مقالة منهجية
يمكن أن توفر إضافة الجينات المعدلة وراثيا مستهدفة تعبيرا جينيا مستمرا أثناء التحايل على إسكات الجينات والطفرات الإدخالية الناجمة عن التكامل العشوائي بوساطة النواقل الفيروسية. يصف هذا البروتوكول منصة إضافة مستهدفة عالمية وفعالة للجينات المعدلة وراثيا في iPSCs البشرية بناء على استخدام TALENs مفتوحة المصدر التي تم التحقق من صحتها ومتبرع يشبه مصيدة الجينات لإيصال الجينات المعدلة وراثيا إلى موضع ملاذ آمن. الأهم من ذلك ، أن التحرير الجيني الفعال محدود المعدل من خلال كفاءة توصيل نواقل تحرير الجينات. لذلك, يركز هذا البروتوكول أولا على إعداد iPSCs للتعداء لتحقيق كفاءة عالية في التوصيل النووي. عندما يتم تفكيك iPSCs إلى خلايا مفردة باستخدام كاشف تفكك الخلية اللطيفة ونقلها باستخدام برنامج محسن, >50٪ يمكن حث الخلايا على أخذ ناقلات تحرير الجينات الكبيرة. نظرا لأن موضع AAVS1 يقع في إنترون الجين النشط (PPP1R12C), متقبل التضفير (SA)- الجين المقاوم للبورومايسين المرتبط (PAC) تم استخدامه لتحديد iPSCs المستهدفة مع استبعاد الخلايا العشوائية للتكامل فقط وغير المنقولة. تزيد هذه الإستراتيجية بشكل كبير من فرصة الحصول على المستنسخة المستهدفة ، ويمكن استخدامها في تجارب استهداف الجينات النشطة الأخرى أيضا. بعد أسبوعين من اختيار بورومايسين بالجرعة المعدلة لخط iPSC محدد, المستنسخة جاهزة ليتم انتقاؤها عن طريق التشريح اليدوي للكبيرة, مستعمرات معزولة إلى قطع أصغر يتم نقلها إلى وسط جديد في بئر أصغر لمزيد من التوسع والفحص الجيني والوظيفي. يمكن للمرء أن يتبع هذا البروتوكول للحصول بسهولة على خطوط iPSC متعددة مراسل GFP مفيدة للتصوير في الجسم الحي وفي المختبر وعزل الخلايا.
اكتشفت القدرة على إعادة برمجة الخلايا الجسدية الإنسان في الجذعية الجنينية التي يسببها الخلايا الجذعية المحفزة تشبه الخلايا (iPSCs) أول من تاكاهاشي آخرون في عام 2007 1. الليفية الجلدية الإنسان transduced مع الفيروسات القهقرية معربا عن أربعة عوامل النسخ (وياماناكا ذلك يطلق عليها اسم العوامل Oct3 / 4، Sox2، عرضت ج. Myc على، وKlf4) لتكون مشابهة إلى حد كبير للخلايا الجذعية الجنينية البشرية (hESCs) على أساس التشكل، والانتشار، والتعبير الجيني، وحالة جينية. بشكل حاسم، iPSCs هي أيضا قادرة على التفريق في الخلايا من جميع الطبقات الجرثومية الثلاث 1. القدرة التكاثري المحتملة والتفريق بين iPSCs يجعلها أدوات جذابة للغاية. عن طريق إعادة برمجة الخلايا من المرضى الذين يعانون من أمراض معينة، يمكن استخدام iPSCs على حد سواء كما نظم في المختبر نموذج المرض والعلاجات كما المحتملة.
لغرض الأخير، يجب أن تعالج العديد من القضايا قبل الإمكانات الكاملة للiPSCsفي عملية إعداد سريرية يمكن أن تتحقق. إمكانيات مكون للأورام في المختبر hESCs مثقف وiPSCs، واستخدام المشتقات xenogenic خلال إعادة برمجة وصيانة الخلايا، والحاجة لتتبع الخلايا المزروعة في الجسم الحي كلها عقبات حاسمة إلى التطبيق السريري من الخلايا الجذعية المحفزة (التعليق بواسطة Hentze آخرون في. 2). سيكون حلا مثاليا للحاجة لتتبع خلايا متمايزة في مرحلة ما بعد زرع ينطوي على علامة للكشف بصريا أن يقاوم إسكات وتلون بغض النظر عن التطبيق. التعبير القوي والمستدام من الجينات المحورة المتكاملة هو الأكثر بسهولة يمكن تحقيقه عندما يتم إدخال الحمض النووي الخارجية إلى ميناء آمن مواضع. وهذا هو، مواقع الجينومية التي تمكن النسخ كاف من متجه متكامل، وفي الوقت نفسه تخفيف الاضطرابات التعبير في الجينات المجاورة 3. واحد موقع من هذه المواقع التي تميزت بشكل جيد جدا منذ اكتشافه هو integr فيروس الغدة المرتبطةالموقع أوجه 1 (AAVS1)، في إنترون الأول من بروتين الفوسفاتيز 1 التنظيمي فرعية 12C (PPP1R12C) الجين. وقد تبين هذا الموضع ليس فقط أن يسمح لحقت والتعبير القوي من الجينات المحورة المتكاملة من خلال تمديد الوقت في الثقافة والتمايز في المختبر 3، ولكن أيضا لحماية المحيطة الجينات من اضطراب النسخي 4؛ ويعتقد أن كل من الميزات أن ذلك يعود إلى وجود عناصر داخلية عازل لونين المرافقة الموقع AAVS1 5.
