$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
مقارنة ISC التوحد الكفاءة في آه لجنة المساواة العرقية وفيل-لجنة المساواة العرقية-ER أنظمة T2
استخدام هذه الأنظمة لجنة المساواة العرقية، السلمون المدخن لتقييم دور الخلايا بانيت، في إعادة إسكانها الأمعاء التالية الضرر، وتوصيف المطلوب من كفاءة إعادة التركيب داخل ISCS. باستخدام مراسل المشروط Rosa26R-lacZ أثبتنا أن في كلا النظامين 3 آخر أيام الاستقراء (نقطة في البوصة) هناك ~ 100٪ إعادة التركيب في الأمعاء الدقيقة (الشكل 1A). Quantitating وجود أليل معاد من قبل QPCR كان مرتبك من الاختلافات في أنماط التعبير لجنة المساواة العرقية بين النظم. أظهر نظام T2 VIL-لجنة المساواة العرقية-ER على 3.53 أضعاف في وجود أليل معاد بالمقارنة مع النظام آه لجنة المساواة العرقية، وذلك بسبب تعبيرها في نسبة أكبر من epitheli16. للتغلب على هذه اعتمدنا استراتيجية مختلفة التي سمحت لنا لمقارنة مباشرة النظم. نحن الناجم عن الفئران مع الأنظمة الحث المختلفة وتحليلها على 30 نقطة في البوصة، الذي الخبايا إيجابية نقطة LacZ وزغابة تمثل حدثا إعادة التركيب ISC. باستخدام هذا النهج أثبتنا أن في كلا النظامين، 3 حقن حمل وكيل (تسليم IP في 80 مغ / كغ في 24 ساعة)، معاد في عدد مساو من ISCS على الرغم من مستويات إعادة التركيب الأولية كونها أكبر بكثير في VIL-لجنة المساواة العرقية-ER T2 نظام 16 (الشكل 1B-د). وعلاوة على ذلك، وذلك باستخدام الحمض النووي المستخرج من الخبايا معاد، أظهرت QPCR لالأليلات معاد زيادة غير كبيرة في إعادة التركيب باستخدام VIL-Cre- نظام ER T2، ويحتمل أن يرجع ذلك إلى إعادة التركيب في خلايا بانيت لم يلاحظ استخدام نظام آه لجنة المساواة العرقية (1D الشكل). وعلاوة على ذلك، وتلطيخ لأنواع الخلايا الطلائية لم يكن إينديكيت أي تغيير في نمط التمايز، صور تمثيلية من كل نوع من الخلايا التحقيق هو مبين في الشكل 2E-2H.
توصيف المعوية الظهارة يلي CatnB الحذف
تقدير حجم الخسارة سرداب
تميز حركية إعادة التركيب في هذه الأنظمة لجنة المساواة العرقية مكنتنا من تحليل الأمعاء الماوس عند معاد أرقام يعادل ISCS. باستخدام مراسل LacZ أظهرت كلا النظامين خسارة كاملة للمعاد (الأزرق) الخلايا في 3 نقطة في البوصة (الشكل 2A). كما ذكرت سابقا بعد ثلاثة أيام حذف CatnB أظهرت الفئران آه لجنة المساواة العرقية فقدان سرداب جزئية، في حين أن الفئران T2 VIL-لجنة المساواة العرقية-ER أظهرت التدمير الكامل للسرداب / زغابة محور 13،16،24 (الشكل 2B-د).
ديناميات الظهارية إعادة تعمير باستخدام التقنيات المذكورة أعلاه وتتميز نحن معلمات متعددة لتمكيننا من فهم هذه الملاحظة. صور تمثيلية من المعلمات وأنواع الخلايا تحليلها باستخدام بروتوكولات 7-10 ترد في (الشكل 3A و 3B). لفترة وجيزة، كانت الخسائر في أقبية تتفق مع مستويات مرتفعة من موت الخلايا المبرمج عرضه في كلا النظامين (الشكل 3E). إلا أن الانقسام والانتشار، ارتفاع الخلوي سرداب، سرداب والتعبير (لا يظهر) البيانات وأشار أن النظام آه لجنة المساواة العرقية على التعافي، ويفترض نظرا لإعادة تعمير من قبل ISCS-معاد للأمم المتحدة (الشكل 3C). في مقارنة صارخة، فشل VIL-لجنة المساواة العرقية-ER T2 لاسترداد رغم احتفاظ الخلايا الظهارية سرداب (الشكل 3D).
