1. بناء GFP ذات الكلمات الدلالية EGL-4 تعرب عن الحيوانات
- استنساخ متعدية GFP الانصهار :: EGL-4 تحت المروج لهذا الجين ODR-3 (2678 BP استخدام المنبع مباشرة من كودون بداية): (ع) ODR-3 :: GFP :: EGL-4. التعبير ODR-3 محركات المروج في أزواج الخلايا العصبية amphid: AWA؛ AWB؛ AWC، وضعيفة في ASH.
- حقن بلازميد (ع) ODR-3 :: GFP :: EGL-4 في الحيوانات (N2) wildtype في 50 نانوغرام / ميكرولتر مع علامات شارك في حقن باستخدام معيار تقنيات التحول الجرثومية سطر 8: (ع) OFM-1: : GFP 9 (25 نانوغرام / ميكرولتر)، و (ع) 1-ODR :: dsRed 10 (25 نانوغرام / ميكرولتر). وODR-1 التعبير محركات المروج في AWC وAWB أزواج amphid الخلايا العصبية، و-1 OFM التعبير محركات المروج في coelomocytes.
- إخضاع الحيوانات المعدلة وراثيا معربا عن صفائف خارج الصبغي بالتفصيل في الخطوة 1.2 إلى أن الأشعة فوق البنفسجية (UV) / trimethylpsoralen (TMP) بروتوكول التكامل11.
- التبييض مزامنة الحيوانات 12 و زراعة منهم على لوحات النمو النيماتودا (NGM) وسائل الاعلام التي تحتوي على OP50 E. كولاي إلى المرحلة L4. غسل الحيوانات L4 من أطباق NGM مع العازلة M9 لإزالة OP50 E. كولاي البكتيريا.
- إزالة M9 العازلة وإضافة 50-100 ميكرولتر من 30 ميكروغرام / مل حل TMP العمل على بيليه دودة في أنبوب مل ميكروسنتريفوج 1.5. التفاف أنبوب 1.5 مل ميكروسنتريفوج في احباط لمنع الضوء المحيط، وتستنهض الهمم بلطف على محور دوار لمدة 15 دقيقة في احباط الملفوفة 1.5 مل أنبوب microcentrifuge. نقل الديدان في حل TMP / دودة لوحة كبيرة NGM غير المصنف.
- كشف الديدان على لوحة للأشعة فوق البنفسجية NGM 350 μJ (X100) باستخدام Stratalinker 2400. ثم تضاف الديدان إلى لوحة تحتوي على OP50 NGM واحتضان في الظلام لمدة 5 ساعة.
- اختيار 50 لوحات الديدان المعدلة وراثيا المصنفة حوالي 10 (2-5 الديدان كل لوحة). نقل لوحات P0 جديدة كل على مدار 24 ساعة لمدة 3 أيام.
- اختيار 250 F1 على نسيليnimals (1 الحيوان في لوحة). استنساخ الحيوانات من 2-4 F2 من كل لوحة F1. تحقق الحيوانات F3 للبحث عن خط نقل 100٪ من خلال النظر في (ع) OFM-1 :: نمط التعبير GFP تحت المجهر الفلورسنت تشريح ل.
- هجين الأباعد خط النهائية المتكاملة (s) مع الحيوانات N2 wildtype 5 مرات. وسوف نشير إلى خط متكامل النهائي pyIs500، وGFP الموسومة EGL-4 جزيء وGFP :: EGL-4.
2. زراعة وصيانة الحيوانات لفحوصات إزفاء النووية
- زراعة الحيوانات pyIs500 عند 25 ° C في 10 سم لوحات NGM القياسية (انظر أدناه للحصول على وصفة) مع المصنف E. OP50 البكتيريا القولونية 13 (الشكل 1).
- في يوم 1، واختيار 04:56 L4 pyIs500 الحيوانات من لوحات تزرع في 25 ° C على 5 سم 10 منفصلة OP50 E. القولونية المصنف لوحات واحتضان عند 25 درجة مئوية (أي، 4-5 L4 الحيوانات في لوحة).
- في يوم 4، ص غسل الكبارopulations من pyIs500 الحيوانات من لوحات كبيرة باستخدام NGM S-بصل العازلة (انظر أدناه للحصول على وصفة). استخدام ماصات زجاجية المتاح لنقل الحيوانات، لأنها سوف تلتزم جانب نصائح ماصة بلاستيكية.
3. على المدى الطويل رائحة المستحثة فحوصات إزفاء النووية
- غسل الحيوانات pyIs500 3 مرات في S-بصل لإزالة البكتيريا. لا يغسل أجهزة الطرد المركزي الحيوانات بين؛ بدلا تسمح الحيوانات لتسوية عن طريق الجاذبية ثابتة في 1.5 مل أنبوب microcentrifuge. فمن الأهمية بمكان لضمان إزالة جميع البكتيريا، والتي اليافوخات NGM خالية من التلوث، والبكتيريا المتبقية سوف تؤثر سلبا على نتائج الفحص إزفاء. أيضا، وجدنا أن التعقيم وأنابيب ميكروسنتريفوج 1.5 مل تنتج "مثبت" الملكية على الجدران الداخلية للأنبوب الذي يسبب الحيوانات التمسك الجانبين، وذلك باستخدام غير تعقيمها ميكروسنتريفوج 1.5 مل أنابيب.
