يصف هذا البروتوكول بنية نظام لإجراء عمليات فصل الجسيمات الآلية ذات الحجم الصغير (0.15-1.5 مل) باستخدام جهاز الموائع الدقيقة، ويناقش طرقا لتحسين أداء الجهاز المضاد للسوائل الصوتية وتشغيله.
Method Article
يصف هذا البروتوكول بنية نظام لإجراء عمليات فصل الجسيمات الآلية ذات الحجم الصغير (0.15-1.5 مل) باستخدام جهاز الموائع الدقيقة، ويناقش طرقا لتحسين أداء الجهاز المضاد للسوائل الصوتية وتشغيله.
والميزة الرئيسية لأجهزة ميكروفلويديك هو القدرة على التعامل مع أحجام عينة صغيرة، وبالتالي تقليل النفايات كاشف والحفاظ على عينة الثمينة. ومع ذلك، من أجل تحقيق القوي التلاعب عينة من الضروري معالجة التكامل الجهاز مع البيئة macroscale. لتحقيق للتكرار، حساسة الجسيمات الفصل مع أجهزة ميكروفلويديك، ويعرض هذا البروتوكول منصة ميكروفلويديك الآلي ومتكاملة الكاملة التي تمكن معالجة الدقيق لل،15-1،5 مل العينات باستخدام أجهزة ميكروفلويديك. وتشمل جوانب مهمة من هذا النظام تخطيط وحدات الجهاز ومواعيد المباريات القوية الناتجة في العالم موثوقة ومرنة لرقاقة الاتصالات، والتعامل مع السائل مؤتمتة بالكامل والتي تنجز حلقة مغلقة جمع العينات، وتنظيف النظام وفتيلة خطوات لضمان عملية قابلة للتكرار. أجهزة ميكروفلويديك مختلفة يمكن استخدامها بالتبادل مع هذه العمارة. نحن هنا دمج جهاز acoustofluidic، التفاصيل characteriz لهاأوجه، وتحسين الأداء، وإثبات استخدامه لحجم-فصل العينات البيولوجية. باستخدام التغذية المرتدة في الوقت الحقيقي خلال التجارب الانفصال، هو الأمثل جمع العينات لحفظ وتركيز العينة. على الرغم من أن تتطلب دمج قطع متعددة من المعدات، ومزايا هذه العمارة وتشمل القدرة على معالجة العينات المجهولة مع أي التحسين الإضافي النظام، وسهولة استبدال الجهاز، ودقيقة وقوية تجهيز العينات.
فصل العينة والتجزئة هي واحدة من أكثر المناطق الواعدة للتطبيق لتقنيات الموائع الدقيقة. مثل هذه الخطوات معالجة العينة هي جزء لا يتجزأ لتشخيص فعالة السريرية، وتطوير العلاجات، وجهود biosurveillance، والتقدم في بحوث علوم الحياة والتكنولوجيا. وقد أظهر عدد لا يحصى من الاستراتيجيات فصل الموائع الدقيقة للجسيمات والغرويات مع وقف التنفيذ السائل، فضلا عن الأنواع الكيميائية والبيولوجية؛ العديد من الاستعراضات توفر لمحات عامة عن التقدم والتطورات الأخيرة في هذه المجالات 1-9. على الرغم من أن العديد من هذه التقنيات فصل الموائع الدقيقة (يشار إليها فيما يلي باسم "أجهزة كور") قد تميزت على نطاق واسع، وقد اعتبرت تقارير قليلة مشكلة فصل العينة على مستوى النظام. الأجهزة الأساسية عادة ما تكون فردية رقائق سنتيمتر النطاق، ربطه إلى أنابيب الفلورو، مع السائل بايدي النزوح أو ضغط المضخة.ومع ذلك، وإذا وعد على microfluidics - بما في ذلك زيادة التشغيل الآلي، والموثوقية، وانخفاض حجم العينة - هو أن تصبح حقيقة واقعة، على الأقل يجب أن تكرس جهدا مساويا لتصميم نظام الفصل التام الذي يتم دمج جهاز كور .
بالإضافة إلى ذلك، يشكل تحديا كبيرا للنهج ميكروفلويديك لbiodetection هو الماكرو إلى واجهة الصغيرة. هذا لا يشير فقط إلى الصلات المادية "العالم إلى رقاقة" من جهاز ميكروفلويديك لمكونات macroscale، وإلى عدم التوافق بين أحجام نموذجية عينة السريرية أو التحليلية (~ 0،1 حتي 10 مل)، وحجم الداخلي للرقائق ميكروفلويديك (~ ،01-10 ميكرولتر)، ولكن أيضا إلى القيود أخذ العينات الإحصائية الناتجة عن سد هذه المقاييس الحجم. وتساهم هذه القضايا إلى الاعتقاد بأن ما قبل تجهيز وإعداد نموذج هي "الحلقة الضعيفة" من biodetection 10 منصة وصفها في هذا العمل تاKES خطوات كبيرة نحو التصدي لهذه التحديات.
إلقاء نظرة على مستوى النظام، هذا البروتوكول تفاصيل تجهيز موثوقة من وحدات التخزين على نطاق والتحليلية على وجه التحديد-المقننة (تتراوح ،15-1،5 مل) على ~ الجداول الزمنية 10 دقيقة. هذا هو "واحدة على زر" العملية: مرة واحدة يتم وضع قارورة تحتوي على مصدر العينة وجهة قارورة لجمع جزء في النظام، يبدأ الأمر "تشغيل" الإجراء، وجميع الخطوات والكمبيوتر التي تسيطر عليها. في نهاية المدى، يمكن إزالة قارورة جمع من نظام لتحليل المصب من الكسور فصل.
الجهاز الأساسية في هذا النظام هو رقاقة acoustophoresis التي تستخرج الثدييات (5-20 ميكرون) جزيئات الخلية الحجم من العينة. يتم اختيار الانفصال Acoustophoretic هنا في المقام الأول لأنها عالية الإنتاجية (إلى 100s من ميكرولتر / دقيقة)، خالية من التسمية، وعدم الاتصال، وبهذا توفر ميزات في فصل فيرو قابلة للحياةإس إي إس من الخلايا التي بعض التقنيات ميكروفلويديك أخرى يمكن أن المباراة. فيزياء الجسيمات الصوتية التركيز، وقد وصفت على نطاق واسع، 11-13، وهي ليست محور هذا البروتوكول، ولكن ملخص موجز للمفاهيم الأساسية يتبع للمساعدة في فهم تطبيق لفصل ميكروفلويديك.
