يتطلب اشتراك JoVE لعرض هذا المحتوى. تسجيل الدخول أو ابدأ نسخة تجريبية مجانية

مقالة منهجية

عزل الإكسوسوم: تقنية لفصل الإكسوسومات عن بلازما مرضى سرطان الرئة ذو الخلايا غير الصغيرة

4.2K مشاهدات

أبريل 30, 2023

في هذه المقالة

الملخص

المصدر: Giallombardo, M., et al. تحليل الحمض النووي الريبي الخارجي في بلازما مرضى سرطان الرئة ذو الخلايا غير الصغيرة (NSCLC) من خلال qPCR: أداة خزعة سائلة مجدية. J. Vis. Exp.(2016).

يمكن استخدام الإكسوزومات المعزولة بالبلازما كطريقة غير جراحية وقابلة للتكرار للكشف عن المؤشرات الحيوية ومتابعتها للكشف المبكر وتطور المرض. يصف هذا الفيديو بروتوكول فصل الإكسوسومات عن عينات البلازما لمرضى سرطان الرئة ذو الخلايا غير الصغيرة ، والتي يمكن استخدامها لاستخراج الحمض النووي والبروتين.

البروتوكول

< p class = "jove_title" >1. عزل Exosome

ملاحظة: تم عزل الإكسوسومات من عينات البلازما باستخدام مجموعة تجارية ، وفقا لبروتوكول الشركة المصنعة وبإضافة معالجة RNAse: (يجب تنفيذ جميع هذه الخطوات باستخدام معدات الحماية الشخصية والبيئية واتباع إجراءات قانونية محددة للتلاعب بالعينات البيولوجية).

  1. خذ 1 مل من البلازما من كل عينة ، مخزنة عند -80 درجة مئوية ، وضعها على الثلج.
  2. الطرد المركزي للعينة عند 2,000 × جم لمدة 20 دقيقة في RT ؛ هذا المقطع إلزامي لإزالة الخلايا والحطام.
  3. انقل المادة الطافية التي تحتوي على البلازما النظيفة إلى أنبوب جديد سعة 1.5 مل.
  4. جهاز الطرد المركزي للأنبوب الجديد عند 10,000 × جم لمدة 20 دقيقة في RT.
  5. انقل المادة الطافية التي تحتوي على البلازما النظيفة إلى أنبوب جديد سعة 1.5 مل.
  6. أضف 100 نانوغرام / مل من الحمض النووي الريبي إلى المادة الطافية واحتضان الأنبوب عند 37 درجة مئوية لمدة 10 دقائق من أجل تحلل الحمض النووي الريبي المتداول.
  7. انقل كل البلازما المعالجة إلى أنبوب جديد سعة 2 مل وأضف 0.5 حجم من 1x PBS.
  8. دوامة العينة من أجل خلط المحاليل.
  9. أضف 0.05 محضر من محلول Proteinase K (مرفق في المجموعة) إلى العينة.
  10. دوامة العينة ثم احتضانها عند 37 درجة مئوية لمدة 10 دقائق.
  11. أضف 0.2 حجم من المخزن المؤقت لهطول الأمطار إلى العينة واخلط المحاليل عن طريق الانعكاس.
  12. احتضان العينة عند 2 درجة مئوية إلى 8 درجات مئوية لمدة 30 دقيقة ثم قم بالطرد المركزي للعينة عند 10,000 × جم لمدة 5 دقائق في RT.
  13. استنشق وتخلص من المادة الطافية. تحتوي الحبيبات على الإكسوسومات المعزولة.
  14. أضف المخزن المؤقت المحدد إلى حبيبات الإكسوسوم من أجل تعليق الإكسوسوم. يعتمد اختيار المخزن المؤقت على التحليل المخطط له ، في هذه الحالة:
    1. أضف 100 ميكرولتر من 1x PBS لإجراء تحليل TEM.
    2. أضف 346.5 ميكرولتر من مخزن التحلل المحدد لاستخراج الحمض النووي الريبي (من مجموعة تجارية) (تنبيه: خطر كيميائي).
    3. أضف 100 ميكرولتر من محلول التحلل لاستخراج البروتين (Tris-HCl 50 ملي مولار ، درجة الحموضة 7.6 - كلوريد الصوديوم 300 ملي مولار - تريتون X-100 0.5٪ - PMSF 1 ملي مولار - ليوبيبتين / أبروتينين 10 ميكروغرام / مل) من أجل إجراء تحليل النشاف الغربي. (تنبيه: المخاطر الكيميائية).
  15. قم بتخزين الإكسوزومات العالقة عند -20 درجة مئوية.

الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.

الإفصاحات

لم يتم الإعلان عن أي تضارب في المصالح.

المواد

قائمة المواد المستخدمة في هذه المقالة الاسم الشركة رقم فهرسي التعليقات مجموعة عزل الإكسوسوم الكلي (من البلازما) إنفيتروجين 4484450 استخدم علاج بروتيناز K ريبونوكلياز أ سيجما ألدريتش R4875-100 ملغ مجموعة RNAspin Illustra الصغيرة 50 جنرال إلكتريك للرعاية الصحية 25-0500-71

الوسوم

RNAse Proteinase K RNA