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Immunology and Infection

Generation von Knock-out-Grund- und erweiterten menschlichen NK-Zellen mit Cas9 Ribonucleoproteins

Published: June 14, 2018 doi: 10.3791/58237

Summary

Hier präsentieren wir Ihnen ein Protokoll zur primären oder erweiterten menschlichen natürlichen (NK) Killerzellen mit Cas9 Ribonucleoproteins (Cas9/RNPs) genetisch zu verändern. Mithilfe dieses Protokolls erzielten wir menschliche NK-Zellen für Umwandlung Wachstumsfaktor-b-Rezeptor 2 (TGFBR2) und Hypoxanthin-Phosphoribosyltransferase 1 (HPRT1) mangelhaft.

Abstract

CRISPR/Cas9 Technologie beschleunigt sich Genom-Technik in vielen Zelltypen, aber so weit gen Lieferung und stabile gentechnische Veränderung im primären NK-Zellen herausfordernd gewesen. Transgen-Lieferung mit Lentivirale oder retrovirale Transduktion führte beispielsweise in einer begrenzten Ausbeute von gentechnisch NK-Zellen durch erhebliche Verfahren verbundenen NK Zelle Apoptose. Wir beschreiben hier eine DNA-freie Methode für Genom-Bearbeitung von menschlichen Grund- und erweiterten NK-Zellen mit Cas9 Ribonucleoprotein komplexe (Cas9/RNPs). Diese Methode erlaubt effiziente ko von TGFBR2 und HPRT1 Gene in NK-Zellen. RT-PCR-Daten zeigten eine signifikante Abnahme der Gen-Expression-Ebene, und ein Zytotoxizität Assay eines repräsentativen Zelle Produkts vorgeschlagen, dass die RNP-modifizierte NK-Zellen weniger empfindlich auf TGFβ wurde. Genetisch veränderte Zellen möglicherweise erweiterte Post-Elektroporation durch Stimulation mit bestrahlten mbIL21 exprimierenden Feeder-Zellen.

Introduction

Krebs-Immuntherapie wurde in den letzten Jahren vorgebracht worden. Genetisch veränderte chimeric Antigen-Rezeptor (Auto)-T-Zellen sind ein hervorragendes Beispiel von veränderter Immunzellen erfolgreich in Krebsimmuntherapie eingesetzt. Diese Zellen wurden vor kurzem genehmigt durch die FDA für die Behandlung gegen CD19 + B-Zell-Tumoren, aber Erfolg ist bisher beschränkt sich auf Krankheiten, die mit ein paar Aktionsleisten Antigene und targeting so begrenzten Antigen Repertoire ist anfällig für Fehler durch immun Flucht. Darüber hinaus haben Auto-T-Zellen auf die Verwendung von autologen T-Zellen wegen der Gefahr der Graft - Versus - Host-Seuche verursacht durch allogenen T-Zellen konzentriert. Im Gegensatz dazu, NK-Zellen sind in der Lage, Tumor Zielen auf ein Antigen-unabhängige Weise zu töten und verursachen keine GvHD, wodurch sie einen guten Kandidat für Krebs Immuntherapie6,7,8,9.

CRISPR/Cas9 Technologie wurde vor kurzem in engineering Immunzellen verwendet, aber genetisch Umprogrammierung NK-Zellen mit Plasmiden seit jeher schwierig. Dies wurde aufgrund von Schwierigkeiten bei Transgen Lieferung in einer DNA-abhängigen Weise wie Lentivirale und retrovirale Transduktion verursacht erhebliche Verfahren verbundenen NK Zelle Apoptosis und der begrenzten Produktion gentechnisch NK-Zellen-4 , 9.

Viele angeborene immune Zellen express hohes Maß an Rezeptoren für Pathogen-assoziierte molekulare Muster wie Retinoic Säure-induzierbaren gen ich (RIG-ich), die es ermöglichen erhöhte Anerkennung von Fremd-DNA. Unterdrückung dieser Wege hat höhere Effizienz der Transduktion in NK-Zellen aktiviert, bei Verwendung von DNA-basierten Methoden für gentechnische Veränderung10.

