Summary
Immunoglobulin G (IgG) N-glycanest caractérisé en utilisant la chromatographie d'interaction hydrophile UPLC. En outre, la structure de IgG N-glycan est clairement séparée. Présenté ici est une introduction à cette méthode expérimentale afin qu'il puisse être largement utilisé dans les milieux de recherche.
Abstract
Glycomics est une nouvelle sous-spécialité dans la recherche sur les systèmes d'omiques qui offre un potentiel significatif dans la découverte de biomarqueurs de prochaine génération pour la susceptibilité aux maladies, la découverte de cibles médicamenteuses et la médecine de précision. D'autres IgG N-glycans ont été rapportés dans plusieurs maladies chroniques communes et suggérés pour avoir le grand potentiel dans des applications cliniques (c.-à-d., biomarqueurs pour le diagnostic et la prévision des maladies). IgG N-glycans sont largement caractérisés en utilisant la méthode de chromatographie d'interaction hydrophile (HILIC) chromatographie liquide ultra-performance (UPLC). UPLC est une technologie de détection stable avec une bonne reproductibilité et une précision quantitative relative élevée. En outre, la structure de L'IgG N-glycan est clairement séparée, et la composition de glycane et l'abondance relative dans le plasma sont caractérisées.
Introduction
N-glycosylation des protéines humaines est unemodification post-traduction n 1 commune et essentielle et peut aider à prédire l'occurrence et le développement des maladies de façon relativement précise. En raison de la complexité de sa structure, on s'attend à ce qu'il y ait plus de 5 000 structures de glycane, offrant un grand potentiel en tant que biomarqueurs diagnostiques et prédictifs pour les maladies2. N-glycansattachés à l'immunoglobuline G (IgG) se sont avérés essentiels pour la fonction d'IgG, et IgG N-glycosylation participe à l'équilibre entre les systèmes pro- et anti-inflammatoires3. L'IgG N-glycosylation différentielle est impliquée dans le développement et la progression de la maladie, représentant à la fois une prédisposition et un mécanisme fonctionnel impliqué dans la pathologie de la maladie. Le rôle inflammatoire de L'IgG N-glycosylation a été associé au vieillissement, aux maladies inflammatoires, aux maladies auto-immunes et au cancer4.
Avec le développement de la technologie de détection, les méthodes suivantes sont les plus largement utilisées dans les glycomics à haut débit : chromatographie d'interaction hydrophile (HILIC) chromatographie liquide ultra-performante avec détection de fluorescence (UPLC-FLR), électrophoresis de gel capillaire multiplex avec fluorescence induite par laser détection (xCGE-LIF), spectrométrie de masse laser assistée par matrice /ionisation (MALDI-TOF-MS) et spectrométrie de masse électrospray de chromatographie liquide (LC-ESI-MS) . Ces méthodes ont surmonté les lacunes précédentes de faible flux, des résultats instables, et une faible spécificité de sensibilité5,6.
UPLC est largement utilisé pour explorer l'association entre IgG N-glycosylation et certaines maladies (c.-à-d., vieillissement7, obésité8, dyslipidémie9, diabète de type II10, hypertension11, accident vasculaire cérébral ischémique12, et la maladie de Parkinson13). Par rapport aux trois autres méthodes mentionnées ci-dessus, UPLC a les avantages suivants5,14. Tout d'abord, il fournit une méthode relative d'analyse quantitative, et l'analyse des données qui implique la normalisation totale de la zone améliore la comparabilité de chaque échantillon. Deuxièmement, le coût de l'équipement et l'expertise requise sont relativement faibles, ce qui facilite la mise en œuvre et la transformation des biomarqueurs de glycosylation en applications cliniques. Présenté ici est une introduction à UPLC afin qu'il puisse être plus largement utilisé.
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Protocol
Tous les sujets inclus dans le protocole ont été approuvés par le Comité d'éthique de l'Université médicale de la capitale, Beijing, Chine12. Le consentement éclairé écrit a été obtenu de chaque sujet au début de l'étude.
1. IgG isolement
- Préparer les produits chimiques, y compris le tampon de liaison (saline tamponnée de phosphate, PBS) : 1x PBS (pH à 7,4), tampon neutralisant : 10x PBS (pH à 6,6-6,8), eluent : 0,1 M d'acide formique (pH à 2,5), solution neutralisante pour l'éluence : 1 M de bicarbonate d'ammonium, tampon stocké : 20 % éthanol 20 mM Tris 0,1 M NaCl (pH 7,4), solution de nettoyage pour la protéine G : 0,1 M NaOH - 30 % propan-2-ol.
