Summary
פרוטוקול זה מתאר את ההמרה של פיברובלסטים בעור לתוך myoblasts ואת הבידול שלהם myotubes. קווי התאים נגזרים מחולים עם הפרעות נוירומוסקולריות וניתן להשתמש בהם כדי לחקור מנגנונים פתולוגיים ולבדוק אסטרטגיות טיפוליות.
Abstract
חקירות הן של הפתופיזיולוגיה והן של המטרות הטיפוליות בדיסטרופיות שרירים נבלמו על ידי היכולת המרובית המוגבלת של מיובלסטים אנושיים. מספר מודלים של עכברים נוצרו אך הם אינם מייצגים באמת את הפיזיופתולוגיה האנושית של המחלה או שאינם מייצגים את הספקטרום הרחב של מוטציות שנמצאו בבני אדם. הנצחת המיובלסטים העיקריים האנושיים היא חלופה למגבלה זו; עם זאת, הוא עדיין תלוי ביופסיות שרירים, אשר פולשניים ולא זמין בקלות. לעומת זאת, ביופסיות עור קלות יותר להשגה ופחות פולשניות לחולים. פיברובלסטים המופקים מביופסיות עור ניתן להנציח ולהשתנות לתוך myoblasts, מתן מקור של תאים עם פוטנציאל מיוגני מעולה. כאן, אנו מתארים שיטת תכנות מחדש מהירה וישירה של פיברובלסט לשושלת מיוגנית. Fibroblasts הם transduced עם שני lentiviruses: hTERT כדי להנציח את התרבות העיקרית ואת MYODפטיש, אשר על תוספת של דוקסיציקלין, גורם ההמרה של fibroblasts לתוך myoblasts ולאחר מכן myotubes בוגרת, אשר מבטאים סמני בידול מאוחר. פרוטוקול transdifferentiation מהיר זה מייצג כלי רב עוצמה לחקור מנגנונים פתולוגיים ולחקור ביותרפיות חדשניות מבוססות גנים או תרופתיות להפרעות נוירומוסקולריות.
Introduction
מודלים תאיים המתקבלים ישירות מרקמות אנושיות שימושיים למודל של הפרעות גנטיות אנושיות רבות, עם היתרון של ההקשר הגנומי המקורי, ובמקרים רבים, שחזור אותם סימני היכר מולקולריים ותאית שנצפו בחולים. בתחום הפרעות נוירומוסקולריות, ביופסיות שרירים היו מקור נהדר למיובלסטים אנושיים ועזרו בהבהרה של מנגנונים פתולוגיים. בנוסף, הם כלי חשוב עבור בדיקות vivo של תרופות וטיפולים גנטיים. מצד אחד, הנגזרת של מיובלסטים משברי שרירים היא קלה יחסית. מצד שני, התרבות והתחזוקה של myoblasts העיקרי הם מאתגרים, בגלל שיעור התפשטות מוגבל שלהם ו senescence משכפל במבחנה1. חלופה למגבלות אלה היא להנציח מיובלסטים עם החדרת הטלומראז האנושי(hTERT)ו / או קינאז תלוי ציקלין 4 (CDK4)גנים 2,3, עם שימור של תכונות שריר השלד4. עם זאת, העקשנות של myoblasts העיקרי עדיין תלוי ביופסיה שרירים, הליך כירורגי עם חסרונות לחולים, אשר, במקרים רבים, יש את השרירים שלהם ניוון מתקדם. לכן, השריר של חולים אלה מורכב מחלק משמעותי של רקמת פיברוטית ו / או שומן ומניב פחות תאי שריר, הדורשים טיהור של התאים בעבר להנצחה.
בניגוד לביופסיות שרירים, ביופסיות עור נגישות יותר ופחות מזיקות לחולים. פיברובלסטים ראשוניים יכולים להיגזר משברי עור במבחנה. למרות fibroblasts אינם מושפעים בעיקר על ידי מוטציות הגורמות הפרעות neuromuscular, הם יכולים להיות transdifferentiated לתוך myoblasts. זה יכול להיות מושגת על ידי החדרת הגן Myod, גורם שעתוק רגולטורי מיוגני5. בכתב יד זה, אנו מתארים את הפרוטוקול להשגת מיובלסטים מופרכים, מהקמת תרבויות פיברובלסטים ועד נטיה של מיוטובים מובחנים (סיכום מייצג של השיטה מתואר באיור 1).
בדיקות פרה-קליניות של אסטרטגיות טיפוליות תלויות במודלים תאיים ובעלי חיים הנושאים מוטציות דומות למוטציות שנמצאו בחולים אנושיים. למרות הפיתוח של מודלים בעלי חיים הפך ריאלי יותר עם התקדמות של טכנולוגיות עריכת גנים כגון CRISPR / Cas96, זה עדיין מאתגר ויקר. לכן, קווי תאים שמקורם בחולה הם אופציה נגישה יש מודלים, המכסה את הספקטרום הגדול של מוטציות של מחלות כגון ניוון שרירים דושן (DMD). Obtention ויצירת מודלים של תאים חיוניים לפיתוח טיפולים מותאמים אישית עבור פתולוגיות כאלה.
בין טיפולים מותאמים אישית שנחקרו, exon דילוג אסטרטגיות הוא אחד המבטיחים עבור dystrophies שרירים שונים7,8. אסטרטגיה זו מורכבת מייצור חלבון קצר יותר אך פונקציונלי. זה מבוצע על ידי הסתרת ההגדרה exon לשחבור, ולכן להוציא את האקסון מוטציה מהשליח הסופי. זוהי טכנולוגיה מבטיחה מאוד שאושרה על ידי ה-FDA עבור DMD. לכן, אנו מתארים גם בפרוטוקול זה, שיטות כדי transfect myoblasts עם שתי exon שונים דילוג על טכנולוגיות קשורות: אוליגונוקלאוטידים antisense (AON) ו U7snRNA-אדנו הקשורים וירוס (AAV). AON transfection הוא כלי טוב עבור ההקרנה הראשונית של מספר רצפים שנועדו לקדם אקסון דילוג9. עם זאת, הפעילות של AONs היא חולפת. כדי לקבל ביטוי מתמשך של רצפי antisense, חקרנו גם RNAs גרעיניים קטנים (snRNAs) בשילוב עם AAV, המאפשר לוקליזציה גרעינית והכללה במכונות השחבור10. U7 הוא snRNA מעורב בעיבוד של mRNA histone שניתן להנדס כדי לאגד חלבונים כי יהיה להפנות אותו לשחבור ולספק רצפי antisense11. השימוש ב- U7 snRNAs שונה בשילוב עם וקטורים AAV מתגבר על מגבלות של AONs וכתוצאה מכך ביטוי מתמשך של AONs והעברה טובה יותר של רקמות שלעניין 12. אנו משתמשים בתאים הנגזרים מחולים DMD עבור פרוטוקול זה כדי להמחיש את אסטרטגיית דילוג exon.
Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.
Protocol
כל הניסויים והביופסיות בוצעו בהתאם לכללים האתיים של המוסדות המעורבים באישור הוועדה המוסדית הארצית של בית החולים לילדים.
1. ייזום תרבות הפיברובלסטים העוריים
- הקמת תרבות פיברובלסטים
- Aliquot 10 מ"ל של מדיום פיברובלסט(טבלה 1)ב 15 מ"ל צינורות חרוט. ביופסיית העור צריכה להיות ממוקמת ומועברת במדיום זה. הביופסיה יכולה להיות מאוחסנת ב 4 מעלות צלזיוס עד שהוא מעובד, מועדף באותו יום.
