Worm-align e Worm_CP, due pipeline open source per raddrizzare e quantificare i dati delle immagini a fluorescenza ottenuti da Caenorhabditis elegans

Worm-align/Worm_CP è un semplice flusso di lavoro FIJI/CellProfiler che può essere utilizzato per raddrizzare e allineare i campioni di caenorhabditis elegans e per ottenere test basati su immagini worm interi senza la necessità di passaggi di formazione precedenti. Abbiamo applicato worm-align/Worm_CP alla quantificazione dell'espressione indotta da shock termico negli animali vivi o goccioline lipidiche in campioni fissi.