Hier beschreiben wir die Methode für die Verwendung einer DNA-freie-Genom-Bearbeitung von primären und erweiterten menschlichen NK-Zellen unter Verwendung Cas9 Ribonucleoprotein komplexe (Cas9/RNPs). Cas9/RNPs besteht aus drei Komponenten, rekombinante Cas9 Protein komplexiert mit synthetischen Single-Guide RNA, bestehend aus einem komplexierten CrRNA und TracerRNA. Diese Cas9/RNPs sind in der Lage Spalten genomische Ziele mit einem höheren Wirkungsgrad im Vergleich zu ausländischen DNA-abhängige Ansätze aufgrund ihrer Lieferung als funktionelle komplexe. Darüber hinaus kann schnelle Abfertigung von Cas9/RNPs aus den Zellen der Ziel-Effekte wie Induktion der Apoptose reduzieren. So dienen sie Durchbrüche oder Knock-ins für homologe Rekombination6,7in Kombination mit DNA zu erzeugen. Wir haben gezeigt, dass Elektroporation von Cas9/RNPs ist eine einfache und relativ effiziente Methode, die die bisherigen Einschränkungen der gentechnischen Veränderung in NK-Zellen überwindet.

TGFβ ist eine große immunsuppressive Cytokine, die die Aktivierung und Funktionen von NK-Zellen hemmt. Es wurde vermutet, dass targeting TGFβ Weg Immunzelle Funktionen erhöhen kann. Wir gezielt die Region Codierung TGBR2 ektodomäne die bindet TGFβ11. Die repräsentativen Ergebnisse zeigen einen deutlichen Rückgang der Ebene der mRNA Expression dieses Gens und weiteren zeigen, dass die veränderten NK-Zellen gegen TGFβ resistent geworden. Darüber hinaus behalten die veränderten Zellen Lebensfähigkeit und proliferative Potential, wie sie in der Lage, erweiterte Post-Elektroporation mit bestrahlten Feeder-Zellen. Daher die folgende Methode ist ein vielversprechender Ansatz zur NK-Zellen genetisch manipulieren, für jeden weiteren klinischen oder wissenschaftliche Zwecke.

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Protocol

Gesunden Spenders buffy Coats wurden als Quellenmaterial aus dem Central Ohio Region amerikanischen Roten Kreuz erhalten. Diese Forschung war entschlossen, ausgenommen Forschung werden durch die institutionelle Review Board der bundesweit Kinderkrankenhaus.

1. menschliche NK Zelle Reinigung und Ausbau

  1. PBMCs von Buffy Coat12isolieren.
    1. 35 mL buffy Coat Probe auf 15 mL Ficoll-Paque Schicht.
    2. Zentrifugieren bei 400 X g für 20 Minuten ohne Bremse und sammeln die PBMC aus der Schnittstelle.
    3. Die wiederhergestellten PBMCs dreimal durch Zugabe von mindestens ein gleiches Volumen an PBS waschen, waschen Sie für 5 Minuten bei 400 X g zentrifugieren und Absaugen der PBC. NK-Zellen kann in diesem Stadium von RosettesSep13isoliert werden.
  2. Erweitern von NK-Zellen durch die Stimulierung mit bestrahlten 10 x 106 mbIL21 exprimierenden Feeder-Zellen am Tag 0, 7 und 14. Ersetzen Sie Medien mit frischen RPMI mit 10 % FBS, 1 % Glutamin, 1 % Penicillin-Streptomycin und 100 IU/mL von Il-2 für die gesamte Medienlautstärke jeden zweiten Tag.

2. gRNA Design und Auswahl

  1. Wählen Sie die spezifische genomic Loci Ziel mit online-Tools, z. B. NCBI, Ensemble.
    Beispiel.
    Beschreibung: Transforming Wachstumsfaktor-Beta-Rezeptor 2 (TGFBRR2) ektodomäne
    Datensatz anzeigen: PF08917
    InterPro anzeigen: IPR015013
    Position: 49 157 aa
    Gezielte Abfolge: Exon 4 des TGFBR2-Gen (ENSG00000163513)
  2. Um die gRNAs zu entwerfen, nutzen Sie CRISPR-Design-Web-Tools wie http://crispr.mit.edu und "Benchling."
    1. Geben Sie in die DNA-Sequenz in Schritt 2.1ausgewählt. Wählen Sie Menschen (hg 19) als ein Ziel-Genom. CRISPR-Führer (20 Nukleotiden gefolgt von einer PAM-Sequenz: NGG) wird aus der zuvor eingegebene Sequenz gescannt werden. Es zeigt auch mögliche Ziel Übereinstimmungen in den ausgewählten Genom.
    2. Wählen Sie die besten drei gRNAs, die die höchste Punktzahl, basierend auf ihre Ziel- und Ziel-Preise haben. Tabelle 1 zeigt beispielsweise der gestalteten CRISPR-RNAs auf Exon 4 des TGFBR2-Gen vorgeschlagen von CRISPR-Design-Web-Tools.
  3. Reihenfolge der CRISPR-RNAs als synthetische Sequenz-spezifische CrRNAs.
  4. Bestellen Sie eine erhaltene transactivating RNA (TracrRNA) durch partiellen Homologie mit dem CrRNA zu interagieren.