REMARQUE : Le niveau de pH est critique dans ce protocole. L'élution d'IgG nécessite un pH très faible, et il ya un risque de perte d'acides sialiques dus à l'hydrolyse acide. Par conséquent, l'élution se produit en quelques secondes, et le pH est rapidement restauré à la neutralité, préservant l'intégrité de l'IgG et les acides sialiques. - Préparer les échantillons : décongeler l'échantillon de plasma congelé puis centrifuger à 80 x g pendant 10 min, et laisser la plaque monolithique de protéine G et les produits chimiques mentionnés ci-dessus pendant 30 min à température ambiante (RT).
- Transférer un échantillon de 100 L (qui peut être utilisé pour détecter 2x pour prévenir la première défaillance) dans une plaque de collecte de 2 ml (ici, un total de six échantillons standard, un échantillon témoin [eau ultra-pure], et 89 échantillons de plasma ont été conçus pour 96 plaques de puits et assignés au hasard à l'assiette).
- Diluer les échantillons avec 1x PBS par 1:7 (v/v).
- Nettoyer une plaque de filtre en polypropylène hydrophile (GHP) de 0,45 m avec 200 ll d'eau ultra-pure (répéter 2x).
- Transférer les échantillons dilués dans la plaque filtrage et filtrer les échantillons dans la plaque de collecte à l'aide d'une pompe à vide (contrôlez la pression du vide à 266,6-399,9 Pa).
- Préparation des plaques monolithiques protéiques G
- Jetez le tampon de stockage.
- Nettoyer les plaques monolithiques avec 2 ml d'eau ultra-pure, 2 ml de 1x PBS, 1 ml d'acide formique de 0,1 M, 2 ml de 10 x PBS, 2 ml de 1x PBS (séquentiellement), et retirer le liquide qui coule à l'aide d'une pompe à vide.
- Transférer les échantillons filtrés dans la plaque monolithique de la protéine G pour la liaison IgG et le nettoyage, puis nettoyer les plaques monolithiques avec 2 ml de 1x PBS (répéter le nettoyage 2x).
- Elute IgG avec 1 ml d'acide formique de 0,1 M et filtrer les échantillons dans la plaque de collecte par pompe à vide, puis ajouter 170 l de 1 M de bicarbonate d'ammonium dans la plaque de collecte.
- Détecter la concentration d'IgG à l'aide d'un spectrophotomètre d'absorption (longueur d'onde optimale de 280 nm).
- Ouvrez le logiciel et sélectionnez le mode protéine-CY3.
- Dessinez 2 l'eau ultra-pure et chargez-la dans l'écran, puis cliquez sur Blank dans le logiciel pour effacer l'écran (répéter 1x).
- Dessinez 2 l'eau ultra-pure et chargez-la dans l'écran, puis cliquez sur Échantillon dans le logiciel pour détecter l'eau ultra-pure.
- Dessinez 2 L d'échantillon IgG et chargez-le dans l'écran, puis cliquez sur Échantillon dans le logiciel pour détecter l'échantillon.
- Dessinez 2 l'eau ultra-pure et chargez-la dans l'écran, puis cliquez sur Blank dans le logiciel pour effacer l'écran.
- Fermez le logiciel.
REMARQUE : La formule de calcul de la concentration d'IgG est la suivante :
CIgG - coefficient d'absorption x extinction (13,7) x 1 000 g/mL
- Mettre l'IgG extrait à sécher dans un four à 60 oC et conserver l'IgG extrait (300 l'IgG extrait pendant 4 h).
- Enlever 300 L d'IgG extrait si la concentration est supérieure à 1 000 g/mL.
- Enlever 350 L d'IgG extrait si la concentration se situe entre 500 et 1 000 g/mL.
- Enlever 400 L d'IgG extrait si la concentration se situe entre 200 et 500 g/mL.
- Enlever 600 L d'IgG extrait si la concentration est inférieure à 200 g/mL.
REMARQUE : La concentration d'IgG devrait être de préférence de préférence 200 g/mL pour une détection ultérieure. La quantité moyenne d'IgG devrait être de préférence de préférence 1 200 g, ce qui peut être testé 2x en cas d'échec du premier test.