توصيف الظواهر الخلوية داخل القبو
أن نفهم لماذا الخبايا من الفئران آه جنة المساواة العرقية، ويمكن إعادة ملء حين أن VIL-لجنة المساواة العرقية-ER T2 لا يمكننا أن تتميز الخلايا الظهارية بعد حذف CatnB ثلاثة أيام. باستخدام التهجين الموضعي (المادة 9)، وتحليل IHC (الباب 7، 8 و 10) في أثبتنا أن الخلايا سرداب في VIL-لجنة المساواة العرقية-ER T2 CatnB flox / الفئران flox كانت غير التكاثري، وتفتقر إلى التعبير عن علامة ISC Olfm4 ، على عكس الخبايا في الفئران آه جنة المساواة العرقية (الشكل 4C و و). كما توصيف الأولي قد أثبتت أن إعادة التركيب في أقبية كان يعادل انتقلنا إلى دراسة دور الخلايا بانيت. أجرينا الفلورسنت المزدوج IHC ضد CatnB وLyz1 لتحديد الخلايا التي فقدت بيتا catenin وسواء كانوا خلايا بانيت (الشكل 5A-5C). كما هو موضح سابقا نحن دemonstrated أن جميع خلايا سرداب تستهدف استخدام نظام T2 VIL-لجنة المساواة العرقية-ER. مقارنة يدخر النظام آه لجنة المساواة العرقية الخلايا بانيت وظهائر زغابة. كانت خلايا بانيت مزيد من احظ فقط تمر موت الخلايا المبرمج بعد CatnB الحذف باستخدام نظام T2 VIL-لجنة المساواة العرقية-ER (الشكل 5D & 5E).

الشكل 1: مقارنة بين النوعية والكفاءة من لجنة المساواة العرقية / السلمون المدخن التوحد داخل الأمعاء الظهارة باستخدام آه لجنة المساواة العرقية وفيل-لجنة المساواة العرقية-ER أنظمة T2 (أ): تصور آه لجنة المساواة العرقية مراسل LacZ التعبير في wholemount صغير (SI. * النهاية البعيدة) والكبيرة (LI؛ * النهاية البعيدة) من نوع الماوس البرية. (ب): نتائج QPCR تغير الاداء أضعاف لمعاد CatnB flox أليل في 1 نقطة في البوصة للمقارنة بين الأنظمة تحريض مختلفة في آه لجنة المساواة العرقية CatnB flox / flox (BNF الناجم) وVIL-لجنة المساواة العرقية-ER T2 CatnB flox / flox (TAM التي يسببها )؛ * P> 0.05 (مان-ويتني [2-ذيل] مقارنة التحكم). (ج) - (ه):. الأمعاء الدقيقة Wholemount تظهر LacZ سرداب إيجابي 30 نقطة لكل بوصة لوحة (ب) - (ه) معدلة من باري وآخرون 16 الرجاء انقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الرقم.

الشكل 2: مقارنة بين آه لجنة المساواة العرقية وفيل-لجنة المساواة العرقية-ER T2 ز> نظم مشروطة حذف CatnB في الأمعاء الظهارة (أ): الأمعاء الدقيقة Wholemount فقدان تظهر الخلايا معاد في آه لجنة المساواة العرقية CatnB flox / flox LacZ + الفئران على مدى 3 أيام. (ب): الكمي لفقدان سرداب بعد 3 أيام حذف CatnB. * P> 0.05 (مان-ويتني [2-ذيل] مقارنة التحكم). (ج & د): عرضية H & E المقاطع من الفورمالين الأمعاء الثابتة يدل فقدان الخبايا بعد CatnB الحذف. (ه) - (ح) مثال من أنواع الخلايا من السيطرة على الفئران: (ه) الخلايا المعوية endocriine، (و) الخلايا الكأسية، (ز) CatnB IHC مما يشير إلى ISC (→) مع النووي B-catenin و(ح) بانيت الخلايا. لوحة (ب) تعديل من باري وآخرون. 16. الرجاء انقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الرقم.
gether.within صفحة = "دائما"> 
الرقم 3: توصيف ظهور النمط الظاهري عند استخدام آه لجنة المساواة العرقية وفيل-لجنة المساواة العرقية-ER أنظمة T2 لمشروطا حذف CatnB في أرقام مماثلة ISCS داخل الأمعاء الظهارة الصغيرة (أ و ب) H & E الفورمالين الملون الأبواب الثابتة تشير إلى موقع سرداب. ارتفاع ([])، وأفكارك (←) والخلايا الإنقسامية (↓). الكمي من متوسط عدد الخلايا في سرداب بين النوع البري (الأزرق) وCatnB flox (برتقالي) الفئران في ثلاث نقاط الوقت (نقطة في البوصة) (ج) ارتفاع سرداب، (د) الانقسام و (ه) موت الخلايا المبرمج (أشرطة الخطأ تشير إلى الانحراف المعياري ). لوحة (ج) - (ه) معدلة من باري وآخرون 16.3429fig3large.jpg "الهدف =" _ فارغة "> الرجاء انقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الرقم.

