يتطلب اشتراك JoVE لعرض هذا المحتوى. تسجيل الدخول أو ابدأ نسخة تجريبية مجانية

مقالة منهجية

بروتوكول لتوصيف التغيرات المورفولوجية

8.6K مشاهدة

DOI:

10.3791/55383

مايو 25, 2017

في هذه المقالة

ملخص

< p class = 'jove_content'> يتم تحديد فعالية المضادات الحيوية بشكل شائع عن طريق إجراء دراسات حركية للقتل وقياس وحدات تشكيل المستعمرة (CFUs). من خلال دمج المجهر الإلكتروني الماسح (SEM) مع هذه الطرق القياسية ، يمكننا التمييز بين التأثيرات الدوائية للعلاج بين المضادات الحيوية المختلفة.

الملخص

تقييم عمل المضادات الحيوية مع تطوير العقاقير الجديدة الموجهة نحو البكتيريا اللاهوائية أمر صعب ومطالب من الناحية الفنية. للحصول على نظرة ثاقبة وزارة الزراعة ممكن، والتغيرات المورفولوجية المرتبطة التعرض للمضادات الحيوية يمكن تصور باستخدام المجهر الإلكتروني المسح (سيم). دمج التصوير سيم مع منحنيات قتل التقليدية قد تحسن رؤيتنا في العمل المخدرات والمضي قدما في عملية تطوير المخدرات. لاختبار هذه الفرضية، وقتل منحنيات ودراسات سيم أجريت باستخدام المخدرات مع وزارة الزراعة المعروفة ولكن مختلفة (فانكومايسين وميترونيدازول). خلايا C. صعب (R20291) نمت مع أو بدون وجود المضادات الحيوية لمدة تصل إلى 48 ساعة. على مدى فترة 48 ساعة، تم جمع الخلايا في نقاط زمنية متعددة لتحديد فعالية المضادات الحيوية والتصوير على سيم. وتمشيا مع التقارير السابقة، كان فانكومايسين وميترونيدازول نشاطا كبيرا للجراثيم بعد 24 ساعة من العلاج على النحو الذي تقاسه وحدة تشكيل مستعمرة (كفو) كونتينغ. باستخدام التصوير سيم، وجدنا أن ميترونيدازول له آثار كبيرة على طول الخلية (> 50٪ تخفيض في طول الخلية لكل المضادات الحيوية؛ P <0.05) مقارنة مع الضوابط والفانكومايسين. في حين لم يتم توثيق الاستجابة المظهري للعلاج من تعاطي المخدرات سابقا بهذه الطريقة، فإنها تتفق مع وزارة الزراعة المخدرات التي تبين تنوع وموثوقية التصوير والقياسات وتطبيق هذه التقنية للمركبات التجريبية الأخرى.

المقدمة

كلوستريديوم ديفيسيل عبارة عن جرثومية إيجابية تشكل البكتريا التي تسبب الجراثيم، مما تسبب في حوالي 500،000 إصابة سنويا في الولايات المتحدة، ويعتبر هذا المرض ممرضا عاجلا على مستوى التهديد من قبل مراكز السيطرة على الأمراض والوقاية منها، وهو أعلى مستوى من المخاطر. 1 شهد العقد الماضي تطورا كبيرا في العقاقير المضادة للميكروبات مع النشاط ضد C. صعب . 2 ، 3 في المختبر الدراسات هي عنصر ضروري من عملية تطوير المخدرات. 4 تقليديا، في المختبر وقابلية الوقت وقتل الدراسات تستخدم للتحقق من صحة الحيوان في المستقبل وغيرها من الدراسات في الجسم الحي .

في حين أن هذه الأساليب تخدم دورا هاما لتقييم عمل القتل، فإنها لا تعبر عن استجابة الخلايا الظاهرية للعلاج الدوائي. من خلال دمج المسح المجهري الإلكتروني (سيم) مع القياسيهد قتل الدراسات الحركية، توصيف أكثر دقة من المضادات الحيوية الآثار المباشرة هو ممكن. 5 ، 6 ، 7 هنا، نقدم طريقة حيث سيم يستخدم كوسيلة للتعرف على فعالية العلاج بالمضادات الحيوية.

الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.

البروتوكول

1. عزل C. صعب من مختلف المصادر البيئية أو السريرية

  1. العزلات البيئية: باستخدام مقياس القطن المعقم مسبقا (مبللة طفيفة مع 0.85٪ كلوريد الصوديوم)، مسحة سطح أي مجال من مجالات الاهتمام (الكلمة، الباب، مقبض، الرف، الخ ). 8 تأكد من ارتداء قفازات معقمة ووضع مسحة في أنبوب معقمة بعد الانتهاء.
  2. العزلات السريرية (البراز): لوحة 10 إلى 100 ملغ من عينات البراز السريري على أجار السيفوكسيتين سيكلوسيرين - الفركتوز (كفا) باستخدام حلقة التلقيح واحتضان تحت ظروف اللاهوائية صارمة لمدة 48 - 72 ساعة. مخزن المستعمرات المعزولة من C. صعب الأسهم في كريوفيالز في -80 درجة مئوية لمزيد من التحليلات. 7 ، 9 ، 10
  3. إثراء عينات مسحة البيئية في الدماغ ضخ القلب (بهي) مرق مع 0.05٪ توروشولات الصوديوم ومكان في غرفة اللاهوائية عند 37 درجة مئويةلمدة 5 أيام. الطرد المركزي 1 مل من الثقافة في 10،000 x ج و ريسوسبيند بيليه في 100 ميكرولتر من الإيثانول.
  4. لوحة الخلايا معلق (50 ميكرولتر) على سيكلوسيرينسيفوكسيتين أجار الفركتوز (كفا) لوحات واحتضان في غرفة اللاهوائية عند 37 درجة مئوية لمدة 40 - 48 ساعة. مخزن المستعمرات المعزولة من C. صعب الأسهم في كريوفيالز في -80 درجة مئوية لمزيد من التحليلات.
  5. اختبار يشتبه C. المستعمرات صعب باستخدام كاشف تراص اللاتكس أو ير.

2. زراعة C. صعب وقتل الإجراءات الحركية

  1. تنمو تنقيته البيئية أو السريرية C. السلالات صعب على لوحات أجار الدم في غرفة اللاهوائية عند 37 درجة مئوية لمدة 48 ساعة.
  2. تأخذ مستعمرة واحدة معزولة مع حلقة التلقيح، ونقله إلى 5 مل بهي المتوسطة في أنبوب 15 مل، وتنمو لمدة 24 ساعة في غرفة اللاهوائية عند 37 درجة مئوية.
  3. تمييع ما قبل الثقافات 1: 100 إلى ما يقرب من 10 6 وحدة تشكيل مستعمرة(كفو) / مل في الطازجة قبل تخفيض بهيس (بهي زائد 5 جرام / لتر استخراج الخميرة و 1٪ L- السيستين) تستكمل مع 0.1٪ توروشولات الصوديوم والتركيز المناسب للمضادات الحيوية (T0).
  4. جمع عينة 1 مل مع ماصة في كل نقطة زمنية (T0، T6، T24، T48) لوحة / انتشار قسامة صغيرة (100 ميكرولتر في التخفيفات المسلسل) على لوحة أجار الدم. السماح للخلايا تنمو على لوحة أجار الدم لمدة 48 ساعة في غرفة اللاهوائية عند 37 درجة مئوية، وعدد عدد الناتجة من المستعمرات لتحديد كفو.

