تطبيق مصفوفة بمساعدة الليزر الامتزاز / التأين وقت الرحلة (MALDI-TOF) مطياف الكتلة (MS) مباشرة إلى ثقافة الدم مرق يعجل تحديد البكتيريا. طريقة عرض هو طريقة سريعة وموثوق بها لتحديد البكتيريا سالبة الجرام مباشرة من ثقافة الدم المرق.
يتطلب اشتراك JoVE لعرض هذا المحتوى. تسجيل الدخول أو ابدأ نسخة تجريبية مجانية
مقالة منهجية
تطبيق مصفوفة بمساعدة الليزر الامتزاز / التأين وقت الرحلة (MALDI-TOF) مطياف الكتلة (MS) مباشرة إلى ثقافة الدم مرق يعجل تحديد البكتيريا. طريقة عرض هو طريقة سريعة وموثوق بها لتحديد البكتيريا سالبة الجرام مباشرة من ثقافة الدم المرق.
دورا هاما في مختبر علم الأحياء المجهرية السريرية هو توفير التعرف السريع على البكتيريا المسببة للعدوى مجرى الدم. تحديد التقليدية يتطلب ثقافة فرعية من مرق أشار ثقافة الدم مع تحديد متاحة إلا بعد المستعمرات على أجار الصلبة قد نضجت. MALDI-TOF MS هو، طريقة سريعة يمكن الاعتماد عليها لتحديد غالبية البكتيريا ذات الصلة سريريا عندما يطبق على المستعمرات على وسائل الاعلام الصلبة. تطبيق MALDI-TOF MS مباشرة إلى ثقافة الدم مرق هو نهج جذابة كما أن لديها القدرة على تسريع تحديد الأنواع من البكتيريا وتحسين التدبير العلاجي السريري. ومع ذلك، مشكلة هامة للتغلب هو إزالة ما قبل التحليل بالتدخل راتنجات والبروتينات والهيموغلوبين الواردة في عينات الدم التي الثقافة، إن لم يكن إزالتها، وتتداخل مع MS الأطياف ويمكن أن يؤدي إلى تحديد درجات التمييز غير كافية أو منخفضة. بالإضافة إلى أنه من الضروري التركيز bacterالجيش العراقي لتطوير أطياف نوعية كافية. يصف الطريقة المعروضة تركيز، وتنقية، واستخراج البكتيريا سالبة الجرام السماح للتشخيص المبكر من البكتيريا من مرق أشار ثقافة الدم.
المرضى الذين يعانون من عدوى مجرى الدم (BSI) وذلك بسبب البكتيريا لا تزال لدينا عالية وفيات في المستشفى، وتتراوح 6-48٪ 1. تسليم المضادات الحيوية المناسبة المجرب يعزز البقاء على قيد الحياة وفي فرعية من المرضى الذين يعانون من التسمم الحاد، كل تأخير ساعة إلى العلاج المناسب يرتبط بقاء انخفضت 2،3. وفقا لذلك، هدفا رئيسيا من المختبر السريري للكشف بسرعة، وتحديد والتواصل وجود البكتيريا في الثقافات الدم لإبلاغ القرارات السريرية. وقد ثبت أن مختبر الميكروبيولوجيا ديها أكبر تأثير على العلاج المضادة للميكروبات في وقت الإبلاغ وصمة عار غرام 4 ومؤخرا، أظهرت دراسة وصفية ذلك الوقت الامتزاز بمساعدة الليزر مصفوفة / تأين مطياف الكتلة الطيران (TOF MALDI-MS) يقوم مباشرة على المرق ثقافة الدم تؤثر وصف في أكثر من ثلث BSI الناجم عن البكتيريا سالبة الجرام 5.
"jove_content"> وقد أدى التطوير التجاري لMALDI-TOF MS إلى أداة فعالة المختبر لتحديد الكائنات الدقيقة 6،7. والآن راسخة التكنولوجيا وتم دمجها في العديد من المختبرات لتحديد سريعة ودقيقة من الكائنات الدقيقة المعزولة على 6،8 وسائل الاعلام الصلبة. التطبيق المباشر للMALDI-TOF MS لثقافة الدم (BC) مرق التي أشار "ايجابية" للكائنات الدقيقة تناشد كل من الأطباء ومديري المختبرات بسبب القدرة على الحصول على تحديد وقت سابق من الكائنات الحية الدقيقة بتكلفة منخفضة.
وقد المنفعة السريرية من التطبيق المباشر للMALDI-TOF MS لثقافة الدم مرق محدودة بسبب مجموعة واسعة من الحساسيات وحظ بالمقارنة مع الأساليب ثقافة المظهرية قياسية استنادا لتحديد الهوية، مع تقارير عن تحديد ناجحة من البكتيريا سالبة الجرام تتراوح 47-98،9 9-11٪. الاختلاف في حساسية المرجحتتعلق تكوين BC مرق، تركيز البكتيريا الأولية، والتباين في أساليب إعداد العينات فضلا عن مجموعة من الكائنات الحية سلبية الغرام التي واجهتها في دراسة السكان 9. مقارنة مع هذه البروتوكولات الأخرى المنشورة على الطريقة المعروضة هنا يتجنب استخدام الإيثانول، كلوريد الأمونيوم أو إضافية (غير المصفوفة) أسيتونتريل. ونتيجة لبيليه البكتيرية سوف تبقى قابلة للحياة (حتى نقطة استخراج البروتين) السماح لطرق الاختبار المظهري التعرض المحتملة ليتم تطبيقها مباشرة إلى هذه الكائنات في المرق. بالإضافة إلى ذلك، فقد تبين طريقة عرض لتكون رخيصة وموثوقة وسريعة مع تحديد البكتيرية المتوفرة في غضون 25 دقيقة من ثقافة الدم غرام النتائج وصمة عار، مع الحد الأدنى 'على يد' الوقت 12.
