مقالة منهجية

استخراج miRNA: طريقة لاستخراج miRNA من عينة البلازما

أبريل 30, 2023

في هذه المقالة

الملخص

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

المصدر: Mensah ، M. et al. ، MicroRNA الخزعة السائلة: تجربة مصنف توقيع البلازما miRNA (MSC) لفحص سرطان الرئة. J. Vis. Exp. (2017).

MicroRNAs (miRNAs) هي حمض النووي الريبي الخاص بالأنسجة وصغير وغير مشفر ينظم التعبير الجيني ، ويمكن أن يمثل مرشحين مثاليين للكشف المبكر عن سرطان الرئة. في البروتوكول المميز ، سنقوم بعزل الحمض النووي الريبي الصغير من عينات دم المريض لفحص سرطان الرئة المبكر.

البروتوكول

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,
< p class = "jove_title" >1. جمع عينات البلازما

  1. اجمع 10 مل من عينة الدم الكاملة في أنابيب التفريغ مع K2EDTA المطلي بالرش وقم بتخزينها في درجة حرارة الغرفة.
    ملاحظه: لتقليل انحلال الدم ، افصل البلازما في غضون 2 ساعة. لا تخزن الدم الكامل في درجة حرارة منخفضة (أي 4 درجات مئوية) لتجنب الصدمة الحرارية وتحلل الخلايا التي تؤدي إلى إطلاق miRNA غير محدد.
  2. في غضون ساعة واحدة ، افصل البلازما بخطوة الطرد المركزي الأولى عند 1،258 × جم و 4 درجات مئوية لمدة 10 دقائق.
  3. انقل المادة الطافية في البلازما إلى أنبوب سعة 15 مل ، وتجنب ملامسة الحلقة اللمفاوية بعناية.
  4. جهاز الطرد المركزي للبلازما مرة ثانية عند 1,258 × جم و 4 درجات مئوية لمدة 10 دقائق.
  5. Aliquot 1 مل من البلازما إلى 1.5 مل من cryovials ، وتجنب جمع جزء البلازما في قاعدة الأنبوب.
  6. قم بتخزين جميع الحصص عند -80 درجة مئوية ، باستثناء واحدة لتقييم انحلال الدم. يجب إجراء التحليل الجزيئي في غضون 5 أسابيع.
فئة

2. استخراج الحمض النووي الريبي الكلي في البلازما

  1. قم بإعداد محلول 1-ثيوجلسرين / تجانس (OMG) مع 20 ميكرولتر من 1-ثيوجلسرين لكل مل من محلول التجانس. نظرا لأن 1-ثيوغليسرين لزج، فقم بتسخين الماصة بعناية للقياس الدقيق. قم بتبريد محلول OMG على الثلج أو عند 2-10 درجة مئوية قبل استخدامه.
    ملاحظه: حل العمل مستقر عند 2-10 درجة مئوية لمدة شهر واحد.
  2. قم بتعليق DNase I المجفف بالتجميد عن طريق إضافة 275 ميكرولتر من الماء الخالي من النوكلياز إلى القارورة واخلطها برفق (لا تقم بالدوامة). كأداة مساعدة بصرية ، أضف 5 ميكرولتر من الصبغة الزرقاء إلى DNase I المعاد تكوينه وقم بتوزيع المحلول في حصص ذات استخدام واحد في أنابيب خالية من النوكلياز. قم بتخزين DNase I المعاد تكوينه عند -30 درجة مئوية إلى -10 درجة مئوية.
  3. بدءا من 200 ميكرولتر من البلازما ، أضف 200 ميكرولتر من محلول OMG المبرد.
  4. دوامة 15-30 ثانية لضمان التجانس الكامل. في حالة حدوث رغوة ، اترك العينة تستقر على الجليد.
  5. أضف 200 ميكرولتر من محلول التحلل و 25 ميكرولتر من البروتيناز K إلى العينة المتجانسة والدوامة لمدة 20 ثانية.
  6. احتضان العينات لمدة 15 دقيقة في خلاط حراري مسخن مسبقا عند 37 درجة مئوية.
  7. قم بتحميل خرطوشة لكل عينة على درج سطح الأداة وضع القابس في الموضع المناسب.
  8. انقل المحللة إلى الموضع المناسب في خرطوشة الجهاز.
  9. أضف 5 ميكرولتر من محلول DNase I إلى الموضع المناسب في الخرطوشة.
  10. أضف 60 ميكرولتر من الماء الخالي من النوكلياز إلى قاعدة كل أنبوب شطف.
  11. حدد طريقة "RSC miRNA Tissue" وابدأ تشغيل التنقية الآلي. يمكن تخزين إجمالي عينات الحمض النووي الريبي عند -80 درجة مئوية.

الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.

الإفصاحات

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,
لم يتم الإعلان عن أي تضارب في المصالح.

المواد

قائمة المواد المستخدمة في هذه المقالة الاسم الشركة رقم فهرسي التعليقات 1x برنامج تلفزيوني لونزا بك-17-516 20xTE عازلة ، درجة الحموضة 8.0 مسبار جزيئي ت11493 قم بتخفيف محلول المخزون 20X للحصول على تركيز نهائي يبلغ 0,1X في الماء الخالي من النوكلياز مياه خالية من النوكلياز ماكسويل RSC miRNA مجموعة المناديل بروميجا إيه إس 1460 تحتوي المجموعة على محلول التجانس و DNase I و Proteinase K و Lysis Buffer والخراطيش. بالنسبة إلى 1-ثيوجلسرين ، يجب تجنب الاستنشاق والتلامس مع الجلد والعينين. استخدمه تحت خزانة الدخان. مجموعة جمع الدم بقفل الأمان بالمكنسة الكهربائية بيكتون ديكنسون 367286-364815 خلاط دوامة فيلب ساينتيفيكا F202A0173 ThermoMixer تي شاكر يوروكلون أ00564 ارفع الخلاط الحراري إلى 37 درجة مئوية قبل البدء في استخراج الحمض النووي الريبي ماكسويل RSC الأداة بروميجا إيه إس 4500 قوارير مبردة 1.5 مل سيجما ألدريتش Z359033

إعادة الطباعة والأذونات

طلب إذن لإعادة استخدام النص أو الأشكال في مقالة JoVE هذه

طلب إذن

الوسوم

RNA Proteinase K 1 DNase 1 miRNA

مقالات ذات صلة