$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
حمض النووي العزلة: الأحماض النووية المعزولة هي PCR amplifiable وخالية من التلوث من البروتين.
مثال 1: الأحماض النووية المستردة هي مناسبة للاستخدام في التطبيقات المستندة إلى PCR. على سبيل المثال، ويبين الشكل 2 التضخيم من الجينات توكسين شيغا المرتبطة E. Enterohemorrhagic O157 كولاي: H7 سلالة مؤسسة كهرباء لبنان-933 (آي تي سي سي # 35150) من إجراء استخراج الحمض النووي / بروتين باستخدام ماصة الاستخراج. تم العثور على جينات توكسين شيغا STX 1 و 2 على STX عاثية امدا مثل المعتدلة وعاثية معيبة في E. Enterohemorrhagic هذه وغيرها من سلالات بكتيريا تحت سيطرة المروج R ف 5 6 7 8. تفعيل استجابة SOS في E. القولونية يؤدي إلى طليعة العاثية الاستقراء و / أو إنتاج السم 9. لقد استخدمت لدينا نسخة معدلة من فحص PCR المضاعفة بواسطة فنغ وآخرون. 1من 1 إلى التعرف على الجينات (1) وSTX STX 2 في كل من الثقافة وعينات من مياه الصرف الصحي ارتفعت. حارات A و B في الشكل 2 تظهر نتائج تضخيم PCR لعينة ثقافة غير المجهزة (حارة A) وعينة ثقافة المجهزة (الصف B). هذه النتائج هي معنى مطابقة تقريبا ليست هناك خسارة من الدقة في الأحماض النووية المجهزة أو معزولة. نحن تضخيم المقبل مياه الصرف الصحي الخام ارتفعت (حارة D) أو الأحماض النووية المعزولة من مياه الصرف الصحي ارتفعت (حارات E & F). هذه المعطيات تشير إلى أن الأحماض النووية معزولة أدت إلى مزيد من التضخيم مقابل الأحماض النووية غير المعزولة من عينات مياه الصرف الصحي ارتفعت. نستنتج إذن أن أزيلت إما مثبطات PCR بطبيعة الحال وجدت في مياه الصرف الصحي على العزلة أو التي كانت تتركز الأحماض النووية على العزلة. مزيج من هذه الفرضيات اثنين هو ممكن أيضا.
تم استخدام مطياف الأشعة فوق البنفسجية القادمة لإظهار أن الأحماض النووية المعزولة كانت حرة نسبيا سبروتين و تلوث. ويبين الشكل 3 أطياف الأشعة فوق البنفسجية من اثنين من E. القولونية O157: H7 حامض النووي الاستخراج، والعزلة وصفها بأنها وباء العزلة، بالمقارنة مع طيف تطبيع للثقافة البكتيرية، وصفت قبل العزلة. أطياف الأشعة فوق البنفسجية من الأحماض النووية المعزولة تمثل أطياف من الأحماض النووية محض، وجود نسبة محسوبة من الامتصاصية بين 260 نانومتر و 280 نانومتر تقترب من 1.8 10. هذه البيانات تظهر أن هناك القليل جدا من البروتين في تلويث جزء الحمض النووي استردادها باستخدام تقنية وصفها.
عزل بروتين: بروتين تعافى من التجربة النووية العزلة حامض / بروتين غير متفاعل مناعيا ومتطابقة electrophoretically على بروتين نقي.
مثال 2: تم تطبيق جزء من البروتين المعزولة إلى E. RapidChek القولونية O157 فحص تدفق الوحشي شرائط (SDIX، وشركة). ضوابط تظهر هوية إيجابية في جميع العينات التي تؤوي E. كولاي O157، مع أو من دون STX الاستقراء (الشكل 4، والممرات وباء وجيم، على التوالي). البيانات في الشكل (4) كما تظهر نتائج إيجابية لتلك العينات ايواء E. القولونية O157 التي تم تجهيزها لالأحماض النووية والبروتين ثم باستخدام ماصة الاستخراج. هذه المعطيات تشير إلى أن بروتين معزولة عن بعضها العينة متفاعل مناعيا وبالتالي التسبب ردا ايجابيا.
تم تنفيذ PCR التضخيم (كما هو موضح في مثال 1) في عينات من البروتين لإظهار أن جزء من البروتين المعزولة كان خاليا من تلويث الأحماض النووية. وكانت نتائج هذه التجارب جميعها سلبية من قبل الكهربائي للهلام. وبالتالي، فإننا نستنتج أن تم فصل محتوى البروتين من العينة من تلويث الأحماض النووية. هذه النتائج، التي اتخذت في كامل مع تلك التي وصفها لهذا المعرض الحمض النووي خطوة العزلة التي يتم عزل الأحماض النووية والبروتين في خطوات تجزئة منفصلة.
تي "> مثال 3:. البروتين المعزول هو مناسبة لالكهربائي
10 الشكل 5 يصور coomassie ملطخة 8٪ هلام الأكريلاميد محملة جيش صرب البوسنة
(الشكل 5، والممرات C &) وجيش صرب البوسنة المعزولة من الفصيلة جوانيداين 6M باستخدام ماصة استخراج وما يرتبط بها من البروتوكول. والتنقل الكهربي للبروتين معزولة لانه مطابق للعينات مراقبة. نستنتج مما تقدم أن عملية الاستخراج لا يغير من هيكل التساهمية من البروتين المعزولة.