الشكل 4: مقارنة بين خصائص ISC باستخدام آه لجنة المساواة العرقية وفيل-لجنة المساواة العرقية-ER أنظمة T2 لمشروطا حذف CatnB في الأمعاء الدقيقة الظهارة الظهارية خلايا سرداب بعد 3 أيام حذف CatnB باستخدام آه لجنة المساواة العرقية (AC) أو بنيت فيالت لجنة المساواة العرقية-ER T2 (مدافع) النظام. (أ و د) H & E قسم تظهر مناطق من فقدان سرداب. (ب و د) كي-67 IHC فقدان التظاهر من خلايا التكاثري باستخدام VIL-لجنة المساواة العرقية-ER T2. (C & F) Olfm4 في الموقع مما يدل على وجود ISCS الوظيفية باستخدام آه لجنة المساواة العرقية. لوحة (أ) - (و) المعدلة من باري وآخرون 16 الرجاء انقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الرقم.

الرقم 5: توصيف خلايا بانيت بعد CatnB الحذف باستخدام نظم T2 فيل-لجنة المساواة العرقية-ER وآه لجنة المساواة العرقية (ميلان): صور المناعي من الخبايا تظهر بانيت الخلية (الحمراء)، B-catenin (الخضراء) ونواة (الأزرق )، سهم يشير غشاء ملزمة بيتا catenin. (دي) IHC لكاسباس 3 يشير إلى خلايا بانيت أفكارك هي غائبة في آه لجنة المساواة العرقية (د) ولكن موجودة في النظام VIL-لجنة المساواة العرقية-ER T2 (ه). لوحة (أ) - (ه) معدلة منباري وآخرون 16. الرجاء انقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الرقم.
| العازلة خلات | * | * | لجعل 100 مل: 4.8 مل 0.2 M حمض الخليك، 45.2 مل 0،2 M الصوديوم خلات و 50 مل الماء المقطر |
| حمض الاسيتيك | فيشر العلمية | C / 0400 / PB17 | |
| أنهيدريد الخل | سيغما | A6404 | |
| الحل أنهيدريد الخل | * | * | 2 M الخليك أنهيدريد في 0.1 M ثلاثي إيثانول أمين هيدروكلوريد |
| الألسيان الأزرق | سيغما | A5268 | |
| الألسيان الأزرق PH 2.5 | * | * لجعل 500 مل: 15 مل حمض الخليك والماء 5 ز الألسيان الأزرق و485 مل المقطر |
| لمكافحة digoxigenin الفوسفاتيز القلوية الضد مترافق | Abcam | ab119345 | |
| B (بيتا) -Naphthoflavone | سيغما | N3633 | BNF، وضخ دون السماح للحل لتبرد كثيرا لمجمع ستنخفض من الحل. الحل يمكن إعادة استخدامها - مخزن في -20 ° C بين الاستخدامات، لا يسخن أكثر من مرتين. |
| Bloxall | ناقلات مختبرات | SP-6000 | |
| BM الأرجواني | روش | 11442074001 | |
| BSA | سيغما | A4503 | ألبومين المصل البقري |
| الكلوروفورم | فيشر العلمية | C / 4920/17 | |
| سترات العازلة / مستضد نزع القناع الحل | ناقلات مختبرات | H-3300 | |
| زيت الذرة | سيغما | C8627 | |
| حل Demucifiying | * | * | 500 مل: 50 مل الجلسرين، 50 مل تريس 0.1M pH8.8، 100 مل ETOH، 300 مل المالحة (0.9٪ كلوريد الصوديوم في الماء)، DTT 1.7 غرام. ويمكن إجراء حل Demucifying مسبقا وتخزينها، ولكن DTT شولد أن تضاف قبل الحضانة (340 ملغ / 100 مل). |
| DEPC المياه المعالجة | تكنولوجيا الحياة | 750023 | |
| DTT | سيغما | 101509944 | |
| EDTA | سيغما | O3690 | 0.5 M |
| الإيثانول | فيشر العلمية | E / 0650DF / 17 | |
| ورق الترشيح | هتما | 3000917 | |
| الفورمالديهايد | سيغما | F8775 | |
| الفورمالين محلول مائي | سيغما | SLBL11382V | محايدة مخزنة الفورمالين |
| الفورماميد | سيغما | F5786 | |