- Nettoyage de la plaque monolithique de protéine G pour la réutilisation
- Laver la plaque avec 2 ml d'eau ultra-pure, 1 ml de 0,1 M NaOH (pour enlever les protéines précipitées), 4 ml d'eau ultra-pure, et 4 ml de 1x PBS (séquentiellement), puis retirer le liquide qui coule à l'aide d'une pompe à vide.
- Laver la plaque avec 2 ml d'eau ultra-pure, 2 ml de propan-2-ol 30 % (pour enlever les protéines hydrophobes liées), 2 ml d'eau ultra-pure et 4 ml de 1 x PBS (séquentiellement), puis retirer le liquide qui coule à l'aide d'une pompe à vide.
- Laver l'assiette avec 1 ml de tampon (20 % d'éthanol et 20 mm Tris et 0,1 M NaCl) et ajouter 1 ml de tampon (20 % d'éthanol et 20 mm Tris et 0,1 M NaCl) à l'assiette, puis laisser la plaque à 4 oC.
2. Libération de Glycan
- Préparer l'IgG séché et stocker les produits chimiques, y compris 1,33% SDS, 4% Igepal (magasin loin de la lumière), et 5x PBS à RT.
- Préparer l'enzyme PNGase F en diluant 250 U enzyme avec 250 L d'eau ultra-pure.
- Dénaturation d'IgG
- Ajouter 30 oL de SDS à 1,33 % et mélanger par vortex, transférer l'échantillon dans un four à 65 oC pendant 10 min, puis le retirer du four et laisser reposer pendant 15 min.
- Ajouter 10 l de 4% igepal et le placer sur l'incubateur secouant pendant 5 min.
- Enlèvement et libération de glycanes
- Ajouter 20 oL de 5x PBS et 30-35 'L de 0.1 mol/L NaOH pour réguler un pH de 8.0, et mélanger par vortexing. Ajouter 4 oL d'enzyme PNGase F et mélanger par vortex. Ensuite, incuber de 18 à 20 h dans un bain d'eau de 37 oC.
- Mettre les glycanes libérés à sécher dans un four à 60 oC pendant 2,5 à 3,0 h.
- Enregistrer les glycanes libérés à -80 oC jusqu'à ce que la mesure soit plus poussée.
REMARQUE : Cette étape est cruciale. La clé de la libération de glycane est d'améliorer l'activité de l'enzyme PNGase F pour maximiser son efficacité.
3. Étiquetage et purification de glycan
- Préparer le réactif d'étiquetage 2-aminobenzamide (2-AB) avec 0,70 mg de 2-AB, 10,50 l d'acide acétique, 6 mg de cyanoborohydride de sodium (NaBH3CN), et 24,50 l de sulfoxure de diméthyle (DMSO) (volume total de 35 l). Ensuite, ajoutez de l'acide acétique, 2-AB, et NaBH3CN dans l'ordre DMSO.
- Étiqueter les glycanes à l'aide de 35 oL de réactif d'étiquetage 2-AB, transférer les glycanes étiquetés à l'oscillateur pendant 5 min, transférer au four pendant 3 h à 65 oC, puis transférer à RT pendant 30 min.
REMARQUE : L'étape entière d'étiquetage de glycan doit être exécutée tout en se protéger de la lumière. - Pretreat une plaque de filtre GHP de 0,2 m avec 200 l d'éthanol à 70 %, 200 l d'eau ultra-pure et 200 l d'acétonitrile à 96 % (4 oC), puis retirer les déchets à l'aide d'une pompe à vide.
- Purification du glycan étiqueté 2-AB
- Ajouter 700 l de 100 % d'acétonitrile à l'acétonitrile étiqueté 2-AB et transférer dans un incubateur secouant pendant 5 min.
- Centrifugeuse à 134 x g pendant 5 min (4 oC).
- Transférer l'échantillon dans une plaque de filtre GHP de 0,2 m pendant 2 min et retirer le filtrate (liquide qui coule) à l'aide d'une pompe à vide.
- Laver le glycane étiqueté 2-AB à l'aide de 200 l d'acétonitrile à 96 % (4 oC) et retirer le filtrate (liquide qui coule) à l'aide d'une pompe à vide 5x-6x.