موجات دائمة الموجات فوق الصوتية صدى في microchannels مملوءة بسائل تنتج حقول الضغوط التي تؤدي إلى ظهور قوى التي تدفع الجسيمات نحو عقد من الضغط المنخفض. حجم قوة يعتمد على حجم الجسيمات، وعلى النقيض عامل الصوتية المستمدة من الكثافة وcompressibilities من الجسيمات النسبية والسوائل تعليق. 14 وعلى هذا النحو، ومناسبة بشكل مثالي الصوتية التركيز على فصل الخلايا الحجم (~ 7-15 ميكرون) من (~ 50-200 نانومتر) جزيئات الفيروسات الحجم. الجسيمات أكبر تهاجر نحو عقدة الضغط؛ ومع ذلك، منذ أن حجم قوة صغيرة جدا لجسيمات أصغر من 2-3 ميكرون، هذه الجزيئات الصغيرة أو الأنواع الذائبة بالكاد تتحرك على الإطلاق. لدينا محددة للتنفيذ الانفصال الصوتية، كما هو موضح سابقا، 15 يشتمل على جدار رقيق لتقسيم القناة السوائل ويسمح الانضباطي، والتنسيب غير المتماثلة من موقف التركيز. وهذا يضيف مرونة في تصميم الجهاز، والفوائد، بما في ذلك أداء زيادة جودة الانفصال والسرعة موصوفة بشكل كامل في أي مكان آخر. 16،17
ومع ذلك، فإن الميزة الرئيسية لهذا النهج التصميم على مستوى النظام المذكور في هذا العمل هو أنه قابل للتكيف مع مجموعة كبيرة ومتنوعة من الأجهزة الأساسية ميكروفلويديك. على سبيل المثال، معظم وسائط فصل الدفق المستمر أخرى، بما في ذلك بالقصور الذاتي، تجزئة حقل التدفق، والنزوح الأفقي القطعية (DLD)، وأنواع مختلفة من الأجهزة حركي كهربي يمكن إدراجها بسهولة، مع إدخال التعديلات المناسبة لمراعاة التغيرات في مدخل / تكوين منفذ ، معدلات التدفق،وأحجام العينة. الأجهزة مع أنواع مختلفة من المجالات على رقاقة (الكهربائية، والمغناطيسية) أو التدرجات (الحرارية والكيميائية) قد تتطلب اتصالات إضافية إلى شرائح، أو دمج أجهزة إضافية، والتي تتسع هذه المنصة.
يوفر هذا البروتوكول الخطوات المطلوبة لتصميم جهاز فصل ميكروفلويديك، وافتعال رقائق السيليكون والزجاج التي كتبها العميق الحفر أيون رد الفعل (DRIE، وهي عملية البلازما حفر متوفرة في العديد من مرافق التصنيع الدقيق، والذي يستخدم بالتناوب دورات الحفر والتخميل لتحقيق عميق الميزات مع الجوانب الرأسية 18). المقبل، وصفنا توصيف الجهاز acoustofluidic لتحديد معايير التشغيل المثلى للانفصال، وأخيرا بالتفصيل نظام الفصل متكاملة وإجراءات تجهيز العينات البيولوجية. ثم يتم عرض النتائج النموذجية توصيف الجهاز والبيانات تجهيز العينات ومناقشتها، والمزايا الرئيسية لهذا APPROوأبرزت منظمة العمل ضد الجوع، بما في ذلك نمطية، متانة، والدقة والأتمتة.
1. Acoustophoretic تصميم الأجهزة وتخطيط الضوئية الرئيسية
ملاحظة: اعتبارات عامة وإرشادات لتصميم عملية التصنيع الدقيق وتخطيط قناع يمكن العثور عليها في النصوص على التصنيع الدقيق ودروس التصميم الضوئية الرئيسية 19-21.

الشكل 1. جهاز Acoustofluidic. اسكتشات تخطيطي العمارة جهاز acoustophoretic. (أ) أعلى عرض، والتي تبين التكوين العام H-فلتر (لا لتوسيع نطاق). (ب) رسم تخطيطي للقناة المقطع العرضي في الموقع والتي تمثلت في أسود متقطع سطر في (أ)، والتي تبين مجال الضغط (أزرق منقط خطوط)، والشعور قوات الصوتية الأولية الإشعاع (PRF) التي تدفع الجسيمات نحو طائرات العقدية (الأسهم الحمراء). قناة المقطع العرضي900 × 200 ميكرون مع جدار حوالي 10 ميكرون سميكة فصل الرئيسي (300 ميكرون واسع) وقنوات الالتفافية. (ج) تمثيل 3D فصل الجسيمات. الرجاء انقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الرقم.
2. غرف الأبحاث تصنيع الرقائق الميكروية لAcoustophoresis
3. جهاز النهائي الجمعية

الشكل 2. فلويديك اللوح، رقاقة تصاعد، والعالم إلى رقاقة واجهة. صور من (أ) رقاقة ميكروفلويديك الصوتية (الأبعاد الخارجية من 70 × 9 × 1 مم) مع المرفقة محول بيزو يؤدي الأسلاك، والتي تبين ثلاث مسارات لفصل قناة أسفل الشريحة، (ب) التجهيزات المسمار الموائعية العرف ومكونات أنابيب تشكيله للواجهة رقاقة إلى العالم، (ج) الشريحة التي شنت على الجانب السفلي من اللوح فلويديك باستخدام تركيبات تحامل، والتي تمتد فتحة في اللوح للسماح لل مروحة التبريد، (د) وجهة نظر العلوي من اللوح مع وصلات أنابيب المرفقة ومروحة التبريد، و (ه) التخطيطي مستعرضة من التجهيزات المسمار الذي واجهة TUBIنانوغرام مع رقاقة ميكروفلويديك شنت. الرجاء انقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الرقم.