3. Design löschen Screening-Primer

  1. Design-Primer überspannt die gRNA spaltstellen für T7E1 Mutation Assay.
  2. Einsatz Primer mindestens 100 bp Weg von den vorhergesagten spaltstelle kleine einfügen-Löschung (Indels) an der SgRNA-Ziel-Site sicherzustellen wird auf 1,5 % Agarosegel nach der Mutation Assay angezeigt. Tabelle 2 zeigt die Primer, die verwendet werden, um die TGFBR2 ektodomäne zu verstärken.

(4) Transduktion von menschlichen Grund- und erweiterten NK-Zellen

Hinweis: Transduktion von Cas9/RNPs Elemente in NK erfolgt durch Elektroporation mit 4D System wie folgt.

  1. Zelle Vorbereitung
    1. Für primäre NK-Zellen, 4 Tage frisch isolierte NK-Zellen in RPMI Medium in Anwesenheit von 100 IE/mL von Il-2 inkubieren und führen die Elektroporation an Tag 5. Ersetzen Sie die Medien täglich, wie zuvor und am Vortag Transduktion beschrieben.
    2. Für erweiterte NK-Zellen, stimulieren die Zellen am Tag 0 mit bestrahlten Feeder-Zellen in einem Verhältnis von 1:1 und die Elektroporation am Tag 5 oder 6 oder 7 durchführen. Ersetzen Sie die Medien täglich, wie zuvor und am Vortag Transduktion beschrieben.
    3. Am Tag der Elektroporation bereiten Sie ein T25-Fläschchen gefüllt mit 8 mL frisches RPMI, enthält 100 IE/mL von Il-2 für Zellen Electroporation und Pre incubate Fläschchen in einem befeuchteten 37 ° C und 5 % CO2 Inkubator.
      Hinweis: Aufgetauten Zellen oder Zellen, die 2Nd oder 3rd Stimulation durchlaufen haben können elektroporiert jederzeit nach ihrer Genesung wie beschrieben werden.
    4. Nehmen Sie 3 bis 4 × 106 Zellen pro Bedingung für 26 µL Transduktion Mix.
      Hinweis: Sehr hoher Konzentration von NK-Zellen in Elektroporation Lösung verbessert die Transduktion Rate.
    5. Waschen Sie die Zellen 3 Mal mit PBS, alle FBS zu entfernen die häufigsten RNase Aktivität enthält. Drehen sie jedes Mal bei 300 X g für 8 Minuten.
      Hinweis: Betrachten Sie 7 Elektroporation Bedingungen für Cas/RNPs als einzigen gRNA (gRNA1, gRNA2, gRNA3) und eine Kombination von zwei gRNAs (gRNA1 gRNA2, gRNA1 gRNA3, gRNA2 + gRNA3) und ein Steuerelement mit keine Cas9/RNPs.
  2. Bilden die CrRNA:tracerRNA / Komplex
    1. CrRNAs (gRNA1, gRNA2 und gRNA3) und TracerRNA in 1 x TE Lösung Endkonzentrationen von 200 μM aufzuwirbeln. Mix-2.2 μL von jeweils 200 μM gRNA mit 200 μM TracerRNA wie in Tabelle 3dargestellt.
    2. Erwärmen Sie die Proben bei 95 ° C für 5 min und auf den Tisch auf Raumtemperatur (15-25 ° C) abkühlen lassen. Shop Nukleinsäuretablette RNAs und CrRNA: TracerRNA/Komplex bei-20 ° C für die spätere Verwendung.
  3. Bilden Sie die RNP-Komplex
    Hinweis:
    um Zeit zu sparen, bilden komplexe während des Waschens RNP Schritt 4.1.5.
    1. Verdünnen Sie für einzelne CrRNA:tracrRNA duplex Reaktion Cas9 Endonuklease, 36 μM wie im Beispiel in Tabelle 4gezeigt.
    2. Für Kombination Transduktion von CrRNA:tracrRNA Maisonetten, verdünnen Cas9 Endonuklease, 36 μM, wie im Beispiel gezeigt Tabelle 5.
    3. Hinzufügen Cas9 Endonuklease CrRNA:tracrRNA Duplex langsam während der wirbelnden PIPETTENSPITZE, über 30 s bis 1 Minute.
    4. Inkubieren Sie die Mischung bei 15-20 min bei Raumtemperatur. Wenn nicht bereit, die Mischung nach der Inkubation zu verwenden, halten Sie die Mischung auf dem Eis bis zur Verwendung.
  4. Elektroporation
    1. Die gesamte Ergänzung der Elektroporation Lösung P3 hinzufügen und bei Zimmertemperatur aufbewahren.
    2. Aufschwemmen der Zelle Pellet (3 bis 4 × 106 Zellen aus Schritt 4.1.5) in 20 μL der P3 primäre 4D Elektroporation Lösung. Vermeiden Sie Luftblasen beim pipettieren.
      Hinweis: die Zellen sollten nicht für eine lange Zeit in P3 Lösung überlassen werden.
    3. Sofort fügen Sie 5 µL der RNP Komplex (Schritt 4.3 hinzu), die Zellsuspension.
    4. Mischen Sie 1 μL von 100 μM Cas9 Elektroporation Enhancer an die Cas9/RNPs/Zelle hinzufügen.
    5. Cas9/RNPs/Zelle Mischung in 20 μL Elektroporation Streifen zu übertragen.
    6. Klopfen Sie leicht die Streifen um sicherzustellen, dass die Stichprobe die Unterseite der Streifen umfasst.
    7. Starten Sie 4D Elektroporation System und wählen Sie das EN-138 -Programm.

