zeigt kaum nachweisbaren Mengen des Proteins und andere Lager sehr hohe BAG3 Ebenen (2A). In diesen Zellen, Proteinverlust Homöostase wurde durch Akkumulation von BAG3-GFP nachgewiesen in perinukleären Aggregate (2A, Pfeile). Im Gegensatz dazu Zelltransduktion mit Adenoviren BAG3-GFP tragen zeigte homoge.......

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Diskussion

Hier beschrieben wir ein Verfahren ermöglicht Verarmungsrettungsexperimente durchgeführt werden, die funktionelle Analyse von zellbiologischen Prozessen anwendbar ist, die besonders empfindlich auf eine Überexpression von Proteinen, die Stöchiometrie und die Dynamik von Proteinkomplexen und makromolekulare Strukturen zu beeinträchtigen. Mitotischen Zellteilung ist ein extremes Beispiel für fein abgestimmte Zelle Morphodynamik, die die dramatische und spektakuläre Veränderungen in der Gesamtstruktur einer Zelle beinhalte.......

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Offenlegungen

Die Autoren haben nichts offenzulegen.

Danksagungen

Diese Arbeit wurde unterstützt von den Canadian Institutes of Health Research (Grant Nr. 7077), sowie von der Bellini Foundation und Roby Fondazione.

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Materialien

Liste der in diesem Artikel verwendeten Materialien
NameUnternehmenKatalognummerKommentare
C2C12 Maus MyoblastenATCCCRL-1772
Adenovirus kundenspezifisches DesignWelgenkundenspezifisches
Design CalciumchloridFisher ScientificC79-500
CellLight® Actin-GFP, BacMam 2.0Thermo FisherC10582
CellLight® Tubulin-RFP, BacMam 2.0Thermo FisherC10614
Dulbecco' s modifizierter Eagle" s medium (DMEM), High GlucoseThermo Fisher11965-092
EDTASigmaE5134
Fetal Bovine Serum (FBS)Thermo Fisher12483-020
FibronectinSigmaF1141
Glasbodenschalen, 35 mmMatTek CorperationP35G-1.5-20-C Case
HeLa-RFP-H2BFreundliches Geschenk von Dr. Sabine Elowe, Qué bec, KanadaKlebig C et al. 2009
HEPESFisher ScientificBP310-1
Pferdeserum, NeuseelandThermo Fisher16050-122
KClFisher ScientificBP366-500
L-GlutaminThermo Fisher25030081
Lipofectamine® RNAiMAX TransfektionsreagenzThermo Fisher13778-150
Minimal essentielles Medium (MEM) AlphaWisent310-101-CL
Minimal essentielles Medium (MEM) Alpha ohne Desoxyribonuleoside/RibonukleosideThermo Fisher12000-022
Minimal essentielles Medium (MEM) Alpha ohne PhenolrotThermo Fisher41061-029
Na2HPO4BiobasicS0404
NaClFisher ScientificBP358-10
OptiMEMThermo Fisher11058-021
rAVCMV-LifeAct-TagGFP2IBIDI60121
siRNA DuplexeDharmaconCustom design
ThymidinSigmaT9250
Trypsin 2,5%Thermo Fisher15090-046

Referenzen

  1. Urnov, F. D., Rebar, E. J., Holmes, M. C., Zhang, H. S., Gregory, P. D. Genome editing with engineered zinc finger nucleases. Nat Rev Genet. 11 (9), 636-646 (2010).
  2. Hsu, P. D., Lander, E. S., Zhang, F. Development and applications of CRISPR-Cas9 for genome engineering. Cell. 157

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Nachdrucke und Genehmigungen

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