3. إعداد عينات لمسح المجهر الإلكتروني

  1. جمع 1 مل من الخلايا من كل نقطة زمنية في أنابيب ميكروسنتريفوج وأجهزة الطرد المركزي في 10،000 x ج لمدة 10 دقيقة. تجاهل طاف وغسل الخلايا في برنامج تلفزيوني.
  2. الطرد المركزي العينات في 10،000 x ج لمدة 10 دقيقة مرة أخرى وتجاهل طاف. إعادة تمييع الخلايا في 1 مل من بارافورمالدهيد 4٪ واحتضان لمدة 1 ساعة في درجة حرارة الغرفة.
  3. عينات الطرد المركزي مرة أخرى لمدة 10 دقيقة في 10،000 زغ وتجاهل طاف. غسل الخلايا مرتين مع الماء المقطر وإعادة تعيين في 100 ميكرولتر من الماء المقطر. ضبط حجم اعتمادا على تعكر الحل.
    ملاحظة: جعل التخفيفات التسلسلية متعددة هي فكرة جيدة.
  4. تسمية كوفرسليبس وإضافة 40 ميكرولتر من العينة على ذلك. احتضان لمدة 15 دقيقة في غطاء محرك السيارة لتدفق السائل والسماح للخلايا على التمسك ساترة. إذا كان السائل لا يزال موجودا، استخدم منفاخ لإزالة السائل.
  5. مكان كوفرسليبس المسمى مع الخلايا في آلة الاخرق مكتب وشريط أسفل. تأمين الذهب الخالص في آلة الاخرق. بدوره على الجهاز والبدء الاخرق في الضغط المنخفض (50 متور). خلايا معطف لمدة 30 ثانية في 80 مللي أمبير، والذي يترجم إلى 20 نانومتر من طلاء الذهب.
  6. نقل الخلايا المغلفة إلى المجهر الإلكتروني الماسح الضوئي.

4. التصوير C. صعب الخلايا على المجهر الإلكتروني المسح الضوئي

  1. تنفيس المجهر الإلكتروني الماسح (سيم) بشكل صحيح من قبل العلاقات العامةإسينغ زر تنفيس على برامج الكمبيوتر.
  2. باستخدام الشريط الكربون، وتأمين كوفرسليبس المغلفة على المرحلة المعدنية. بمجرد تنفيس سيم، يجب فتح الباب بسهولة. قفل المرحلة المعدنية في غرفة سيم عن طريق شد عليه في.
  3. انقر فوق الزر بومب في برنامج الكمبيوتر. سوف سيم تكون صالحة للاستخدام عندما يقرأ النظام "فاك موافق".
  4. انقر على كاشف سي تحت علامة التبويب كاشفات. بدوره على شعاع من خلال النقر على الزر الذي يعرض الجهد. بدء التصوير في الجهد المنخفض (5 كيلو فولت) قبل زيادة الجهد (تصل إلى 15 كيلو فولت). ستظهر صورة بعد تشغيل الحزمة.
  5. باستخدام وظيفة تتبع، والعثور على منطقة على كوفرسليبس المغلفة إلى الصورة. التكبير في المنطقة والعثور على هياكل على شكل قضيب. هذه هي كلوستريديوم صعب .
  6. التكبير والتركيز على الصورة لمعايرة النظام. وينبغي أن يتم ذلك على مسافات عمل متعددة: 15 و 9 و 5 مم. صورة على مسافة عمل 5 مم.
  7. قم بتشغيل uلترا عالية الدقة وضع التصوير والبدء في التركيز وتحسين الاستجماتيزم.
  8. بدء التركيز في التكبير عالية. استخدام التركيز الخشنة وغرامة تبديل لهذا الغرض. ضبط الاستجماتيزم وكذلك للحصول على صورة أوضح.
    1. ضبط الاستجماتيزم في التكبير عالية. للقيام بذلك، وضبط الصيغ الاستجماتيزم (أنها تبدو مشابهة للتبديل التركيز غرامة / الخشنة) والتحقق من الصورة عن وضوح عن طريق التكبير رقميا على برامج الكمبيوتر.
  9. سي وظيفة المسح البطيء لجمع صورة ذات جودة عالية. حفظ الصورة التي تم جمعها كملف .TIFF، والتي سيتم استخدامها للتحليل. تأكد من تحديد شريط البيانات إذا تم إجراء القياسات أثناء التحليل.
  10. جمع الصور في زوايا مختلفة (تصل إلى 52 درجة عن طريق تحويل زاوية مباشرة على سيم.الزاوية الصور تميل إلى الكشف عن مزيد من المعلومات العمق.
  11. تغيير شعاع الجهد اعتمادا على الخلايا التي يتم تصويرها. الحفاظ على هذا في الغالب بين 5-15 كيلوفولت لجميع التجارب.
  12. بعد اكتمال التصوير، قم بإيقاف تشغيل الحزمة ورفع مسافة العمل إلى 20 مم. ويمكن بعد ذلك تنفيس الغرفة ويمكن إزالة المرحلة. نسخ جميع الصور على محرك الأقراص لمزيد من التحليل.

