1. إنتاج فيروس التهاب الكبد B (HBV) المؤتلف الذي يشفر البروتين المراسل
- تحضير خلايا HepG2
- تحضير وسط زراعة الخلايا (وسط Dulbecco's modified Eagle's medium (DMEM) المكمل بـ 10% مصل جنين البقر (FBS)، و100 U/ml بنسلين، و100 µg/ml ستريبتومايسين، و100 U/ml أحماض أمينية غير أساسية).
- زرع 4 x 106 من خلايا HepG2 (سرطان الخلايا الكبدية البشرية G2) في طبق قطر 10 سم مغطى بالكولاجين في 10 ml من وسط الزراعة قبل يوم من عملية عفن الخلايا (transfection). تُحضن خلايا HepG2 عند 37 °C في حاضنة رطبة تحتوي على 5% CO2.
ملاحظة: عند زرع ما يقرب من 4 x 106 من خلايا HepG2 في طبق قطر 10 سم مغطى بالكولاجين في 10 ml من وسط الزراعة، ستصل نسبة تلاقي الخلايا (confluency) إلى 70-90% في اليوم التالي.
- عفن الخلايا (Transfection)
- إجراء عملية عفن لخلايا HepG2 باستخدام 5 µg من pUC1.2HBV delta epsilon15 (بلازميد تضاعف HBV يحتوي على حذف في تسلسل epsilon) و 5 µg من pUC1.2HBV/NL15 باستخدام كاشف عفن وفقاً لتعليمات الشركة المصنعة.
- في اليوم التالي، يُزال وسط الزراعة ويُضاف 10 ml من وسط زراعة جديد.
- بعد مرور أسبوع على عملية العفن، يُنقل وسط الزراعة الذي يحتوي على HBV المؤتلف إلى أنبوب سعة 50 ml، ثم يتم الانتقال إلى الخطوة 1.3. يُضاف 10 ml من وسط زراعة جديد إلى الطبق الذي يحتوي على الخلايا المعفنة.
ملاحظة: يتم الحفاظ على إنتاج HBV المؤتلف لمدة 4 أسابيع. ويمكن تخزين وسط الزراعة الذي يحتوي على HBV المؤتلف عند 4 °C لمدة شهر واحد.
- تنقية HBV المؤتلف
- إزالة حطام الخلايا من وسط الزراعة الذي يحتوي على HBV المؤتلف عن طريق الطرد المركزي (2,300 x g لمدة 5 min).
- تمرير الطافي عبر مرشح غشائي بمسامية 0.45 µm.
- إضافة حجم مساوٍ من 26% PEG/1.5 M NaCl (بولي إيثيلين جلايكول 6000: 130 g، وكلوريد الصوديوم NaCl: 49 g، و 1 ml من 0.5 M EDTA (حمض إيثيلين ثنائي الأمين رباعي الخليك) عند pH 8.0، و 5 ml من 1 M HEPES (حمض N-2-hydroxyethylpiperazine-N'-2-ethanesulfonic) عند pH 7.6 في 500 ml) إلى وسط الزراعة الذي يحتوي على HBV المؤتلف والمزج برفق. تُحضن العينة طوال الليل عند 4 °C.
- الطرد المركزي عند 2,300 x g لمدة 20 min عند 4 °C.
- التخلص من الطافي وإذابة الراسب في 0.5 ml من TNE (10 mM Tris، و 50 mM NaCl، و 1 mM EDTA).
- إزالة الحطام عن طريق الطرد المركزي عند 2,300 x g لمدة 5 min.
- تحميل 0.5 ml من TNE الذي يحتوي على HBV المؤتلف فوق 0.8 ml من السكروز بتركيز 20% في TNE.
- الطرد المركزي عند 100,000 × g لمدة 3 hr عند 15 °C.
- التخلص من أكبر قدر ممكن من الطافي، والاحتفاظ بالراسب. يُعاد تعليقه في 1 ml من DMEM خالي من المصل لكل 40 ml من وسط الزراعة الأصلي.
- التحضين طوال الليل عند 4 °C.
- الترشيح عبر مرشح بمسامية 0.45 µm. تحضير حصص (aliquots) بحجم 0.5 ml وتخزينها عند -80 °C.
ملاحظة: في حال لوحظ تلوث عينة الفيروس الأصلية ببروتين مراسل (reporter protein)، يتم تنقية الفيروس عن طريق الطرد المركزي الفائق بتدرج الكثافة للسكروز بتركيز 5-30% في TNE عند 100,000 x g لمدة 2 hr، أو الطرد المركزي متوازن الكثافة باستخدام CsCl (كلوريد السيزيوم) من 1.1-1.6 g/ml عند 150,000 x g لمدة 50 hr.