הערה: השתמש ביופסיה העור בתוך 24-36 שעות, כדי למנוע צמיחה פוטנציאלית של זיהום. - לשאוף את המדיה מהצינור ולשטוף את הביופסיה עם 10 מ"ל 1X PBS (טמפרטורת החדר) שלוש פעמים. לאחר הכביסה השלישית, להשאיר את PBS בצינור.
- יוצקים את PBS ואת העור על צלחת 10 ס"מ2.
- באמצעות אזמלים סטריליים, לחתוך את הביופסיה לתוך שברים קטנים ככל האפשר.
- בעזרת פיפטה, מעבירים שבר עור בודד ומפילים אותו לתבשיל נקי של 10 ס"מ2. מניחים 10 עד 12 שברים למנה.
- לשאוף את עודף PBS מכל קטע. היזהר לא לשאוף את השבר.
- מכסים את הכלים חלקית עם המכסה ומאפשרים שברי העור להתייבש במשך 5-20 דקות. אין לאפשר לרסיסים להתייבש יתר על המידה.
- לאחר השברים יבשים, להטות את המנה ב 45 מעלות ולאט לאט להוסיף 12 מ"ל של מדיום fibroblast לפינה. מנמיכים את המנה, מפיצים בזהירות את המדיה כדי שהרסיסים לא יתרוממו על ידי התקשורת.
- מניחים את הכלים לתוך האינקובטור (37 מעלות צלזיוס, 5% CO2). החלף את המדיה ב- 5-7 ימים ופעם בשבוע לאחר מכן.
- שימו לב לפיברובלסטים העולים מהשבר (איור 2) וברגע שהם מתכנסים, תעבירו את התאים ל-75 ס"מ2 בקבוקים. הסר את המדיום, לשטוף את התאים עם PBS ולהוסיף 1 מ"ל 0.25 % טריפסין. דגירה ב 37 מעלות צלזיוס במשך 5 דקות או עד שכל התאים מורמים. הוסף 10 מ"ל בינוני צמיחה fibroblast כדי לעכב את טריפסין ולהעביר את התאים בקבוק חדש.
הערה: עבור מינוח מספר מעבר, P1 נקבע כאשר fibroblasts הראשון שיצא מן הביופסיה העור מועברים בקבוק חדש לשגשוג.
- Aliquot 10 מ"ל של מדיום פיברובלסט(טבלה 1)ב 15 מ"ל צינורות חרוט. ביופסיית העור צריכה להיות ממוקמת ומועברת במדיום זה. הביופסיה יכולה להיות מאוחסנת ב 4 מעלות צלזיוס עד שהוא מעובד, מועדף באותו יום.
- הקפאה של קווי פיברובלסט ראשוניים
- לאחר בקבוקון 75 ס"מ2 הוא confluent, לשטוף אותו עם 10 מ"ל 1X PBS ושואף PBS.
- הוסף 3 מ"ל של 0.25 % טריפסין לפני השטח של התא. מניחים את הבקבוק באינקובטור במשך 5 דקות. בדוק את הבקבוקים מתחת למיקרוסקופ כדי לראות אם התאים מורמים. אם לא, מניחים את הבקבוק בחזרה באינקובטור למשך 5 דקות נוספות.
- לאחר התאים מנותקים, להוסיף 7 מ"ל של מדיה fibroblast לבקבוק פיפטה למעלה ולמטה כדי resuspend התאים. לאסוף את התאים לתוך צינור חרוט 50 מ"ל.
- הכן 100 μL aliquot של כחול trypan, ולהסיר 100 μL מן המדגם להיות cryopreserved, לערבב עם כחול trypan. לטעון את התערובת על המוציטרומטר לספור. לספור את התאים בארבעה שדות שונים של המוציטרומטר מתחת למיקרוסקופ. כדי לחשב את המספר הכולל של תאים, השתמש בנוסחה: (תאים שנספרו/100) * נפח התרבות.
- לסובב את הצינורות חרוט ב 300 x גרם במשך 10 דקות בטמפרטורת החדר או 4 מעלות צלזיוס.
- לשאוף את המדיום ולהזרים מחדש את התאים בנפח נאות של מדיום הקפאה: 1 מ"ל לכל 1 מיליון תאים / בקבוקון. פיפטה למעלה ולמטה כדי הומוגניזציה ולהפיץ 1 מ"ל לכל cryovial שכותרתו.
- מניחים את הבקבוקונים בתיבת ההקפאה, ומאפשרים לבקבוקונים לקפוא בקצב של 1 מעלות צלזיוס לדקה במקפיא של -80 מעלות צלזיוס למשך הלילה.
- למחרת להעביר את הבקבוקונים למיכל חנקן נוזלי או -150 מעלות צלזיוס מקפיא.
2. הקמת קו התא פיברומיובלסט (FM)
- זרע פיברובלסטים ראשוניים בכ-30% מההתקהלות בשתי בארות של צלחת של 12 בארות (2 x 104 תאים /well) כדי לקבל כ-50% מההתקהלות למחרת.
- עבור התמרה lentiviral, להוסיף 2 כדי 5 x 109 vg (חלקיקי גנום ויראלי) של hTERT-puromycin lentivirus ב 400 μL של מדיום פיברובלסט. לבאר השנייה, להוסיף רק 400 μL של מדיום fibroblast. הוסף 1 מ"ל של מדיה למחרת.
הערה: פלסמידים לייצור lentivirus התקבלו מהקבוצה שפרסמה את Chaouch et al, 2009 נייר. הם מתוארים גם בנפרד Aure et al, 200713 עבור hTERT plasmid ו Barde et al, 200614 עבור מערכת Tet-on מנוצל עבור העיצוב של פלסמיד MyoD. הם הושגו הודות להסכם העברת חומרים עם Genethon, צרפת (אנא צרו קשר עם ד"ר וינסנט Mouly כדי להשיג פלסמידים אלה - vincent.mouly@upmc.fr). בקצרה, hTERT מורכב גרסה hTERT 1 מונע על ידי מקדם CMV בעוד puromycin מונע על ידי מקדם PGK. פלסמיד MyoD מכיל גרסה MyoD 1 מונע על ידי מקדם CMV תחת שליטתו של rtTA2 מדכא. פלסמיד זה מכיל גם את הבחירה hygromycin לידי ביטוי בזכות מקדם SV40.
Lentiviruses יוצרו באמצעות ייצור lentiviral רגיל (ראה וואנג ומקמנוס JoVe פרוטוקול15). בקצרה, עוזר MDL, Rev-Helper, SVS-G-עוזר היו transfected באמצעות משקעים סידן כלוריד גם של hTERT או MyoD פלסמידים. לאחר 48 שעות, supernatant נאסף, ולאחר מכן במשך שלושה ימים נוספים. כל העל-טבעיים התרכזו אז על-ידי אולטרה-צנטריפוגה. לאחר מכן נעשה שימוש חוזר בכדור לתוך מאגר Tris-HCL+NaCl+EDTA. הערכת טיטר הוערכה על ידי מבחני qPCR סטנדרטיים של lentivirus. - יום או יומיים לאחר מכן, מעבירים את התאים לצלחת של 6 בארות ומגדלים אותם עד שהם מגיעים ל-60-70% מפגש.
- להשלים את המדיום fibroblast עם 1 מיקרוגרם / מ"ל של puromycin ולהוסיף 2 מ"ל לכל באר.