التقدم في الأدوات الهندسية الجينوم ما يزيد قليلا على مدى العقد الماضي قد سهلت كثيرا من السهولة والكفاءة التي يمكن تحقيقها التلاعب الجيني في أي نوع من الخلايا. بينما اعتمدت التجارب الناجحة الأولى على مستويات منخفضة جدا من إعادة التركيب مثلي الذاتية (HR) مع الجهات المانحة التي أدخلت على تحقيق استهداف الجينات في المجالس الاقتصادية والاجتماعية 6،7، واستخدام nucleases في مواقع محددة، مثل nucleases إصبع الزنك (ZFNs)، أن significantly لحث على إعادة التركيب مثلي من خلال توليد استراحة DNA المزدوج تقطعت بهم السبل وزيادة كبيرة في كفاءة مثل هذه التجارب 8،9. جعلت تطويعها لأغراض أخرى كل النسخ مثل المنشط المستجيبات (حكايات) من النباتات المسببة للأمراض زانثوموناس جنسا وبدائية النواة تتجمع interspaced بانتظام يكرر المتناوب قصيرة (كريسبر) / نظام Cas9 إلى كفاءة مصمم nucleases في مواقع محددة استهداف الجينات في الخلايا الجذعية المحفزة على الوصول إليها و منهجية العملية 10-13.
ووصفت ورقة الأخيرة وسيلة فعالة لتحقيق التكامل مستقر من الأخضر الفلورسنت مراسل الكاسيت في AAVS1 آمن الميناء مكان في iPSCs الإنسان باستخدام nucleases حكاية (TALENs) 14. حافظت هذه iPSCs استهدفت مضان حتى بعد التمايز الموجهة إلى العضلية وزرع في نموذج الفأر من احتشاء عضلة القلب (MI)، وتوفير أدلة قوية لفائدة مثلثابت المحفزة الفلورسنت الخلايا الجذعية 14. للحصول على المستعمرات المستهدفة، تم استخدام طريقة الجينات فخ فيه على الربط-متقبل (SA)، 2A-الشق الذاتي تسلسل الببتيد يضع بوروميسين N-أسيتيل ترانسفيراز (PAC) الجينات تحت سيطرة PPP1R12C المروج الذاتية. وبالتالي، iPSCs فقط التي أدرجت المتبرع DNA في موضع AAVS1 تعبر عن PAC، مما يجعلها اختيار على أساس بوروميسين المقاومة. (الشكل 1، 15). تفاصيل هذا البروتوكول إجراءات لتوليد AAVS1-GFP iPSCs ذكرت في الورقة الأخيرة 14، بما في ذلك عملية transfecting iPSCs مع TALENs والجهات المانحة 9.8 كيلوبايت لدمج جزء DNA 4.2kb في موضع AAVS1 آمن الميناء، واختيار iPSCs على أساس بوروميسين المقاومة، واختيار المستعمرات للتوسع نسيلي. التقنيات الموضحة في هذه الوثيقة يمكن تطبيقها على العديد من التجارب الهندسة الجينوم.
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
1. إعداد مصفوفة الغشاء القاعدي وطلاء بلستيكور
2. إعداد E8 المتوسطة
3. ذوبان iPSCs
4. صيانة والركض الروتيني لiPSCs
5. إعداد MEFS وiPSCs لTansfection
6. لطيف خلية التفكك الكاشف علاج لالثانية ترنسفكأيشن من iPSCs باستخدام نظام Electroporation لل
7. بوروميسين اختيار iPSCs المستهدفة
8. مستعمرة الإلتقاط والتوسع من iPSCs المستهدفة
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
ويرد التصور للبروتوكول في الشكل 2، مع الفترات التي iPSCs هي المستزرعة في مختلف المتوسطة التي أبرزها إما أخضر أو أزرق لE8 لNutriStem. من المهم أن بالنقل فقط iPSCs ذات جودة عالية؛ دراسة أطباق الثقافة في جميع أنحاء الصيانة الروتينية والتحقق من أن الثقافات IPSC تحتوي على المستعمرات متميزة أساسا تحمل التشكل مثل الحصوه (الشكل 3A)؛ خلايا متباينة لا ينبغي أن تشغل أكثر من 10٪ من الثقافة. ويتم تقييم Transfectability من iPSCs والأمثل باستخدام ناقلات صغيرة pM...
