مقالة منهجية

تقييم حالة Palmitoylation لبروتينات غشاء الخلية من أنسجة دماغ الفئران

يوليو 8, 2025

في هذه المقالة

الملخص

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

المصدر: Speca, D. J., et al. مقايسة تحول هلام تبادل Acyl-PEGyl للتحديد الكمي لبالميتويلاسیون لبروتينات غشاء الدماغ. J. Vis. Exp. (2020).

يوضح الفيديو تحليل حالة البالميتويل لبروتينات غشاء الخلية المعزولة من أنسجة دماغ الفئران. تتضمن العملية تعريض السيستين غير البالميتويليات ومنعها ، ثم استخدام بوليمر يرتبط بالسيستين البالميتويل ، مما يساعد في تقييم حالة البالميتويلاسیون للبروتينات المعزولة.

البروتوكول

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

تمت مراجعة جميع الإجراءات التي تنطوي على عينات حيوانية والموافقة عليها من قبل لجنة المراجعة الأخلاقية الحيوانية المناسبة.

< p class = "jove_title" >1. تحضير أغشية دماغ الفأر

  1. اقطع رأس الفأر باستخدام جهاز المقصلة وقم بتشريح الدماغ بسرعة (في <1 دقيقة ، إن أمكن ، لتقليل تغيرات البالميتويل التي قد تحدث أثناء إجراء التشريح). تجانس على الفور في 10 مل من مخزن التجانس (الجدول 1) في الخالط الزجاجي (~ 12 ضربة) على الجليد.
  2. تعمل أجهزة الطرد المركزي على التحلل لمدة 15 دقيقة عند 1,400 × جم عند 4 درجات مئوية. انقل المادة الطافية إلى أنبوب جديد على الجليد. أعد تعليق الحبيبات (~ 6 ضربات) في حجم متساو من مخزن التجانس والطرد المركزي عند 710 × جم لمدة 10 دقائق عند 4 درجات مئوية.
  3. اجمع بين المواد الطافية من الخطوة 1.2 وأجهزة الطرد المركزي عند 40,000 × جم لمدة 20 دقيقة عند 4 درجات مئوية.
  4. تخلص من المادة الطافية (الجزء العصاري الخلوي) وأعد تعليق جزء الغشاء المحبب (P2) في المخزن المؤقت للتجانس.
    ملاحظه: يمكن تجميد العينات وتخزينها في درجة حرارة -80 درجة مئوية لاستخدامها لاحقا.
  5. إجراء اختبار حمض البيسنكونينيك (BCA) لتحديد مستويات البروتين. بالنسبة لمقايسة إزاحة هلام تبادل Acyl-PEGyl (APEGS) ، ابدأ ب ~ 100-200 مجم بروتين (بحد أقصى 250 مجم) بحجم 470 ميكرولتر من المخزن المؤقت A (الجدول 1) في أنبوب 1.5 مل. صوتيا وأجهزة الطرد المركزي عند >13,000 × جم لمدة 10 دقائق عند 25 درجة مئوية لإزالة البروتين غير القابل للذوبان. نقل البروتين المذاب إلى أنبوب جديد سعة 1.5 مل.
< p class = "jove_title" >2. مقايسة إزاحة هلام تبادل Acyl-PEGyl (APEGS)