- שמור על התאים תחת בחירה עד שכל התאים בבאר הבקרה ימותו (עד 12 ימים), שינוי מדיה כל 2-3 ימים. מעבר התאים מצלחת 6-באר לשתי מנות 10 ס"מ2 לשגשוג נוסף.
- להקפיא בקבוקונים של פיברובלסטים לאחר הבחירה. תווית כ- F(hTer).
- זרע hTERT-מבטא פיברובלסטים (F(hTer)) בערך 30% מפגש במדיום fibroblast, בשתי בארות של צלחת 12-באר, יש כ 50% מפגש למחרת.
- עבור התמרה lentivirus, לערבב 2 עד 5 x 109 vg של MyoD-hygromycinB lentivirus ב 400 μl של מדיום fibroblast ולהוסיף בארות בהתאמה; לבאר השלישית להוסיף 400 μl בינוני פיברובלסט. הוסף 1 מ"ל של מדיום למחרת.
- יום או יומיים לאחר מכן מעבירים את התאים לצלחת של 6 בארות וגדלים עד 60-70% מפגש.
- להשלים את מדיום הצמיחה fibroblast עם hygromycin B (400 מיקרוגרם / מ"ל) ולהוסיף 2 מ"ל לכל באר.
- שמור על התאים תחת בחירה עד שכל התאים בבאר הבקרה ימותו (עד 12 ימים), שינוי מדיה כל 2-3 ימים.
- להקפיא בקבוקונים של פיברובלסטים לאחר הבחירה. תווית כ- FM ואחריה מספר זיהוי התא/שם התא.
3. פרוטוקול ההסתעף
- זרעי FM על 10 ס"מ2 מנות עם 30-40% מפגש. בצלחת של 12 באר, זרע 6 x 104 תאים (זה תלוי בקו התא הבודד).
הערה: עבור immunostaining, תאי זרע על כיסויי זכוכית או שקופיות תא מצופה Matrigel. לדלל Matrigel ב 1:10 במדיום DMEM, להוסיף נפח מספיק כדי לכסות את פני השטח, ולתת את השקופיות לשבת בטמפרטורת החדר במשך שעה אחת. לשאוף את ממש לפני זריעת התאים. - עבור אינדוקציה myoblasts, כאשר fibroblasts הגיע 70% מפגש (איור 3A),לשטוף את פני התא עם PBS ולהוסיף מדיה מיובלסט טרי בתוספת טרי 8 מיקרוגרם / מ"ל דוקסיציקלין.
הערה: ההצלחה של בידול נפגעת בעבר 80% מפגש. - לאחר יומיים-שלושה, התאים הם 90-95% מפגשים והמורפולוגיה שלהם תשתנה (איור 3B). יש לשטוף את משטח התא באמצעות PBS ולהוסיף מדיית בידול טרייה בתוספת דוקסיציקלין טרי של 8 מיקרוגרם/מ"ל.
- המשך לשנות מדיה כל 2-3 ימים ללא מעבר עד להקמת myotubes (אשר באמצעות מורפולוגיה) (איור 3C).
- שבעה עד עשרה ימים לאחר תחילת הבידול myotube, תאים צריכים להיות מובחנים לחלוטין ועלול להתחיל להתנתק או למות. לפני שזה קורה, לקצור myotubes לניתוח נוסף.
הערה: מהלך הזמן של היווצרות myotube תלוי בקו התא. מוטציות בחלבונים הקשורים לשרירים עלולות להפריע לפוטנציאל המיאוגני. כאשר myotubes מתחילים להיראות בהירים ולהסתכל לבן על הגבולות זה אות שהם מתחילים להתנתק (איור 4). - כדי לקצור myotubes, לאסוף מדיה ולהעביר אותו צינור חרוט 50 מ"ל. המדיום עשוי להכיל מיוטובים שהתנתקו.
- לשטוף את myotubes עם 5 מ"ל PBS ולהעביר PBS לצינור 50 מ"ל.
- הוסף 3 מ"ל של 0.25 % טריפסין לפני השטח של התא. מניחים את המנה באינקובטור במשך 5 דקות. בדוק את המנה מתחת למיקרוסקופ כדי לראות אם התאים מורמים. אם לא, הניחו אותו בחזרה באינקובטור למשך 5 דקות נוספות.
- לאחר התאים מנותקים, להוסיף 7 מ"ל של מדיה fibroblast לצלחת פיפטה למעלה ולמטה כדי resuspend את התאים. לאסוף את התאים לצינור חרוט 50 מ"ל.
- צנטריפוגה ב 1,200 x גרם במשך 7 דקות ב 4 מעלות צלזיוס.
- בזהירות לשאוף את הנוזל, מבלי להפריע גלולה. לאחסן את כדורי ב -80 מעלות צלזיוס עד לעיבוד נוסף.
4. חיסון של מיוטובים מובחנים
הערה: עבור immunostaining, לגדל את התאים בכיסויי זכוכית או שקופיות תא כאמור לעיל.
- לאחר myotubes מובחנים באופן מלא, לשאוף את המדיה בזהירות לשטוף את השקופיות עם PBS. לשאוף את פי.אס.אס.
- מוסיפים 4% PFA טריים (500 μL לבאר של צלחת של 12 באר) ומדגרים בטמפרטורת החדר במשך 10 דקות. לשאוף את PFA.
- יש לשטוף עם 1 מ"ל PBS.
- דגירה עם גליצין 0.2 M בטמפרטורת החדר, במשך 10 דקות. לשאוף גליצין.
- לחלחל עם PBS 0.5% TritonX-100 (300 μL / באר של צלחת 12-well), במשך 10 דקות עם תסיסה עדינה.
- חסום עם 300 μL / באר של פתרון חסימה, במשך 10 דקות עם תסיסה עדינה.
- דגירה עם נוגדן ראשוני מדולל 1:50 ב 300 μL של פתרון חסימה, במשך 2 שעות בטמפרטורת החדר, עם רעידות עדינות.
- יש לשטוף שלוש פעמים עם 1 מ"ל/באר של PBS למשך 5 דקות, עם רעידות עדינות.
- דגירה עם נוגדן משני מדולל 1:500 ב 300 μL של פתרון חסימה, במשך שעה אחת, בטמפרטורת החדר, עם רעידות עדינות. מכסים את הצלחת בנייר אלומיניום.
- יש לשטוף שלוש פעמים עם 1 מ"ל/באר של PBS למשך 5 דקות, עם רעידות עדינות.
- דגירה עם DAPI מדולל PBS במשך 10 דקות. יש לשטוף שלוש פעמים עם 1 מ"ל/באר של PBS.
- הוסף טיפה של מדיום הרכבה לשקופית זכוכית. הסר את הכיסוי עם מלקחיים ומניחים אותו עם הפנים כלפי מטה על טיפת מדיום הרכבה.
- הפוך החלקה על מגבת נייר ולחץ בעדינות כדי להסיר בועות ועודף של מדיום הרכבה.
- לאטום את השקופיות עם לק ולאחסן ב 4 מעלות צלזיוס עד הדמיה.
5. אנטיסנס אוליגונוקלאוטידים
הערה: הפרוטוקול שלהלן הוא עבור transfection של צלחת 6-well. כוונן אמצעי אחסון בהתאם עבור לוחות קטנים או גדולים יותר. transfection נעשה 100% מיובלסטים קונגלאנט כאשר התאים מוכנים לשלב הבידול.
