$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
فيروس الانفلونزا (IAV) هو فيروس يلفها وينتمي إلى عائلة فيروسات مخاطية قويمة. يتم ترميز جيناته على مجزأة، السلبي، بمعنى واحد الذين تقطعت بهم السبل جينوم الحمض النووي الريبي. في البشر، IAV يسبب التهابات الجهاز التنفسي، والتي تحدث في تفشي وباء الموسمية ويحمل احتمالات الأوبئة العالمية 1. على الربط إلى بقايا حمض اللعابي على سطح الخلية المضيفة 2، والمنضوية IAV بواسطة الإلتقام تعتمد على بالكلاذرين ومسارات مستقلة بالكلاذرين 3-8. الوسط الحمضي (درجة الحموضة <5.5) في فجوات التقامي يتسبب في تغيير متعلق بتكوين رئيسيا في IAV ارتفاع بروتين سكري هيماغلوتينين (HA)، مما يؤدي إلى انصهار الفيروسية والراحل endosomal غشاء 9. مرة واحدة قفيصة IAV (كما يشار إليها هنا ب "الأساسية" الفيروسي) قد فر من الإندوسومات أواخر (ليه)، وغير المصقول في العصارة الخلوية تليها النقل من ribonucleoproteins الفيروسية (vRNPs) في نواة - موقع ستكاثر الفيروس و والنسخ 10-13. قبل تفعيل حمض HA الفيروس يواجه انخفاض تدريجي في درجة الحموضة في النظام التقامي، الذي يعبي الأساسية للتفكك اللاحق 14-16. في هذا "فتيلة" خطوة القنوات الأيونية M2 في الغشاء الفيروسي توسط في تدفق البروتونات وK +10،14،16. التغير في تركيز الأيونية في الداخل فيروس يزعج التفاعلات تراكم من البروتين مصفوفة الفيروسي M1 وحزمة vRNP ثمانية، ويسهل IAV uncoating في السيتوبلازم التالية الغشاء الانصهار 10،14-17.
وقد أعاق تحليل مباشر والكمي للخطوة فتيلة من حقيقة أن الإندوسومات يصعب الوصول تجريبيا. كانت عملية الإدخال، وعلاوة على ذلك، إلى حد كبير غير متزامن. وبالإضافة إلى ذلك، المقايسات نقطة النهاية، مثل QRT-PCR RNA من القياسات أو العدوى الفيروسية المفرج عنهم، لا تقدم صورة تفصيلية عن الحالة البيوكيميائية للcapsi الفيروسيةد في أي خطوة معينة من الدخول. في حين اضطراب الإندوسومات من سيرنا أو العلاج من تعاطي المخدرات ساهم بشكل كبير في فهم دخول IAV 18-20، صقل صعب وعرضة لآثار جانبية غير محددة في برنامج الاندوسوم النضج لرقابة مشددة.
لتجنب هذه المشاكل، ونحن تكيفت لفي المختبر بروتوكول سبق وضعها على أساس استخدام سرعة التدرج الطرد المركزي 17. وعلى النقيض من المحاولات الأخرى 21،22، 23،24، التي استندت في معظمها على مزيج من انشقاق بروتين والعلاج المنظفات تليها تحليل EM، مكن هذا النهج نتيجة قابلة للقياس بسهولة. الطرد المركزي من خلال طبقات متدرجة مختلفة يسمح الجسيمات المترسبة إلى أن تتعرض لوتتفاعل مع الظروف المتغيرة في الطريقة التي تسيطر عليها. في بروتوكول المعروضة، IAV المستمدة من السوائل السقاء توضيح أو الجسيمات الفيروسية النقاء والرسوبية إلى الجلسرين من طبقتينالتدرج التي تحتوي الطبقة السفلى المنظفات غير الأيونية NP-40 (الشكل 1). كما يدخل الفيروس الثانية، طبقة التي تحتوي على مواد التنظيف، وبالفاعلات والفيروسية المغلف الدهون والبروتينات السكرية المغلف بلطف وتركت وراءها. جوهر، ويتألف من vRNP حزمة ثمانية ومحاطة بطبقة مصفوفة والرواسب بمثابة هيكل مستقر في جزء بيليه. البروتينات الأساسية الفيروسية، مثل M1 والبروتين النووي المرتبطة vRNP (NP)، يمكن تحديدها في بيليه بواسطة SDS-PAGE وCoomassie تلطيخ. على وجه الخصوص، والاستفادة من المواد الهلامية التدرج المتاحة تجاريا وتلطيخ مع الغروية حساسة للغاية Coomassie 25، وتمكن عالية الدقة وكشف حتى كميات صغيرة من البروتينات المرتبطة الأساسية الفيروسية.
هذا يضع أساسا لاختبار ما إذا كانت الظروف مختلفة مثل درجة الحموضة، تركيز الملح، والعوامل uncoating المفترضة لها آثار على سلوك الترسيب من المكونات الأساسية وSTABIL الأساسية إيتي. لتحقيق هذا الهدف، يتم تعديل فقط، الطبقة السفلى التي تحتوي على مواد التنظيف في التدرج الجلسرين عن طريق إدخال عامل أو شرط من الفائدة. وكانت هذه التقنية قيمة خاصة في التحقيق في تأثير القيم الرقم الهيدروجيني وتركيز الملح مختلفة على سلامة جوهر IAV 16. يمكن رصد الخطوات الوسيطة من IAV uncoating بما في ذلك تفكك طبقة المصفوفة في درجة الحموضة الحمضية أقل ما يقال (<6.5)، يليه vRNP التفكك في الرقم الهيدروجيني 5.5 وانخفاض 16،17 (الشكل 1). وتعززت الخطوة الأخيرة أبعد من ذلك وجود ارتفاع K + التركيز في طبقة الجلسرين، والتي تعكس بيئة التقامي أواخر 16. وبالتالي، بأنه الفيروس وجوهر الرسوبية من خلال التدرج أنها شهدت بيئة المتغيرة التي يحاكي الظروف في الإندوسومات. وكانت النتيجة التفكيك التدريجي للالأساسية الفيروسي في المختبر، واستكمال النتائج المستمدة من المقايسات بيولوجيا الخلية.
ر "> وقد مكن الطريقة المعروضة هنا سريع وتحليل تكرار للغاية من IAV (X31) و (A / WSN / 33) وIBV (B / لي / 40) uncoating الناجمة عن الحامضية وزيادة K
+16،17 فضلا عن التفكيك من النوى الفيروسة المخاطانية على قلوية درجة الحموضة تعرض
17. فمن المتصور أن النهج يمكن أن تتكيف مع الفيروسات يلفها أخرى لاكتساب نظرة ثاقبة الخصائص الكيميائية الحيوية للهيكل قفيصة الفيروسية والتفكيك القفيصة أثناء دخول الخلية.