$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
ملاحظة: قبل التثبيت، يتم الانتهاء من جميع الخطوات في غطاء تدفق الصفحي العقيمة.
1. 2D مصفوفة
ملاحظة: وتستخدم المصفوفات 2D لتحديد النسبة المئوية للخلايا تشكيل إنفادوسومس ومنطقة تحلل المصفوفة في الخلية.

الشكل 1: البروتوكول. ملخص البروتوكول المستخدمة لإعداد الجيلاتين والكولاجين أنا المصفوفات. فمن الممكن لجعل مصفوفة الجيلاتين فقط أو الجيلاتين والكولاجين أنا مختلطة المصفوفة. الرجاء انقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الرقم.
- مصفوفة الجيلاتين
ملاحظة: وتستخدم مصفوفات الجيلاتين الفلورسنت لتحديد تدهور المصفوفة، ويستخدم غير الفلورسنت الجيلاتين لتعزيز التصاق ألياف الكولاجين I. حصيرة الجيلاتين الفلورسنتوتستخدم أيضا الأرز ل بودوسوم ودراسات إنفادوبوديا (انظر الشكل 1 ). - تحت غطاء تدفق الصفحي العقيمة، ضع قطعة من بارافيلم (20 سم × 15 سم) على منطقة العمل وتطهيره مع الايثانول 70٪.
- قسامة 20 قطرات ميكرولتر من 1 ملغ / مل الجيلاتين في خط، متباعد حوالي 1 سم بعيدا؛ راجع الشكل 1 لتنظيم الحبرية.
- تغطية كل 20 ميكرولتر الجيلاتين قطرة مع ساترة الزجاج تعقيمها (12 ملم في القطر).
- احتضان لمدة 20 دقيقة في درجة حرارة الغرفة. إذا كان الجيلاتين الفلورسنت، حمايته من الضوء.
- قسامة 40 قطرات ميكرولتر من 0.5٪ غلوتارالدهيد في 1X الفوسفات مخزنة المالحة (بس) في خط، كل متباعدة حوالي 1 سم تحت خط كوفرسليبس من الخطوة 1.1.3.
تنبيه: غلوتارالدهيد هو عامل تثبيتي سامة. استخدم القفازات ولا تستنشق. - باستخدام ملقط مرصع بالجواهر، ونقل كل ساترة الجيلاتين المغلفة إلى قطرة غلوتارالدهيد.
ملاحظة ذلكمن الطبيعي أن قطرة الجيلاتين الصغيرة لا تزال على بارافيلم. لا تعيد استخدام هذا لتجربة أخرى. - احتضان لمدة 40 دقيقة في درجة حرارة الغرفة. ل كوفرسليبس الفلورسنت، حمايتها من الضوء.
- خذ 24-جيدا لوحة زراعة الخلايا وملء كل بئر مع 500 ميكرولتر من برنامج تلفزيوني العقيمة 1X. وضع كوفرسليبس، الجانب الجيلاتين تصل، في كل بئر.
- غسل مرتين في برنامج تلفزيوني 1X لمدة 5 دقائق لكل منهما.
ملاحظة: في هذه الخطوة، كوفرسليبس يمكن استخدامها للتجريب أو المخزنة في برنامج تلفزيوني 1X في 4 درجات مئوية. غير-- الفلورسنت كوفرسليبس يمكن تخزينها لمدة أسبوع واحد، ويمكن تخزين كوفرسليبس الفلورسنت لمدة 48 ساعة.
- فيبريلار نوع الكولاجين أنا مصفوفة
ملاحظة: يستخدم نوع الكولاجين فيبريلار I مصفوفة لدراسة تشكيل إنفادوسوم الخطي وتدهور المصفوفة المرتبطة بها. يتم استخدام مزيج من الكولاجين الفلورسنت الأول وغير الفلورسنت الجيلاتين كوفرسليبس ل كولوكاليز علامات إنفادوسوم مع ألياف الكولاجين (على سبيل المثال، F- أكتين طn القناة الحمراء الحمراء، الكولاجين I في القناة الحمراء، Tks5 في القناة الخضراء، وصبغ هويشت لصمة نووية). من ناحية أخرى، ويستخدم مزيج من غير الفلورسنت الكولاجين أنا مع غير الفلورسنت الجيلاتين كوفرسليبس لتعظيم عدد علامات إنفادوسوم ملطخة (على سبيل المثال، F- أكتين في القناة الحمراء الحمراء، كورتاكتين في القناة الحمراء، Tks5 في والقناة الخضراء، وصبغ هويشت لصمة نووية). وأخيرا، يتم استخدام مزيج من الكولاجين غير الفلورسنت I مع كوفرسليبس الجيلاتين الفلورسنت لتحديد الانحراف المرتبط بالجيلاتين (على سبيل المثال، F- أكتين في القناة الحمراء الحمراء، Tks5 في القناة الحمراء، في القناة الخضراء، وصبغ هويشت للحصول على وصمة نووية) (انظر الشكل 1). يستخدم صبغ هويشت لصمة عار النواة، وأنه يتحقق أيضا للتلوث الميكوبلازما، بالإضافة إلى اختبار ير القيام به بانتظام على خطوط الخلايا المستخدمة. - الكولاجين الفلورسنت I
- استخدام الكولاجين التجاري أنا المستخرجة من وتر ذيل الفئران في 0.02 N أسي الخليكد. سحب كمية الكولاجين أنا ضروري لإعداد 500 ميكرولتر من محلول ساترة في تركيز النهائي من 0.4 ملغ / مل من الكولاجين أولا.