- לשאוף את התקשורת צמיחה myoblast ולשטוף את התאים עם 1 מ"ל PBS.
- הוסף 500 μL / באר של מדיה OptiMEM ודגרת ב 37 °C (69 °F) במשך 1 שעה.
- לדלל את oligonucleotide antisense (AON) ב 100 μL של OptiMEM לריכוז הסופי הרצוי (כלומר 50 nM, 100 nM, 200 nM, 500 nM). דגירה בטמפרטורת החדר במשך 5 דקות.
הערה: פרוטוקול זה ממוטב עבור AONs 2'omethyl-phosphorothioate. - מערבבים את lipofectamine עם OptiMEM (נפח סופי של 100 μL) כדי לתת יחס סופי של 1:1 (מיקרוגרם DNA: μL lipofectamine). דגירה בטמפרטורת החדר במשך 5 דקות.
- מערבבים את ליפופקטמין מדולל עם AON מדולל. מערבבים בעדינות על ידי pipetting ודגר במשך 20 דקות בטמפרטורת החדר כדי לאפשר היווצרות מורכבת. הימנע בועות אוויר.
- הוסף 200 μL של ליפופקטמין ותערובת AON לבארות בהתאמה. דגירה התאים לילה ב 37 °C (69 °F), 5% CO2.
- למחרת להסיר את תערובת transfection ולהוסיף 2 מ"ל של מדיה בידול חם בתוספת דוקסיציקלין.
- לאסוף תאים לפחות שלושה ימים מאוחר יותר עבור מיצוי RNA או שבעה עד 21 ימים במקרה של ניתוח חלבון.
הערה: ימי הבידול הדרושים לגילוי RNA ו/או ביטוי חלבון עשויים להשתנות בהתאם לגן העניין או לקו התא. במקרה של DMD, ניתן לזהות mRNA שלה בתוך שלושה ימים. גילוי חלבון דיסטרופין דורש לפחות שבעה ימים. זה ישתנה בהתאם לקו התא. ריכוזים גבוהים של AON ו מגיב transfection יכול להשפיע על transdifferentiation.
6. התמרה AAV1-U7
הערה: פרוטוקול זה היה אופטימיזציה עבור צלחות 6-באר. התאם את אמצעי האחסון באופן פרופורציונלי לאזור פני השטח של התרבות. התמרים נעשים 100% מיובלסטים משולבים כאשר התאים מוכנים לשלב הבידול. AAV1 הוא Serotype AAV עם יכולת התמרוצות הטובה ביותר של מיובלסטים תרבותיים.
- לשאוף את מדיום הצמיחה myoblast ולשטוף את התאים עם 1 מ"ל PBS.
- לדלל 0.5-1 x 1011 חלקיקים ויראליים של AAV1-U7 ב 700 μL של מדיה בידול חם בתוספת דוקסיציקלין.
הערה: אנו משתמשים qPCR כדי לקבוע את הריכוז הנגיפי. כמות הווירוס לשימוש עשויה להשתנות בהתאם לשיטת הכימות ויש לקבוע אותה בעבר באמצעות מבחני עיתונאי. - מוסיפים את התערובת הנגיפית לבאר על ידי הפלתה הומוגנית.
- למחרת, להוסיף 1.3 מ"ל של מדיה בידול חם בתוספת דוקסיציקלין.
- לאסוף את התאים לפחות שלושה ימים מאוחר יותר עבור מיצוי RNA או שבעה עד 21 ימים במקרה של ניתוח חלבון.
7. מיצוי RNA
הערה: כל החומר המשמש בשלב זה צריך להיות ללא RNase.
- הוסף 500 μL של TRIzol לכל גלולה ו pipet למעלה ולמטה מספר פעמים כדי להבטיח כי התאים הם lysed הומוגנית.
- מעבירים את lysate התא בצינור 1.5 מ"ל דגירה במשך 5 דקות בטמפרטורת החדר.
- מוסיפים 100 μL של כלורופורם ומנערים ידנית במשך 15 שניות. דגירה במשך 5 דקות בטמפרטורת החדר.
- צנטריפוגה ב 12,000 x גרם במשך 15 דקות ב 4 מעלות צלזיוס. לאסוף את השלב מימית (העליון) ולהעביר אותו צינור חדש 1.5 מ"ל.
- עבור נפח אחד של השלב מימית, להוסיף 1 נפח של אתנול 100% ומערבבים על ידי pipetting.
הערה: אנו ממליצים על טיהור עמודות וריכוז. - העבר את הדגימה לעמודת IC Zymo-Spin בצינור איסוף וצנטריפוגה ב 12,000 x g עבור 30 s. השלך את הזרימה.
- לעיכול DNase I בטור, יש לשטוף מראש את העמודה עם 400 μL RNA לשטוף חוצץ. צנטריפוגה ב 12,000 x g עבור 30 s. השלך את הזרימה.
- הכן 40 μL של תערובת תגובת DNase לכל מדגם. מערבבים 5 μL DNase אני עם 35 μL DNA עיכול מאגר.
- הוסף את התערובת ישירות למטריצת העמודות. דגירה בטמפרטורת החדר במשך 15 דקות.
- הוסף 400 μL RNA הכנת מאגר לעמודה צנטריפוגה ב 12,000 x g עבור 30 s. השלך את הזרימה.
- הוסף 700 μL RNA לשטוף מאגר לעמודה צנטריפוגה ב 12,000 x g עבור 30 s. השלך את הזרימה.
- הוסף 400 μL RNA לשטוף מאגר לעמודה צנטריפוגה ב 12,000 x g במשך 2 דקות כדי להבטיח הסרה מלאה של מאגר לשטוף. העבירו את העמודה בזהירות לצינור 1.5 מ"ל נטול RNase.
- הוסף 15 מים נטולי גרעינים μL ישירות למטריצת העמודים. דגירה במשך 5 דקות וצנטריפוגה ב 12,000 x g במשך דקה אחת.
הערה: לאסוף את RNA eluted ולהחיל אותו שוב על העמודה כדי להגדיל את התשואה. צנטריפוגה ב 12,000 x g במשך דקה אחת. - מניחים דגימות על קרח לכמת את הדגימות ב Nanodrop.
- אחסן דגימות ב- -80 °C (69 °F).
8. ניתוח RT-PCR
הערה: בשלב זה, אנו מציגים הצעה של ריאגנטים כדי לזהות את הביטוי של dystrophin mRNA, אבל זה יכול להיות מותאם בקלות ריאגנטים אחרים של בחירה.
- היפוך שעתוק
- להפשיר את כל ריאגנטים ולשמור אותם על קרח.
- הכן תערובת עם 4 μL של מאגר תגובה 5x, 2 μL של dNTP לערבב (10 מ"מ), 1 μL של מעכב ריבולוק RNase, ו 1 μL של RevertAid RT.
- מערבבים את הצינור בעדינות וצנטריפוגה בקצרה.
- בצינורות PCR 0.2 מ"ל, להוסיף את הנפח ההולם של RNA על מנת לקבל 1 מיקרוגרם לכל תגובה. הוסף מים ללא גרעין q.s.p 12 μL. כלול צינור אחד ללא שעתוק הפוך כפקד שלילי צינור אחד עם מים ללא גרעין במקום RNA.
- להפיץ 8 μL של תערובת תגובה לכל צינור. הנפח הכולל הוא 20 μL.