4. توصيف الصوتية التركيز الأداء
يتم تجميع مكونات النظام اللازمة لالصوتية التركيز توصيف معا في قائمة المواد: ملاحظة. خطوات 4.1 و 4.2 تطبيق أدناه لأي جهاز كور استخدامها مع هذه المنصة، في حين تصف الخطوات اللاحقة عمليات محددة إلى الجهاز acoustofluidic مناقشتها هنا.

الشكل (3). الممثل مسح التردد. مثال على البيانات تردد المسح الضوئي للجانب جيدا (A) وسيئة إلى جانب (B) بيزو ورقاقة. الصف العلوي: كثافة الفلورسنت من الخرز (الأحمر يمثل عالية، والأزرق يمثل كثافة منخفضة). الصف الأوسط: الحد الأقصى لكثافة في كل تردد. الصف السفلي: موقع الكثافة القصوى، حيث يشير إلى توقع خط متقطع أحمر التركيز الموقف، والماس الحمراء تشير إلى تردد الرنين على النحو الذي يحدده الحد الأقصى للكثافة.ز "الهدف =" _ فارغة "> الرجاء انقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الرقم.
5. الفصل الآلي
ملاحظة: يتم تشغيل التجربة الفصل الآلي لفصل الجزيئات الكبيرة من الجزيئات الصغيرة نظرا لالصوتية تركز القوات تعتمد على حجم المطبقة في رقاقة ميكروفلويديك. يتم تجميع مكونات النظام المطلوبة معا في قائمة المواد.

الرقم 4. الصوتية لتكوين النظام لتجارب الفصل الآلي. خطوط زرقاء تتبع مسار تدفق الرئيسي من خلال النظام. كل الخطوط الخضراء والسوداء هي 0.03 "القطر الداخلي (ID) أنابيب، وجميع خطوط زرقاء ورمادية بلون هي 0.01" أنابيب ID، مع هxception من لفائف القابضة، التي هي 0.03 "ID، ومقيد التدفق، والتي هي 0.006" ID. تمتلئ المحاقن مع العازلة، وملفات عقد يكون حجم كاف (550 ميكرولتر) لمنع امتصاص أي عينات أو الكواشف التنظيف في الحقن. الرجاء انقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الرقم.
ويسلط الضوء على الملامح الرئيسية لتصميم الجهاز السمعي-ميكروفلويديك في الشكل 1، وصفا كاملا في مكان آخر. 15 وباختصار، جنبا إلى جنب تدفق تيارين السوائل في قناة الانفصال، وفصلها عن قناة الالتفافية موازية بجدار رقيقة السيليكون. منذ حجم قوة الإشعاع الأساسي موازين مع حجم الجسيمات، الجزيئات الكبيرة تهاجر من تدفق الدخل المختلط العينة نحو العقدة الضغط الصوتية الموجودة في المجاور تيار السائل الانتعاش، في حين لا تزال جسيمات صغيرة في مجرى الأصلي (الشكل 1B، C). وتنقسم الهندسة المعمارية ثنائي القناة يحسن الجسيمات الفصل 17 ويسمح تعديل موقف عقدة باستخدام مختلف السوائل قناة تجاوز 16 في اللوح فلويديك والتركيبات يوفر منصة قوية للعالم لرقاقة الاتصالات، وتصميم وحدات يمكن تغيير سريع بين رقائق الموائعية (الشكل 2). هذا جonfiguration يسمح أيضا اتصالات السوائل عكسها، الذي ختم تصل إلى 1000 رطل لكل بوصة مربعة، ليتم بسرعة وبشكل موثوق (الشكل 2B، E).
ويمكن تقدير الدقة التردد و الرنانة من شريحة باستخدام الحسابات التحليلية 1D بسيطة (راجع الخطوة 1.1.1). من أكثر اكتمالا نموذج 2D محدود عنصر لدينا جهاز المقطع العرضي، 16 موقف مع التركيز المتوقع ل2-عقدة الرنين هو 225 ميكرون من الجدار والتردد المتوقع هو 1.68 ميغاهيرتز. ومع ذلك، يمكن الدقة و الأجهزة الحقيقية تختلف من ± 100 كيلو هرتز، اعتمادا على درجة حرارة التشغيل واقتران الأصداء الطولية والعرضية. ولذلك، بعد تجميع الجهاز، الدقة و يجب التحقق منها تجريبيا في معدلات تدفق ذات الصلة والفولتية محرك بيزو، كما هو موضح في الخطوة 4 من البروتوكول. ويبين الشكل 3 بالاشعة تردد التمثيلي الذي اتخذ في 200 ميكرولتر / دقيقة، مع المياه في القنوات الرئيسية والالتفافية، و 20 V ص الموردة إلى بيزو. عندما اقتران بين بيزو وجهاز ميكروفلويديك أمر جيد، وسوف تركز الجسيمات بإحكام على تردد الرنين، مما أدى إلى الذروة واضحة في كثافة الفلورسنت والهجرة إلى موضع التركيز المتوقع (الشكل 3A). في المقابل، عندما يكون هناك سوء اقتران، والجسيمات لن تركز بشكل جيد وستكون النتائج تردد المسح تكون مشابهة إلى الشكل 3B. في مثل هذه الأجهزة، قد تحتاج محول بيزو إلى إعادة تركيبه، إذا تم استخدام مادة لاصقة عكسها. خلاف ذلك، وهذا الجهاز غير مناسب عندما عالية الجودة مع التركيز أو تدفق سريع حاسمة لتطبيق المطلوب. البيانات في الشكل (3) تبلغ اختيار تردد التشغيل لتجارب لاحقة، والجهد وتدفق نطاق سعر متاح للجسيمات كفاءة الانفصال.
الملفات / ftp_upload / 53051 / 53051fig5.jpg "/>
الرقم 5. المعالجة الآلية للعينة. (A) رسم تخطيطي للعينة التي تم تحميلها في ملف عينة. (B) لمحة تدفق ممثلا لتجربة فصل ناجحة. (C) التدفق الجانبي من الفصل تشغيل خلالها منفذ SPO انسداد في حوالي 220 ثانية. الرجاء انقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الرقم.
