Simulación basada en la estructura y muestreo de los movimientos de proteínas del factor de transcripción a lo largo del ADN desde el paso a escala atómica hasta la difusión de grano grueso

El objetivo de este protocolo es revelar la dinámica estructural de la difusión unidimensional de la proteína a lo largo del ADN, utilizando una proteína de dominio WRKY del factor de transcripción vegetal como un sistema ejemplar. Para ello, se han implementado simulaciones de dinámica molecular tanto atomísticas como de grano grueso junto con extensos muestreos computacionales.