- מניחים צינורות בתרמוציקלר ומדגרים במשך 5 דקות ב 25 מעלות צלזיוס ואחריו 60 דקות ב 42 מעלות צלזיוס. לעצור את התגובה על ידי חימום ב 70 מעלות צלזיוס במשך 5 דקות.
- מניחים את הצינורות על קרח או ב -20 מעלות צלזיוס לאחסון ארוך יותר.
- Pcr
הערה: עיצוב פרייומרים בצמתים exons רצוי.- ריאגנטים וורטקס לסובב למטה לפני השימוש.
- הכן תערובת מאסטר באמצעות פריימר קדמי 0.5 μL (25 מיקרומטר), פריימר הפוך 0.5 μL (25 מיקרומטר), 12.5 μL 2x PCR מאסטר מיקס, ו 8.5 μL של מים ללא גרעין לדגימה.
- Aliquot 22 μL של מאסטר לערבב לתוך צינור עבור כל מדגם.
- הוסף 3 μL של cDNA (150 ng) לצינור PCR בהתאמה שלה. הוסף 3 μL של מים ללא גרעין לצינור בקרה שלילי PCR.
- וורטקס ולסובב את צינורות PCR.
- דגירה הצינורות תרמוציקלר ב 95 °C (95 °F) במשך 3 דקות, 95 °C (75 °F עבור 30 s, °C (30 °F) עבור (1 דקות / kb) 34 פעמים, 72 °C (72 °F) ° C במשך 5 דקות.
הערה: טמפרטורת חישול אופטימלית ניתן לקבוע באופן אמפירי. לתערובת המאסטר המוצעת, הפחת 5 מעלות צלזיוס מטמפרטורת ההיתוך של פריימר. - לטעון 12 μL של תגובת PCR על ג'ל agarose ולהקפיא את הדגימות ב -20 מעלות צלזיוס.
9. איתור ביטוי דיסטרופין על ידי פריחה מערבית
הערה: פרוטוקול זה מותאם במיוחד לדיסטרופין, חלבון קרום גדול. ייתכן שיהיה צורך בתנאים מסוימים עבור חלבונים שונים.
- מיצוי חלבונים
- לאחר 7-21 ימים של בידול, לאסוף תאים עם 5 מ"ל של PBS עם 100 μL 0.5 M EDTA, ו 50 מעכבי פרוטאז μL. דגירה ב 37 °C (69 °F) עד תאים להתנתק. צנטריפוגה ב 1,200 x גרם במשך 5 דקות ב 4 מעלות צלזיוס. הצמד להקפיא את גלולה על ידי טבילת הצינור בחנקן נוזלי. לאחסן את גלולה ב -80 מעלות צלזיוס או להמשיך לשלב התזה.
- הכן מאגר תמוגה על ידי הוספת 1% של דיגיטונין, 1% מעכבי פרוטאז, 10% מעכבי פוספטאז, ומאגר בסיס לנפח הכולל (60 μL לכל גלולה תא).
- הוסף 60 μL של מאגר תמוגה לכדור התא, על קרח. סוניקאט במשך 5 שניות. בואו נשב על קרח במשך 8 שניות. חזור על צעדי sonication ומנוחה פעמיים.
- דגימות דגירה על קרח במשך 30 דקות.
- צנטריפוגה ב 14,000 x גרם במשך 20 דקות ב 4 מעלות צלזיוס.
- העבר את supernatant לצינורות נקיים.
- לכמת דגימות על ידי חומצה bicinchoninic (BCA) assay, בעקבות הוראות היצרן.
- מערבבים את פתרון החלבון עם הנפח המתאים של מאגר לאמלי. הפוך aliquots של 100 מיקרוגרם. במידת הצורך, כוונן את עוצמת הקול ל- 25 μl עם מאגר תמוגה בסיסית. אחסן דגימות ב- -80 °C (69 °F).
- פריחה מערבית
- להפשיר דגימות על קרח.
- Denature את הדגימות ב 100 מעלות צלזיוס במשך 5 דקות, ואז לקרר אותם בקרח, לסובב למטה.
- לדלל את 20X Tris-אצטט SDS פועל מאגר ב 200 מ"ל dH2O ולהוסיף 500 μL נוגד חמצון.
- הכן את 3-8% טריס-אצטט פוליאקרילאמיד ג'ל על ידי הסרת מסרק ושטיפה עם dH2O. להרכיב את הג'ל במנגנון אלקטרופורזה. מלא את התא הפנימי במאגר פועל.
- טען 5 μL של סולם חלבון ו 25 μL של מדגם בג'ל. מלא את התא החיצוני במאגר פועל.
- לרוץ ב 80 V עבור 1 שעה ב 4 מעלות צלזיוס. לאחר מכן, ב 120 V עבור 2 שעות ב 4 מעלות צלזיוס.
- הכן 3 L של מאגר העברה 1X עם 150 מ"ל של מתנול 20X, 150 מ"ל של מאגר העברה 20X, ו 2,700 מ"ל של dH2O. לקרר אותו עד 4 מעלות צלזיוס.
- חותכים 4 חתיכות של נייר מסנן וחתיכה אחת של קרום nitrocellulose. משרים את מסנן הנייר ואת הממברנה במגש עם מאגר העברה.
- מוציאים בעדינות את הג'ל מהמארז ומרכיבים אותו במנגנון ההעברה עם נייר סינון, ממברנה וספוגים. הג'ל ממוקם בצד השלילי והממברנה בצד החיובי.
- הפעל העברה ב 300 mA, ערבוב, ב 4 מעלות צלזיוס, לילה.
- לחסום את הממברנה ב 10 מ"ל של חיץ חסימה במשך 1 שעות עם תסיסה עדינה, בטמפרטורת החדר.
- הכן פתרון נוגדנים ראשוני עם 10 מ"ל של חיץ חסימה ו 50 μL של נוגדן דיסטרופין (1:200).
- השלך את מאגר החסימה והוסף את פתרון הנוגדנים העיקרי. דגירה עם תסיסה עדינה לפחות 2 שעות בטמפרטורת החדר או לילה ב 4 מעלות צלזיוס.
- יש לשטוף את הממברנה שלוש פעמים עם 0.1% טווין PBS, למשך 5 דקות בעצבנות עדינה.
- הכן פתרון נוגדנים משני באמצעות 10 מ"ל של פתרון חסימה, 2 μL של נוגדן נגד ארנב (1:5000), ו 20 μL של 0.2% Tween.
- מוסיפים את פתרון הנוגדנים המשני לקרום. דגירה למשך שעה עם תסיסה עדינה, מכוסה בנייר אלומיניום להגנה מפני אור.
- השלך את תמיסת הנוגדן ושטוף את הממברנה 3 פעמים עם 0.1% Tween PBS, במשך 5 דקות עם תסיסה עדינה, מוגן מפני אור.
- חשיפה ותמונה של הממברנה במכשיר הדמיה.
- הכתים את הממברנה עבור חלבון כולל עם כתם Revert 700 סה"כ חלבון, בהתאם להוראות היצרן.
הערה: זיהוי דיסטרופין על ידי חולצה מערבית תלוי בגיל / מוטציה של המטופל ואת היכולת של התא להתיך ולהישאר מחובר מספיק זמן כדי לצבור מספיק דיסטרופין.
Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.
Representative Results
פרוטוקול זה מראה כיצד להקים תרבויות פיברובלסט אנושיות שמקורן בעור ולהמיר אותן למיובלסטים ולאחר מכן למיוטובים מובחנים. סוג זה של קו התא הוא מאוד שימושי לחקר הפרעות neuromuscular ובדיקות במבחנה של טיפולים פוטנציאליים.