- إضافة 5 كاربوكسي x استرامين سوتشينيميديل استر في تركيز النهائي من 10 ميكروغرام / مل، وتحسب للحجم النهائي من حل الكولاجين الأول (نكس 500 ميكرولتر).
- مزيج من الحل عن طريق بيبتينغ صعودا وهبوطا واحتضان لمدة 5 دقائق في درجة حرارة الغرفة، محمية من الضوء.
- تمييع إلى الحجم النهائي مع 1X دولبيكو الفوسفات مخزنة المالحة (دبس) التي تحتوي على الكالسيوم والمغنيسيوم، واستخدامها مباشرة.
- فيبريلار الكولاجين أنا ساترة
- استخدام غير الفلورسنت أو الفلورسنت الجيلاتين كوفرسليبس أعدت سابقا في الخطوة 1.1.
- إعداد محلول من الفلورسنت أو غير الفلورسنت الكولاجين أنا في تركيز النهائي من 0.4 ملغ / مل في دبس 1X تحتوي على الكالسيوم والمغنيسيوم.
- إضافة 500 ميكرولتر من الفلورسنت أو غير الفلورسنت الكولاجين I حل لكلساترة في 24-جيدا لوحة زراعة الخلايا.
- احتضان لمدة 4 ساعات عند 37 درجة مئوية للكولاجين الأول البلمرة.
- بعد الحضانة، وإزالة الكولاجين الزائد أنا عن طريق إمالة لوحة و بيبتينغ على جانب البئر (وليس مباشرة على ساترة) لتجنب إتلاف المصفوفة.
ملاحظة: لا يمكن تخزين هذه المصفوفة. البذور الخلايا مباشرة بعد إزالة الكولاجين الزائدة I.
2. خلية البذر، وقت الثقافة، والتثبيت
- اعتمادا على نوع الخلية، وإعداد الخلايا في وسط الثقافة المناسبة وإضافة خلايا لحجم النهائي من 500 ميكرولتر لكل بئر.
- لتوصيف قدرة خط الخلية لتشكيل إنفادوسوم الخطي وتحلل المصفوفة، لوحة الخلايا لمدة 4 ساعات و 12 ساعة و 24 ساعة على الكولاجين أنا مصفوفة لتحديد حركية تشكيل إنفادوسوم الخطي ونشاط تدهور المرتبطة بها.
ملاحظة: يحتوي الجدول 1 على أمثلة لخطوط الخلايااختبارها في المختبر. | خط الخلية | عدد الخلايا لكل ساترة | وقت الاتصال مع مصفوفة للخطي إنفادوسوم الكمي | وقت الاتصال مع مصفوفة لقياس الكمي من انحطاط إنفادوسوم الخطي |
| مدا مب 231 | 40000 | 4 ح | 12 ح |
| HUH7 | 40000 | 12 ح | 24 ساعة |
| هيب 3B | 40000 | 12 ح | 24 ساعة |
| سنو 398 | 40000 | 12 ح | 24 ساعة |
| نيه 3T3 سرك | 30000 | 4 ح | 12 ح |
| A431 | 50000 | 6 ح | 24 ساعة |
| A549 | 40000 | 12 ح | 24 ساعة &# 160؛ |
| الخام | 40000 | 12 ح | 12 ح |
| PAE | 40000 | 12 ح | 12 ح |
الجدول 1: زرع الخلايا ووقت الحضانة المرجعية. يعرض هذا الجدول قائمة غير شاملة من خطوط الخلايا المستخدمة لدراسة إنفادوسوم الخطي. وهو يشير إلى عدد الخلايا للبذور على المصفوفة، والوقت اللازم لمراقبة إنفادوسوم الخطي، والوقت اللازم لمراقبة تدهور المصفوفة المرتبطة بها. إنفادوسوم الخطي لها عمر قصير. لتكون قادرة على مراقبة إنفادوسوم الخطي في الحد الأقصى لعدد الخلايا، يجب أن تكون الخلايا في اتصال مع مصفوفة الكولاجين أنا لفترة قصيرة من الزمن. من ناحية أخرى، لتكون قادرة على تصور تدهور الجيلاتين ذكرت، يجب أن تكون الخلايا في اتصال مع مصفوفة الكولاجين أنا لفترة أطول من الوقت من تلك المذكورة أعلاه. - بعد إزالة وسط زراعة الخلايا،إصلاح كوفرسليبس لمدة 10 دقيقة في 500 ميكرولتر من بارافورمالدهيد 4٪ في برنامج تلفزيوني 1X.