- Elute 2-AB étiqueté glycane avec 100 L d'eau ultra-pure 3x.
- Transférer le glycane étiqueté 2-AB dans un four pour sécher à 60 oC pendant 3,5 h.
- Enregistrer les N-glycansétiquetés à -80 oC jusqu'à ce que la mesure soit plus poussée.
4. Chromatographie d'interaction hydrophile et analyse des glycanes
- Conditionnement des instruments UPLC et préparation des phases mobiles
- Préparer des phases mobiles incluant le solvant A : 100 mM d'ammonium formate (pH 4,4), solvant B : 100 % d'acétonitrile, solvant C : 90 % d'eau ultra-pure (10 % de méthanol) et solvant D : 50 % de méthanol (eau ultra-pure).
- Ouvrez le logiciel pour contrôler les phases mobiles.
- Laver les instruments UPLC à un débit de 0,2 mL/min (50 % solvant B et 50 % solvant C) en équilibre pendant 30 min, puis à un débit de 0,2 ml/min (25 % solvant A et 75 % solvant B) équilibrant pendant 20 min, puis un débit de 0,4 ml/min d'équilibrage.
- Dissoudre les n-glycans étiquetés avec 25 l d'un mélange d'acétonitrile à 100 % et d'eau ultra-pure à un ratio de 2:1 (v/v). Ensuite, la centrifugeuse à 134 g pendant 5 min (4 oC) et la charge de 10 l des n-glycansétiquetés dans les instruments UPLC.
- Séparez les n-glycans étiquetés à un débit de 0,4 ml/min avec un gradient linéaire de 75 % à 62 % d'acétonitrile pendant 25 min. Ensuite, effectuez une analyse par échelle d'étalon dextran/colonne de glycopeptide sur un UPLC à 60 oC (ici, les échantillons ont été conservés à 4 oC avant l'injection).
- Détecter la fluorescence N-glycane à des longueurs d'ondes d'excitation et d'émission de 330 nm et 420 nm, respectivement.
- Intégrez les glycanes en fonction de la position de pointe et du temps de rétention.
- Calculer la valeur relative de chaque pic de Glycan (GP)/ tous les pics de Glycan (GP) (pourcentage, %) comme suit: GP1: GP1/GPP 100, GP2: GP2/GPs 100, GP3: GP3/GPs10, etc.
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Representative Results
Comme le montre la figure 1, IgG N-glycansont été analysés en 24 pics initiaux de glycane IgG (GP) basés sur la position de pointe et le temps de rétention. Les structures N-glycansont disponibles par la détection de spectrométrie de masse selon une étude précédente ( tableau1)15. Pour s'assurer que les résultats étaient comparables, la normalisation totale de la superficie a été appliquée, dans laquelle la quantité de glycane s'est exprimée en pourcentage de la superficie totale intégrée.
Pour évaluer la répétabilité et la stabilité de la méthode, l'échantillon standard a été testé en parallèle six fois. Comme le montre le tableau 2, le coefficient de variation (CV) de 24 omnipraticiens variait de 1,84 % à 16,73 %, 15 (62,50 %) dont étaient inférieurs à 10 %. Les omnipraticiens dont les proportions sont relativement faibles (1,16 %) ont montré des erreurs de mesure élevées (plus de 10 % du CV). De plus, les profils IgG N-glycancombinés à 76 personnes ( figure2) indiquaient que la position de GP était stable, que la forme de GP était semblable et que l'intégration des échantillons maintenait les mêmes intervalles. Les résultats ci-dessus indiquent que la méthode est stable et reproductible.
Comme le montre le tableau 3, 36 autres caractères dérivés décrivant les abondances relatives de galactosylation, de sialylation, de bisecting GlcNAc et de fucosylation de base ont été calculés par les 24 glycanes directement mesurées. Par exemple, G2/G0 (GP12/GP2) reflétait le niveau de galactosylation (di-/a-) sans fucosylation de base et en bisecting GlcNAc. G2/G1 (GP14/[GP8 - GP9]) reflétait le niveau de galactosylation (di-/mono-) avec fucosylation de noyau et sans couper En deux GlcNAc. Enfin, G1/G0 ([GP10 - GP11]/GP6) reflétait le niveau de galactosylation (mono-/a-) avec la fucosylation de base et la coupe GlcNAc. Ces calculs des glycanes dérivés suivent un principe, pour voir le changement d'un seul trait de glycosylation.