באיור 1מוצג ייצוג סכמטי של ההמרה הפיברובלסטית . איור 2A מציג שבר עור ואת הפיברובלסטים העולים ממנו. יש להעביר את הפיברובלסטים למנה חדשה כאשר מגיעים להתכנסות (איור 2B). איור 3A מציג את המפגש האידיאלי של פיברובלסטים לפני שהוא משתנה למדיום הצמיחה של מיובלסט בתוספת דוקסיציקלין. התאים צריכים להיות סביב 70% confluent כי הם עדיין להתרבות במהלך תהליך ההמרה. אם התאים הם מעל 80% confluent, הבידול עלול להיות בסכנה. ההמרה ל myoblasts לוקח יומיים עד ארבעה ימים, וזה אושר על ידי התבוננות של המורפולוגיה. התאים מתארכים ומכוונים במקביל, כפי שמוצג באיור 3B. לאחר התוספת של מדיום הבידול, המיאובלסטים מפסיקים להתחלק ומתחילים להתמזג כדי ליצור מיוטובים רב-גרעיניים (איור 3C). כאשר גבולות myotubes נראים לבנים ובהירים, הם עומדים להתנתק (איור 4). בשלב זה, לאסוף או לתקן את התאים.
הצלחת הבידול תשתנה בין קווי תאים/מוטציות שונות. חיסון חלבוני שרירים המבוטאים על ידי מיוטובים בוגרים מאשר את הפוטנציאל המיאוגני של פיברובלסטים שעברו המרה (איור 5). ניתוח RNA-Seq המשווה בין מיוטו FM ושריר השלד הראה ביטוי ברמה גבוהה של תעתיקים מהעוברים (MYH3) ויילודים (MYH8) גנים של שרשרת מיוסין ומתאם כולל טוב עם שריר (איור 6). תעתיקים לחלבונים הסרקומריים הענקיים טיטין (TTN), ערפילין (NEB) ו אובסקורין (OBSCN) באים לידי ביטוי גם על ידי מיוטובים FM, המציין upregulation של תעתיקים גדולים אלה המעורבים myofibrillogenesis. לכן, לתאי FM יש פרופיל ביטוי ספציפי לשריר, המוכיח כי הם פונדקאית שימושית ואמינה עבור קווי תאים שמקורם בשרירים.
כדי להמחיש דילוג אקסון, השתמשנו בפרוטוקול זה באחד הכפילים exon השכיחים ביותר בגן DMD. שכפול של אקסון 2 מוביל לשיבוש מסגרת הקריאה DMD, ובכך שחזור מסגרת הקריאה לאחר דילוג exon צריך להוביל לביטוי של דיסטרופין באורך מלא. עם זאת, ייתכן גם כי דילוג על exon 2 הוא יעיל מאוד וכתוצאה מכך תעתיק מחוץ למסגרת. עם זאת, במקרה זה, דילוג על שני העותקים של exon 2 גורם לניצול של אתר כניסה חלופי פנימי ריבוזום (IRES) נוכח exon 5, ובכך לייצר דיסטרופין N-קטוע פונקציונלי שזוהה בחולים עדיין אמבולנטי בשנות ה -70 שלהם12. איור 7A מציג תוצאות מייצגות של RT-PCR של תאי FM עם שכפול exon 2. תאי FM טופלו עם AON או AAV1-U7 הנושאים רצף antisense לדלג exon 2. באיור 7B, כשל חיסוני מראה את הגילוי של הדיסטרופין N-קטוע בתאי FM שטופלו ב- AAV1-U7. טיפול במבחנה של תאי FM משמש כהוכחת רעיון לאסטרטגיות דילוג exon.
איור 1: ייצוג סכמטי של המרת פיברובלסטים לתאים מיוגניים. ביופסיה של העור מתקבלת מנבדקים אנושיים. שברי עור מונחים על מנות תרבות. בתוך שבוע, פיברובלסטים מתחילים לצוץ. Fibroblasts הם תחילה transduced עם הגן hTERT, ולאחר מכן עם הגן Myod, באמצעות וקטורים lentiviral. לאחר בחירת אנטיביוטיקה של תאים נגועים, ההמרה למיובלסטים נגרמת על ידי תוספת של דוקסיציקלין למדיום הצמיחה myoblast. בתוך יומיים עד ארבעה ימים, התאים מתארכים ומכוונים במקביל. לאחר המעבר למדיום בידול, הפתיל myoblast אחד עם השני וליצור myotubes multinucleated. לחץ כאן כדי להציג גירסה גדולה יותר של איור זה.
איור 2: שברי ביופסיה של העור בתרבות. (A)פיברובלסטים ראשונים העולים מרסיס העור. (B)פיברובלסטים קונפלונטיים הגיחו מרסיס העור. סרגל קנה מידה: 50 מיקרומטר. אנא לחץ כאן כדי להציג גירסה גדולה יותר של איור זה.
איור 3: התמרה פיברובלסטים. (A)תמונה מייצגת של 70% פיברובלסטים משולבים. (B)myoblasts שהוסבו יש מורפולוגיה מוארכת והם מאורגנים במקביל. (C)Myotubes היו מובחנים במשך 7 ימים. סרגל קנה מידה: 50 מיקרומטר. אנא לחץ כאן כדי להציג גירסה גדולה יותר של איור זה.
איור 4: תמונה מייצגת של ניתוק myotubes. החצים מציינים את הקצוות הלבנים והבהירים של myotubes מתחיל להתנתק. סרגל קנה מידה: 50 מיקרומטר. אנא לחץ כאן כדי להציג גירסה גדולה יותר של איור זה.
איור 5: אימונופלואורסצנטיות של מיוטובים מובחנים. Immunostaining של שרשרת כבדה מיוסין myotubes נגזר בריא (A) אדם וחולים עם הפרעות נוירומוסקולריות (B ו- C). ב- B מוצגים תאים מסוג ניוון מיוטוני 1 (DM1) הנושאים 230 חזרות CTG, וב- C הם תאי DM1 עם 900 חזרות CTG. סרגל קנה מידה: 100 מיקרומטר.
איור 6: תבנית תעתיק של מיוטובי FM בהשוואה לשריר השלד. תבנית תעתיק של מיוטובי FM בהשוואה לשריר השלד. ספירת הקריאה למיליון קריאות ממופות עבור 12,134 תעתיקים מוצגים עבור ספריות Illumina RNA-Seq שהוכנו ממיאוטובות FM וביופסיה של שרירי השלד האנושי. רמות התמליל בין שתי הספריות היו מתאם פירסון של 0.71 ומתאם דירוג ספירמן של 0.73. תעתיקים לשרשראות הכבדות של המיוסין ההתפתחותי ולחלבונים הסרקוומריים הגדולים מודגשים באדום. לחץ כאן כדי להציג גירסה גדולה יותר של איור זה.