- غسل مرتين مع برنامج تلفزيوني 1X.
- تخزين في 4 درجات مئوية، محمية من الضوء.
3. المناعي
- بيرمابيليز الخلايا لمدة 10 دقيقة مع حل الطازجة من 0.2٪ تريتون X-100 في برنامج تلفزيوني 1X. لا تقم بإعادة استخدام هذا الحل.
- غسل كوفرسليبس مرتين مع برنامج تلفزيوني 1X.
- وضع قطعة من بارافيلم (20 سم × 15 سم) على مقاعد البدلاء.
- تمييع الأجسام المضادة الأولية في 4٪ ألبومين المصل البقري (بسا) في برنامج تلفزيوني 1X، كما هو موضح في جدول المواد .
- قسامة 50 قطرات ميكرولتر من حل الأجسام المضادة الأولية في خط، كل متباعدة حوالي 1 سم بعيدا.
- وضع كل ساترة على قطرة.
- احتضان لمدة 40 دقيقة في درجة حرارة الغرفة، محمية من الضوء.
- بعد فترة الحضانة، وغسل مرتين مع برنامج تلفزيوني 1X.
- تمييع الأجسام المضادة الثانوية، فالويدين، وصبغ هويشت في 4٪ بسا في 1XPBS.
- قسامة 50 قطرات ميكرولتر من المزيج، كل متباعدة حوالي 1 سم تحت السطر الأول من كوفرسليبس، كما فعلت سابقا.
- وضع كل ساترة على قطرة.
- احتضان لمدة 30 دقيقة في درجة حرارة الغرفة، محمية من الضوء.
- بعد الحضانة، وغسل مرتين مع برنامج تلفزيوني 1X.
- اغسل مرة واحدة بالماء المقطر لإزالة الأملاح.
- جبل كوفرسليبس على شريحة زجاجية مع البلمرة تصاعد المتوسطة.
- السماح كوفرسليبس الجافة بين عشية وضحاها في درجة حرارة الغرفة، محمية من الضوء، قبل المجهري.
4. الكميات

الشكل 2: الخطي إنفادوسوم الكمي. الماكرو يتطلب الصور متحد البؤر F- أكتين و Tks5 تلطيخ (الشكل: 1،024 × 1،024). ( A ) أولا، افتح الصورة F- أكتين وجعل قناع. ( B ) ثم، فتحصورة Tks5 وعتبة ذلك. تطبيق الماكرو. ( C ) ستظهر نتائج تحليل في جدولين. عدد إنفادوسوم الخطية في الخلية وغيرها من المعلومات، مثل النسبة المئوية للمنطقة المستخدمة من قبل إنفادوسوم الخطي في الخلية، سيكون في جدول ملخص. سيكون حجم كل إنفادوسوم الخطي في جدول النتائج. الرجاء انقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الرقم.
- النسبة المئوية للخلايا التي تشكل إنفادوسوم الخطية
- عد الخلايا التي تشكل إنفادوسوم الخطية، ما يقرب من 100 خلية لكل ساترة (استخدام تريبليكاتس التقنية). تحديد ما لا يقل عن 300 خلية لكل n، مع n = 3.
- حساب النسبة المئوية للخلايا التي تشكل إنفادوسوم الخطية من خلال اتخاذ متوسط ثلاث تجارب مستقلة، مما أدى إلى 900 الخلايا كميا.
- الخطي إنفادوسوم حجم ورقم لكل خلية
- استخدام إيماجيج مع الماكرو التكميلي.
تدهور لكل خلية - استخدام كوفرسليبس ثلاثة في حالة.
- تأخذ 30 صورة في ساترة من الجيلاتين الفلورسنت ونوى هويست الملطخة.
- استخدام برنامج إيماجيج كما هو موضح في مارتن خ وآخرون. 9 -
5. 3D الغزو الكولاجين الفحص

الشكل 3: مخطط فحص الغزو. ملخص لبروتوكول الفحص الغزو. الكولاجين الأول هو عبر ربط مع سوتسينيميديل استر صبغ وبلمرة لمدة 1 ساعة عند 37 درجة مئوية. يتم إضافة الخلايا في وسط خالية من المصل على رأس الكولاجين أنا سد العجز. يتم وضع إدراج في واي المتوسطةث 10٪ فبس. يتم إصلاح الكولاجين أنا المقابس 1 ساعة بعد زرع الخلايا في السيطرة و 3 أيام بعد زرع الخلايا في حالة تجريبية لتحديد قدرة الغزو من الخلايا. الرجاء انقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الرقم.
