1. الطيور البرية التقاط باستخدام الشباك الضباب
- لالتقاط shorebird ، وإنشاء شبكات في ضباب موقعا نشطا العلف مثل المستنقعات ، الشاطئ ، أو الطين المسطحة.
- المثلثة الشريحة من خط حلقات واحدة من نهاية صافي الضباب حول القطب والقطب إدراج عموديا في الوحل.
- تمتد الصافية ، القطب الثاني من خلال إدراج حلقات المثلثة في الطرف الآخر من صافي الضباب وإدراج عموديا قطب في الوحل ، والتأكد من أن يتم تدريسها للخطوط المثلثة.
- حالما يتم القبض على الطيور ، واستخراج الطيور من الشبكة والعودة الى المحطة النطاقات.
2. المسحة المذرقية أخذ العينات
- جمع مسحات المذرقية مباشرة بعد التقاط
- تحديد موقع مجرور واستخدام الأصابع لابعاد المحيطة الريش
- بسط a الداكرون أو بوليستر معقمة ذات الرؤوس المسحة ، الجذعية نهاية الأول ، ويبلل طرف العقيمة مع وسائل الاعلام عن نقل الفيروس بسهولة أكبر في ينظف. بعد تبليل ، يتم إدراج برفق الرأس كله من المسحة في مجرور. محيط مسحة من داخل مجرور بواسطة التدوير ببطء وإزالة المسحة مسحة من مجرور.
- إدراج غيض مسحة مباشرة في قارورة نقل عينة فيروسية وسائل الإعلام ؛ تدوير رمح المسحة بين الإبهام والسبابة بينما المسحة في وسائل الإعلام. لديك مساعد إكمال الإجراء عن طريق سحب غيض من الظهر مسحة من الجزء السفلي من القارورة ~ 1 سم وقطع رمح المسحة مع زوج من مقص ذلك غيض المسحة يبقى في قارورة ورمح لا تتداخل مع إغلاق الغطاء. غطاء القنينة بإحكام. تطهير المقص مع الكحول بين عدة قطاعات في مهاوي المسحة.
- ضع قارورة في الثلاجة مربع تحتوي اما الثلج الجاف أو كمادات الثلج.
3. البلعوم مسحة أخذ العينات
- فتح منقار الطائر بلطف بحيث الشق منعري مرئيا
- بسط مسحة نظيفة من الحزمة ، الجذعية نهاية الأول ، ويبلل طرف مع وسائل الاعلام عن نقل الفيروس بسهولة أكبر في ينظف
- دون لمس أي تلميح إلى السطوح الأخرى ، وأدخله في الفم والمسحة افتتاح منعري على سقف الفم ويستمر مرة أخرى نحو منطقة البلعوم أو الحنجرة
- مكان غيض مسحة مباشرة في قارورة نقل وسائل الاعلام الفيروسية. تدوير رمح المسحة بين الإبهام والسبابة بينما المسحة في وسائل الإعلام. كما ذكر أعلاه ، لديك مساعد سحب غيض من الظهر مسحة من الجزء السفلي من القارورة ~ 1 سم وقطع رمح المسحة مع زوج من مقص ذلك غيض المسحة يبقى في قارورة ورمح لا تتداخل مع غطاء الإغلاق. غطاء القنينة بإحكام. تطهير المقص مع الكحول بين عدة قطاعات في مهاوي المسحة.
- ضع قارورة في الثلاجة مربع تحتوي على جليد جاف أو كمادات الثلج.
4. تداول الطيور والإفراج
- عودة الطيور الى موقع اعتقال والافراج عنه في الوقت المناسب (<20mins). وينبغي أن يكون على بينة من معالجات لمبادئ الرفق بالحيوان ، ويكون في حالة تأهب لعلامات الطيور معاناة أثناء أخذ العينات (أي سحجات ، والتقاط عضلي وقصور أو ارتفاع الحرارة). وينبغي أن يدرج الإسعافات الأولية الأساسية في قائمة المعدات.
5. مرافق الاختبار
- ويمكن اختبار عينات في أي مكان مغلق مثل البحوث أو مقطورة خيمة ، مع امدادات الطاقة (الجهد التنظيم مولد للطاقة) لتشغيل وحدة PCR وجهاز كمبيوتر مربوط.
6. استخراج الحمض النووي الريبي
- أجري استخراج الحمض النووي الريبي مع طقم ميني RNeasy مع تعديلات طفيفة لتعليمات الشركة الصانعة التالية Spackman آخرون 1
- دوامة المتوسط مسحة لمدة 3-5 ق ونقل 350 ميكرولتر لأنبوب microcentrifuge 2 مل. ملاحظة : حافظ على ما تبقى العينة على الجليد في حالة PCR إيجابية العينات تحتاج إلى rescreened H5 أو اختبار يحتاج إلى تشغيل.
- إضافة 350 ميكرولتر من RLT العازلة (مع لي ، β) ودوامة لمدة 5 ثانية.
- إضافة 350 ميكرولتر من الايثانول الصف RNA 70 ٪.