איור 7: נציג RT-PCR וכתם מערבי המציג דילוג exon DMD בתאי FM. (A) ביטוי DMD על ידי RT-PCR. Fibroblasts מחולה מחסה שכפול של exon DMD 2 הוסבו לתאי FM. RNA שחולץ מביופסיה שרירים שימש כפקד, מראה כי תאים לא מטופלים FM להביע את אותו תעתיק כפול. לתאי FM שטופלו ב- AON יש דילוג חלקי על שכפול exon 2, בעוד שתאים שטופלו ב- AAV1-U7 הראו דומיננטיות של תעתיקים עם דילוג על שכפול exon 2. (ב) כשל חיסוני מייצג של תאי FM שטופלו ב-AAV1-U7. דיסטרופין קטן יותר N-קטוע זוהה 14 ימים לאחר הטיפול (מסומן על ידי החץ). נתונים שפורסמו בעבר בווין ואח '. תרגום מאקסון DMD 5 IRES תוצאות isoform דיסטרופין פונקציונלי כי מוחלש דיסטרופינופתיה בבני אדם ועכברים. רפואת טבע. 2014. 2020 שפרינגר טבע בע"מ. לחץ כאן כדי להציג גירסה גדולה יותר של איור זה.
| מדיום צמיחה פיברובלסט | DMEM עם 20% FBS, 1% אנטי-מיקרוטי אנטיביוטי |
| מדיום הקפאה | 10% DMSO, 90% בינוני פיברובלסט |
| פתרון מניית דוקסיציקלין 1000X | 8 מ"ג דוקסיציקלין במים טהורים במיוחד 1 מ"ל. סנן במסנן מזרק 0.22 מיקרומטר. אלציטוט בצינורות PCR. יש לאחסן ב-20°C(20°C), מוגן מפני אור. |
| מדיום מיובלסט | מדיום צמיחת תאי שריר השלד (ראה רשימה לעיל) עם תוספי מזון, 8 מיקרוגרם / מ"ל דוקסיציקלין. לדוגמה: 100 μL של פתרון מלאי 1000X ב 100 מ"ל. |
| מדיום בידול | אידול תאי שריר השלד בינוני עם תוספי מזון (ראה רשימה לעיל), 8 מיקרוגרם / מ"ל דוקסיציקלין. לדוגמה: 100 μL של פתרון מלאי 1000X ב 100 מ"ל. |
| פתרון חסימה עבור כתמי IF | 10% סרום עיזים (או סרום של בעלי חיים שבו גדל נוגדן משני) ב 1X PBS |
| מאגר בסיס להפקת חלבונים | NaCl 150 מ"מ, טריס 50 מ"מ, 0.05 % NP-40. כוונן את ה-pH ל-7.4. יש לאחסן ב-4 מעלות צלזיוס. |
טבלה 1: מתכונים בינוניים
Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.
Discussion
כדי להשיג קווי תא FM באיכות טובה, כמה צעדים הם קריטיים. ככל שביופסיה של העור מעובדת מוקדם יותר, כך גדלים הסיכויים להשיג פיברובלסטים בריאים. מספר המעבר של תרבויות פיברובלסטים חשוב גם הוא. לתאים ראשיים יש יכולת התפשטות מוגבלת ולאחר מעברים רבים, הם נכנסים בהיגיון משכפל. לכן, עדיף שיש מלאי של fibroblasts במספר מעבר נמוך ולהפוך תאים במעבר המוקדם ככל האפשר.
צעד חשוב נוסף הוא גם הפקה ויראלית בעלת טוהר מרבי וכימות מדויק. לדוגמה, כימות גנום ויראלי באמצעות qPCR מספק מדידות סבירות, אך כימות על ידי ddPCR (PCR טיפה דיגיטלית) מדויק יותר.
בנוסף, המפגש ההולם של פיברובלסטים להמרת מיובלסט הוא קריטי. אם התאים הם מתחת 70% או מעל 80% confluent, הבידול מיוגני עלול להיפגע. אם התאים תואמים מדי, תהיה סופרפוזיציה של שכבות של myotubes, אשר מפריעים כתמים והדמיה. הריכוז של דוקסיציקלין חיוני להפעלה נכונה וביטוי מתמשך של גן Myod. זה מאוד קריטי תמיד להוסיף את הדוקסיציקלין למדיום ממש לפני ביצוע שינויים במדיה, כפי שהוא מתפרק במהירות לאחר מדולל בינוני ומאוחסן ב 4 מעלות צלזיוס. המלאי צריך להיות מאוחסן ב -20 מעלות צלזיוס בריכוז של 1000X ומוגן מפני אור. אל תקפיא מחדש אל תקפיא אליטות מופשרות. חשוב מאוד לעקוב אחר פרטים אלה כדי להבטיח ניסויים לשחזור ולהפלות בידול לקוי עקב מוטציה גנטית מבעיות טכניות. עם זאת, בהתאם למוטציה או לסוג המחלה, הבחנה טובה לא יכולה להיות אפשרית. כדי להבטיח תוצאות מהימנות, חשוב מאוד לשכפל ניסויים במספרי מעבר דומים.
מניסיוננו, יכולת הבידול נמשכת לפחות עד מעבר 25-27, במיוחד בפקדים מסוג פראי. אותו הדבר עשוי להיות תקף עבור כמה קווי תאים חולים, אבל זה תלוי בקו התא. קווי תאים מסוימים של DMD עדיין שומרים על הפוטנציאל המיאוגני מעל P20. באופוזיציה, סוג ניוון מיוטוני 1 (DM1) קו התא הציג מיוגניות מופחתת לאחר P8. עם זאת, במקרה של DM1, זה לא מפתיע כפי שהוכח כי מוטציות DM1 בעקיפין לשחק תפקיד בידול שרירים16. שימור יכולת הבידול מיוגני צריך להיות מטופל בנפרד, אבל בדרך כלל, רוב קווי התא לשמור אותו עד P20-25.
לסיכום, ההמרה של fibroblasts לתוך myoblasts הוא כלי רב עוצמה ללמוד ולבדוק אסטרטגיות טיפוליות עבור הפרעות נוירומוסקולריות. זה מקל על גישה מודלים תאים אנושיים על ידי הימנעות העקשנות המורכבת של ביופסיות שרירים ולהפחית את אי הנוחות של ביופסיה שרירים עבור המטופלים.
Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.
Disclosures
בית החולים הארצי לילדים העניק רישיון לתוכנית הדילוג Exon 2 המתוארת בזאת ל-Audentes Therapeutics. K.M.F. ו N.W. קיבלו תשלומי תמלוגים כתוצאה מרישיון זה.
Acknowledgments
ברצוננו להודות לד"ר וינסנט מולי על ששיתף את הידע שלו בעבר בנוגע למודל. עבודה זו נתמכה על ידי המכונים הלאומיים לבריאות בארה"ב המכון הלאומי להפרעות נוירולוגיות ושבץ (R01 NS043264 (K.M.F., ו R.B.W.)), המכונים הלאומיים לבריאות בארה"ב המכון הלאומי של דלקת פרקים ומחלות שרירים ושלד ועור (NIAMS) (P50 AR070604-01 (K.M.F., K.M., R.N., ו N.W.). N.W. קיבל תמיכה מלגות מאוניברסיטת אוהיו סטייט / ארצית בית החולים לילדים שריר הקבוצה ואת קרן פיליפ. עבודה זו נתמכה גם על ידי קרנות פנימיות לפי שיקול דעת וחלק מעבודת הדילוג exon 2 נתמכה גם על ידי CureDuchenne (K.M.F.) והאיגוד הצרפתי קונטר לס מיופתיות. מספר IRB: IRB #: IRB10-00358/ CR00005138 ו- IBCSC#: IBS00000123.