5. Post Transduktion

  1. Lassen Sie die Zellen in den Streifen 3 Minuten ruhen.
  2. Die Küvette 80 µL der Pre äquilibriert Kultur Medien hinzu und übertragen Sie sanft die Probe in Flaschen.
  3. 48 Stunden nach Transduktion, Auszug genomischen DNA aus 5 × 105 Zellen für die Gen-Deletionen screening.
  4. Verstärken Sie das Gen des Interesses unter Verwendung der Zündkapseln in Schritt 3.2 mit Taq-DNA-Polymerase-Kits entwickelt.
  5. PCR-Amplifikate Heteroduplexes für die T7EI Verdauung zu bilden und das Produkt für 30-60 Minuten mit einem T7EI Enzym in 37 ° c inkubieren
    Hinweis: Die T7EI, die Probe wird bevorzugt für das screening, wie es ist schnell, einfach und bietet reinigen Elektrophorese Ergebnisse im Vergleich zur Verwendung von Surveyor-Assay. Aber diese Methode kann nicht erkennen, Einfügungen und Löschungen von < 2 Basen, die durch nicht-homologe Ende verbinden (NHEJ) Aktivität in Cas9 RNPs Experimente14generiert werden.
  6. Führen Sie die verdaute DNA auf 1,5 % Agarosegel bei 110 V für 30-45 Minuten, alle 15 Minuten visualisieren das Gel.
  7. Stimulieren Sie den Rest der Zellen mit den mbIL21-mit dem Ausdruck Feeder-Zellen in einem Verhältnis von 1:1.
  8. Fünf Tage nach der Stimulation extrahieren die RNA für die Gen-Expression-Ebene mit qPCR.
  9. Führen Sie Calcein Assays als zuvor gemeldeten12. Kurz, laden Sie Zielzellen mit Calcein AM (im Beispiel gezeigt, 3 µg/mL/1.000.000 DAOY Zellen diente). Zytotoxizität Assays durch ausruhen über Nacht in IL2 NK-Zellen vorbereiten (100 IE/mL) plus oder minus 10 ng/mL lösliche TGFβ. Führen Sie Calcein Assays in der gleichen Zytokine wie der NK-Zellen über Nacht ausgeruht waren.

