مقالة منهجية

تصور البكتيريا في نيماتودا باستخدام المجهر الفلورسنت

18.9K مشاهدات

DOI:

10.3791/4298

أكتوبر 19, 2012

في هذه المقالة

ملخص

تبادل المنافع والمصالح لدراسة بين Xenorhabdus البكتيريا و Steinernema الديدان الخيطية، وأساليب لرصد وجود البكتيريا والديدان الخيطية موقع داخل. المنهج التجريبي، والتي يمكن تطبيقها على النظم الأخرى، ينطوي على البكتيريا الهندسة للتعبير عن بروتين الفلورية الخضراء وتصور، وذلك باستخدام البكتيريا المجهري مضان داخل الديدان الخيطية شفافة.

الملخص

Symbioses، والذين يعيشون معا من اثنين أو أكثر من الكائنات الحية، على نطاق واسع في جميع ممالك الحياة. عن اثنين من أكثر الكائنات في كل مكان على وجه الأرض، والديدان الخيطية البكتيريا تشكل مجموعة واسعة من الجمعيات التكافلية التي تتراوح من المفيد الممرضة 1-3. واحد هذه الجمعيات هي العلاقة متبادل المنفعة بين البكتيريا والديدان الخيطية Xenorhabdus Steinernema، التي برزت بوصفها نظاما من طراز التعايش 4. النيماتودا الممرضة للحشرات هي Steinernema، وذلك باستخدام المتكافل البكتيرية بهم لقتل الحشرات 5. لنقل بين المضيفين الحشرات، والبكتيريا استعمار الامعاء من الديدان الخيطية في المرحلة المعدية الأحداث 6-8. في الآونة الأخيرة، وقد ثبت عدة أنواع النيماتودا الأخرى للاستفادة من البكتيريا لقتل الحشرات 9-13، والتحقيقات بدأت دراسة التفاعلات بين النيماتودا والبكتريا في هذه النظم <سوب> 9.

وصفنا طريقة لرؤية المتكافل البكتيرية داخل أو على مضيف الديدان الخيطية، والاستفادة من الشفافية البصرية من الديدان الخيطية عند عرضها بواسطة المجهر. صممت هذه البكتيريا في التعبير عن بروتين فلوري، مما يسمح التصور من خلال الفحص المجهري مضان. وتتوفر العديد من البلازميدات التي تحمل الجينات ترميز البروتينات التي يتألق عند أطوال موجية مختلفة (أي أخضر أو أحمر)، والاقتران من البلازميدات من الإشريكية القولونية سلالة المانحة إلى المتلقية المتكافل البكتيرية ناجحة لمجموعة واسعة من البكتيريا. تم تطوير الأساليب المذكورة للتحقيق في العلاقة بين carpocapsae Steinernema وXenorhabdus nematophila 14. وقد استخدمت أساليب مماثلة للتحقيق في غيرها من الديدان الخيطية-بكتيريا الجمعيات 9، 15-18، وفي النهج وبالتالي ينطبق عموما.

والتقىهود يسمح توصيف جود البكتيريا والديدان الخيطية التوطين داخل في مراحل مختلفة من التنمية، وتوفير نظرة ثاقبة لطبيعة تكوين الجمعيات وعملية الاستعمار 14 و 16 و 19. التحليل المجهري يكشف كل من تواتر الاستعمار بين السكان وتوطين البكتيريا لاستضافة الأنسجة 14، 16، 19-21. هذا هو ميزة على غيرها من أساليب رصد البكتيريا داخل السكان الديدان الخيطية، مثل صوتنة 22 أو طحن 23، التي يمكن أن توفر مستويات متوسط ​​الاستعمار، ولكن قد لا، على سبيل المثال، تميز السكان مع ارتفاع وتيرة منخفضة الأحمال المتكافل من السكان مع تردد انخفاض الأحمال المتكافل عالية. يمكن تمييز وتيرة وحمولة من البكتيريا استعمار أهمية خاصة عند فحص الجرثومي أو وصف المسوخ للاستعمار الظواهر 21، 24. في الواقع، وقد استخدم المجهر مضان في فحص إنتاجية عالية من المسوخ البكتيرية لعيوب في الاستعمار 17 و 18، وأقل شاقة من الأساليب الأخرى، بما في ذلك صوتنة 22، 25-27 و الفردية تشريح الديدان الخيطية 28 و 29.

البروتوكول

1. بناء على الإجهاد الجرثومي نيون عبر اقتران

  1. تنمو سلالة المتلقي (للفحص المتكافل) وسلالة المانحة ليلة وضحاها. ينبغي أن سلالة المانحة، وعادة ما كولاي، تكون قادرة على التبرع من خلال اقتران DNA، وينبغي أن تتحول مع. بلازميد (الجدول 2) الذي يحمل الجين ترميز بروتين فلوري اعتمادا على البلازميد، يمكن أيضا سلالة المساعد الاقتران تكون مطلوبة. إذا كان الأمر كذلك، ينبغي أيضا أن تنمو هذه السلالة بين عشية وضحاها. يجب أن تزرع سلالة سلالة المانحة والمساعدة مع المضادات الحيوية لتحديد لصيانة بلازميد.

الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.

المناقشة

بروتوكول الموصوفة هنا يوفر طريقة للكشف البصري من البكتيريا داخل مجموعة الديدان الخيطية (الشكل 1). هذه الطريقة يستفيد من الشفافية البصرية من الديدان الخيطية والقدرة على تسمية fluorescently البكتيريا، مما يتيح تحليل في الجسم الحي من البكتيريا داخل المضيف الديدان الخيطية (الشكل 3). على وجه التحديد، فإن هذا النهج يحدد توطين البكتيرية داخل مضيفه. عن طريق عد السكان الديدان الخيطية والتسجيل لحضور البكتيرية، يمكن تحديد وتيرة الاستعمار الجرثومي عب.......

الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.

الإفصاحات

الإعلان عن أي تضارب في المصالح.

شكر وتقدير

الكتاب أود أن أشكر أوجينيو فيفاس، Heungens كورت، مارتنز اريك، كولز تشارلز، سكر داربي، Stabb اريك، وتود Ciche لما قدموه من مساهمات في تطوير هذا البروتوكول والأدوات المستخدمة. وقدم الدعم KEM وJMC من المعاهد الوطنية للصحة (NIH) الجائزة الوطنية خدمة أبحاث T32 (AI55397 "الميكروبات في الصحة والمرض"). وأيد من قبل JMC مؤسسة العلوم الوطنية (NSF) زمالة دراسات عليا أبحاث. وأيد هذا العمل من المنح المقدمة من المؤسسة الوطنية للعلوم (IOS-0920631 0950873 وIOS).

....

الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.

المواد

قائمة المواد المستخدمة في هذه المقالة
الاسمالشركةرقم فهرسيالتعليقات
اسم كاشف شركة كتالوج رقم التعليقات (اختياري)
الدهون آجار
(العقيمة)
8 غرامات المرق المغذي، 15 غراما أجار، 5 خلاصة الخميرة غرام، 890 مل ماء، 10 مل 0.2 جم / مل MgCl 2. 6H 2 0، 96 مل شراب الذرة * حل، 4 مل زيت الذرة *
اثارة وسائل الاعلام بينما تتدفق لوحات
* إضافة مادة معقمة التعقيم بعد
شراب الذرة الحل
(العقيمة)
7 مل شراب الذرة، و 89 مل ماء
ومزيج الأوتوكلاف
البيض الحل 16،6 مل هيبوكلوريت الصوديوم 12٪، 5 مل KOH 5M، 80 مل ماء
استذابة مرق
(العقيمة)
5 خلاصة الخميرة غراما و 10 غراما تريبتون، 5 غرامات ملح، 1 L المياه
ومزيج الأوتوكلاف
Microfuge الصياد 13-100-675 فإن أي microfuge التي تحمل أنابيب microfuge العمل
نبذ بيكمان 366802 كبير الطرد المركزي التي تحمل قمة الجدول 15 مل و 50 مل المخروطية أنابيب
معقمة 60 مم X 15 مم طبق بتري الصياد 0875713
50 مل أنابيب الطرد المركزي الصياد 05-539-6
15 مل أنابيب الطرد المركزي الصياد 05-531-6
العقيمة 100 مم X 20 مم طبق بتري الصياد 0875711Z أعمق من أطباق بتري القياسية
24 لوحة جيدا غرينر بيو واحد 662000-06
مجهر المجهر الفلورسنت يحتاج قدرات متوافق مع fluorophore الخاص
بارافورمالدهيد علوم المجهر الإلكتروني 15710
PBS
(العقيمة)
8 ز كلوريد الصوديوم
0.2 غرام KCL
1،44 ز نا 2 HPO 4
0،24 ز KH 2 PO 4
1 L المياه

ضبط الرقم الهيدروجيني إلى 7.4 في المياه وإلى 1 L والأوتوكلاف
Microfuge أنابيب الصياد 05-408-138 2 مل أو 1.5 مل أنابيب
الرجاجة فإن أي شاكر الذي يتسبب في السائل لتحريك بلطف العمل
Diaminopimelic حمض سيجما D-1377 إذا لزم الأمر، استكمال وسائل الإعلام إلى التركيز أو مم 1

المراجع

  1. Holterman, M., van der Wurff, A. Phylum-wide analysis of SSU rDNA reveals deep phylogenetic relationships among nematodes and accelerated evolution toward crown clades. Mol. Biol. Evol. 23, 1792-1800 (2006).
  2. Lambshead, P. J. D., Boucher, G.

الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.

إعادة الطباعة والأذونات

طلب إذن لإعادة استخدام النص أو الأشكال في مقالة JoVE هذه

طلب إذن

الوسوم

Xenorhabdus nematophila Steinernema carpocapsae GFP

مقالات ذات صلة