Figure 1 : chromatogramme UPLC d'un individu. IgG N-glycans ont été analysés en 24 pics initiaux de glycan IgG (GP) basés sur la position de pointe et le temps de rétention. GP8 représente la somme de GP 8a et GP 8b. GP16 représente la somme de GP 16a et GP 16b. La structure des glycanes dans chaque pic chromatographique et le pourcentage moyen de structures individuelles sont indiqués dans le tableau 1 et le tableau 2. Veuillez cliquer ici pour voir une version plus grande de ce chiffre.
Figure 2 : chromatogramme UPLC de 76 individus. Les profils IgG N-glycanont été combinés à partir de 76 individus pour démontrer la répétabilité et la stabilité de la méthode. Veuillez cliquer ici pour voir une version plus grande de ce chiffre.
Tableau 1 : Structure des 24 glycans IgG initiaux. GP: pic de glycan; F: fucose; R : nombre d'antennes attachées à la séquence centrale (existant de deux NAcetylglucosamine (GlcNAc) et de trois résidus de mannose); B: bisecting GlcNac; G: galactose; S: acide sialique. Les schémas structurels sont définis comme suit: carré bleu: GlcNac; cercle vert: mannose; triangle rouge : fucose de noyau/fucose d'antenne ; cercle jaune: galactose; rhomb violet : acide sialique.
| Pic de Glycan | Moyenne (SD) | CV (%) | Pic de Glycan | Moyenne (SD) | CV (%) |
| GP1 (en) | 0.23 (0.017) | 7.28 | GP13 (en) | 0.50 (0.043) | 8.64 |
| GP2 (en) | 0.24 (0.034) | 13.97 | GP14 (en) | 19.54 (0.36) | 1.84 |
| GP3 (en) | 0.96 (0.16) | 16.73 | GP15 (en) | 1.16 (0.14) | 11.63 |
| GP4 (en) | 19.52 (0.58) | 2.98 | GP16 (en) | 2.79 (0.19) | 6.93 |
| GP5 (en) | 0.17 (0.024) | 13.86 | GP17 (en) | 1.29 (0.13) | 9.78 |
| GP6 (en) | 3.19 (0.26) | 8.22 | GP18 (en) | 13.16 (0.51) | 3.85 |
| GP7 (en) | 0.29 (0.033) | 11.51 | GP19 (en) | 2.12 (0.21) | 9.76 |
| GP8 (en) | 16.45 (0.62) | 3.77 | GP20 (en) | 0.12 (0.018) | 14.91 |
| GP9 (en) | 8.97 (0.52) | 5.74 | GP21 (en) | 1.05 (0.17) | 16.09 |
| GP10 (en) | 2.97 (0.22) | 7.34 | GP22 (en) | 0.18 (0.025) | 14.16 |
| GP11 (en) | 0.30 (0.041) | 13.82 | GP23 (en) | 2.14 (0.14) | 6.45 |
| GP12 (en) | 1.27 (0.026) | 2.08 | GP24 (en) | 1.43 (0.13) | 9.12 |
Tableau 2 : Précision de la méthode. L'échantillon standard est testé en parallèle six fois pour évaluer la répétabilité et la stabilité de la méthode. CV: Coefficient de Variation; GP: Pic de Glycan; SD: Déviation standard.
| Glycans dérivés | Formules | Glycans dérivés | Formules |
| Galactosylation | Fucosylation Fucosylation | ||
| G2/G0 | GP12/GP2 | F1/F0 | GP4/GP2 |
| GP14/GP4 | GP6/GP3 | ||
| GP15/GP6 | GP9/GP7 | ||
| G2/G1 | GP12/GP7 | GP14/FGP12 | |
| GP14/(GP8MD GP9) | GP15/GP13 | ||
| GP15/(GP10MD GP11) | GP18/GP17 | ||
| G1/G0 | GP7/GP2 | GP23/GP21 | |
| GP9/GP4 | GP24/GP22 | ||
| GP10MD GP11)/GP6 | |||
| Sialylation (Sialylation) | Bisecting GlcNAc | ||
| S2/S0 | GP21/GP12 | B1/B0 | GP3/GP2 |
| GP22/GP13 | GP6/GP4 | ||
| GP23/GP14 | (GP10-GP11)/ (GP8 GP9) | ||
| GP24/GP15 | GP13/GP12 | ||
| S2/S1 | GP21/GP17 | GP15/GP14 | |
| GP23/GP18 | GP19/GP18 | ||
| GP24/GP19 | GP22/GP21 | ||
| S1/S0 (S1/S0) | GP17/GP12 | GP24/GP23 | |
| GP18/GP13 | |||
| GP16/GP14 | |||
| GP19/GP15 | |||
Tableau 3 : Calcul des glycanes dérivés. GP: pic de glycan; F: fucose; B: bisecting GlcNac; G: galactose; S: acide sialique.
