وهناك طريقة لتوليد وعلى وجه التحديد لتوصيف شامل التشكل من الفطريات الخيطية الرشاشيات النيجر، والذي يسمح للعلاقة الرياضية للظهور المورفولوجية والإنتاجية.
مقالة منهجية
وهناك طريقة لتوليد وعلى وجه التحديد لتوصيف شامل التشكل من الفطريات الخيطية الرشاشيات النيجر، والذي يسمح للعلاقة الرياضية للظهور المورفولوجية والإنتاجية.
أ. الفطريات الخيطية النيجر هو سلالة تستخدم على نطاق واسع في مجموعة واسعة من العمليات الصناعية من المواد الغذائية إلى صناعة المستحضرات الصيدلانية. واحدة من الخصائص الأكثر إثارة للاهتمام، وغالبا ما لا يمكن السيطرة عليها من هذا الكائن الحي هو الخيطية مورفولوجيا المعقدة. وهي تتراوح بين كريات كروية كثيفة على فطر لزج (الشكل 1). ومن المعروف المعلمات عملية مختلفة ومكونات للتأثير على التشكل الفطرية 1. منذ الإنتاجية المثلى يرتبط بقوة مع شكل المورفولوجية محددة، ومورفولوجيا الفطرية غالبا ما يمثل عنق الزجاجة للإنتاجية في الإنتاج الصناعي.
وثمة نهج مستقيم إلى الأمام وأنيقة للسيطرة على وجه التحديد شكل الصرفي هو إضافة الجزيئات غير العضوية الصغيرة غير قابلة للذوبان (مثل سيليكات المغنيسيوم المائي، وأكسيد الألومنيوم أو أكسيد التيتانيوم السليكات) إلى الثقافة المتوسطة التي تسهم في انتاج الانزيم زادت 2-6. منذ وجود obv[إيووس] العلاقة بين مورفولوجيا الجسيمات الدقيقة تعتمد على إنتاج انزيم من المرغوب فيه لربط رياضيا الإنتاجية وظهور الصرفي. ولذلك يستهدف كمي وصف دقيق وشامل الصرفي.
وبالتالي، فإننا نقدم وسيلة لتوليد وتوصيف الجسيمات الصغيرة التي تعتمد هياكل شكلية، وإلى ربط مورفولوجيا الفطرية مع إنتاجية (الشكل 1) الذي يساهم ربما التوصل إلى فهم أفضل للmorphogenesis من الكائنات الحية الدقيقة الخيطية.
أ. سلالة المؤتلف يزرع النيجر SKAn1015 لمدة 72 ساعة في L 3 أثارت مفاعل حيوي للدبابات. بالإضافة إلى ذلك من قبل من الجسيمات الدقيقة التلك في تركيزات من 1 غرام / لتر، 3 غ / ل و 10 جرام / لتر قبل التلقيح يتم إنشاء بتكاثر مجموعة متنوعة من الهياكل الشكلية. وتؤخذ عينات معقمة بعد 24 ساعة و 48 و 72 لتقرير من التقدم والنمو ونشاط انزيم المنتجة. والمنتج شكلت هو انزيم ذات القيمة العالية β-فركتوفورانوزيداز، وحفاز بيولوجي هام لتشكيل الجدد سكر في المواد الغذائية أو صناعة الأدوية، والذي يحفز من بين أمور أخرى على رد فعل من السكروز إلى جلوكوز 7-9. ولذلك، فإن القياس الكمي للجلوكوز بعد إضافة السكروز ينطوي على قدر من إنتاج فركتوفورانوزيداز-β. يتم تقدير الجلوكوز من قبل الله / POD الفحص-10، والتي يتم تعديلها لتحليل الإنتاجية العالية في لوحات عيار 96-جيدا الصغرى.
يتم فحص مورفولوجيا الفطرية بعد 72 ساعة من قبل المجهر وتتميز تحليل الصور الرقمية. في القيام بذلك، ويتم حساب عوامل شكل جسيمات عن التشكل الكلي الفطرية مثل قطر فيريه، ومنطقة المتوقعة، محيط، دائرية، نسبة الجانب، استدارة صلابة اوند مع صورة مفتوحة المصدر يماغيج برنامج معالجة. يتم الجمع بين المعايير ذات الصلة لعدد الصرف أبعاد (MN) 11، الذي تمكن من توصيف شاملمورفولوجيا الفطرية. وسلط الضوء على علاقة وثيقة من عدد الصرف والإنتاجية من خلال الانحدار الرياضية.
1. إعداد المفاعل وبدء زراعة
وتجرى الزراعات مفاعل حيوي 4 في مجموع.
2. معقم أخذ العينات بعد 24 و 48 و 72 ساعة من زراعة
3. تحديد وزن الكتلة الحيوية الجافة بعد 24 و 48 و 72 ساعة من زراعة
4. تقرير نشاط الأنزيمية خارج الخلية فركتوفورانوزيداز-β-POD بواسطة مقال الله / بعد 24 و 48 و 72 ساعة من زراعة
تخزين العينات في الثلج باستمرار في الوقت الذي تعمل معهم.
5. المجهري والتحليل الآلي للصورة بعد 72 ساعة من زراعة