بعد تحديد الرقائق التي هي فصل فعالة، وإدماجها في النظام هو مبين في الشكل (4). يتم التقليل من مجموع النظام اجتاحت حجم باستخدام أنابيب مع 0.01 "القطر الداخلي على طول مسار التدفق الرئيسي (خطوط زرقاء). ويوضح الشكل 5A الماكياج من المكونات عينة نموذجية أكسب من خلال النظام. مطلوب كمية صغيرة من "عازلة الرائدة" (~ 35 ميكرولتر) إلى preceدي العينة في تدفق للقضاء على تقلبات تدفق بينما العينة يتحرك من خلال رقاقة الانفصال. ويبين الشكل 5B تدفق البيانات الناتجة من التجربة الآلي الفصل الصوتية الناجحة. الملامح الرئيسية مسيرته الناجحة ما يلي: (1) زيادة عابرة في معدل التدفق في كل من LPO ومكتب التخطيط الاستراتيجي تراكم الضغوط ويبدأ السائل في التدفق من خلال النظام، (2) ارتفاع حاد مما يدل على مرور فقاعة الهواء (ل أقحم يظهر ملف تعريف الموسع للفقاعة واحدة)، والتي ينبغي أن تصل إلى مكتب التخطيط الاستراتيجي قبل LPO بسبب تدفق غير المتكافئ من وسائل اثنين، (3) تدفق ثابت من خلال كل وسائل بين فقاعات الهواء اثنين كما العينة التحركات من خلال النظام، و (4) يتم تسليم انخفاض تدريجي في معدل التدفق في كل المنافذ بعد حجم العينة الكامل للنظام. يدير إشكالية واضحة على الفور من ملامح تدفق مشابهة الشكل 5C، حيث يبدو أن مكتب التخطيط الاستراتيجي أصبح انسداد بعد حوالي 220 ثانية. في ثي يجب تشغيل الصورة الحالة، إجراء تنظيف مماثلة لتلك التي وصفها في الخطوة 5.3 لتنشيط القناة.

الرقم 6. جهاز Tunability: حجم الجسيمات والجهد الأثر. في المئة من المجهرية البوليسترين المستخرج في LPO يعتمد على حجم الجسيمات والجهد الموردة إلى piezoceramic. كل سطر يتوافق مع الجهد تشغيل مختلف على تردد الرنين، تحدد كما هو موضح في الخطوة 4. مجموع معدل التدفق من خلال الجهاز هو 200 ميكرولتر / دقيقة، مع ترددات محرك التطبيقية بين 1.62 و 1.64 ميغاهيرتز. أشرطة الخطأ تمثل الانحراف المعياري لا تقل عن ثلاثة تجارب منفصلة. مستنسخة وتعديلها بإذن من الجمعية الملكية للكيمياء من http://pubs.rsc.org / EN / المحتوى / ArticleLanding / 2014 / AN / c4an00034j.الهدف = "_ فارغة"> الرجاء انقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الرقم.
الشكل 6 يبين جمعت نتائج الفصل باستخدام مختلف الأحجام البوليسترين الجسيمات وبيزو القيادة الفولتية التي تبرهن على معايير التشغيل اللازمة لفصل كفاءة. بشكل عام، يطلب من ارتفاع الفولتية (أي أكبر قوات الصوتية) لاستخراج جزيئات أصغر، كما هو متوقع. الفولتية حملة لا يمكن زيادة إلى أجل غير مسمى، ولكن نظرا إلى مزيد من تبديد الحرارة وتفاقم الآثار الناجمة عن تدفق الصوتية. تخدم 13 المؤامرة بمثابة دليل عام لالجسيمات أحجام فصل الجسيمات التي تظهر انتعاش اختلافا كبيرا في محرك أقراص معينة الجهد (على سبيل المثال، 10- والجسيمات 2 ميكرومتر في 8.8 V ص) سيفصل أيضا. عموما، السكان الجسيمات مع فرق كبيرة الحجم، مثل الفيروسات (~ 100 نانومتر) والخلايا (~ 10 ميكرون) يمكن فصلها بسرعة وكفاءة، كما يمكن الخلايا من مهرجان دبي السينمائي الدوليالأحجام erent (على سبيل المثال، 6-8 ميكرون الكريات الحمراء قرصي و8-15 ميكرون الكريات البيض). الشروط المحددة المطلوبة للعمل مع أنواع الخلايا الأخرى يجب أن يكون مصمما تجريبيا، كما شكل الخلية وكثافة والانضغاطية تؤثر على النقيض لها الصوتية، بالإضافة إلى حجم الخلية. تحقيقا لهذه الغاية، والإجراءات في الخطوة 4 هي مفيدة لتحديد شروط الفصل قابلة للاستخدام أي خلية أو الجسيمات نوع جديد، وليس فقط لتقييم نوعية جهاز acoustophoresis معين.

الرقم 7. كفاءة فصل خلية للفيروسات عينات ارتفعت. نتائج الفصل من (A) خلايا راجي ارتفعت مع فيروس حمى الضنك (DENV) و (ب) الخلايا راجي وخلايا الكلى بوا ارتفعت مع جولدن جيت الفيروسات (GGV). يتم تحديد النسب المئوية التي تم جمعها باعتبارها جزء من الفيروسات أو الخلايا تخرج من معينمنفذ بالمقارنة مع المبلغ الإجمالي الخروج من رقاقة. أشرطة الخطأ (A) هي الانحراف المعياري من 3 محاكمات، في حين تم تجهيز العينات في (B) مرة واحدة فقط نظرا لانخفاض الكميات المتاحة. تم استخدام برنامج تلفزيوني 1X باعتبارها منطقة عازلة عينة والانتعاش السائل، مع الماء في القناة الالتفافية لجميع التجارب. وتراوحت ترددات التشغيل رقاقة بين 1.60 و 1.64 ميغاهيرتز، مع الفولتية محرك تتراوح أعمارهم بين 16 و 20 V ص. الرجاء انقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الرقم.
