Karakterisering av en patogen Escherichia coli-stamme avledet fra Oreochromis spp. Gårder ved bruk av helgenomsekvensering

Gjennomførbarheten av helgenomsekvenseringsstrategier (WGS) ved hjelp av stasjonære instrumenter har forenklet genomundersøkelsen av hver mikrobe av folkehelserelevans i en laboratorieinnstilling. En metodologisk tilpasning av arbeidsflyten for bakteriell WGS er beskrevet og en bioinformatikk rørledning for analyse er også presentert.