| Glutaraldehye | سيغما | G6257 | |
| H 2 O 2 | سيغما | 216763 | |
| Haematoxylin | ريمون خروف | 12698616 | |
| HBSS | GIBCO | 14175-053 | HBSS (-MgCl2 +؛ -CaCl2) |
| العازلة التهجين | * | * | 5 × SSC، 50٪ الفورماميد، 5٪ SDS، 1 ملغ / مل الهيبارين، 1 ملغ / مل العجل الحمض الريبي النووي النقال الكبد |
| الهيدروكينون | سيغما | H9003 | |
| ImmPACT DAB البيروكسيد | ناقلات مختبرات | SK-4105 | |
| ناقلات مختبرات | MP-7402 | |
| Immpress HRP المضادة للأرنب مفتش كيت | ناقلات مختبرات | MP-7401 | |
| مسحوق الأنسجة المعوية | * | * | تم الجمع بين الأمعاء الدقيقة من 5 فئران بالغة والمتجانس في الحد الأدنى للحجم الجليد الباردة PBS. تم إضافة 4 مجلدات من الأسيتون الجليد الباردة إلى الأمعاء المتجانس، الذي يخلط جيدا وحضنت على الجليد لمدة 30 دقيقة. تم طرد هذا وغسلها بيليه استخدام الأسيتون الجليد الباردة. كان هذا أيضا طرد وبيليه الناتجة تنتشر على ورقة الترشيح ويترك ليجف. مرة واحدة تجف تماما ووضع حد لاستخدام مواد لمسحوق ناعم باستخدام مدقة وقذائف هاون. |
| K-فروسيانيد | سيغما | P-3667 | |
| K-فيروسيانيد | سيغما | P3289 | |
| الليفاميزول | سيغما | L0380000 | |
| Methacarn | * | * | 60٪ الميثانول: 30٪ الكلوروفورم: 10٪ حمض الخليك |
| الميثانول | فيشر العلمية | M / 4000/17 | |
| MgCl2 | سيغما | M8266 | |
| مصل الماعز العادي | ناقلات مختبرات | S-1012 | NGS |
| مصل الأرنب العادي | داكو | X0902 | NRS |
| NTMT | * | * | 100 ملي كلوريد الصوديوم، و 100 ملي تريس حمض الهيدروكلوريك، 50 ملي MgCl2، 0.1٪ Tween20، 2 مم الليفاميزول |
| PAP القلم | ناقلات | H-400 | |
| امتصاص العرق | سيغما | P6148 | |
| PBT | * | * | 0.5 M كلوريد الصوديوم، و 10 ملي TrisHCL الرقم الهيدروجيني 7.5، 0.1٪ توين 20 |
| البنسلين / الستربتوميسين | GIBCO | 15140-122 | 100X solutiuon. |
| الفوسفات مخزنة المالحة (10X) | فيشر العلمية | BP3994 | Dilluted 01:10 مع الماء المقطر لجعل 1X |
| شرائح PLL | سيغما | P0425-72EA | شرائح المجهر بولي-L-ليسين |
| بروتين K | سيغما | P2308 | |
| حل بروتين ك | * | * | تمييع بروتين K في 200 ميكروغرام / مل في 50 ملي تريس، 5 ملي EDTA. |
| Ralwax | BDH | 36154 7N | |
| المخفض الحل | * | * | لجعل 100 مل: 1 ز هيدروكينون، 5 ز سلفيت الصوديوم و 100 مل من الماء المقطر |
| RnaseA | سيغما | R6148 | |
| ملحي | * | * | 0.9٪ كلوريد الصوديوم في الماء المقطر |
| SDS | سيغما | I3771 | |
| مصل الأغنام | سيغما | S3772 | |
| نترات الفضة | سيغما | S / 1240/46 | |
| الحل الفضة | * | * | لجعل 100 مل: 10 مل العازلة خلات، 87 مل من الماء المقطر، 3 مل 1٪ نترات الفضة |
| أسيتات الصوديوم | فيشر العلمية | S / 2120/53 | |
| كلوريد الصوديوم | سيغما | S6753 | كلوريد الصوديوم |
| كبريتيت الصوديوم | سيغما | 239321 | |
| SSC | سيغما | 93017 | 20x وسيترات الصوديوم المالحة |
| الشريط الجراحية | فيشر العلمية | 12960495 | |