للتدليل على فائدة من هذا المنبر للانفصال الجسيمات البيولوجي، ونحن استخدم لأول مرة لمعالجة العينات البيولوجية تتميز جيدا: خلايا الإنسان راجي (10 5 خلية / مل، متوسط قطرها 8-10 ميكرون 25) ارتفعت مع فيروس حمى الضنك (DENV، 10 5 PFU / مل، قطر تقريبي 50 نانومتر 26). الشكل 7ويبين النسبة المئوية للخلايا راجي وDENV التي تم جمعها في كل من مكتب التخطيط الاستراتيجي وLPO (الذي يعرف بأنه جزء من كل نوع الجسيمات التي تم جمعها من كل منفذ مقارنة مع المبلغ الإجمالي للكل الجسيمات التي تم جمعها من رقاقة). وتكررت التجربة في ثلاث نسخ، وكان كميا الخلايا راجي باستخدام عداد كولتر، في حين كان كميا DENV باستخدام العكسية النسخ البلمرة الكمي سلسلة من ردود الفعل (RT-QPCR).
بعد ذلك، تم اختبار أداء النظام في السيناريو الذي هو أكثر واقعية لمعالجة العينات السريرية، التي الخصائص الفيزيائية الدقيقة للجسيمات قد يكون غير معروف، وكميات عينة المتاحة أقل. هنا، قمنا بتقييم فصل البوابة الذهبية التي تم تحديدها مؤخرا للفيروسات (GGV)، ثعبان الممرض اصابة خلايا الكلى الأصلة العاصرة 27 حجم جسيمات الفيروس GGV لم يتم قياسها، ولكن منذ GGV ينتمي إلى عائلة الفيروسات الرملية، فإنه ومن المرجح لحجم مماثل، ما بين 100 و 150 نانومتر. 28 ومعالجة العينات مع GGV ارتفعت (10 4 PFU / مل) إلى خلايا راجي الإنسان (وليس هدفا العدوى للفيروس)، والخلايا أفعى الكلى (الهدف العدوى لGGV، الحجم التقريبي 10 ميكرون 27)، مع كل أنواع الخلايا في 10 4 خلية / مل. كما كانت هذه العينات متوفرة بكميات منخفضة، وقد سجلت نتائج الانفصال عن واحد فقط تشغيل تجريبي في هذا العمل. ويبين الشكل 7B النسبة المئوية للخلايا راجي، خلايا بوا، وGGV التي تم جمعها من مكتب التخطيط الاستراتيجي وLPO. وتم قياس كمية الخلايا في هذه التجارب التي تعول على عدادة الكريات وكانت كمية الفيروسات التي RT-QPCR.
يعرض هذا البروتوكول التكامل على مستوى النظام من أجهزة ميكروفلويديك لمعدات macroscale لأداء الآلي تجهيز العينات البيولوجية. ونمطية من هذا المنبر يسمح لها أن تكون قابلة للتكيف مع أي جهاز التدفق المستمر، وكمثال على ذلك، يركز على بروتوكول المعروضة على تميز وتحسين أداء جهاز فصل الجسيمات acoustofluidic. ويسلط الضوء على ثلاث مزايا رئيسية من هذا البروتوكول: (ط) نمطية ورقاقة إلى عالم التواصل، (ب) توصيف قوية من أداء الجهاز، و (ج) المعالجة الآلية من وحدات التخزين عينة المقننة على وجه التحديد لفصل الجسيمات.
أنا. نمطية ورقاقة إلى عالم التواصل
كما هو مبين في الشكل 2، هي التي شنت على رقاقة ميكروفلويديك على اللوح المخصص لتناسب بسهولة على مرحلة المجهر للمراقبة المباشرة. اللوح يحتوي # 6-40 الثقوب مؤسسة الأمم المتحدة الخيوط على 5 مم الشبكة الملعب، ENAبلينغ رقاقة لتأمينها، والاتصالات السوائل في هذا الشأن. ونظرة خاطفة الاتصالات السوائل أنابيب مع نهايات تشكيله، والذي ختم ضد رقاقة فلويديك مع المطاط ختم وجه حشية وطوق الفولاذ المقاوم للصدأ. هذا المخطط واجهة يجعل لاستبدال سهلة رقاقة وإعادة تصميم الجهاز السريع، مما يتطلب قليل أو أي تغييرات على مكونات النظام الأخرى، وآثار أقدام رقاقة المقدمة مطابقة لشكل شبكة. على سبيل المثال، وقد استخدمنا هذه المنصة مع رقائق ميكروفلويديك لالكهربائي الدفق المستمر، تحلل الخلايا الحرارية، 29 خلط السريع من الكواشف لتخليق المواد الكيميائية، والقبض على خلية واحدة والاستجواب.
ثانيا. توصيف قوية من أداء الجهاز
من أجل تحسين أداء أي جهاز فصل ميكروفلويديك، يجب أولا أن تتسم عملياتها بدقة. النظام هو موضح هنا يدعم وضع بروتوكولات السريع والآلي للقيام بذلك. لأمثل محددلو لالصوتية التركيز الأجهزة، ونوعية التركيز، تردد التشغيل، والموقف من الجسيمات التي تركز في قناة ميكروفلويديك يجب أن تقاس لكل جهاز على حدة. هذه القياسات تتطلب تجتاح من خلال مجموعة من الترددات محرك piezoceramic، الفولتية ومعدلات التدفق، لتحديد مجموعات المعلمة المثلى للانفصال ذات جودة عالية. بروتوكول المعروضة تختلف تلقائيا هذه المعلمات الانضباطي ويلتقط ذات الصلة data- أي والصور الفلورسنت من الجزيئات المتدفقة في القناة التي هي في مرحلة ما بعد معالجتها لتوليد القياسات المطلوبة من الجسيمات التي تركز الجودة، والتردد، وموقف (الشكل 3).