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Discussion
L'UPLC sert de méthode d'analyse quantitative relative5,15. Les résultats indiquent que l'UPLC est une technologie de détection stable avec une bonne reproductibilité et une précision quantitative relative. La quantité de glycanes dans chaque pic est exprimée en pourcentage de la superficie totale intégrée à l'aide de l'UPLC, qui est la valeur relative. La quantification relative améliore la comparabilité des échantillons d'essai. En outre, 96 plaques de protéines G de puits sont utilisées pour purifier IgG avec 96 échantillons à la fois pour la détection à haut débit. La capacité de la protéine G à lier IgG est plus grande que celle de la protéine A, comme décrit dans les études précédentes15,16.
En outre, les structures d'IgG N-glycan sont clairement séparées. Les glycanes IgG dérivés décrivent le niveau de galactosylation, de sialylation, de bisecting GlcNAc, et de fucosylation de noyau, qui sont calculés par l'IgG N-glycansinitial. Dans une étude précédente, certains glycans dérivés (FBn, FBG0n / G0n, FBn / Fntotal, Bn / (Fn - FBn), FBG2n / FG2n/ (BG2n - FBG2n), BG2n / (FG2n - FBG2n)) pourrait refléter le changement dans les niveaux de glycosylation multiples, mais ne reflète pas le niveau de gcosycosylation spécifique15.
Récemment, une étude à grande échelle a montré que la galactosylation IgG (appelée Gal-ratio) peut servir de biomarqueur prometteur pour le dépistage du cancer dans plusieurs types de cancer17. La distribution de la galactosylation IgG est mesurée en calculant les intensités relatives des agalactosylated (G0) vs monogalactosylated (G1) et digalactosylated (G2) N-glycansselon la formule (G0/[G1 - G2 x 2]). Le Gal-ratio reflète le niveau de galactosylation avec la fucosylation de noyau et sans couper en deux GlcNAc. Par conséquent, plusieurs IgG N-glycans initiaux ont été combinés avec un glycane dérivé, représentant le niveau d'un trait spécifique de glycosylation. Les calculs des glycanes dérivés suivent un principe qui explore les changements dans un seul trait de glycosylation fixé sur un autre trait de glycosylation.
Dans le protocole actuel, le pH est important pour maintenir la stabilité des structures IgG et glycane, en particulier pour stabiliser la sialylation terminale. Par conséquent, la valeur du pH de la solution doit être strictement contrôlée, et le pH de la solution exposée à IgG doit être restauré ainsi que les glycanes maintenus à un niveau de pH neutre. En outre, l'étape de libération de glycane est essentielle dans ce protocole. La clé de la libération de glycane est d'améliorer l'activité de l'enzyme PNGase F pour maximiser son efficacité. Par exemple, il a été constaté que 18-20 h est optimale pour la digestion PNGaseF. Cette étape doit être pleinement réagie.
Il y a quelques limites de cette technique. La méthode utilisée ne peut pas différencier les glycanes libérés des portions Fab et Fc d'IgG. Les glycans de Fab et Fc sont connus pour être différents. Avec les développements dans la glycoprotéomique, les techniques de détection peuvent mesurer les niveaux d'IgG combinant N-glycans pour explorer le rôle de L'IgG N-glycanset N-glycosylation dans les maladies. Le coût de l'équipement est relativement faible; cependant, le coût par échantillon est assez élevé.
En résumé, ce protocole introduit UPLC afin qu'il puisse être largement utilisé. Une évaluation et une normalisation complètes des méthodes analytiques sont nécessaires avant que des quantités importantes de temps et de ressources ne soient investies dans des études à grande échelle. À mesure que l'UPLC est de plus en plus utilisé, les effets de l'IgG N-glycans et de la glycosylation Nsur certaines maladies peuvent être déterminés avec plus de précision, et les biomarqueurs de glycosylation peuvent être utilisés pour des applications cliniques.