5. معالجة الصور وتحليلها

  1. تحميل وتثبيت البرمجيات المتاحة بحرية، فيجي (http://fiji.sc)، على جهاز الكمبيوتر.
  2. افتح ملف الصورة في فيجي.
  3. باستخدام وظيفة الخط، تتبع بدقة شريط مقياس.
  4. انقر فوق علامة التبويب تحليل في برنامج فيجي وأخيرا حدد وظيفة تحديد مقياس. ستظهر نافذة ستتطلب تحديد المسافة المعروفة استنادا إلى شريط المقياس. تغيير وحدة طول وكذلك انقر فوق موافق.
  5. الآن بعد أن يتم معايرة البرنامج لمسافة، استخدم وظيفة خط لقياس طول الخلية. للحصول على طول، استخدم الدالة خط لتتبع الخلية في مجملها. حدد علامة التبويب تحليل مرة أخرى ثم انقر على قياس. يجب طول التطبيقالأذن في الوحدات المشار إليها سابقا.

الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.

النتائج

كلوستريديوم ديفيسيل هو بكتيريا تشكيل بوغ وبالتالي فمن الضروري تحديد الاختلافات التشكل بين الخضري وخلايا بوغ قبل أي تحليل وظيفي. الشكل 1 يوضح الصور التمثيلية للخلايا الخضرية التي تم التقاطها خلال المرحلة الأسية من منحنى النمو وخلايا بوغ. كما هو مبين، والخلايا الخضرية طويلة، على نحو سلس، والهياكل على شكل قضيب في حين أن الجراثيم صغيرة، والهياكل البيضاوية التي لديها الخارجي الخام. وظيفيا، والخلايا الخضرية تنمو وتقسيم ...

الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.

المناقشة

وكان الهدف من الدراسة الحالية لخلق طريقة عالية الإنتاجية لعزل C. صعب واختبار الحساسية للمضادات الحيوية باستخدام المجهر الإلكتروني المسح (سيم) كوسيلة لتوصيف أكثر دقة من العمل الدوائي للمضادات الحيوية. باستخدام البروتوكولات المبينة هنا، أثبتنا أن التصوير استجابة الظواهر الخلية للعلاج بالمضادات الحيوية يمكن أن تكشف عن نظرة ثاقبة في العمل الدوائي للدواء. في المجموع، الجزء التصوير من هذا البروتوكول يستغرق ما يقرب من 2 ساعة في مدة بعد جمع الخلايا، ولكن يمكن أن يكون أكثر تمييزية...

الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.

الإفصاحات

تلقت KWG دعما بحثيا سابقا وحاليا من Merck & Co. و Summit ، PLC.

شكر وتقدير

تم دعم هذه التجارب من خلال منح بحثية من Merck and Co. and Summit ، PLC.

الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.