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
الخطوات الأكثر أهمية للجيل ناجح من AAVS1 آمن الميناء استهدفت iPSCs الإنسان هي: (1) يعطي كفاءة TALEN والجهات المانحة البلازميدات إلى iPSCs من قبل ترنسفكأيشن. (2) تحسين تفكك iPSCs إلى خلايا واحدة قبل ترنسفكأيشن والطلاء كثافة بعد ترنسفكأيشن. (3) تحسين الجرعة ووقت المخدرات الاختيار على أساس نمو خط IPSC. (4) تشريح بعناية واختيار المستعمرات المستهدفة ونقل لوحة جديدة / جيد. بالمقارنة مع الطرق المماثلة المستخدمة في ورقة Hockemeyer في 10، وتستخدم هذا البروتوكول زوج من المصدر الم...
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
تعلن المؤلفين أنه ليس لديهم المصالح المالية المتنافسة.
تم دعم هذا البحث من قبل الصندوق المشترك للمعاهد الوطنية للصحة وبرنامج البحوث الداخلية التابع للمعهد الوطني لالتهاب المفاصل وأمراض الجهاز العضلي الهيكلي والجلد.
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
| الاسم | الشركة | رقم فهرسي | التعليقات |
|---|---|---|---|
| مصفوفة غشاء قاعدي لعامل النمو المخفض (GFR) من ماتريجل ، * خالية من LDEV ، 10 مل | Corning | 354230 | يخزن عند -20 درجة مئوية. |
| متجر DMEM / F-12 | Life Technologies | 11320-033 | عند 4 درجات مئوية. |
| Costar 6 Well Clear Multiple Well Well Processor TC | Corning | 3506 | |
| Essential 8 | Medium Life Technologies | A1517001 | تخزين الوسط القاعدي عند 4 درجات مئوية. تخزين المكملات الغذائية عند -20 درجة مئوية. |
| Y-27632 ثنائي هيدروكلوريد | توكرس | 1254 | يحفظ في درجة حرارة الغرفة. بمجرد إذابتها في H2< / sub>O ، قم بتخزينها في درجة حرارة -20 درجة مئوية. |
| كلوريد الصوديوم | Sigma | S5886-500G | |
| UltraPure 0.5 M EDTA ، درجة الحموضة 8.0 | Life Technologies | 15575-020 | |
| DPBS ، بدون كالسيوم ، خال من المغنيسيوم | Life Technologies | 14190-250 | |
| 100 مم طبق الثقافة المعالج TC | Corning | 430167 | |
| DR4 MEF 2M IRR - Academic | GlobalStem | GSC-6204G | يخزن في النيتروجين السائل. |
| DMEM ، نسبة عالية من الجلوكوز ، بيروفات | لايف تكنولوجيز | 11995-040 | يخزن في درجة حرارة 4 درجات مئوية. |
| مصل الأبقار الجنيني المحدد ، من أصل | أمريكي HyClone | SH30070.03 | يخزن عند -20 درجة مئوية ؛ ذوبان الجليد عند 4 درجات ؛ ج بين عشية وضحاها ونقل الصوت. تخزين الكميات عند -20 درجة ؛ ج لحين الحاجة. |
| محلول الأحماض الأمينية غير الأساسية MEM (100X) | Life Technologies | 11140-050 | يخزن في درجة حرارة 4 درجات مئوية. |
| 4D-Nucleofector الوحدة الأساسية | Lonza | AAF-1001B | جزء من نظام التثقيب الكهربائي |
| 4D-Nucleofector X وحدة ; | Lonza | AAF-1001X | جزء من نظام التثقيب الكهربائي |
| P3 Primary Cell 4D-Nucleofector X Kit L (24 RCT) | Lonza | V4XP-3024 | عند الوصول ، قم بإزالة محلول الخلية الأولية واستكمله وتخزينه في درجة حرارة 4 درجات مئوية. |
| تقنيات كاشف حياة تفكك الخلايا StemPro Accutase | A1110501 | في -20 درجة مئوية ، قم بإذابة الثلج بين عشية وضحاها عند 4 درجات ؛ C وتسخين aliquot في 37 & deg; ج حمام مائي قبل الاستخدام. | |
| NutriStem XF / FF Culture Medium | Stemgent | 01-0005 | يخزن في -20 درجة مئوية ، قم بإذابة الثلج بين عشية وضحاها عند 4 درجات ؛ C |
| AAVS1 TALENs (pZT-AAVS1-L1 و pZT-AAVS1-R1) | Addgene | 52637 و 52638 | |
| AAVS1-CAG-EGFP المتبرع بإعادة التركيب المتماثل | Addgene | 22212 | |
| Puromycin Dihydrochloride | Life Technologies | A11138-03 | يخزن في -20 درجة مئوية. قم بإعداد كميات العمل من 1 مجم / مل في ddH 2< / sub>O. |
| زجاج البورسليكات القابل للتصرف باستور بيبيتس | فيشر سيانتيفيك | 13-678-20A | |
| سورفال ليجند XTR (مبرد) ، 120 فولت 60 هرتز | حراري علمي | 75-004-521 | |
| TX-750 4 & مرات 750 مل دلو متأرجح الدوار | الحراري العلمي | 75003607 | |
| محلول تريبان الأزرق ، 0.4٪ | تقنيات الحياة | 15250-061 |
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
طلب إذن لإعادة استخدام النص أو الأشكال في مقالة JoVE هذه
طلب إذن