6. ممثل النتائج
من خلال إضافة جزيئات التلك A. الصغرى يتم تغيير النيجر SKAN 1015 التشكل من التشكل بيليه صحيح إلى التشكل أو فطر حتى فرقت. في حين أن تعرض بيليه التشكل في الظروف القياسية يتم إنشاء مورفولوجيا فطر بواسطة مكملات من المتوسط مع 10 جم / لتر من الجسيمات الدقيقة التلك (الشكل 4). في الوقت نفسه نشاط فركتوفورانوزيداز-β يزيد حوالي 03-05 مارس أضعاف. ألف التكميلي من 1 أو 3 غرام / لتر من بودرة التلك يؤدي إلى التشكل مشتتة، مع نشاط فركتوفورانوزيداز الضعف (الشكل 4).
ويمكن للمورفولوجيا الجسيمات الصغيرة التي تعتمد بشكل شامل ووصف من قبل مورعدد phology التي يمكن حسابها باستخدام المعايير التي تحددها تحليل الصور التلقائي. والكريات جولة تماما وعلى نحو سلس في صور مجهرية تظهر دوائر الكمال. لمثل هذه الجسيمات في عدد الصرف لديها قيمة 1. يمكن تبسيط أصغر جزء من التشكل فطر كخط أحادي البعد مما أسفر عن عدد من الصرف 0. وجميع أشكال وسيطة المورفولوجية مثل الكريات غير النظامية ممدود أو كتل لذلك قيم بين 0 و 1. وسوف جزيئات كبيرة نوعا ما يؤدي إلى جزيئات، وارتفاع الفطرية مع سطح كبير أو جزيئات ممدود، في عدد الصرف منخفضة نوعا ما 11.
في الظروف القياسية في التشكل في مفاعل 1 عدد المعروضات الصرف حوالي 0.8. في التشكل في مفاعل 4 مع بودرة التلك 10 جرام / لتر ويتميز المنغنيز حوالي 0.1. عدد الصرف للمفاعلات 2 و 3، مع تركيز بودرة التلك من 1 و 3 جرام / لتر، وتقع بين هذين النقيضين، مما يدل على morpho فرقتبليد الحركة. منذ الدقيقة مورفولوجيا الجسيمات تعتمد يرتبط ارتباطا وثيقا مع إنتاجية β-فركتوفورانوزيداز، يتم الحصول على وجود علاقة رياضية لعدد الصرف والإنتاجية مماثلة إلى الشكل 5.

الشكل 1. الخطة الشاملة للتصميم التجريبية وإجراء تحليلي ألف. يزرع النيجر (مع أو بدون الجسيمات الدقيقة) في L 3 اثار خزان مفاعل حيوي لمدة 72 ساعة. بعد 24، يؤخذ 48 و 72 عينة هكتار لتقدير الوزن الجاف الكتلة الحيوية والنشاط β-فركتوفورانوزيداز، والتي يتم استخدامها مرة أخرى لحساب انتاجية محددة. بعد 48 ساعة يتم فحص مورفولوجيا الفطرية بواسطة المجهر وتتميز تحليل الصور الرقمية. يتم الجمع بين المعايير ذات الصلة من تحليل الصور لعدد علم الصرف، والذي هو رياضي ترتبط إنتاجية محددة.
الشكل 2. خطوات لمعالجة الصور لمجهرية لتوليد صور لهياكل شكلية من أ. النيجر. الخطوة 1: الحصول على الصور بواسطة المجهر. الخطوة 2: تحسين صورة إذا لزم الأمر. الخطوة 3: binarization صورة بالأبيض والأسود، والأبيض (ثنائي) ولدت في صورة يماغيج. الخطوة 4: يتم معالجة الصورة الثنائية من قبل ويتم مسح كائن غير مرغوب فيه. الخطوة 5: يجري التحليل الصرفي مع وظيفة "تحليل الجزيئات" لليماغيج مصدر برنامج مفتوح.

الشكل 3. المورفولوجية أشكال مختلفة من A. يعتمد على تركيز الجسيمات الدقيقة المضافة النيجر. وأضاف مع زيادة تركيز الجسيمات الدقيقة يمكن أن يكون حجم بيليه تراجع بدقة وصولا الى كريات النوى قذيفة صغيرة، وأسراب صغيرة والمشيجة حتى فرقت بحرية. هندسة مورفولوجية وpergillus النيجر SKAn1015 بواسطة مكملات الجسيمات الدقيقة في ثقافة المغمورة. بدون المجهرية الدقيقة (A)، و 10 ملغم / لتر (B)، 0.1 غ / لتر (C)، 0.2 غرام / لتر (D)، 0.3 غرام / لتر (E)، و 0.6 غرام / لتر (F)، 1.0 جرام / لتر (G)، 1.5 غرام / لتر (H)، 2.0 غرام / لتر (I)، 2.5 غرام / لتر (J)، 3.0 غرام / لتر (K)، 3.5 غرام / لتر (L)، 4.0 غرام / لتر (M )، 4.5 غرام / لتر (N) و 5.0 غرام / لتر (O)، و 10 جرام / لتر (ف) و 15 غ / ل (س)، و 20 جرام / لتر (R)، و 30 جرام / لتر (S) و 40-50 جرام / لتر (T). وقد أخذت الصور بواسطة المجهر الضوئي بعد 72 ساعة من زراعة.