Materials
| Name | Company | Catalog Number | Comments |
| 100 mm dish | Corning | 430167 | |
| 0.25% Trypsin-EDTA, phenol red | Thermo Fisher | 2500056 | |
| 10X Phosphate buffered saline (PBS) | Fisher Scientific | BP3994 | |
| 12-well plate | Corning | 3513 | |
| 20X Transfer buffer | Thermo Fisher | NP00061 | |
| 20X Tris-acetate SDS running buffer | Thermo Fisher | LA0041 | |
| 3-8% Tris-Acetate gel | Thermo Fisher | EA0378BOX | |
| 75 cm2 flask | Corning | 430641U | |
| Antibiotic-Antimicotic 100X | Thermo Fisher | 15240062 | |
| Anti-myosin heavy chain, sarcomere antibody | Developmental Studies Hybridome Bank | MF20 supernatant | Dilution 1:50 |
| Antioxidant | Thermo Fisher | NP0005 | |
| BCA Protein Assay | Thermo Fisher | 23227 | |
| Chloroform | Sigma-Aldrich | C2432 | |
| DAPI | Thermo Fisher | D3571 | Dilution 1:1000 |
| Digitonin | Millipore Sigma | 300410250MG | |
| Dimethyl sulfoxide | Sigma-Aldrich | D2438 | |
| DMEM, High glucose, GlutaMAX supplement, Pyruvate | Thermo Fisher | 10569044 | |
| DNAse I set (250U) | Zymo Research Corporation | E1010 | |
| Doxycycline Hydrochloride | Fisher Scientific | BP2653-5 | |
| Dup2 human primers | Fw_5' GCTGCTGAAGTTTGTTGG TTTCTC 3' |
Rv_5' CTTTTGGCAGTTTTTGCC CTGT 3' |
|
| Dystrophin antibody | Abcam | ab15277 | Dilution 1:200 |
| Fetal bovine serum | Thermo Fisher | 16000 | |
| Glycine | Sigma-Aldrich | G8898 | |
| Goat anti-mouse, Alexa Fluor 488 | Thermo Fisher | A11001 | Dilution 1:1000 |
| Halt Protease inhibitor cocktail 100X | Thermo Fisher | 78430 | |
| Hemocytometer | Hausser Scientific | 3100 | |
| Hygromycin B | Thermo Fisher | 10687010 | |
| IRDye 680RD goat anti-Rabbit IgG (H+L) | Li-Cor | 926-68071 | Dilution 1:5000 |
| Lab-Tek II CC2 chamber slide system | Thermo Fisher | 15852 | |
| Laemmli | Bioworld | 105700201 | |
| Lipofectamine 3000 Transfection Reagent | Thermo Fisher | L3000008 | |
| Matrigel GFR membrane matrix | Corning | 354230 | |
| Methanol | Fisher Scientific | A412P-4 | |
| Mr. Frosty Freezing Container | Thermo Fisher | 51000001 | |
| Nitrocellulose membrane 0.45 µm | GE Healthcare Life Sciences | 10600002 | |
| Normal Goat serum control | Thermo Fisher | 10000C | |
| Odyssey Blocking Buffer (PBS) | Li-Cor | 927-40003 | Blocking buffer for Western blot |
| Opti-MEM I Reduced Serum Medium | Thermo Fisher | 11058021 | |
| Paraformaldehyde | Sigma-Aldrich | 158127 | |
| PCR master mix | Thermo Fisher | K0172 | |
| Phosphatase inhibitor | Thermo Fisher | A32957 | |
| Precision Plus Protein Dual Color Standards | Bio Rad | 1610374 | |
| Puromycin | Thermo Fisher | A1113803 | |
| Revert 700 Total Protein Stain for Western Blot Normalization | Li-Cor | 926-11021 | |
| RevertAid kit | Thermo Fisher | K1691 | |
| RNA Clean & Concentrator-25 | Zymo Research Corporation | R1018 | |
| Scalpels | Aspen Surgical | 372611 | |
| Skeletal Muscle Cell Differentiation medium | Promocell | C23061 | |
| Skeletal Muscle Cell Growth medium | Promocell | C23060 | |
| Triton X-100 | Acros Organics | 215682500 | |
| TRIzol reagent | Thermo Fisher | 15596026 | |
| Tween 20 | Fisher Scientific | BP337500 | |
| Ultra low temperature freezer | Thermo Scientific | 7402 | |
| UltraPure 0.5M EDTA, pH 8.0 | Thermo Fisher | 15575020 | |
| Vectashield antifade mounting medium | Vector Labs | H1000 |
References
- Bigot, A., et al. Replicative aging down-regulates the myogenic regulatory factors in human myoblasts. Biology of the Cell. 100 (3), 189-199 (2008).
- Mamchaoui, K., et al. Immortalized pathological human myoblasts: Towards a universal tool for the study of neuromuscular disorders. Skeletal Muscle. 1 (34), (2011).
- Pantic, B., et al. Reliable and versatile immortal muscle cell models from healthy and myotonic dystrophy type 1 primary human myoblasts. Experimental Cell Research. 342 (1), 39-51 (2016).
- Thorley, M., et al. Skeletal muscle characteristics are preserved in hTERT/cdk4 human myogenic cell lines. Skeletal Muscle. 6 (1), 43 (2016).
- Chaouch, S., et al. Immortalized skin fibroblasts expressing conditional MyoD as a renewable and reliable source of converted human muscle cells to assess therapeutic strategies for muscular dystrophies: Validation of an exon-skipping approach to restore dystrophin in duchen. Human Gene Therapy. 20 (7), 784-790 (2009).
- Zarei, A., Razban, V., Hosseini, S. E., Tabei, S. M. B. Creating cell and animal models of human disease by genome editing using CRISPR/Cas9. The Journal of Gene Medicine. 21 (4), 3082 (2019).
- Echevarría, L., Aupy, P., Goyenvalle, A. Exon-skipping advances for Duchenne muscular dystrophy. Human molecular genetics. 27 (2), 163-172 (2018).
- Hwang, J., Yokota, T. Recent advancements in exon-skipping therapies using antisense oligonucleotides and genome editing for the treatment of various muscular dystrophies. Expert reviews in molecular medicine. 21, 5 (2019).
- Wein, N., et al. Efficient Skipping of Single Exon Duplications in DMD Patient-Derived Cell Lines Using an Antisense Oligonucleotide Approach. Journal of Neuromuscular Diseases. 4 (3), 199-207 (2017).
- De Angelis, F. G., et al. Chimeric snRNA molecules carrying antisense sequences against the splice junctions of exon 51 of the dystrophin pre-mRNA induce exon skipping and restoration of a dystrophin synthesis in Δ48-50 DMD cells. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 99 (14), 9456-9461 (2002).
- Gorman, L., Suter, D., Emerick, V., Schümperli, D., Kole, R. Stable alteration of pre-mRNA splicing patterns by modified U7 small nuclear RNAs. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 95 (9), 4929-4934 (1998).
- Wein, N., et al. Translation from a DMD exon 5 IRES results in a functional dystrophin isoform that attenuates dystrophinopathy in humans and mice. Nature Medicine. 20 (9), 992-1000 (2014).
- Auré, K., Mamchaoui, K., Frachon, P., Butler-Browne, G. S., Lombès, A., Mouly, V. Impact on oxidative phosphorylation of immortalization with the telomerase gene. Neuromuscular Disorders. 17 (5), 368-375 (2007).
- Barde, I., et al. Efficient control of gene expression in the hematopoietic system using a single Tet-on inducible lentiviral vector. Molecular Therapy. 13 (2), 382-390 (2006).
- Wang, X., McManus, M.
- Amack, J. D., Mahadevan, M. S.