- الطرد المركزي في 5000 x ج لمدة 5 دقائق.
- إضافة 600 ميكرولتر من طاف على عمود الدوران وضعت في أنبوب جمع 2 مل. تحتفظ العينة المتبقية في رفوف أنبوب اختبار.
- أجهزة الطرد المركزي لمدة 20 ثانية في XG 10000 والمرتجع من خلال تدفق.
- كرر الخطوات من 17-18 حتى يتم تمرير كافة العينة من خلال عمود الدوران.
- العمود تدور في مكان نظيف 2 أنبوب جمع مل.
- إضافة 700 ميكرولتر من RW1 العازلة إلى العمود وتدور أجهزة الطرد المركزي في 25 ق ز س 10000 تجاهل التدفق من خلال.
- إضافة 500 العازلة RPE ميكرولتر إلى العمود وتدور أجهزة الطرد المركزي لمدة 25 ثانية في ز س 10000 تجاهل التدفق من خلال.
- كرر الخطوة 22 لمجموعه اثنين من يغسل مع العازلة RPE.
- الطرد المركزي عمود الدوران لدقائق إضافية في 2 ز س 14000 تجاهل أنبوب جمع.
- مكان العمود تدور في أنبوب 1.5 مل نظيف وإضافة microcentrifuge 50μl nuclease خالية من المياه. يحضن في درجة حرارة الغرفة لمدة 60 ثانية.
- أزل الحمض النووي الريبي من خلال الدوران لمدة 60 ثانية في xgf 10000 أو 60 ثانية. مكان تنقية العينة على الجليد.
7. إعداد الضوابط السلبية
- وقد تم إعداد الكواشف مجفد لاستخدامها في فحص PCR وفقا لتعليمات من ايداهو تكنولوجيز تجميد المجفف الكاشف أدوات الكشف عن أنفلونزا مجسات TaqMan والهدف 1 (الاساي - ASY - 0109).
- الطرد المركزي السلبية فيال كاشف التحكم (أحمر) لمدة 3 ليالي لضمان الكريات هي في القاع.
- إزالة الغطاء ، وجعل بصريا تأكد من الكريات في القاع.
- إضافة 20 ميكرولتر العازلة إعادة إعماره من 2 س و 20 ميكرولتر الصف الكاشف المياه.
- خلاصة ودوامة لمدة 5 ليالي في أقصى سرعة.
- أجهزة الطرد المركزي لمدة 3 ليالي لجلب السائل إلى قاع القارورة.
- فحص البصر وممهى بيليه ، إن لم يكن كرر الخطوات من 31-32.
- 19 ميكرولتر ماصة للخليط رطب في أنبوب Lightcycler الشعرية ، كرر الخطوة ماصة في شعري الثاني الحصول على نسخة مكررة.
8. إعداد عينات الاختبار
- الطرد المركزي القارورة كاشف معروف (الأزرق) لمدة 3 ثوانى لضمان الكريات هي في القاع.
- إزالة الغطاء ، وجعل بصريا تأكد من الكريات في القاع.
- إضافة 40 ميكرولتر تنقيته من الحمض النووي الريبي.
- خلاصة ودوامة لمدة 5 ليالي في أقصى سرعة.
- أجهزة الطرد المركزي لمدة 3 ليالي لجلب السائل إلى قاع القارورة.
- فحص البصر وممهى بيليه ، إن لم يكن كرر الخطوات من 38-39.
- 19 ماصة ميكرولتر من خليط رطب في أنبوب Lightcycler الشعرية ، كرر الخطوة ماصة في شعري الثاني الحصول على نسخة مكررة.
9. إعداد الضوابط الإيجابية
- الطرد المركزي الكاشف مراقبة إيجابية فيال (الخضراء) لمدة 3 ليالي لضمان الكريات هي في القاع.
- إزالة الغطاء ، وجعل بصريا تأكد من الكريات في القاع.
- إضافة 20 ميكرولتر العازلة إعادة إعماره من 2 س و 20 ميكرولتر الصف الكاشف المياه.
- خلاصة ودوامة لمدة 5 ليالي في أقصى سرعة.
- أجهزة الطرد المركزي لمدة 3 ليالي لجلب السائل إلى قاع القارورة.
- فحص البصر وممهى بيليه ، إن لم يكن كرر الخطوات من 45-46.
- 19 ميكرولتر ماصة للخليط رطب في أنبوب Lightcycler الشعرية ، كرر الخطوة ماصة في شعري الثاني الحصول على نسخة مكررة.
10. أنابيب الطرد المركزي الشعرية
- مرة واحدة وقد أعدت كل من الأنابيب الشعرية للدفعة تحميلها على جهاز الطرد المركزي صغيرة مزودة محولات الشعرية.
- الطرد المركزي عند أدنى الإعداد بواسطة الضغط على زر أسفل النبض لمدة 1 ثانية. هذه التحويلات السائل إلى أسفل في التحضير للاختبار.
11. التشغيل السريع
- إنشاء ملف جديد. تحكم تسمية إيجابية ، ومراقبة سلبية ، وعينات (بواسطة رقم الهوية الخاصة بهم).
