$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
تم تنفيذ جميع الإجراءات التي تنطوي على جمع العينات وفقا لإرشادات IRB الخاصة بالمعهد.
< p class = "jove_title" >1. إعداد المخزن
المؤقت
ملاحظة: في حالة إجراء تسلسل الحمض النووي الريبي النهائي، عالج جميع مساحات العمل والأدوات بدقة باستخدام حل إزالة التلوث RNase لمنع تدهور الحمض النووي الريبي.
- تحضير المخزن المؤقت للتحلل.
- قم بإذابة ما يلي في الماء المقطر (H2O) حتى 50 مل: 5.47 جم من السكروز (0.32 م نهائي) ، 250 ميكرولتر من 1 M كلوريد الكالسيوم (CaCl2) (5 ملي مولار نهائي) ، 150 ميكرولتر من أسيتات المغنيسيوم 1 م (Mg (CH3COO) 2) (3 ملي مولار نهائي) ، 10 ميكرولتر من 500 ملي مولار حمض الإيثيلين ديامين تترا أسيتيك (EDTA) (0.1 ملي مولار نهائي) ، 500 ميكرولتر من 1 M حمض تريس هيدروكلوريك (Tris-HCl) (درجة الحموضة 8) (10 ملي مولار نهائي) ، 50 ميكرولتر من Triton X-100 (0.1٪ نهائي) ، و 17 ميكرولتر من 3 M dithiothreitol (DTT ، 1 ملي مولار نهائي ، أضف طازجا) (انظر جدول المواد).
- تحضير السكروز عازلة
- قم بإذابة ما يلي في H2O المقطر حتى 50 مل: 30.78 جم من السكروز (1.8 م نهائي) ، 150 ميكرولتر من 1 م مجم (CH3COO) 2 (3 ملي مولار نهائي) ، 500 ميكرولتر من 1 M Tris-HCl (درجة الحموضة 8) (10 ملي مولار نهائي) ، 17 ميكرولتر من 3 M DTT (1 ملي مولار نهائي ، أضف طازجا).
فئة
2. تفكك الأنسجة المجمدة في تعليق أحادي النواة
- أضف 4 مل من محلول التحلل المثلج البارد إلى مطحنة مناديل زجاجية سعة 7 مل ، واستمر في وضع الثلج. قم بتشريح ما يقرب من 200-400 مجم من قشرة البالغين البشرية المجمدة حديثا ، وقم بتفريغ ما يقرب من 50 ضعفا ، وانقل الأنسجة المتجانسة إلى أنبوب بولي بروبيلين فائق الطرد المركزي سعة 12 مل.
- باستخدام ماصة سعة 5 مل ، أضف 6.5 مل من السكروز البارد إلى قاع أنبوب الطرد المركزي الفائق ، مع الحرص على عدم إزعاج الطبقة بين السكروز وتجانس الأنسجة.
ملاحظة: في حالة معالجة عينات إضافية ، قم بموازنة الأنابيب بعناية حسب الوزن عن طريق إضافة مخزن مؤقت إضافي للتحلل إلى العينة الأخف. يعد التوازن الدقيق لأنابيب الطرد المركزي الفائق أمرا ضروريا لمنع تلف الدوار وضمان الدوران بالسرعة المناسبة.
فئة
3. الطرد المركزي الفائق
جهاز - الطرد المركزي الفائق المحلل عند 24,400 دورة في الدقيقة (101,814 × جم) لمدة 1 ساعة عند 4 درجات مئوية><.
ملاحظه: قد لا تكون الحبيبات مرئية إذا بدأت بأقل من 200 ملغ من الأنسجة.
- أضف 600 ميكرولتر من المحلول الملحي المخزن بالفوسفات (PBS) (الكالسيوم (Ca2+) والمغنيسيوم (Mg2+) خالي) إلى حبيبات النوى واحتضنه على الجليد لمدة 10 دقائق قبل إعادة التعليق.
- الماصة لأعلى ولأسفل 50 مرة لإعادة تعليق حبيبات النوى على الجليد.
- استخدم مقياس كثافة الدم لتصور النوى السليمة تحت المجهر وللتأكد من أن تركيز إعادة التعليق أعلى من 105 نوى / مل قبل الانتقال إلى الخطوة التالية (اجمع 10 ميكرولتر من النوى المعلقة مع 10 ميكرولتر من التريبان الأزرق).
فئة
4. حضانة الأجسام المضادة
- لوضع علامة مناعية على العينة لفرز النوى المنشطة بالفلورة (FANS) ، أضف 500 ميكرولتر من حبيبات العينة المعلقة ، 490 ميكرولتر من 1x PBS (Ca2+ ، Mg2+ مجانا) ، 10 ميكرولتر من 10٪ ألبومين مصل البقر (BSA) (0.1٪ نهائي) ، 1 ميكرولتر من الجسم المضاد للفأر المضاد للنيوتروجين المقترن بالأذيني (أليكسا فلور) 555 (NeuN-AF555 ، التركيز النهائي 1: 1000) ، و 1 ميكرولتر من الجسم المضاد للفأر المضاد ل PAX6 المترافق مع الوفيكوسيانين (PAX6-APC ، التركيز النهائي 1: 1000).
ملاحظه: يمكن إضافة الأجسام المضادة البديلة المترافقة مع الفلوروفورات الأخرى. هنا ، تم استخدام الفأر المضاد ل OLIG2 المترافق مع AF488 (تركيز 1: 1000) مع نتائج إيجابية.
- قم بإجراء عناصر تحكم 4 ′ و 6-diamidino-2-phenylindole (DAPI) فقط وأحادية اللون لإعداد معلمات البوابات ، باستخدام كمية صغيرة من العينة حسب الضرورة.
- لإجراء تحكم أحادي اللون AF555 ، أضف 20 ميكرولتر من حبيبات العينة المعلقة ، و 970 ميكرولتر من 1x PBS (Ca2+ ، Mg2+ مجانا) ، و 10 ميكرولتر من 10٪ BSA (0.1٪ نهائي) ، و 1 ميكرولتر من الجسم المضاد NeuN-AF555 (تركيز 1: 1000).
- لإجراء تحكم أحادي اللون APC ، أضف 20 ميكرولتر من حبيبات العينة المعلقة ، و 970 ميكرولتر من 1X PBS (Ca2+ ، Mg2+ مجانا) ، و 10 ميكرولتر من 10٪ BSA (0.1٪ نهائي) ، و 1 ميكرولتر من الجسم المضاد PAX6-APC (تركيز 1: 1000).
- لإجراء التحكم في DAPI (4',6-diamidino-2-phenylindole) فقط, أضف 20 ميكرولتر من حبيبات العينة المعلقة, 970 ميكرولتر من 1X PBS (Ca2+, Mg2+ مجانا), و 10 ميكرولتر من 10٪ BSA (0.1٪ نهائي) (سيتم إضافة DAPI لاحقا, انظر 4.4).
ملاحظه: إذا تم استخدام أكثر من جسمين مضادين ، يوصى بإجراء التحكم في التألق ناقص واحد (FMO) بالإضافة إلى عناصر التحكم أحادية اللون.
- احتضان العينات وأدوات التحكم مع الدوران في الظلام لمدة 1 ساعة عند 4 درجات مئوية.
- أضف DAPI عند 1: 1000 إلى جميع العينات وعناصر التحكم ، وتابع الفرز.