الشكل 4. نشاط فركتوفورانوزيداز في اعتماد التلك الجسيمات الدقيقة تركيز 1 غرام / لتر (مفاعل 2)، 3 غرام / لتر (مفاعل 3) و 10 غرام / لتر (مفاعل 4). لم يتم استكمال مفاعل 1 مع الجزيئات الدقيقة، وهنا تتم زراعة تحت الظروف القياسية.

الشكل 5. علاقة جيدة الممثل (R 2 = 0.91) في علم الصرفعدد وإنتاجية محددة. يتم رسم عدد المورفولوجيا (الإحداثي السيني) ضد إنتاجية محددة (الإحداثي الثاني). الانحدار غير الخطية تعطي ارتباط الأسي.
وكان التعديل من التشكل الفطرية من اهتمام في مجال التكنولوجيا الحيوية منذ عقود عديدة. وقد حاولت دراسات مختلفة لعملية اختيار تختلف المعلمات مثل قيمة درجة الحموضة، ومدخلات الطاقة، ودرجة الحرارة، والمغذيات متوسطة الحجم أو تركيز اللقاح 1، ولكن تعاني من سيطرة غير دقيقة وغير كاملة بدلا من التشكل، ارتفاع تكاليف الطاقة، والآثار تثبيط أو عدم الاستقرار الناتج، وفي المقابل، ومكملات من الجسيمات الدقيقة يسمح للهندسة دقيقة من التشكل الفطرية من خلال صقل تباين حجم الجسيمات وتركيز. هذا يفتح آفاقا جديدة لاستخدام جزيئات متناهية الصغر من أجل التحسين ومصممة خصيصا من تصميم التشكل إنتاج عالية في إنتاج التكنولوجيا الحيوية مع أ. النيجر والكائنات الدقيقة الخيطية الأخرى.
تحليل الصور الرقمية هي وسيلة سهلة للتكرار لوصف الفطرية مورفولوجيا الماكرو. ومع ذلك، فإن العديد من المعلمات لقصص الأطفال الحجم والشكل والسطحيةثالثا البنى الصرفية وصفها في المؤلفات يجعل تقييم سريع للمورفولوجيا الفطرية معقدة. عدد الصرف كما عرضت مجموعة من المعايير ذات الصلة، والابتعاد عن هذا النقص، ويمكن استخدامها ليس فقط لتوصيف شامل لهياكل شكلية، بل أيضا لارتباط الرياضية مباشرة مع الإنتاجية. هذا يجعل من جديد تقدير من الإنتاجية عن طريق التشكل معين، وبالتالي التخصيص من التشكل للالعملية تحتاج ممكن.
باستخدام عدد الصرف، فمن الممكن أن نميز بين مختلف بيليه وmorphologies أجمة 4،5. لمزيد من التطوير لعدد الصرف ومراعاة البعد كسورية ويبدو أن واعدة. والبعد كسورية يعطي قياس لمدى تعقيد والشامل ملء خصائص كائن 13 و predestinated وبالتالي لتوصيف شامل لمورفولوجيا فطر.
على كرeation من مورفولوجية عالية فطر المنتجة، ومع ذلك، قد يؤدي إلى مشاكل مع أداء عملية خاصة في زراعة على نطاق واسع، لأنه قد تم على شكل نمو mycelial أظهرت في وقت سابق لعرض أكبر بكثير اللزوجة مرق ثقافة 2. هذا يؤدي إلى مشاكل مع انتقال الحرارة والكتلة وتشكيل مناطق راكدة غير مختلطة، والتي تتطلب مساهمة أكبر من الطاقة، وجعل زراعة أكثر تكلفة لتشغيل 1. ولذلك ينبغي النظر في العلاقة بين مورفولوجيا الفطرية وثقافة مرق اللزوجة عند تغيير الصرف وإدماجها في نماذج أخرى.
ليس لدي ما يكشف.
المؤلفين الامتنان بالدعم المالي المقدم من مؤسسة البحوث الألمانية (DFG) عن طريق مركز البحوث التعاونية SFB 578 "من جين إلى المنتج" في الجامعة التقنية براونشفايغ، ألمانيا.
طلب إذن لإعادة استخدام النص أو الأشكال في مقالة JoVE هذه
طلب إذن