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Representative Results

Elektroporation Effizienz

Zur Optimierung der Elektroporation von Cas9/RNPs haben wir 16 verschiedene Programme mit Transduktion von GFP-targeting SiRNA und DNA Plasmid in NK-Zellen getestet. Flow Cytometry Test zeigte, dass die EN-138 den höchsten Anteil an Lebensfähigkeit und Transduktion Zelleffizienz (35 % lebenden GFP positive Zellen) für beide Teilchen (Abbildung 1 und Abbildung 2). Interessanterweise war die Effizienz der Verwendung dieses Programms für Cas9/RNPs Elektroporation höher, da wir 60 % Senkung TGFBR2 mRNA Ausdruck Niveaus (Abbildung 5 sahen). Darüber hinaus könnte die gentechnisch veränderten NK-Zellen gewachsen und erweitert für 30 Tage und kryokonservierten (Daten nicht gezeigt).

Mutation assay

Cas9/RNPs mit gRNA2, gRNA1 + gRNA2 und gRNA3 hatten erfolgreiche TGFBR2 ektodomäne gen Knockout, aber gRNA1 allein nicht machen T7E1 nachweisbar Indels (Abbildung 3). Abbildung 4 zeigt darüber hinaus erfolgreich ko von menschlichen HPRT1 (Hypoxanthin-Phosphoribosyltransferase 1) im erweiterten menschlichen NK-Zellen mit kommerziell gRNAs zur Verfügung gestellt. Nach Band Densitometrie die proportional Indel-Tarife mit gRNA1 + gRNA2 führte zu 34 % Band für TGFBR2 NK-Zellen geändert, 25 % für gRNA3 und 81 % des HPRT Gens modifiziert NK-Zellen.

Gen Ausdruck Ebene assay

Stellvertretend für unser Ergebnis zeigt Abbildung 5 die Wirkung des Cas9/RNPs (gRNA1 + gRNA2) auf mRNA Produktionsniveau von TGFBR2 ektodomäne, mittels RT-PCR analysiert. Wie im Diagramm zu sehen, die mRNA Expression des Gens gezielte deutlich zurückgegangen.

Zytotoxizität

Wie in Abbildung 6zu sehen, nach Inkubation gRNA1 + gRNA2, gRNA2 und gRNA3 modifizierten Cas9/RNPs Zellen mit TGFβ1, zusammen mit DAOY Zellen kultiviert; die veränderten Zellen zeigten signifikanten Rückgang ihrer Zytotoxizität Ebene im Vergleich zur Kontrollgruppe die IL-2 in den Medien über Nacht hatte. Dieses Ergebnis zeigt, dass die Cas9/RNPs geändert Zellen ihre Zytotoxizität Funktion in Anwesenheit von TGFβ1 und zeigt behalten, dass die veränderten Zellen TGFβ1 resistent geworden.

Figure 1
Abbildung 1. Diese Zahlen zeigen die Elektroporation Effizienz von SiRNA und Plasmid DNA GFP in NK-Zellen mit dem EN-138-Programm zum Ausdruck zu bringen. Wie hier zu sehen, ist die NK Zellviabilität 77,5 % und 35 % der lebenden Zellen GFP positiv waren. Bitte klicken Sie hier für eine größere Version dieser Figur.

Figure 2
Abbildung 2. Diese Abbildung zeigt die Rentabilität und Effizienz eines anderen 16 Programme, die für die Elektroporation Optimierung (DN 100) getestet. Bitte klicken Sie hier für eine größere Version dieser Figur.

Figure 3
Abbildung 3. Cas9/RNPs-vermittelten TGFBR2 ko in verbrauchte (a) primäre NK-Zellen (b) T7E1 Mutation Assay gemessen. T7E1 Enzym erkennt und bindet sich nicht übereinstimmende DNA. Jede kleine Band (blaue Pfeile) stellt verdaute DNA-Fragmente, die eine Indel tragen. Bitte klicken Sie hier für eine größere Version dieser Figur.

Figure 4
Abbildung 4. Cas9/RNPs - vermittelte HPRT Störungen im erweiterten NK-Zellen durch T7E1 Mutation Assay gemessen. Bitte klicken Sie hier für eine größere Version dieser Figur.