  1. تعطيل روابط ثاني كبريتيد ومنع السيستين الحرة.
    1. تعطيل روابط ثاني كبريتيد عن طريق احتضان 25 ملي مولار تريس (2-كربوكسي إيثيل) فوسفين (TCEP ؛ 25 ميكرولتر ، مضاف من محلول مخزون ؛ الجدول 1) لمدة 60 دقيقة عند 55 درجة مئوية.
    2. كتلة السيستين الحرة مع 50 ملي مولار N-ethylmaleimide (NEM ؛ 12.5 ميكرولتر ، مضاف من محلول مخزون ؛ الجدول 1) في درجة حرارة الغرفة لمدة 3 ساعات < / > ملاحظه: يمكن تمديد رد الفعل بين عشية وضحاها.
  2. قم بإجراء ترسيب الميثانول الكلوروفورم (CM).
    1. انقل محلول البروتين من أنبوب سعة 1.5 مل إلى أنبوب بولي بروبيلين أو زجاج يمكن طرده في دوار دلو متأرجح بسرعة متواضعة. أنبوب 5 مل مثالي. أضف أربعة مجلدات (2 مل) من الميثانول (MeOH) والدوامة لفترة وجيزة.
    2. أضف مجلدين (1 مل) من الكلوروفورم والدوامة لفترة وجيزة.
    3. أضف ثلاثة أحجام (1.5 مل) من الماء منزوع الأيونات (dH2O) والدوامة لفترة وجيزة.
    4. الطرد المركزي للعينات عند 3,000 × جم لمدة 30 دقيقة عند 25 درجة مئوية في دوار دلو متأرجح.
    5. قم بإزالة المرحلة العليا وتجاهلها بعناية.
    6. أضف 3 أحجام (1.5 مل) من MeOH واخلطها برفق ولكن جيدا ، مع الحرص على عدم تجزئة فطيرة البروتين غير الشفافة.
    7. جهاز طرد مركزي عند 3,000 × جم لمدة 10 دقائق عند 25 درجة مئوية في دوار دلو متأرجح.
    8. باستخدام ماصة مصلية زجاجية ، قم بإزالة أكبر قدر ممكن من المرحلة العلوية دون إزعاج فطيرة البروتين.
    9. اشطف الحبيبات بعناية ب 1 مل من MeOH.
    10. جفف الحبيبات بالهواء لمدة لا تقل عن 10 دقائق
      ملاحظه: يمكن تخزين الحبيبات المجففة عند -20 درجة مئوية.
  3. قم بإجراء انقسام روابط بالميتويل ثيوستر مع هيدروكسيلامين (NH2OH ، HAM).
    1. أعد تعليق ترسيب البروتين في 125 ميكرولتر من العازلة A وصوتنة لفترة وجيزة. جهاز طرد مركزي عند >13,000 × جم لمدة 10 دقائق عند 25 درجة مئوية لإزالة المواد غير القابلة للذوبان. نقل البروتين المذاب إلى أنبوب جديد سعة 1.5 مل.
    2. أضف 375 ميكرولتر من المخزن المؤقت H (HAM + ؛ الجدول 1) أو المخزن المؤقت T (HAM-; الجدول 1) واحتضان العينات لمدة 60 دقيقة عند 25 درجة مئوية.
  4. كرر هطول الأمطار CM الموصوف في الخطوة 2.2.
    ملاحظه: يمكن تخزين الحبيبات المجففة عند -20 درجة مئوية.
  5. أضف mPEG إلى السيستين غير المحمي.
    1. أعد تعليق الحبيبات في 100 ميكرولتر من المخزن المؤقت A الذي يحتوي على 10 ملي مولار TCEP. نقل إلى أنبوب سعة 1.5 مل
      ملاحظه: من الطبيعي أن يحدث فقدان كبير للبروتين أثناء خطوات هطول الأمطار. سيتم تنفيذ جميع الخطوات اللاحقة في أنبوب سعة 1.5 مل ، مما يحد من حجم البروتين بحد أقصى ~ 120-130 ميكرولتر. سيؤدي ذلك إلى تقليل فقدان البروتين أثناء هطول الأمطار النهائي CM.
    2. أضف 20 ملي مولار mPEG-5k (25 ميكرولتر ، مضاف من محلول مخزون ؛ الجدول 1) لعينة البروتين وخلطها عن طريق سحب العينات. احتضن لمدة 60 دقيقة عند 25 درجة مئوية مع دوران من طرف إلى طرف.
    3. لإزالة mPEG-5k غير مدمج ، قم بإجراء ترسيب CM كما هو موضح في الخطوة 2.2 باستخدام هذه الأحجام المعدلة: 4 أحجام من MeOH (500 ميكرولتر) ، ومجلدان من الكلوروفورم (250 ميكرولتر) ، و 3 أحجام من dH2O (375 ميكرولتر). جهاز طرد مركزي عند >13,000 × جم لمدة 10 دقائق عند 25 درجة مئوية.
    4. قم بإزالة المرحلة العليا بعناية كما كان من قبل ، وتجنب الفطيرة السميكة والندفية. أضف 1 مل من MeOH واخلطه برفق ولكن جيدا. جهاز طرد مركزي عند >13,000 × جم لمدة 10 دقائق عند 25 درجة مئوية.
    5. قم بإزالة المادة الطافية بعناية واشطف الحبيبات ب 1 مل من MeOH. جهاز طرد مركزي عند >13,000 × جم لمدة 10 دقائق عند 25 درجة مئوية><. ملاحظه: يمكن تخزين الحبيبات المجففة عند -20 درجة مئوية.
    6. أعد تعليق الحبيبات المجففة في 50 ميكرولتر من المخزن المؤقت A (بدون TCEP أو أي عامل اختزال).

الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.

النتائج

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

الجدول 1: الحلول المستخدمة لمقايسة APEGS. يمكن تحضير المخزن المؤقت للتجانس والمخزن المؤقت A في وقت مبكر ؛ ومع ذلك ، أضف مثبطات البروتياز وفلوريد فينيل ميثيل سلفونيل (PMSF) مباشرة قبل الاستخدام. يجب تحضير جميع الحلول الأخرى طازجة.

...
Bufferالمكوناتconc.تعليقات

الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.

الإفصاحات

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,
لم يتم الإعلان عن تضارب في المصالح.

المواد

قائمة المواد المستخدمة في هذه المقالة
الاسمالشركةرقم فهرسيالتعليقات
هيدروكسيلامين (HAM) ثيرموفيشر 26103
Methoxy-PEG-(CH2)3NHCO(CH2)2-MAL (mPEG)NOFME-050MAميغاواط ~ 5000 كيلو دالتون
ميكروفوجإيبندورف5415R أو ما يعادلها من المعدات
ن-إيثيل مالميد (NEM)كالبيوكيم34115شديد السمية
تصوير بصري لقياس الكثافةAzure Biosystemsتصوير جزيئي حيوي من الياقوت أو ما يعادلها من المعدات
أنابيب البولي بروبلين مع غطاء فيشر العلمي14-956-1D
الماصات المصلية (الزجاج)فيشر العلمي13-678-27D
أجهزة الطرد المركزي على الطاولةبيكمانAllegra X-15R أو ما يعادلها من المعدات
تريس (2-كربوكسي إيثيل) فوسفين هيدروكلوريد (TCEP) EMD ميليبور 580560

إعادة الطباعة والأذونات

طلب إذن لإعادة استخدام النص أو الأشكال في مقالة JoVE هذه

طلب إذن

الوسوم

مقالات ذات صلة