المواد

قائمة المواد المستخدمة في هذه المقالة
الاسمالشركةرقم فهرسيالتعليقات
شاش قطني العنايةPRM21408C
كلوريد الصوديومماكرون7532
50 مل أنابيبفالكون352098
ضخ القلب في الدماغ (BHI)   ؛المعيارC5141
L-cysteineAlfa AesarA10389
مستخلص الخميرةالمعيارC741
الصوديوم taurocholateAlfa AesarA18346
الغرفة اللاهوائيةCoyالفينيل الغرفة اللاهوائية
Cycloserinecefoxitin الفركتوز أجار (CCFA)أنظمة AnaerobeAS-213
لوحات أجار الدم التشخيصهارديA-10
كاشف تراص اللاتكسأوكسويدDR1107AC. مجموعة اختبار ديفان
الطرد المركزيالدقيقة Eppendorf222363204
PBSGibco10010-031
4٪ بارافورمالدهايدفيشر Scientific50-259-98
شرائح مجهرJ. ملفين العلامة التجارية المحررة7525M75 × 25mm
تدفق هودLabconcoالفئة الثانية من النوع A2 & nbsp ؛خزانة السلامة الحيوية
آلة الاخرق المكتبيةDenton VacuumDesk II
الشريطالبلاستيكي الأساسي05072-ABSPI شريط كربوني لاصق
مزدوج الوجهينDenton VacuumTAR001-01582.375 " القطر × .002 بوصة مجهر إلكتروني ماسح رقائق الذهب السميكة
FEIXL-30
أنابيب الذهب

المراجع

  1. Lessa, F. C., et al. Burden of Clostridium difficile infection in the United States. N Engl J Med. 372 (9), 825-834 (2015).
  2. Vickers, R. J., et al. Ridinilazole: a novel therapy for Clostridium difficile infection. Int J Antimicrob Agents. 48 (2), 137-143 (2016).
  3. Shah, D., et al. Clostridium difficile infection: update on emerging antibiotic treatment options and antibiotic resistance. Expert Rev Anti Infect Ther. 8 (5), 555-564 (2010).
  4. Ambrose, P. G., et al. New EMA guideline for antimicrobial development. Lancet Infect Dis. 12 (4), 265-266 (2012).
  5. Bassères, E., et al. Impact on toxin production and cell morphology in Clostridium difficile by ridinilazole (SMT19969), a novel treatment for C. difficile infection. J Antimicrob Chemother. 71 (5), 1245-1251 (2016).
  6. Endres, B. T., et al. A novel method for imaging the pharmacological effects of antibiotic treatment on Clostridium difficile. Anaerobe. 40, 10-14 (2016).
  7. Endres, B. T., et al. Evaluating the Effects of Surotomycin Treatment on Clostridium difficile Toxin A and B Production, Immune Response, and Morphological Changes. Antimicrob Agents Chemother. 60 (6), 3519-3523 (2016).
  8. Alam, M. J., Anu, A., Walk, S. T., Garey, K. W. Investigation of potentially pathogenic Clostridium difficile contamination in household environs. Anaerobe. 27, 31-33 (2014).
  9. Aitken, S. L., et al. In the Endemic Setting, Clostridium difficile Ribotype 027 Is Virulent But Not Hypervirulent. Infect Control Hosp Epidemiol. , 1-6 (2015).
  10. Basseres, E., et al. Impact on toxin production and cell morphology in Clostridium difficile by ridinilazole (SMT19969), a novel treatment for C. difficile infection. J Antimicrob Chemother. 71 (5), 1245-1251 (2016).
  11. Walters, B. A., Roberts, R., Stafford, R., Seneviratne, E. Relapse of antibiotic associated colitis: endogenous persistence of Clostridium difficile during vancomycin therapy. Gut. 24 (3), 206-212 (1983).
  12. Chilton, C. H., et al. Evaluation of the effect of oritavancin on Clostridium difficile spore germination, outgrowth and recovery. J Antimicrob Chemother. 68 (9), 2078-2082 (2013).
  13. Ofosu, A. Clostridium difficile infection: a review of current and emerging therapies. Ann Gastroenterol. 29 (2), 147-154 (2016).
  14. McDonald, L. C., et al. An epidemic, toxin gene-variant strain of Clostridium difficile. New Eng J Med. 353 (23), 2433-2441 (2005).

الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.

إعادة الطباعة والأذونات

الوسوم

المجهر الإلكتروني الماسحمنحنيات القتلتحليل طول الخليةعد الوحدات المكونة للمستعمراتالمزارع اللاهوائيةالطلاء بالذهببرنامج Fiji