- البرنامج 1 : إعداد نموذج عقد RNA
- دورات = 1
- تحليل الوضع = بلا
- درجة الحرارة = 40 هدفا
- فترة حضانة = 30 دقيقة
- معدل درجة الحرارة الانتقالية = 20 درجة مئوية / ثانية (الافتراضي)
- الهدف الثانوي درجة الحرارة = 0 (الافتراضي)
- الخطوة الحجم = 0 (الافتراضي)
- تأخير خطوة = 0 (الافتراضي)
- اكتساب وضع = بلا (الافتراضي)
- البرنامج 2 : رنا تمسخ
- دورات = 1
- تحليل الوضع = بلا
- درجة الحرارة = 94 هدفا
- فترة حضانة = 120s
- معدل درجة الحرارة الانتقالية = 20 درجة مئوية / ثانية (الافتراضي)
- الهدف الثانوي درجة الحرارة = 0 (الافتراضي)
- الخطوة الحجم = 0 (الافتراضي)
- تأخير خطوة = 0 (الافتراضي)
- اكتساب وضع = بلا (الافتراضي)
- البرنامج 3 : رنا التضخيم
- دورات = 45
- تحليل الوضع تحليل = السيارات
- درجة الحرارة المستهدفة ، الجزء 1 = 94 ؛ الجزء 2 = 60
- فترة حضانة ، الجزء 1 = 0 ثانية ، الجزء 2 = 20 ق
- معدل انتقال الحرارة ، SEG 1 & 2 = 20 درجة مئوية / ثانية (الافتراضي)
- الهدف الثانوي درجة الحرارة ، SEG 1 & 2 = 0 (الافتراضي)
- الحجم الخطوة ، SEG 1 & 2 = 0 (الافتراضي)
- تأخير الخطوة ، SEG 1 & 2 = 0 (الافتراضي)
- وضع الاستحواذ ، الجزء 1 = لا شيء ؛ الجزء 2 = واحد
- مضان معلمات
- طريقة العرض : قناة مضان 2 (CH2 / 1)
المكاسب : - الفصل 1 (F1) = 1
- الفصل 2 (F2) = 8
- CH 3 (F3) = 1
- لعرض البيانات في الوقت الحقيقي ومضان لكل عينة ، حدد عينة من الفائدة وانقر على زر 'الرسم البياني عرض" في الجزء السفلي من الشاشة
- لكل الشعرية ، وتتضمن النتائج التالية :
- # -- يحدد موقف دائري من دائري
- اسم العينة -- يقدم اسم العينة
- السيطرة -- indentifies نوع العينة لكل عينة
- نتائج -- يحسب باستخدام العلاقة بين مضان العينة ومستوى مضان الخلفية في العينة
- النتيجة -- يعرض على النتيجة الاجمالية للعينة
12. ممثل النتائج :
> النتائج المحتملة تشمل ما يلي :
الحاضر : أحمر 'الحاضر' دعوة لاختبار / عينة مجهولة تشير إلى أنه تم تحديد الهدف في تلك العينة والضوابط كانت ناجحة.
لم يتم الكشف عن : A الخضراء "لم يتم الكشف عن" دعوة لاختبار / عينة مجهولة لا تشير إلى أنه تم تحديد الهدف في تلك العينة واختبار الضوابط كانت ناجحة.
يرجى أكرر : A 'الرجاء تكرار" يشير إلى أن السيطرة إيجابية أو سلبية فاشلة.
ويرد مثال لتحليل الناجحة التي قام بها في 7200 RAPID في الشكل 4. يتم تضخيمه لسيطرة الإيجابية ويولد مضان كشفها (المحور الصادي) في حوالي 25 دورة (محور س). عتبة دورة (CT)> 35 هو وقف انتاج المواد الانشطارية وافقت على معظم المختبرات المرجعية AIV. لذلك ، أنتجت الضوابط الإيجابية لهذا الأسلوب إشارة الفلورسنت ضمن عدد من الدورات قبلت (0-35) للكشف عن AIV. في المقابل ، فإن السيطرة السلبية لا تولد إشارة الفلورسنت حتى بعد 45 دورات. وبالمثل ، فإن العينات التي تم جمعها من twelve الطيطوي الغربية لم تولد إشارة الفلورسنت مشيرا الى ان الطيور كانت سلبية للAIV. ومما يشجع متابعة اختبار جميع العينات الايجابية في المختبر التقليدية لضمان أن يتم إنتاج أي خطأ ايجابيات كاذبة.

التقاط Shorebird الرقم 1. استخدام شبكات الضباب.

الشكل 2. المذرقية جمع العينات والفم والبلعوم من أقل الطيطوي.

الشكل 3. برمجة 7200 RAPID لتضخيم الحمض النووي الريبي.

الشكل 4. Fluorogram التي تم إنشاؤها بواسطة RAPID 7200 المحمولة RRT - PCR تبين كيف الضوابط الإيجابية والسلبية يجب أن تظهر في الفحص بنجاح. انقر هنا لعرض صورة كاملة الحجم