Method Article

طريقة حسابية لقياس النشاط الإيقاعية يطير

DOI:

10.3791/55977

October 28th, 2017

In This Article

Summary

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

وتقدم طريقة لقياس السمات الزمنية الرئيسية ينظر في إيقاعات الحركية الإيقاعية يطير. ويتحقق القياس الكمي باحتواء النشاط يطير مع الموجي نموذج متعدد حدودي. تصف معلمات النموذج بالشكل وحجم صباح والمساء قمم النشاط اليومي.

Abstract

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

وفي معظم الحيوانات والنباتات، الساعات الإيقاعية تنسق العمليات الجزيئية والسلوكية ومزامنتها بدوره الضوء الظلام اليومية. الآليات الأساسية التي تكمن وراء هذا التحكم الزمني هي دراسة على نطاق واسع باستخدام ذبابة الفاكهة melanogaster المورفولوجية ككائن نموذج. في الذباب، عادة هو درس على مدار الساعة من خلال تحليل تسجيل الحركي multiday. هذا تسجيل يظهر نمط ثنائي الصيغة معقدة مع اثنين من قمم النشاط: ذروة صباح اليوم الذي يحدث حول الفجر، وذروة مساء الذي يحدث حول الغسق. تشكل معا هذه القمم اثنين الموجي الذي يختلف كثيرا عن ذبذبات جيبية الملاحظ في الجينات على مدار الساعة، مما يوحي بأن آليات بالإضافة إلى عقارب الساعة آثاراً عميقة في إنتاج أنماط الملاحظ في البيانات السلوكية. هنا ونحن توفر إرشادات حول استخدام أسلوب حسابي وضعت مؤخرا أن رياضيا ويصف أنماط الزمانية في نشاط الطيران. الأسلوب الذي يناسب بيانات النشاط مع الموجي نموذجي يتكون من أربع عبارات الأسى وتسع معلمات المستقلة التي تصف تماما في الشكل وحجم صباح والمساء قمم النشاط. معلمات المستخرجة يمكن أن تساعد في توضيح الآليات الحركية من ركائز التي تكمن وراء أنماط النشاط ثنائي الصيغة عادة الملاحظ في إيقاعات الحركي يطير.

Introduction

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

على مدار الساعة الإيقاعية مذبذب بيوكيميائية ذاتية مع فترة من حوالي 24 ساعة وفي كل مكان تقريبا في الحيوانات والنباتات1،2. ويساعد على مدار الساعة مزامنة العمليات الداخلية للكائن الحي والسلوك بدوره الظلام الضوء الخارجي. ودرست التركيبة الجينية لعقارب الساعة الإيقاعية منذ الستينات على نطاق واسع باستخدام ذبابة الفاكهة، ميلانوجاستير دال. في هذه الحشرة، جوهر على مدار الساعة الإيقاعية يتكون من أربعة من البروتينات: الفترة والخالدة، وعلى مدار الساعة، ودورة. وتشكل هذه المكونات الأساسية جنبا إلى جنب مع جزيئات أخرى حلقة التغذية مرتدة التي تنتج ذبذبات جيبية ما يقرب من ساعة الجينات3،

Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.

Protocol

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

1-قياس يطير الحركة استخدام المورفولوجية نشاط رصد (السد)

ملاحظة: لمزيد من التفاصيل، انظر المرجع 5.

  1. تحضير الفردية يطير أنابيب مع الأغذية في نهاية واحدة والقطن على الآخر. ينبغي مختومة النهاية مع الطعام لمنع الطعام من الجفاف. وضع
    1. ز 5-6 من الأغذية ذبابة في كوب 50 مل. قطع الطعام إلى قطع صغيرة حتى يكون من السهل أن تذوب عليه.
    2. 32 توصيل أنابيب زجاجية الفردية مع شريط المطاطي.
    3. تذوب المواد الغذائية في الكأس بالتدفئة في فرن ميكروويف لوقف س. 10-15 الميكروويف كل 5 s ويهز الكأس لضمان ذوبان متساوية من المواد الغذائية بعناية.
    4. بينما الغذاء لا يزال السائل، وضع أنابيب فردية معدّة في ا....

Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.

Results

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

الطريقة المعروضة هنا يسمح التحديد الكمي للسمات الرئيسية في نمط الحركة يطير. ويتحقق القياس الكمي باحتواء البيانات المتعلقة بالنشاط مع نموذج الذي يتكون من أربع عبارات الأسى:

figure-results-1

النموذج يحتوي على معلمات المستقلة التسعة التي تصف نمط النشاط. تعريف معلمات بMD،بMR، وب

Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.

Discussion

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

ويعرض هذا العمل إرشادات لاستخدام أداة حسابية التي توفر وصفاً كمياً لنمط الحركة يطير. الأداة تناسبها بيانات الحركة مع نموذج رياضي يتكون من أربع عبارات الأسى معا تصف بالشكل والحجم من قمم م وه. يتم الحصول على القيم النهائية لمعلمات نموذج من تركيب أطياف الطاقة للبيانات، حيث يمكن تجنب استخدام البيانات الخام أرتيفاكتوال الآثار التي يمكن أن تفرض البيانات binning أو تصفية على قيم المعلمة. يمكن استخدام معلمات النموذج ثم بمواصلة دراسة الحركة يطير والآليات التي تؤدي إلى قمم النشاط.

ويمكن تقييم نوعية التر.......

Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.

Disclosures

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

الكتاب ليس لها علاقة بالكشف عن.

Acknowledgements

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

ونحن ممتنون ستانيسﻻف لازوبولو للحصول على مساعدة مع محتوى الفيديو.

....

Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.

Materials

List of materials used in this article
NameCompanyCatalog NumberComments
ذبابة الفاكهة مراقب النشاطTriKineticsDAM2 ، DAM5يقيس موقع الطيران باستخدام شعاع الأشعة تحت الحمراء المفردة
MatLabMathworksبيئة الحوسبة ولغة البرمجة ، يجب أن يتضمن MatLab صناديق أدوات التحسين والرياضيات الرمزية
ذبابة الفاكهة السوداء   ؛لكل [S] ، لكل [L] ، iso31 (النوع البري)يمكن إجراء تحليلنا مع طفرات الذباب في أي فترة يومية

References

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,
  1. Pittendrigh, C. S. Circadian systems: general perspective. Biological Rhythms. II, 57-80 (1981).
  2. Zhang, E. E., Kay, S. A. Clocks not winding down: unravelling circadian networks. Nat Rev Mol Cell Biol. 11 (11), 764-776 (2010).
  3. Tataroglu, O., Emery, P.

Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.

Reprints and Permissions

Request permission to reuse the text or figures of this JoVE article

Request Permission

Tags

Fly Circadian ActivityDrosophila MelanogasterLocomotor RecordingExponential ModelCircadian PeriodMorning PeakEvening PeakMATLAB AnalysisLight Dark CycleActivity Monitoring

Related Articles