توصيف كامل للأداء الجهاز السمعي يتطلب تكرار الخطوات 4.4 و 4.5 حسب الحاجة في ظل ظروف تجريبية مختلفة. على سبيل المثال، تم العثور على موقف التركيز المطلق للشريحة عن طريق تشغيل التفحص تردد في معدلات تدفق منخفضة نسبيا والجهد العاليالصورة لضمان الهجرة كاملة إلى الموقع عقدة. بالإضافة إلى ذلك، يمكن لهذه بالاشعة تردد تقييم جودة التجمع الجهاز (عند تشغيل مع الخرز البوليسترين من حجم معروفة)، أو لتحديد كيف يمكن لنوع الجسيمات سابقا مجهول سوف تتصرف في نظام (بعد اتسم رقاقة مع الخرز). وهناك رقاقة مع نقل الطاقة جيدة من piezoceramic إلى القناة ميكروفلويديك يؤدي إلى التركيز ضيق في معدلات تدفق عالية (> 1 مل / دقيقة) والفولتية المنخفضة (12-15 V ص)، في حين أن تلك مع نقل الطاقة الفقراء لا يركز حتى في انخفاض معدلات تدفق (<100 ميكرولتر / دقيقة) والفولتية العالية (> 20 V ص). لقد وجدنا أن اتصال حميم بين رقاقة ميكروفلويديك وpiezoceramic أمر بالغ الأهمية لنقل الطاقة كفاءة في السائل. مزيد من التحقيق في الطريقة الأمثل للالترابط رقاقة ميكروفلويديك وpiezoceramic سيمكن إنتاج موثوق للأجهزة عالية الأداء.
وأخيرا، كاملةصورة لعملية عبوة acoustophoretic ويمكن الحصول عليها من خلال الجمع بين القياسات تردد مسح الصورة القائمة في الخطوة 4 (والشكل 3) مع التهم الجسيمات التي تم جمعها من مكتب التخطيط الاستراتيجي وLPO وظائف المعلمات التشغيل ذات الصلة، من تجارب الانفصال التي أجريت مع المجهرية كما هو موضح في الخطوة 5. كما هو مبين في الشكل (6)، مثل سلسلة من التجارب الآلي يمكن أن تميز بسرعة أداء جهاز الفردية وtunability، إعلام المستخدم من الفضاء المعلمة الأمثل لتشغيل الجهاز لفصل الجسيمات.
ثالثا. المعالجة الآلية عينة صغيرة لفصل الجسيمات
لميكروفلويديك القائم على رقاقة معالجة عينة ناجحة ودقيقة، فمن الأهمية بمكان أن يعتمد عليه وعلى وجه التحديد متر، والحمل، وتقديم، وجمع كميات من السوائل لأنها تمر من خلال. هذه الدقة هي أهمية خاصة عندما يكون حجم العينة صغير(~ 0،1-1 مل)، وهو أمر شائع في بيئة معملية السريرية أو البحثية. 30 دقيقة التعامل مع العينة يمثل تحديا في التجارب ميكروفلويديك التقليدية التي تستخدم انسحاب اليدوي من العينة في حقنة والتسريب في جهاز مع عدم وجود ردود فعل من عند العينة وقد تم فصل ومتى ينبغي جمعها. بروتوكول المعروضة توظف الآلي عينة لفائف التحميل والاستغناء يقترن مع ردود الفعل في الوقت الحقيقي من أجهزة الاستشعار تدفق لتمكين فصل استنساخه من وحدات التخزين عينة صغيرة.
ويبين الشكل 5 لمحات تدفق قياس في مكتب التخطيط الاستراتيجي وLPO من تجربة الفصل نموذجية. أولا، يتم تحميل المخزن الرئيسي لللا يقل عن 35 ميكرولتر لضمان تدفق مستقر قبل أن تصل عينة الشريحة الصوتية. لا ينصح عينة كميات أقل من 100 ميكرولتر لهذا التكوين النظام، لأن عينة التخفيف نظرا إلى المخزن المؤقت الرائدة يصبح المفرط. ويتم استخدام المكونات من الهواء في بداية الالبريد الحقن قبل المخزن المؤقت مما يؤدي إلى فصل المكونات عينة من السائل الذي يلي، ومنع الاختلاط والتخفيف من العينة، والتي تخدم كمؤشر على أجهزة استشعار التدفق. بعد عابرة الأولي كسائل يبدأ تتحرك من خلال النظام، وإشارات ارتفاع حاد في كل وسائل تشير إلى مرور الهواء فقاعة الأولى. يتم اتباع هذه العابرين قبل فترة طويلة من تدفق مستقر كما تدفقات العينة من خلال النظام، ثم موجة أخرى عندما يمر الهواء فقاعة الثانية، وأخيرا انخفاض في نهاية المطاف في معدل التدفق إلى الصفر بعد توقف ضخ حقنة.
يتم استخدام مرور المقابس الهواء من خلال أجهزة استشعار تدفق كنقاط الزناد لتبديل صمامات لتشغيل وإيقاف جمع العينات، وبالتالي التقليل من عينة المفقودة والتخفيف كتبها كميات السوائل غير العينة. حلقة مغلقة قياس أحجام العينة المجهزة يلغي الحاجة إلى إعادة برمجة هذه القيم قبل بدء التجربة في كل مرة يتم تغيير نموذج الإدخال. هذه الميزةأهمية خاصة عندما يكون حجم عينة محدودة، على سبيل المثال في حالة العديد من العينات السريرية. يساعد في الوقت الحقيقي رصد تدفق أيضا في استكشاف الأخطاء وإصلاحها. تشغيل الفقراء (على سبيل المثال، تسد تشكل في واحدة من وسائل) هو واضح على الفور من التشكيلات الجانبية الناتجة عن تدفق، كما في الشكل 5B.
للتدليل على المرونة والفعالية في فصل acoustofluidic باستخدام بنية النظام قدم، DENV تنقيته ومخزونات فيروس GGV وقد ارتفعت في الأسهم الخلية ومفصولة معالجة من خلال رقاقة ميكروفلويديك. ويبين الشكل 7A أن الخلايا راجي تم فصل جيدا من الفيروسات، و97 تم العثور٪ من الخلايا راجي الخروج من رقاقة أن يكون في أمر الشراء المحلي، وبالتالي يترك عينة عالي التخصيب من DENV في مكتب التخطيط الاستراتيجي. في المقابل، كانت كفاءة DENV فصل أقل، مع 70٪ من DENV الخروج من رقاقة وجدت في مكتب التخطيط الاستراتيجي. ويمكن أن يعزى هذا إلى طفيفا خلط الحمل الحراري الناجمة عن يتحول من separatiعلى القناة، ولكن من المرجح أن بعض الجسيمات DENV المهاجرة جنبا إلى جنب مع الخلايا راجي في LPO. الخلايا المهاجرة أفقيا عبر يبسط جر بعض السوائل معهم، حتى في انخفاض عدد رينولدز. من خلال هذه الآلية، وكذلك امتصاص السطح غير محدد، نقل الجزيئات الفيروسية في LPO. ومع ذلك، فإن العينة عالي التخصيب من DENV في مكتب التخطيط الاستراتيجي هي فائدة كبيرة، على سبيل المثال عندما يستخدم دي نوفو تسلسل لكشف وتحديد الفيروسات.