| تاموكسيفين | سيغما | T5648 | TAM، وضخ دون السماح للحل لتبرد كثيرا لمجمع ستنخفض من الحل. الحل يمكن إعادة استخدامها - مخزن في -20 ° C بين الاستخدامات، لا يسخن أكثر من مرتين. |
| TBS / T | تشوير الخلية | # 9997 | |
| ترايثولامين هيدروكلوريد | سيغما | T1502 | |
| تريس، HCL | إينفيتروجن | 15567-027 | |
| Tween20 | سيغما | TP9416 | |
| VectaMount | ناقلات مختبرات | H-5000 | |
| VectaShield Hardset تصاعد المتوسطة مع دابي | ناقلات مختبرات | H-1500 | |
| Vectastain ABC كيت | Vectأو مختبرات | PK-4001 | |
| X-غال | PROMEGA | V3941 | |
| X-غال تثبيتي | * | * | 2٪ الفورمالديهايد، 0.1٪ غلوتارالدهيد في 1XPBS |
| X-غال وصمة عار | * | * | X-غال وصمة عار. 200 ميكرولتر X-غال (A) في 50 مل من محلول B (0،214 ز MgCl2، 0.48 ز K-فروسيانيد، 0.734 غرام K-فيروسيانيد في 500 مل PBS). ويمكن إجراء حل B يصل oin مسبقا وتخزينها في 4 درجات مئوية |
| زيلين | فيشر العلمية | X / 0200/21 | |
Immpress HRP المضادة للماوس مفتش كيت
الجدول 1: المواد والأساليب
د> 1/200، و 30 دقيقة في RT
| الهدف | بيتا Catenin | الليزوزيم | Ki67 | كاسباس 3 | Villin |
| مصدر تجاري من أب الأساسي | تنبيغ مختبرات | Neomarkers | ناقلات مختبرات | أنظمة R & D | سانتا كروز |
| عدد كتالوج | 610154 | RB-372 | VP-K452 | AF835 | SC-7672 |
| رفع أب الابتدائية في | الماوس (ماب) | أرنب (PAB) | الماوس (ماب) | أرنب (PAB) | الماعز (PAB) |
| استرجاع مستضد | حمام ماء يغلي / السيترات العازلة | حمام ماء يغلي / السيترات العازلة | حمام ماء يغلي / السيترات العازلة | حمام ماء يغلي / السيترات العازلة | حمام ماء يغلي / السيترات العازلة |
| كتلة الغلوثانيون | Bloxall أو 2٪ H 2 O 2، 45 ثانية | Bloxall أو 1.5٪ H 2 O 2، 30 دقيقة | Bloxall أو 0.5٪ H 2 O 2 و 20 دقيقة | Bloxall أو 2٪H 2 O 2، 45 ثانية | Bloxall أو 3٪ H 2 O 2 و 20 دقيقة |
| كتلة المصل | 1٪ BSA، 30 دقيقة | 10٪ NGS، 30min في | 20٪ NRS، 20 دقيقة | 10٪ NGS، 45 دقيقة | 10٪ NRS، 30 دقيقة |
| غسل العازلة | PBS | TBS / T | TBS / T | PBS | TBS / T |
| شروط أب الأساسي | 1/300، 2 ساعة على RT | 1/100، 1hr في RT | 1/50، 1hr في RT | 1/750، س / ن ب 4 ° C | 1/500، 1hr في RT |
| أب الثانوي | Immpress HRP المضادة للماوس مفتش كيت | Immpress HRP المضادة للأرنب مفتش كيت | الأرنب المعقدة البيروكسيديز المضادة للماوس | البيروكسيديز الماعز المضادة للأرنب | الأرنب المعقدة البيروكسيديز مكافحة الماعز |
| شروط أب الثانوي | 1 ساعة على RT | 30min في في RT | 1/200، 30 دقيقة في RT | 1/200، 30 دقيقة في RT |
| تضخيم الإشارات | N / A | N / A | ABC عدة | ABC عدة | ABC عدة |
| الكشف عن إشارة | ImmPACT DAB البيروكسيد | ImmPACT DAB البيروكسيد | ImmPACT DAB البيروكسيد | ImmPACT DAB البيروكسيد | ImmPACT DAB البيروكسيد |
| المناعي الأجسام المضادة | Alexafluor 488 | Alexafluor 594 | N / A | N / A | N / A |
| خصائص المناعي | الإثارة ماكس 488 / الانبعاث ماكس 525 | الإثارة ماكس 595 / الانبعاث ماكس 617 | | | |
| تعيين تصفية المشترك | FITC | تكساس الأحمر | | | |
محتوى ">
الجدول 2: IHC الأجسام المضادة والشروط