- الكولاجين أنا المكونات الإعداد
- جعل دورة الوقت من 4 ساعة، 12 ساعة، 24 ساعة، 48 ساعة، و 72 ساعة لأول تجربة لتحديد حركية الغزو في هلام وفقا لنوع الخلية. لكل تجربة، إضافة نقطة زمنية 1 ساعة كنقطة زمنية مرجعية عند حدوث أي غزو.
- إعداد الحل I الكولاجين على الجليد تحت غطاء محرك السيارة تدفق العقيمة الصفحي. إعداد 500 ميكرولتر من الحل ل 3 إدراج غرفة بويدن.
- نضح 1 ملغ من الكولاجين الفئران الذيل التجاري الأول لإعداد حل مع تركيز النهائي من 2 ملغ / مل الكولاجين أولا.
- إضافة 5 كاربوكسي x رودامين سوتشينيميديل استر فيتركيز النهائي من 1 ميكروغرام / مل، وتحسب للحجم النهائي من حل الكولاجين الأول (في هذه الحالة، 500 ميكرولتر).
- تخلط جيدا واحتضان لمدة 5 دقائق على الجليد تحت غطاء تدفق الصفحي العقيمة، محمية من الضوء.
- إضافة 50 ميكرولتر من الجليد الباردة، وتصفية 10X بس و 6.25 ميكرولتر من الجليد الباردة 1 M هيدروكسيد الصوديوم (هيدروكسيد الصوديوم).
- إضافة الماء المعقم وفقا لصيغة 443.75 - × ميكرولتر من الكولاجين أولا.
- إضافة 100 ميكرولتر من الحل لكل غرفة بويدن إدراج.
- احتضان لمدة 1 ساعة عند 37 درجة مئوية للسماح للبلمرة.
- إضافة المتوسطة ثقافة الخلية المخصب مع مصل الأبقار الجنين (فبس) في آبار جديدة؛ مكان إدراج في هذه الآبار.
- البذور 30000 الخلايا على رأس الكولاجين أنا سد العجز في وسط فبس خالية.
- بعد زراعة الخلايا في 37 درجة مئوية، وإصلاح الكولاجين أنا سد لمدة 30 دقيقة في بارافورمالدهيد 4٪ في برنامج تلفزيوني 1X.
- المناعي كاملة كما في الخطوة 3، باستثناء الخطوات التالية: بيرمابيليزي مع 0.2٪ تريتون X-100 في برنامج تلفزيوني 1X لمدة 30 دقيقة، وليس 10 دقيقة. احتضان مع حلول الأجسام المضادة الأولية والثانوية لمدة 1.5 ساعة لكل منهما، بدلا من 40 دقيقة و 30 دقيقة، على التوالي. وصمة عار ل F- أكتين أو نوى لتوطين الخلايا.
- بعد المناعي، واستخدام مشرط لقطع حول غشاء إدراج ونقل بعناية الكولاجين أنا سد العجز إلى طبق قاع الزجاج. تأكد من أن الجزء العلوي من الكولاجين أنا المكونات على اتصال مع الزجاج. إبقاء غشاء إدراج تعلق على الجزء السفلي من الكولاجين أنا سد من أجل الحفاظ على سلامة المكونات.
ملاحظة: الكولاجين أنا المكونات لا تزال سليمة في طبق القاع الزجاجي. عمق بين أسفل الزجاج والبلاستيك المحيطة أسفل الزجاج ما يعادل سمك المكونات. - وضع ساترة على الكولاجين أنا المكونات وجبل مع البلمرة تصاعد المتوسطة لمنع المكونات من الجفاف.
- استخدام المجهر متحد البؤر مقلوب لصورة الكولاجين أنا سد العجز. الجزء العلوي منالمكونات هو في اتصال مع أسفل الزجاج من الطبق.
- الحصول على كومة ض من أعلى إلى أسفل الكولاجين أنا سد لتصور غزو الخلية. تحديد سمك Z- المكدس من خلال دراسة مدى عمق الخلايا تغزو مجال التصوير. إجراء عمليات الاستحواذ مع هدف النفط 40X في شكل 512 × 512 مع حجم Z- خطوة من 0.25 ميكرون.
ملاحظة: كمرجع، متوسط z-- المكدس للخلايا مدا-مب-231 3 أيام بعد البذر هو 30 ميكرون.