Figure 5
Abbildung 5. mRNA Ausdruck Ebene des TGFBR2 ektodomäne in CRISPR geändert NK-Zellen durch Cas9/RNPs (gRNA1 + gRNA2) eingeführten mittels RT-PCR. GAPDH diente als eine endogene Steuerung gen. Der Rückgang der RNA Ebenen zeigt eine Störung des TGFBR2-Gen (± SEM bedeuten P Wert < 0,0001). Bitte klicken Sie hier für eine größere Version dieser Figur.

Figure 6
Abbildung 6. a. Die Zytotoxizität Assay anhand einer repräsentativen Stichprobe von Cas9/RNPs geändert (gRNA1 + gRNA2, gRNA2 und gRNA3) NK Zellen zeigt, dass über Nacht Inkubation der Zellen mit TGFβ1 ihre Fähigkeit, DAOY Zellen lysiert nicht deutlich verringert. b. im Vergleich zu nicht veränderten NK-Zellen, die Cas9/RNP modifizierte NK-Zellen (gRNA2 und gRNA3) sind weniger anfällig für TGFβ1 (Mittelwert ± SEM). Bitte klicken Sie hier für eine größere Version dieser Figur.

gRNA Nr. gRNA Sequenz Als synthetische CrRNA bestellt
gRNA1 5 CCCCTACCATGACTTTATTC 3 / AltR1/rArGrUrCrArUrGrGrUrArGrGrGrGrArGrCrUrUrGrGrUrUrUrUrArGrArGrCrUrArUrGrCrU/AltR2 /
gRNA2 5 ATTGCACTCATCAGAGCTAC 3 / AltR1/rArUrUrGrCrArCrUrCrArUrCrArGrArGrCrUrArCrGrUrUrUrUrArGrArGrCrUrArUrGrCrU/AltR2 /
gRNA3 5 AGTCATGGTAGGGGAGCTTG 3 / AltR1/rArG rUrCrA rUrGrG rUrArGrGrGrG rArGrC rUrUrG rGrUrUrUrUrA rGrArG rCrUrA rUrGrCrU/AltR2 /

Tabelle 1. Drei entworfen gRNAs Exon 4 des TGFBR2 ektodomäne als synthetische CrRNA Ziel.

TGFBR 2 ektodomäne Primer FWD 5 GTC TGC TCC AGG TGA TGT TTA T3
TGFBR2 ektodomäne Primer REV 5 GGG CCT GAG AAT CTG KATZE TTA 3

Tabelle 2. Zündkapseln benutzt, um das TGFBR2 ektodomäne gen verstärken

Komponente Betrag (uL)
200 µM crRNA 2.2
200 µM Tracer RNA 2.2
IDTE Puffer 5.6
Endprodukt 10

Tabelle 3. Bilden die CrRNA:tracerRNA / Komplex mit 200 µM RNAs

Komponente Betrag (µL)
PBS 1
CrRNA:tracrRNA duplex (aus Schritt 4.2) 2 (200 Pmol)
Alt-R Cas9 Endonuklease (61 µM lieferbar) 2
Gesamtvolumen 5 ul

Tabelle 4. Verdünnen Sie für einzelne CrRNA:tracrRNA duplex Reaktion Cas9 Endonuklease bis 36 µM.

Komponente Betrag (µL)
PBS 1
CrRNA:tracrRNA duplex (ex. gRNA1) 1 (100 Pmol)
CrRNA:tracrRNA duplex (ex. gRNA2) 1 (100 Pmol)
Alt-R Cas9 Endonuklease 2
Gesamtvolumen 5 ΜL

Tabelle 5. Für Kombination verdünnen Transduktion von CrRNA:tracrRNA Duplex Cas9 Endonuklease bis 36 µM.

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Discussion

DNA-abhängige Änderung der NK-Zellen hat4,9streitig gemacht. Wir, stellten daher direkt eine synthetisch vorgeformten Ribonucleoprotein (RNPs) Komplex und Cas9 Protein als gereinigtes Protein in Grund- und erweiterten NK Zellen8. Diese Methode erlaubte uns, Deckelung, zu beseitigen, Beschatten, und andere transkriptionelle und translationalen Prozesse gestartet durch RNA-Polymerase II, die NK Zelle Apoptose DNA-abhängige Signaltransduktion Methoden zugeordnet verursachen.