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Disclosures
Les auteurs n'ont rien à révéler.
Acknowledgments
Ces travaux ont été appuyés par des subventions de la National Natural Science Foundation of China (81673247 et 81872682) et de la subvention collaborative Australie-Chine (NH et MRC - APP1112767 -NSFC 81561128020).
Materials
| Name | Company | Catalog Number | Comments |
| 2-aminobenzamide, 2-AB | Sigma, China | ||
| 96-well collection plate | AXYGEN | ||
| 96-well filter plate | Pol | 0.45 um GHP | |
| 96-well monolithic plate | BIA Separations | ||
| 96-well plate rotor | Eppendorf Co., Ltd, Germany | T_1087461900 | |
| Acetic acid | Sigma, China | ||
| Acetonitrile | Huihai Keyi Technology Co., Ltd, China | ||
| Ammonium bicarbonate | Shenggong Biological Engineering Co., Ltd, China | ||
| Ammonium formate | Beijing Minruida Technology Co., Ltd. | ||
| Constant shaking incubator/rocker | Zhicheng analytical instrument manufacturing co., Ltd, China | ZWY-10313 | |
| Dextran Calibration Ladder/Glycopeptide column | Watts technology Co., Ltd, China | BEH column | |
| Dimethyl sulfoxide (DMSO) | Sigma, China | ||
| Disodium phosphate | Shenggong Biological Engineering Co., Ltd, China | ||
| Electric ovens | Tester instruments Co., Ltd | 202-2AB | |
| Empower 3.0 | Waters technology Co., Ltd, America | ||
| Ethanol | Huihai Keyi Technology Co., Ltd, China | ||
| Formic acid | Sigma, China | ||
| GlycoProfile 2-AB Labeling kit | Sigma, China | ||
| HCl | Junrui Biotechnology Co., Ltd, China | ||
| High-speed centrifuge | Eppendorf Co., Ltd, Germany | 5430 | |
| Igepal | Sigma, China | ||
| Low temperature centrifuge | Eppendorf Co., Ltd, Germany | ||
| Low temperature refrigerator | Qingdao Haier Co., Ltd | ||
| Manifold 96-well plate | Watts technology Co., Ltd, China | 186001831 | |
| Methanol | Huihai Keyi Technology Co., Ltd, China | ||
| Milli-Q pure water meter | Millipore Co., Ltd, America | Advantage A10 | |
| NaOH | Shenggong Biological Engineering Co., Ltd, China | ||
| PH tester | Sartorius Co., Ltd, Germany | PB-10 | |
| Phosphate buffered saline, PBS | Shenggong Biological Engineering Co., Ltd, China | ||
| Pipette | Eppendorf Co., Ltd, Germany | 4672100, 0.5-10μl & 10-100μl & 20-200μl & 1000μl | |
| PNGase F enzyme | Sigma, China | ||
| Potassium dihydrogen phosphate | Shenggong Biological Engineering Co., Ltd, China | ||
| Propan-2-ol | Huihai Keyi Technology Co., Ltd, China | ||
| SDS | Sigma, China | ||
| Sodium chloride | Shenggong Biological Engineering Co., Ltd, China | ||
| Sodium cyanoborohydride (NaBH3CN) | Sigma, China | ||
| Spectrophotometer | Shanghai Yuanxi instrument Co., Ltd | B-500 | |
| Transfer liquid gun | Smer Fell Science and Technology Co., Ltd, China | 4672100 | |
| Tris | Amresco, America | ||
| Ultra-low temperature refrigerator | Thermo Co., Ltd, America | MLT-1386-3-V; MDF-382E | |
| Ultra-performance liquid chromatography | Watts technology Co., Ltd, China | Acquity MLtraPerformance LC | |
| Vacuum Pump | Watts technology Co., Ltd, China | 725000604 | |
| Volatilizing machine/Dryer | Eppendorf Co., Ltd, Germany | T_1087461900 | |
| Vortex | Changzhou Enpei instrument Co., Ltd, China | NP-30S | |
| Water-bath | Tester instruments Co., Ltd | DK-98-IIA | |
| Weighing balance | Shanghai Jingke Scientific Instrument Co., Ltd. | MP200B |
References
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