- بينما الحيوانات تسوية بين يغسل، تشكل رانه الحل التكيف. إضافة 100 مل من S-بصل عازلة لاسطوانة مل التخرج 100. إضافة إلى التكيف مع رائحة S-بصل وختم الاسطوانة باستخدام شريط من Parafilm. إذا التكيف أداء بنزيلديهايد إضافة 7.5 ميكرولتر من بنزيلديهايد إلى 100 مل من S-بصل، للتكيف butanone إضافة 11 ميكرولتر من butaone-2 إلى 100 مل من S-القاعدية. قلب بلطف (لا يهز) الاسطوانة التي تحتوي على تخرجه S-بصل ورائحة 30 مرات لإنشاء مستحلب موحدة.
- بعد غسل النهائي في S-بصل، والسماح للحيوانات لتسوية وإزالة جميع السائل. تسمية أنبوب واحد "+ لقد" أو "التكيف" وغيرها من أنبوب "لقد-" أو "unadapt". ثم يضاف 1 مل من مزيج التكيف مع التكيف أنبوب microcentrifuge (+ VE)، وإضافة 1 مل من S-بصل إلى أنبوب التحكم ميكروسنتريفوج unadapted (-VE). في محاولة للحفاظ أعداد الحيوانات ما بين 100 و 200 في كل أنبوب. مع بعض الممارسة، فمن الممكن لتقدير العدد التقريبي للحيوانات في بيليه بالعين.
- وضع أنبوب 1.5 مل ميكروسنتريفوج غطاء حاميلكل أنبوب (يمنع فتح الأغطية من تفرقع) ووضع أنابيب على محور دوار لمدة 80 دقيقة. لقد وجدنا أن التعرض رائحة بين 60 دقيقة ودقيقة تعطي نتائج مماثلة 80 (سواء نتيجة في استجابات التكيف على المدى الطويل). ومع ذلك، 80 دقيقة التعرض يوفر نتائج أكثر اتساقا في أيدينا. وبالتالي لدينا جميع المقايسات التكيف على المدى الطويل هي موحدة باستخدام رائحة دقيقة 80 التعرض (الشكل 2).
- بعد 80 دقيقة، وغسل الحيوانات 3 مرات في S-القاعدية. سماح للحيوانات لتسوية عن طريق الجاذبية بين كل غسل.
4. على المدى القصير الناجم عن رائحة فحوصات إزفاء النووية
- في حالة التكيف رائحة قصيرة الأجل، واستخدام نفس البروتوكول وفقا لفحوصات طويلة الأجل الناجمة عن رائحة النبات (3،1-3،4 خطوات)، بدلا من احتضان ولكن هذه الحيوانات في التكيف pyIs500 رائحة لمدة 80 دقيقة، واستخدام التعرض 30 دقيقة . تحديد مقدار رائحة الناجم عن المقايسات إزفاء النووية المبينة أدناه (الخطوة 5) هو نفسه بالنسبة لتير قصيرة وطويلة الأجلالتعرض م.
5. سجل رائحة الناجم عن الحدث إزفاء النووية
- جعل 2٪ الاغاروز منصات تحتوي على 5 ملي أزيد الصوديوم (نان 3) عن طريق إذابة هلام الاغاروز الكهربائي في DH 2 0. وضع قطرة واحدة من الاغاروز المنصهرة التي تحتوي نان 3 على شريحة ميكروسكوب زجاجية. ضع شريحة أخرى على الفور المجهر الزجاج على الشريحة الأولى لشد قطرة من الاغاروز المنصهر. يترك لمدة 30 ثانية، ثم ندف بلطف بعيدا المجهر الشرائح المجهر ترك شريحة واحدة مع لوحة مسطحة من الاغاروز مم 1 ~.
- بعد غسل النهائي في S-بصل، والسماح للالديدان لتسوية في أنبوب مل ميكروسنتريفوج 1.5 و إزالة جميع السائل. ثم تضاف الحيوانات قطرة من الحكمة على منصات الاغاروز من الشرائح المجهر عدة. من المهم للحفاظ على أعداد الحيوانات في الشريحة ما بين 50 و 100. والعديد من الحيوانات أيضا لكل شريحة تعقيد التهديف وخلق توهج في كثير من الأحيان بعد تناثر الضوء الأزرق الإثارة. قد السائل الزائديكون الأشرار من منصة الاغاروز باستخدام الصغيرة كيم القضاء. وضع الزجاج 0.5 مم غطاء للانزلاق على منصة واسمحوا الوقوف لمدة 2 دقيقة للسماح لنان 3 إلى شل الحيوانات. ملاحظة، يمكن استرداد الحيوانات من الشرائح بعد التسجيل. فإن الحيوانات التعافي من التخدير بعد ساعة 3 نان 1 ~ إذا نقل إلى لوحة NGM المصنف إلى قطرة من الاحتياطي M9.