Darüber hinaus verwendet die Methode berichtet hier gereinigtes Cas9 Protein komplexiert als Cas9/RNPs, die unmittelbar nach der Elektroporation und werden abgebaut, schnell, dadurch zunehmende zielgerichtet und abnehmende Ziel Effekte über aktuelle Protokolle 5 , 6 , 7 , 16. Darüber hinaus einen neuen Ansatz der Elektroporation um Cas9/RNP transduzieren mit hohem Wirkungsgrad zu optimieren ist ein weiterer entscheidender Schritt vorgestellt, die gelten für andere Gene von Interesse. Diese Methode kann für die Änderung einer größeren Anzahl von NK-Zellen mit im Handel erhältlichen größeren Elektroporation Küvetten (Daten nicht gezeigt) skaliert.

Zusammenfassend kann Cas9/RNPs zur menschlichen Grund- und erweiterten NK-Zellen für die Krebsimmuntherapie unter Verwendung der oben beschriebenen Methode genetisch zu verändern. Unsere Ergebnisse zeigten auch, dass ein erfolgreiche ko von der ektodomäne TGFBR2 -gen führt zu diesen veränderten NK-Zellen immer beständig TGFβ111.

Kombination von RNP Lieferung mit einer Schablone DNA (z. B. natürlich Recombinogenic Adeno-assoziierte Virus (AAV) Spender Vektoren) können ortsspezifische gen Einfügung durch homologe Rekombination3,18,19 .

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Disclosures

DAL dient diente als Berater für Kurier Therapeutics, Obsidian Therapeutics, Intellia Therapeutics, Merck Research Laboratories und Miltenyi Biotec / Eigenkapital/Leitung CytoSen Therapeutics hat.

Acknowledgments

Wir erkennen Brian Tullius für seine freundliche Hilfe bei der Bearbeitung der Handschrift.

Materials

Name Company Catalog Number Comments
RosetteSep™ Human NK Cell Enrichment Cocktail STEMCELL Technologies 15065 The RosetteSep™ Human NK Cell Enrichment Cocktail is designed to isolate NK cells from whole blood by negative selection.
Ficoll-Paque® PLUS GE Healthcare - Life Sciences 17-1440-02
Alt-R® CRISPR-Cas9 tracrRNA Integrated DNA Technologies 1072532 TracrRNA that contains proprietary chemical modifications conferring increased nuclease resistance. Hybridizes to crRNA to activate the Cas9 enzyme
Alt-R® CRISPR-Cas9 crRNA Integrated DNA Technologies Synthetically produced as Alt-R® CRISPR-Cas9 crRNA, based on the sequence of designed gRNA targeting the gene of intrest
Alt-R® Genome Editing Detection Kit Integrated DNA Technologies 1075931 Each kit contains T7EI endonuclease, T7EI reaction buffer, and T7EI assay controls.
Platinum® Taq DNA Polymerase High Fidelity Invitrogen 11304-011
4D-Nucleofector™ System Lonza AAF-1002B
Human recombinant IL-2 Protein Novartis 65483-0116-07
P3 Primary Cell 4D-Nucleofector™ X Kit Lonza V4XP-3032 Contains pmaxGFP™ Vector, Nucleofector™ Solution, Supplement, 16-well Nucleocuvette™ Strips
Non-targeting: Custom siRNA, Standard 0.05 2mol ON-TARGETplus Dharmacon CTM-360019
Alt-R® S.p. Cas9 Nuclease 3NLS Integrated DNA Technologies 1074181 Cas9 Nuclease
DNeasy® Blood & Tissue Handbook Qiagen 69504
RNeasy Mini Kit Qiagen 74104
Calcein AM ThermoFisher C3099
TGFβ Biolegend 580706
Alt-R® CRISPR-Cas9 Control Kit, Human Integrated DNA Technologies 1072554 Includes tracrRNA, HPRT positive control crRNA, negative control crRNA#1, HPRT Primer Mix, and Nuclease-Free Duplex Buffer.
IDTE pH 7.5 (1X TE Solution) Integrated DNA Technologies 11-01-02-02
Alt-R® Cas9 Electroporation Enhancer Integrated DNA Technologies 1075915 Cas9 Electroporation Enhancer