هذه طريقة بسيطة بروتوكول تدور تحلل في المنزل باستخدام استخراج حمض الفورميك تطبيقها مباشرة على إيجابية مرق ثقافة الدم لتحديد غرام ب سلبيacteria مع التكنولوجيا MALDI-TOF MS.
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
1. ثقافة الدم الحساء العلم بأنها "ايجابية"
2. غرام وصمة عار على استعداد
4. تركيز ثقافة الدم في مرق
5. كرر الطرد المركزي غسل خطوات
6. تحلل الخلايا المتبقية
7. استخراج البروتينات البكتيرية
8. إعداد MALDI-TOF الهدف بلايت
9. MALDI-TOF مكان الهدف اللوحة في مطياف الكتلة
10. MALDI-TOF MS Spectra اقتناء
11. تفسير تحليل آخر من MALDI-TOF MS العشرات
12. إزالة MALDI-TOF الهدف بلايت
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
تتم مقارنة ولدت MALDI-TOF MS الأطياف لقاعدة البيانات المرجعية المتكاملة للأطياف. يتم تخصيص نقاط لوغاريتمي على الثقة من المباراة بين عزل واختبار قاعدة البيانات المرجعية يعزل، مع توصية من النتيجة ≥ 1.7 اللازمة لتحديد المستوى المحتمل لأجناس (الشكل 1) و≥ 2.0 لتحديد المحتملة على الأنواع (الشكل 2). تقرير لمستوى الأنواع عندما كانت النتيجة ≥ 1.7 و 5 هويات الأولى يقابله برنامج الكتابة يتسق (الشكل 1) 12. يوضح الشكل 3
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
من المهم عند تطبيق MALDI-TOF MS للثقافة مرق الدم الذي يتم تنفيذ الخطوات آخر الطرد المركزي مع الرعاية الكافية لا في التعديل مكونات فصلها. من المهم بصفة خاصة لإزالة مكونات ثقافة الدم والبروتينات الخلوية الإنسان، بما في ذلك الهيموغلوبين، والتي قد تنتج طفرات التدخل مع أطياف MALDI-TOF.
على الرغم من أن MS بتصنيع يوصي بتخفيض درجة من ≥ 2.0 للأنواع و≥ 1.7 لتحديد جنس، وأشارت تقارير أخرى انخفاض درجات لوغاريتمي (المدى ≥ 1.4 ...
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
يعلن الكتاب أنه ليس لديهم مصالح مالية المتنافسة.
| الاسم | الشركة | رقم فهرسي | التعليقات |
|---|---|---|---|
| BACTEC Plus الهوائية / F متوسطة | بيكتون ديكنسون. BD ، فرانكلين ليكس ، نيوجيرسي ، الولايات المتحدة الأمريكية | 442192 | |
| BACTEC Lytic / 10 Anaerobic / F Medium | Becton Dickinson. BD ، فرانكلين ليكس ، نيوجيرسي ، الولايات المتحدة الأمريكية | 442265 | |
| BACTEC Peds Plus Medium | Becton Dickinson. BD ، فرانكلين ليكس ، نيوجيرسي ، الولايات المتحدة الأمريكية | 442194 | |
| Vacutainer - جهاز نقل الدم | Becton Dickinson. BD ، فرانكلين ليكس ، نيوجيرسي ، الولايات المتحدة الأمريكية | 364880 | جهاز أخذ العينات للاستخدام الفردي يقلل من خطر إصابة الإبر |
| Vacutainer SST 5.0 مل ، Advance plus | Becton Dickinson ؛ BD ، فرانكلين ليكس ، نيوجيرسي ، الولايات المتحدة الأمريكية | 367954 | مصل أنبوب |
| حقنة 10 مل | بيكتون ديكنسون ؛ BD ، فرانكلين ليكس ، نيوجيرسي ، الولايات المتحدة الأمريكية | 302143 | |
| ماصة نقل | سامكو ، الولايات المتحدة الأمريكية | ماصة نقل 222-20S | |
| (ذات رؤوس دقيقة) | سامكو ، الولايات المتحدة الأمريكية | الدقيق 232-20S | |
| (2.0 مل) | Eppendorf ، هامبورغ ، ألمانيا | 0030.120.094 | |
| مياه معقمة (خالية من DNAse و RNAse) Life | Technologies ، كارلسباد ، كاليفورنيا ، الولايات المتحدة الأمريكية | 10977-015 | |
| حمض الفورميك | سيجما ألدريتش ، سانت لويس ، ميسوري ، الولايات المتحدة الأمريكية | F0507 | |
| محلول مصفوفة ؛ | Bruker Daltonics ، بريمن ألمانيا | 285074 | 10 مجم / مل & alpha -cyano-4-hydroxycinnamic acid ، 50٪ acetonitrile ، 2.5٪ حمض ثلاثي فلورو أسيتيك |
| Benchtop microflex LT MALDI-TOF MS | Bruker Daltonics ، بريمن ألمانيا | باستخدام برنامج BioTyper 3.1 (Build 65) و FlexControl 3.3 (Build 99) |
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.