ويبين الشكل 7B أنه في إحدى التجارب، تم العثور فقط حوالي 70٪ من خلايا بوا الخروج من رقاقة في LPO، مقارنة مع ما يقرب من 100٪ كفاءة فصل الخلايا راجي. الفرق في الأداء الفصل بين أنواع الخلايا اثنين قد يعزى إلى متوسط حجم أصغر أو أقل كثافة الخلايا بوا بالمقارنة مع الخلايا راجي، وبالتالي يؤدي إلى القوات الصوتية أصغر. لتأكيد أو دحض هذه الافتراضات، وحجم وكثافة ومورفولوجية بواالخلايا في تعليق (التي تنمو عادة ملتصقة) من الخلايا بوا يجب أن تقاس بدقة، محاولة لمزيد من التحقيق. في نفس التجارب، على غرار التجارب مع DENV، الجزء الأكبر من GGV تعافى خرجت من مكتب التخطيط الاستراتيجي، مما يشير إلى إثراء جزء الفيروسي.
البيانات المقدمة تسلط الضوء على التحديات الكامنة في الهندسة منصات على نطاق واسع المطبقة لمعالجة مجموعة متنوعة من العينات البيولوجية. الأهم من ذلك، يمكن للتفاعلات البيولوجية تبدأ للعب كبير كدور إلى التأثيرات الفيزيائية والميكانيكية. ومع ذلك، تظهر أيضا هذه التجارب الأولية للقوة ووعد باستخدام هذا بنية النظام لتجهيز العينات في التطبيقات السريرية والبحوث. ونتيجة ل، جيدا اتسم نظام المهندسة قوي، وتوفر هذه المنصة القدرة على البحث عن إجابات على أسئلة علمية جديدة.
ليس لدى المؤلفين ما يكشفون عنه.
تم تنفيذ هذا العمل تحت رعاية وزارة الطاقة الأمريكية من قبل مختبر لورانس ليفرمور الوطني بموجب العقد DE-AC52-07NA27344 ، وبدعم جزئي من قبل برنامج البحث والتطوير الموجه للمختبر (LDRD) التابع ل LLNL ، 14-LW-077. يشكر المؤلفون مايكل ويلسون ومارك ستينجلين وجو ديريسي في جامعة كاليفورنيا ، سان فرانسيسكو على تقديم عينات من خلايا GGV و Boa بسخاء. يقر EJF بالدعم المقدم من برنامج LLNL Lawrence Scholar للدراسات العليا. يقر MS بالدعم المقدم من مكتب جامعة كاليفورنيا لبرنامج أبحاث رسوم المختبر. LLNL-JRNL-665235
| Name | Company | Catalog Number | Comments |
|---|---|---|---|
| المواد المطلوبة للخطوات 1-3: تصميم الجهاز وتصنيعه وتركيبه | |||
| رقاقة السيليكون المصقولة على الوجهين | Silicon Quest International، Inc. سان خوسيه ، كاليفورنيا ، الولايات المتحدة الأمريكية | 100 مم < ؛ 100> رقاقة رئيسية | 1-20 أوم سم ، 495 &# 177 ؛ 25 &# 160 ؛ ومايكرو. م |
| رقاقة زجاجية | الجانب بولين الموتراسونية ، إيتون ، أوهايو ، الولايات المتحدة الأمريكية | 100 مم × 0.5 مم بورو | |
| مقاوم للضوء ، AZ 1518 | MicroChemicals GmbH ، أولم ، ألمانيا | AZ 1518 | Photoresist تستخدم للالتصاق بالرقاقة إلى رقاقة فارغة لحفر DRIE |
| Photoresist ، AZ 4620 | MicroChemicals GmbH ، Ulm ، ألمانيا | AZ 4620 | Photoresist لتحديد أنماط السوائل وعبر القناع |
| DRIE البلازما الحفر | STPS, نيوبورت, NP, المملكة المتحدة | Multiplex Advance Oxide Etch (AOE) نظام | |
| رقاقة بوندر | الرؤى الإلكترونية Group, St.Florian am Inn ، النمسا | EVG 501 | |
| Dicing saw | Kulicke & amp صناعات سوفا ، سنغافورة | K& S 982 | |
| طقم الايبوكسي | تكنولوجيا الايبوكسي ، بيليريكا ، ماساتشوستس ، الولايات المتحدة الأمريكية | EPO-TEK 301 | الايبوكسي المستخدمة للجمع بين بيزو ورقاقة الموائع |
| الدقيقة PZT piezoceramic ؛ | Piezo Systems ، Woburn ، MA ، الولايات المتحدة الأمريكية | PSI-5A4E | 37.5 & مرات ؛ 10 & مرات 0.5 مم |
| 28 AWG Kynar الأسلاك الصلبة المعزولة | Squires Electronics ، Cornelios ، OR ، الولايات المتحدة الأمريكية | UL1422 | |
| 2-جزء من الايبوكسي الفضي ؛ | MG Chemicals ، Surrey ، BC ، كندا | 8331 | مادة لاصقة موصلة لربط الأسلاك تؤدي إلى PZT |
| L-edit | Tanner EDA ، Monrovia ، CA ، الولايات المتحدة الأمريكية | Ledit v15.1 64 بت | برنامج CAD لتخطيط |
| المضخة المزدوجة | جهاز هارفارد ، هوليستون ، ماساتشوستس ، الولايات المتحدة الأمريكية | سلسلة دكتوراه فائقة ، 703007 | |
| 5 & # 160; محاقن مل | بيكتون ديكنسون ، فرانكلين ليكس ، نيوجيرسي ، الولايات المتحدة الأمريكية | 309646 | |
| لور إلى محول المنفذ الخيوط | IDEX ، أوك هاربور ، واشنطن ، الولايات المتحدة الأمريكية | P-659 | يربط المحقنة بأنابيب |