الشكل 1، لوحة ج: تصوير نموذجي حامض النووي إجراءات استخراج يتم خلط العينة مع ثيوسيانات جوانيداين 6M في أنبوب عينة ومرت أكثر من خمس مرات المواد الماصة. بعد مرور آخر، يضاف إلى عينة من البروتين العازلة الاستخراج. تغسل الأحماض والمواد الماصة متجهة النووي مرتين مع الايثانول. العينة ثم الهواء درييد ومزال من المواد الماصة.

الشكل 1، لوحة (ب): تصوير لإجراء استخراج بروتين نموذجي عينة مختلطة مع عازلة عزل بروتين من الخطوة 1، الشكل 1، لوحة يتم تمرير عبر المواد الماصة للماصة استخراج 2 15 مرة. ما تبقى من إجراءات لانه مطابق للبروتوكول استخراج حمض النووي.

الشكل 2: صورة سلبية لبروميد إيثيديوم هلام الاغاروز الملون أجري المضاعفة الجينات توكسين 1 و 2 شيغا تجربة التضخيم باستخدام عينات من ثقافة (الممرات A و B) أو عينات من مياه الصرف الصحي الخام ارتفعت مع إ. O157 كولاي: H7 (الممرات D، E و F). واما العينات وأضاف مباشرة إلى أنبوب رد فعل PCR (الممرات A و D)، أو عينات تم معالجتها باستخدام بروسس العزلةتم إضافة الصورة والأحماض النووية لاستخراج أنبوب رد فعل PCR (عينات B، E و F). بروتوكول PCR هو تعديل واحد التي وصفها فنغ وآخرون 11. تعديل لدينا استهدفت فقط تلك تضخيم من قبل STX 1 (الشريط السفلي) وSTX 2 (الشريط العلوي) أزواج التمهيدي، والتسرب جميع أزواج التمهيدي الأخرى. ممر C هو سلم 1KB من BioRad.

الشكل 3: نتائج التحليل الطيفي للأشعة فوق البنفسجية من E. O157 كولاي: H7 الأحماض النووية معزولة باستخدام ماصة استخراج ذكرت وصفت والأحماض النووية معزولة عزلة أ و ب العزلة. تم اختباره أيضا الطيف للأشعة فوق البنفسجية من العينة قبل استخراج الحمض النووي ويسمى ما قبل العزلة. وقد تم الحصول على الأطياف باستخدام U3010 هيتاشي الطيف وما يرتبط بها من حزمة البرامج.

الشكل 4: صور لون من شرائط الاختبار RapidChek تم عزل محتوى البروتين من العينات المستخدمة في الشكل 2 باستخدام ماصة استخراج واختبار التفاعلات المناعية بواسطة فحص تدفق الوحشي. حارات AC هي الضوابط غير المجهزة، وهذا هو، وأضيف ثقافة الخلية إلى شريط الاختبار دون استخلاص الحامض النووي أو البروتين. (أ) هو ممر E. كولاي BL21 DE3 pLysS كعنصر تحكم سلبي، والممرات وباء وجيم هاء المعرض O157 كولاي: H7 التي كانت غير المعالجة (B)، أو تعامل مع C mitomycin لمدة 4 ساعات (C). من خلال مد خطوط H تظهر نتائج مضيفا ان البروتين المستخرج من شرائط اختبار تدفق الوحشي. تم بحث الممرات D و E باستخدام بروتين مستخلص من E. كولاي BL21 DE3 pLysS إما دون (D) أو مع العلاج C mitomycin (E) كما الضوابط السلبية. حارات FH إظهار النتائج عند استخراج البروتين من E. O157 القولونية: تم استخدام H7. تم استخراج بروتين من دون علاج (F)، أو في الفترة من 2 ساعة (G) أو 4 ساعة (H) Mitomycin الثقافات C المعالجة.نتائج إيجابية إنتاج خط مزدوج أحمر.

تم عزل صورة لالملون Coomassie SDS-PAGE جيش صرب البوسنة من حل باستخدام ماصة استخراج والبروتوكولات وصف: الرقم 5. حارات A و C هي الممرات السيطرة على 250 ميكروغرام / مل و 500 ميكروغرام / مل على التوالي. حارات B و D تصور BSA تعافى من الحلول التي تحتوي على تركيزات نفس الضوابط الخاصة بكل منها.