- في هذه المرحلة لا بد من أن كل مجرب وضع المفتاح لتتبع الشريحة التي هي تجريبية (+ VE) والشريحة التي هي الشريحة التحكم (-VE) الشريحة، وتمرير الشرائح إلى شخص آخر من شأنها أن يسجل عمياء GFP: EGL-4 نمط التوطين. وهذه السيطرة لأي تحيز المجرب.
- نقاط ما بين 50 و 100 في الحيوانات الشريحة باستخدام المجهر الفلورسنت تستقيم مع الأهداف التكبير 10X، 40X 63X والمرشحات وGFP / RFP. أولا، حدد موقع الحيوانات تحت التكبير 10x باستخدام مشرق مجال الإضاءة. ثانيا، تحديد موقع الخلايا العصبية AWC عن طريق إيقاف مشرقاتي مجال الإضاءة وباستخدام فلتر RFP. و(ع) ODR-1 :: محركات dsRed التعبير في الخلايا العصبية وAWB AWC. الخلايا العصبية لديها AWC مميزة البيضاوي على شكل أجسام الخلايا بالمقارنة مع أجسام الخلايا AWB التي هي أصغر ودائرية الشكل (الشكل 2).
- مرة واحدة وقد يقع جسم الخلية AWC، والتحول إلى تصفية GFP وتسجيل توطين GFP: EGL-4 كما نووية أو حشوية. باستخدام عداد يسمح للمجرب لمواصلة البحث في العدسة في حين سجل الشريحة. ملاحظة: يتم تكرار خطوات 5،1-5،5 على الأقل 3 مرات في أيام منفصلة لإنتاج بيانات ذات دلالة إحصائية (أرقام 1-2).
6. رصد GFP الموسومة EGL-4 من خلال استعادة التكيف رائحة طويلة الأمد
- بعد الخطوة 3.5، تقسيم سكان pyIs500 الحيوانات في نقاط متعددة ومأخوذة عن GFP النووية مقابل حشوية :: EGL-4 في AWC في نقطة الصفر مرة (وهذا هو، بعد التعرض دقيقة 80) ومنقطة ultiple وقت لاحق (الشكل 3).
- نقل كل من التحكم (-VE) وحيوانات التجارب (+ VE) باستخدام ماصات زجاجية المتاح على لوحات NGM.
- السماح لاستعادة الحيوانات لفترات مختلفة من الوقت وإعادة النظر في توطين GFP :: EGL-AWC 4in في كل نقطة زمنية كما في خطوات 5،1 حتي 5،5.
7. المواد
لوحات NGM: ل1 L 1 0 إضافة إلى L 2 DDH: 21 ز Bacto أجار، 3 ز كلوريد الصوديوم (كلوريد الصوديوم)؛ 2.5 غرام Bacto-ببتون. الأوتوكلاف وسائل الإعلام. بعد التعقيم، وأجار بارد حتى درجة حرارة 54 ° C. يقرأ إضافة الحلول التالية: فوسفات البوتاسيوم 25 مل العازلة 1M، 1 مل كبريتات المغنيسيوم M 1 (MgSO 4)؛ 1 مل الكالسيوم كلوريد M 1 (CaCl 2) (1)؛ الكولسترول مل في الإيثانول (5 ملغ / مل الأسهم).
1 M ثنائي القاعدة K 2 HPO 4 174،2 ز / مول: للحصول على 500 مل: 400 مل في O 2 DDH، ويحل 87،1 ز Dibasiج K 2 HPO 4. ضبط مستوى الصوت إلى 500 L مع DDH 2 O. تصفية تعقيم باستخدام 500 مل وحدة تصفية العقيمة.
1 M أحادى KH 2 PO 4 136،1 ز / مول: ل 1 L: في 800 مل O 2 DDH، ويحل 136،1 ز أحادى KH 2 PO 4. ضبط مستوى الصوت إلى 1 L مع DDH 2 O. تصفية تعقيم باستخدام 500 مل وحدة تصفية العقيمة.
1 فوسفات البوتاسيوم M (K 3 PO 4) 6.0 درجة الحموضة عازلة: ل 1 L: في وحدة تصفية العقيمة 1 L، إضافة 868 مل من 1 M KH 2 PO أحادى 4. تسمح وحدة لتصفية من خلال، ثم يضاف مل 132 من 1 M ثنائي القاعدة HPO 2 K 4. تسمح وحدة لتصفية جميع السائل. إزالة وحدة تصفية وضبط درجة الحموضة إلى 6.0. تخزين في درجة حرارة الغرفة.
S-بصل: ل1 L: إضافة 50 مل 1M K 3 PO 4 العازلة، ودرجة الحموضة ~ 6.0؛ و 20 مل 5M عبد القدير كلوريد الصوديوم. ملء إلى 1 L معDDH 2 O. الأوتوكلاف الحل.
M9: ل1 L: 3 ز KH 2 PO 4 و 6 ز نا 2 HPO 4 و 5 ز كلوريد الصوديوم، 1 مل 1 M MgSO 4، H 2 O. ملء إلى 1 0 2 مع L DDH. تعقيم بواسطة التعقيم.