| Union | IDEX ، أوك هاربور ، واشنطن ، الولايات المتحدة الأمريكية | P-623 | يربط العالم بتوصيلات الرقائق بأنابيب البوليمر الفلوري. يمكن أيضا استخدام webbed |
| الطويق 1 / 4-28 مسطح القاع | IDEX ، أوك هاربور ، واشنطن ، الولايات المتحدة الأمريكية | P-200 | تستخدم مع الجوز لإجراء اتصالات بين الأنابيب والحقنة ، وأجهزة استشعار التدفق والعالم لتقطيع الأجهزة |
| Nut ؛ 1 / 4-28 شقة القاع | IDEX ، أوك هاربور ، واشنطن ، الولايات المتحدة الأمريكية | P-202 | تستخدم مع الطويق لإجراء اتصالات بين الأنابيب والحقنة ، وتدفق sesnsors والعالم لرقاقة الأجهزة |
| 1/16 "OD أنابيب البوليمر الفلوري | IDEX ، أوك هاربور ، واشنطن ، الولايات المتحدة الأمريكية | 1912L | أنابيب لتوصيل مضخات الحقنة بالعالم بتوصيلات الرقائق. حجم الأنبوب ليس حرجا أثناء خطوات التثبيت (معرف .01-.03 "يستخدم عادة ، أرقام الأجزاء المناسبة الأخرى: 1907L ، 1902L). |
| أنابيب الفلوروبوليمر ذات معرف صغير | IDEX ، أوك هاربور ، واشنطن ، الولايات المتحدة الأمريكية | 1476-20 | تستخدم لقيود التدفق: 0.006 "معرف ، 1/16" OD FEP & nbsp ؛ |
| نظرة خاطفة | تتصل من رقاقة إلى أنابيب البوليمر الفلوري. | ||
| مروحة تبريد | Multicomp ، ليدز ، إنجلترا | MC19663 | |
| مولد وظيفة | Agilent ، سانتا كلارا ، كاليفورنيا ، الولايات المتحدة الأمريكية | 33220A | |
| مضخم صوت RF | ENI ، روتشستر ، نيويورك | 325 لوس أنجلوس | يجب أن تكون قادرة على تضخيم الإشارات من < ؛ 1&# 160; V في نطاق 1-2 &# 160 ؛ ميغاهيرتز إلى 25&# 160; Vpp إلى piezo. |
| الضوئية لكاميرا CCD | ، Tucscon ، AZ ، الولايات المتحدة الأمريكية | CoolSnap HQ | |
| المجهر المقلوب | Zeiss ، Oberkochen ، ألمانيا | Axiovert S100 | |
| FITC | Chroma Tech ، VT ، USA | SP101 | |
| Objective ، 10X | Zeiss ، Oberkochen ، ألمانيا | ACHROPLAN | |
| Oscilloscope | Tektronix ، Beaverton ، OR ، الولايات المتحدة الأمريكية | TDS3014B | لمراقبة خرج الجهد بواسطة مضخم الترددات اللاسلكية |
| MatLab | Mathworks ، Natick ، MA ، الولايات المتحدة الأمريكية | R2014a | |
| برنامج واجهة برنامج التشغيل لدمج كاميرا القياسات الضوئية مع برنامج LabVIEW | R Cubed ، Lawrenceville ، نيوجيرسي ، الولايات المتحدة الأمريكية | SITK | |
| Tween 20 | Sigma Aldrich ، سانت لوسي ، ميزوري ، الولايات المتحدة الأمريكية | P9416 | |
| Dragon Green Fluorescent 5.76 أو 7.32 & # 160 ؛ ومايكرو. m Beads | Bangs Laboratory ، في ، الولايات المتحدة الأمريكية | FS06F | |
| مواد إضافية مطلوبة للخطوة 5: | |||
| صمامات الفصل الآلي متعددة المنافذ | VICI ، هيوستن ، تكساس ، الولايات المتحدة الأمريكية | C25Z-3180EUHA | في التكوين الحالي هناك حاجة إلى 4 صمامات |
| Flow | Sensors Sensirion ، Westlake Village ، CA ، الولايات المتحدة الأمريكية | SLI-1000 | |
| أنابيب البوليمر الفلوري ، .01 و .03 "ID | IDEX ، Oak هاربور ، واشنطن ، الولايات المتحدة الأمريكية | 1902L و 1912L | PFA عالي النقاء المفضل |
| Nut | VICI ، هيوستن ، تكساس ، الولايات المتحدة الأمريكية | ZN1PK-10 | يستخدم مع الطويق لإجراء اتصالات بين الأنابيب والصمامات. أرقام الأجزاء البديلة: MZN1PK-10 ، LZN1PK-10 |
| Ferrule | VICI ، هيوستن ، تكساس ، الولايات المتحدة الأمريكية | ZGF1PK-10 | تستخدم مع الجوز لإجراء اتصالات بين الأنابيب والصمامات. |
| LabVIEW | National Instruments ، أوستن ، تكساس ، الولايات المتحدة الأمريكية | LabVIEW نظام التطوير المهني | برنامج أتمتة المختبرات |
| PBS | Teknova ، Hollister ، CA ، الولايات المتحدة الأمريكية | P0200 | |
| Raji Cells | ATTC ، Manassas ، VA ، الولايات المتحدة الأمريكية | CCL86 | |
| Boa Cells | تفضل بتوفير مختبر DeRisi في UCSF | ||
| GGV | يرجى تقديم مختبر DeRisi في جامعة كاليفورنيا في سان فرانسيسكو | ||
| DENV | الفضل بالمقدمة من Jose Pena في LLNL | ||
| Coulter Counter Z2 | Beckman Coulter ، Brea ، CA ، الولايات المتحدة الأمريكية | Z2 | |
| مقياس الدم | فيشر العلمي ، والتمان ، ماساتشوستس ، الولايات المتحدة الأمريكية | 0267151B | |
Request permission to reuse the text or figures of this JoVE article
Request Permission