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References

  1. Guven, H., et al. Efficient gene transfer into primary human natural killer cells by retroviral transduction. Experimental Hematology. 33 (11), 1320-1328 (2005).
  2. Alici, E., Sutlu, T., Sirac Dilber, M. Retroviral gene transfer into primary human natural killer cells. Methods in Molecular Biology. 508, 127-137 (2009).
  3. Carlsten, M., Childs, R. W. Genetic Manipulation of NK Cells for Cancer Immunotherapy: Techniques and Clinical Implications. Frontiers in Immunology. 6, 266 (2015).
  4. Mehta, R. S., Rezvani, K. Chimeric Antigen Receptor Expressing Natural Killer Cells for the Immunotherapy of Cancer. Frontiers in Immunology. 283, 9 (2018).
  5. Zuris, J. A., et al. Cationic lipid-mediated delivery of proteins enables efficient protein-based genome editing in vitro and in vivo. Nature Biotechnology. 33 (1), 73-80 (2015).
  6. Wang, M., et al. Efficient delivery of genome-editing proteins using bioreducible lipid nanoparticles. PNAS. 113 (11), 2868-2873 (2016).
  7. Liang, Z., et al. Efficient DNA-free genome editing of bread wheat using CRISPR/Cas9 ribonucleoprotein complexes. Nature Communications. 8, 14261 (2017).
  8. DeWitt, M. A., Corn, J. E., Carroll, D. Genome editing via delivery of Cas9 ribonucleoprotein. Methods. , 9-15 (2017).
  9. Rezvani, K., Rouce, R., Liu, E., Shpall, E. Engineering Natural Killer Cells for Cancer Immunotherapy. Molecular Therapy. 25 (8), 1769-1781 (2017).
  10. Sutlu, T., et al. Inhibition of intracellular antiviral defense mechanisms augments lentiviral transduction of human natural killer cells: implications for gene therapy. Human Gene Therapy. 23 (10), 1090-1100 (2012).
  11. Viel, S., et al. TGF-beta inhibits the activation and functions of NK cells by repressing the mTOR pathway. Science Signaling. 9 (415), (2016).
  12. Somanchi, S. S., Senyukov, V. V., Denman, C. J., Lee, D. A. Expansion, purification, and functional assessment of human peripheral blood NK cells. JoVE. (48), (2011).
  13. Lee, D. A., Verneris, M. R., Campana, D. Acquisition, preparation, and functional assessment of human NK cells for adoptive immunotherapy. Methods in Molecular Biology. , 61-77 (2010).
  14. Vouillot, L., Thelie, A., Pollet, N. Comparison of T7E1 and surveyor mismatch cleavage assays to detect mutations triggered by engineered nucleases. G3. 5 (3), Bethesda. 407-415 (2015).
  15. Eyquem, J., et al. Targeting a CAR to the TRAC locus with CRISPR/Cas9 enhances tumour rejection. Nature. 543 (7643), 113-117 (2017).
  16. Liang, X., et al. Rapid and highly efficient mammalian cell engineering via Cas9 protein transfection. Journal of Biotechnology. 208, 44-53 (2015).
  17. Kim, S., Kim, D., Cho, S. W., Kim, J., Kim, J. S. Highly efficient RNA-guided genome editing in human cells via delivery of purified Cas9 ribonucleoproteins. Genome Research. 24 (6), 1012-1019 (2014).
  18. Chmielecki, J., et al. Genomic Profiling of a Large Set of Diverse Pediatric Cancers Identifies Known and Novel Mutations across Tumor Spectra. Cancer Research. 77 (2), 509-519 (2017).
  19. Schultz, L. M., Majzner, R., Davis, K. L., Mackall, C. New developments in immunotherapy for pediatric solid tumors. Current Opinion in Pediatrics. 30 (1), 30-39 (2018).

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Naeimi Kararoudi, M., Dolatshad, H., More

Naeimi Kararoudi, M., Dolatshad, H., Trikha, P., Hussain, S. R. A., Elmas, E., Foltz, J. A., Moseman, J. E., Thakkar, A., Nakkula, R. J., Lamb, M., Chakravarti, N., McLaughlin, K. J., Lee, D. A. Generation of Knock-out Primary and Expanded Human NK Cells Using Cas9 Ribonucleoproteins. J. Vis. Exp. (136), e58237, doi:10.3791/58237 (2018).

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